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Association mapping for Phytophthora pod rot resistance in a cacao (Theobroma cacao L.) population grown in farmers' field. Efombagn Mousseni Ives Bruno, Sounigo Olivier, Courtois Brigitte, Fouet Olivier, Jeanneau Mélanie, Lemainque Arnaud, Pavek Sylvana, Lanaud Claire. 2016. International Journal of Agriculture and Biosciences, 5 (6) : 329-336.

Discovery and mapping of a new expressed sequence tag-single nucleotide polymorphism and simple sequence repeat panel for large-scale genetic studies and breeding of Theobroma cacao L. Allègre Mathilde, Argout Xavier, Boccara Michel, Fouet Olivier, Roguet Yolande, Bérard Aurélie, Thévenin Jean-Marc, Chauveau Aurélie, Rivallan Ronan, Clément Didier, Courtois Brigitte, Gramacho Karina Peres, Boland-Auge Anne, Tahi Mathias Gnion, Umaharan Pathmanathan, Brunel Dominique, Lanaud Claire. 2012. DNA Research, 19 (1) : 23-35.

Insight into the wild origin, migration and domestication history of the fine flavour nacional Theobroma cacao L. variety from Ecuador. Loor Solorzano Rey Gaston, Fouet Olivier, Lemainque Arnaud, Pavek Sylvana, Boccara Michel, Argout Xavier, Amores Fredy, Courtois Brigitte, Risterucci Ange-Marie, Lanaud Claire. 2012. PloS One, 7 (11):e48438, 11 p.

A reference genetic map of C. clementina hort. ex Tan.; citrus evolution inferences from comparative mapping. Ollitrault Patrick, Terol Javier F., Chen Chunxian, Federici Claire T., Lotfy Samia, Hippolyte Isabelle, Ollitrault Frédérique, Bérard Aurélie, Chauveau Aurélie, Cuenca José, Costantino Gilles, Kacar A.Yildiz, Mu Lisa, Garcia-Lor Andrés, Froelicher Yann, Aleza Pablo, Boland Anne, Billot Claire, Navarro Luis, Luro François, Roose Mikeal L., Gmitter Frederick G. Jr., Talon Manuel, Brunel Dominique. 2012. BMC Genomics, 13 (593), 20 p.

Structural characterization and mapping of functional EST-SSR markers in Theobroma cacao. Fouet Olivier, Allègre Mathilde, Argout Xavier, Jeanneau Mélanie, Lemainque Arnaud, Pavek Sylvana, Boland Anne, Risterucci Ange-Marie, Loor Rey Gaston, Tahi G.Mathias, Sabau Xavier, Courtois Brigitte, Lanaud Claire. 2011. Tree Genetics and Genomes, 7 (4) : 799-817.

Invasions toolkit: Current methods for tracking the spread and impact of invasive species. Kamenova Stefanyia, Bartley T.J., Bohan David A., Boutain J.R., Colautti R.I., Domaizon Isabelle, Fontaine Colin, Lemainque Arnaud, Le Viol I., Mollot Grégory, Perga M.E., Ravigné Virginie, Massol François. 2017. In : Networks of Invasion: A Synthesis of Concepts. Bohan David A. (ed.), Dumbrell Alex J. (ed.), Massol François (ed.). Londres : Academic Press, 85-182. (Advances in Ecological Research, 56) ISBN 978-0-12-804338-7

Mosaic genome structures of interspecific banana cultivars shed a new light on banana domestication. Baurens Franc-Christophe, Martin Guillaume, Salmon Frédéric, Lemainque Arnaud, Yahiaoui Nabila, D'Hont Angélique. 2018. In : Abstract Book Dynagev 2018. Réseau scientifique DYNAGEV. Rennes : INRA, Résumé, 1 p. Colloque annuel DynaGeV : Dynamique des génomes végétaux. 4, Rennes, France, 21 Juin 2018/22 Juin 2018.

