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Article de revue

Epidemic intelligence in Europe: A user needs perspective to foster innovation in digital health surveillance. Bouyer Fanny, Thiongane Oumy, Hobeika Alexandre, Arsevska Elena, Binot Aurélie, Corrèges Déborah, Dub Timothée, Mäkelä Henna, Van Kleef Esther, Jori Ferran, Lancelot Renaud, Mercier Alizé, Fagandini Ruiz Francesca, Valentin Sarah, Van Bortel Wim, Ruault Claire. 2024. BMC Public Health, 24:973, 20 p.
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Animal disease surveillance: How to represent textual data for classifying epidemiological information. Valentin Sarah, Decoupes Rémy, Lancelot Renaud, Roche Mathieu. 2023. Preventive Veterinary Medicine, 216:105932, 9 p.
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Dissemination of information in event-based surveillance, a case study of Avian Influenza. Valentin Sarah, Boudoua Bahdja, Sewalk Kara, Arinik Nejat, Roche Mathieu, Lancelot Renaud, Arsevska Elena. 2023. PloS One, 18 (9):e0285341, 18 p.
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Fusion of spatiotemporal and thematic features of textual data for animal disease surveillance. Valentin Sarah, Lancelot Renaud, Roche Mathieu. 2023. Information Processing in Agriculture, 10 (3) : 347-360.
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Elaboration of a new framework for fine-grained epidemiological annotation. Valentin Sarah, Arsevska Elena, Vilain Aline, De Waele Valérie, Lancelot Renaud, Roche Mathieu. 2022. Scientific Data, 9:655, 12 p.
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Understanding outbreak data dissemination in event based surveillance systems. Application on avian influenza using PADI-web. Boudoua B., Hautefeuille Claire, Arsevska Elena, Valentin Sarah. 2022. International Journal of Infectious Diseases, 116, suppl. IMED abstracts 2021, Résumé : S99. International Meeting on Emerging Diseases and Surveillance (IMED 2021). 8, 4 Novembre 2021/4 Novembre 2021.
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ITEXT-BIO: Intelligent Term EXTraction for BIOmedical analysis. Kafando Rodrique, Decoupes Rémy, Valentin Sarah, Sautot Lucile, Teisseire Maguelonne, Roche Mathieu. 2021. Health Information Science and Systems, 9:29, 23 p.
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Identifying associations between epidemiological entities in news data for animal disease surveillance. Valentin Sarah, Lancelot Renaud, Roche Mathieu. 2021. Artificial Intelligence in Agriculture, 5 : 163-174.
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Monitoring online media reports for early detection of unknown diseases: Insight from a retrospective study of COVID-19 emergence. Valentin Sarah, Mercier Alizé, Lancelot Renaud, Roche Mathieu, Arsevska Elena. 2021. Transboundary and Emerging Diseases, 68 (3) : 981-986.
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PADI-web 3.0: A new framework for extracting and disseminating fine-grained information from the news for animal disease surveillance. Valentin Sarah, Arsevska Elena, Rabatel Julien, Falala Sylvain, Mercier Alizé, Lancelot Renaud, Roche Mathieu. 2021. One Health, 13:100357, 10 p.
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EpidNews: Extracting, exploring and annotating news for monitoring animal diseases. Goel Rohan, Valentin Sarah, Delaforge Alexis, Fadloun Samilha, Sallaberry Arnaud, Roche Mathieu, Poncelet Pascal. 2020. Journal of Computer Languages, 56:100936, 12 p.
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PADI-web: A multilingual event-based surveillance system for monitoring animal infectious diseases. Valentin Sarah, Arsevska Elena, Falala Sylvain, De Goër Jocelyn, Lancelot Renaud, Mercier Alizé, Rabatel Julien, Roche Mathieu. 2020. Computers and Electronics in Agriculture, 169, 105163, 5 p.
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Web monitoring of emerging animal infectious diseases integrated in the French Animal Health Epidemic Intelligence System. Arsevska Elena, Valentin Sarah, Rabatel Julien, De Goër de Hervé Jocelyn, Falala Sylvain, Lancelot Renaud, Roche Mathieu. 2018. PloS One, 13 (8):e0199960, 25 p.
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Communication avec actes

EpiStrat-Eval : outil d'évaluation des stratégies d'extraction d'informations spatiales pour la veille en épidémiologie. Mahdoubi Y., Valentin Sarah, Idrissi N., Roche Mathieu. 2024. In : Journées francophones d'Ingénierie des Connaissances (IC PFIA 2024). AFIA, L3I, La Rochelle université. Talence : AFIA, 107-110. Journées francophones d'ingénierie des connaissances (IC 2024). 35, La Rochelle, France, 1 Juillet 2024/5 Juillet 2024.
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KEOPS-CTS: Knowledge ExtractOr Pipeline System pour l'analyse de Champs Thématiques Stratégiques. Valentin Sarah, Helmer Thierry, Rouviere Xavier, Roche Mathieu. 2024. In : Journées francophones d'Ingénierie des Connaissances (IC PFIA 2024). AFIA, L3I, La Rochelle université. Talence : AFIA, 45-50. Journées francophones d'ingénierie des connaissances (IC 2024). 35, La Rochelle, France, 1 Juillet 2024/5 Juillet 2024.
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TETIS @ Challenge TextMine 2024 : Reconnaissance d'entités géographiques dans un corpus des Instructions nautiques. Decoupes Rémy, Interdonato Roberto, Kafando Rodrique, Roche Mathieu, Syed Mehtab Alam, Teisseire Maguelonne, Valentin Sarah. 2024. In : Atelier sur la fouille de textes : TextMine 24. Cuxac Pascal (ed.), Lopez Cédric (ed.). Association EGC. Vandoeuvre-les-Nancy : Association EGC, 119-123. Atelier TextMine2024, Dijon, France, 23 Janvier 2024/23 Janvier 2024.
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Dissemination of information in event-based surveillance. Valentin Sarah, Boudoua Bahdja, Hautefeuille Claire, Lancelot Renaud, Roche Mathieu, Arsevska Elena. 2022. In : Abstracts Book: International Conference on Animal Health Surveillance. Copenhague : ICAHS4 Conference, 12-16. International Conference on Animal Health Surveillance (ICAHS4). 4, Copenhague, Danemark, 3 Mai 2022/5 Mai 2022.
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Automated processing of multilingual online news for the monitoring of animal infectious diseases. Valentin Sarah, Lancelot Renaud, Roche Mathieu. 2020. In : Proceedings of the LREC 2020 Workshop on Multilingual Biomedical Text Processing (MultiligualBIO 2020). Maite Melero (ed.). European Language Resources Association (ELRA). Paris : ELRA, 33-36. ISBN 979-10-95546-65-8 MultilingualBIO 2020, Marseille, France, 11 Mai 2020/16 Mai 2020.
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Information retrieval for animal disease surveillance: a pattern-based approach. Valentin Sarah, Lancelot Renaud, Roche Mathieu. 2020. In : Proceedings of the 11th International Workshop on Health Text Mining and Information Analysis. Holderness Eben (ed.), Yepes Antonio Jimeno (ed.), Lavelli Alberto (ed.), Lavelli Anne-Lyse (ed.), Pustejovsky James (ed.), Rinaldi Fabio (ed). Stroudsburg : Association for Computational Linguistics, 70-78. (LOUHI, 2020) ISBN 978-1-952148-81-1 International Workshop on Health Text Mining and Information Analysis, 16 Novembre 2020/20 Novembre 2020.
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PADI-web: An event-based surveillance system for detecting, classifying and processing online news. Valentin Sarah, Arsevska Elena, Mercier Alize, Falala Sylvain, Rabatel Julien, Lancelot Renaud, Roche Mathieu. 2020. In : Human language technology. Challenges for computer science and linguistics. Vetulani Zygmunt (ed.), Paroubek Patrick (ed.), Kubis Marek (ed.). Cham : Springer, 87-101. (Lecture Notes in Computer Science, 12598) ISBN 978-3-030-66526-5 Language and Technology Conference. 8, Poznan, Pologne, 17 Novembre 2017/19 Novembre 2017.
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EpidNews : un explorateur de données épidémiologiques pour la surveillance des maladies animales. Delaforge Alexis, Goel Rohan, Fadloun Samilha, Valentin Sarah, Sallaberry Arnaud, Roche Mathieu, Poncelet Pascal. 2019. In : Journées francophones d'ingénierie des connaissances IC PFIA 2019. AFIA. Toulouse : AFIA, Résumé, 215-216. Journées francophones d'Ingénierie des Connaissances (IC 2019). 30, Toulouse, France, 2 Juillet 2019/4 Juillet 2019.
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PADI-web: un système automatique multilingue pour la veille sanitaire internationale en santé animale. Valentin Sarah, Rabatel Julien, Arsevska Elena, Falala Sylvain, De Goër Jocelyn, Mercier Alize, Lancelot Renaud, Roche Mathieu. 2019. In : Journées francophones d'ingénierie des connaissances IC PFIA 2019. AFIA. Toulouse : AFIA, 235-239. Journées francophones d'Ingénierie des Connaissances (IC 2019). 30, Toulouse, France, 2 Juillet 2019/4 Juillet 2019.
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EpidNews: An epidemiological news explorer for monitoring animal diseases. Goel Rohan, Sallaberry Arnaud, Fadloun Samilha, Roche Mathieu, Valentin Sarah, Poncelet Pascal. 2018. In : Proceedings of the 11th International Symposium on Visual Information Communication and Interaction (VINCI 2018). Klein Karsten (ed.), Li Yi-Na (ed.), Kerren Andreas (ed.). New York : ACM, 10 p. International Symposium on Visual Information Communication and Interaction (VINCI 2018). 11, Växjö, Suède, 13 Août 2018/15 Août 2018.
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How to combine spatio-temporal and thematic features in online news for enhanced animal disease surveillance? Valentin Sarah, Lancelot Renaud, Roche Mathieu. 2018. In : Knowledge-Based and Intelligent Information & Engineering Systems: Proceedings of the 22nd International Conference, KES-2018, Belgrade, Serbia. Amsterdam : Elsevier, 490-497. (Procedia Computer Science, 126) International Conference on Knowledge-Based and Intelligent Information and Engineering Systems (KES 2018). 22, Belgrade, Serbie, 3 Septembre 2018/5 Septembre 2018.
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Communication par affiche

An automatic animal diseases surveillance system based on textual media analysis. Valentin Sarah, Falala Sylvain, De Goër Jocelyn, Arsevska Elena, Rabatel Julien, Roche Mathieu, Lancelot Renaud. 2018. . Montpellier : s.n., 1 poster InnovSur 2018 : ‘INNOVATION in Health Surveillance’ International Forum, Montpellier, France, 16 Mai 2018/18 Mai 2018.
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Communication sans actes

Surveillance automatisée de sources non-officielles pour la veille sanitaire internationale : évaluation rétrospective sur la fièvre aphteuse en Afrique. Valentin Sarah, Lancelot Renaud, Roche Mathieu. 2018. . Montpellier : LIRIMA-CIRAD-ES-UMR TETIS, Résumé, 1 p. LIRIMA Workshop "Agriculture numérique en Afrique", Montpellier, France, 4 Avril 2018/4 Avril 2018.
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Towards an automatic animal diseases surveillance system based on textual media analysis. Valentin Sarah, Roche Mathieu, Lancelot Renaud. 2018. In : Actes de conférences : Le printemps de Baillarguet. CIRAD. Montpellier : CIRAD, Résumé, 16. Le printemps de Baillarguet 2018. 10, Montpellier, 28 Mai 2018/29 Mai 2018.
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Towards an emerging animal disease surveillance system based on textual media analysis. Valentin Sarah, Lancelot Renaud, Roche Mathieu. 2018. . Montpellier : CIRAD, Résumé, 1 p. Living territories 2018 "Information and territory: from data to action", Montpellier, France, 22 Janvier 2018/24 Janvier 2018.
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Thèse

Extraction and combination of epidemiological information from informal sources for animal infectious diseases surveillance. Valentin Sarah. 2020. Montpellier : Université de Montpellier, 2017 p. Thèse de doctorat : Informatique : Université de Montpellier
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Document technique et de recherche

Annotation of epidemiological information in animal disease-related news articles: guidelines. Valentin Sarah, Arsevska Elena, Vilain Aline, De Waele Valérie, Lancelot Renaud, Roche Mathieu. 2021. Montpellier : CIRAD, 8 p.
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