Comparative genetic mapping between clementine, pummelo and sweet orange and the interspecicic structure of the clementine genome. Ollitrault Patrick, Terol Javier F., Chen Chunxian, Federici Claire T., Lotfy Samia, Hippolyte Isabelle, Ollitrault Frédérique, Bérard Aurélie, Chauveau Aurélie, Cuenca José, Costantino Gilles, Kacar A.Yildiz, Mu Lisa, Garcia-Lor Andrés, Curk Franck, Froelicher Yann, Aleza Pablo, Boland Anne, Billot Claire, Navarro Luis, Luro François, Roose Mikeal L., Gmitter Frederick G., Talon Manuel, Brunel Dominique. 2015. In : Proceedings of the XIIth International Citrus Congress: International Society of Citriculture. Navarro Luis (ed.), Sabater-Muñoz Beatriz (ed.), Moreno Pedro (ed.), Peña Leandro (ed.). ISHS. Leuven : ISHS, 561-573. (Acta Horticulturae, 1065) ISBN 978-94-62610-53-8 International Citrus Congress: Citrus and Health. 12, Valence, Espagne, 18 Novembre 2012/23 Novembre 2012.

Association mapping on cocoa: A way to identify functional SSR markers linked to yield, tolerance to black pod and mirids assessed in Cameroon and develop a marker assisted breeding program. Sounigo Olivier, Efombagn Bruno, Lemainque Arnaud, Pavek Sylvana, Fouet Olivier, Nsouga Amougou F., Yédé, Babin Régis, Ten Hoopen Gerben Martijn, Courtois Brigitte, Lanaud Claire. 2010. In : 16th International Cocoa Research Conference. Proceedings : towards rational cocoa production and efficient use ofr a sustainable world cocoa economy = 16e Conférence internationale sur la recherche cacaoyère.Actes ; 16 Conferencia Internacional de Pesquisas em Cacau. Actas ; 16 Conferencia Internacional de investigacion en cacao. Actas : vers une économie cacaoyère durable : quelles stratégies d'approche ? ; para uma produção racional de cacau e o seu uso eficiente para uma economia mundial sustentada do cacau ; hacia una produccion racional y un uso eficiente del cacao para la sustentabilitd. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, 153-158. ISBN 978-065-959-5 Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 16, Bali, Indonésie, 16 Novembre 2009/21 Novembre 2009.

Genetic identification and characterisation of new microsatellite markers derived from expressed tag sequences (est) in Theobroma cacao L. Lanaud Claire, Argout Xavier, Fouet Olivier, Jeanneau Mélanie, Loor Rey Gaston, N'Goran Jeanne A.K., Lemainque Arnaud, Legavre Thierry, Sabau Xavier, Wincker Patrick, Da Silva Corinne, Gramacho Karina Peres, Risterucci Ange-Marie. 2010. In : 15th International Cocoa Research Conference : cocoa productivity, quality, profitability, human health and the environment = 15e Conférence internationale sur la recherche cacaoyère : Productivité, qualité, rentabilité du cacao, santé humaine et environnement ; 15 Conferencia Internacional de Pesquisas em Cacau. Cacau : produtividade, qualidade, rentabilidade, saude humanna e amb. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, 519-523. Conférence internationale sur la recherche cacaoyère. 15, San José, Costa Rica, 9 Octobre 2006/14 Octobre 2006.

Mapping a new set of gene-based markers to identify candidate genes controlling useful traits in T. cacao. Fouet Olivier, Argout Xavier, Allègre Mathilde, Risterucci Ange-Marie, Courtois Brigitte, Sabau Xavier, Tahi G.Mathias, Pavek Sylvana, Lemainque Arnaud, Boland-Auge Anne, Lanaud Claire. 2010. In : 16th International Cocoa Research Conference. Proceedings : towards rational cocoa production and efficient use ofr a sustainable world cocoa economy = 16e Conférence internationale sur la recherche cacaoyère.Actes ; 16 Conferencia Internacional de Pesquisas em Cacau. Actas ; 16 Conferencia Internacional de investigacion en cacao. Actas : vers une économie cacaoyère durable : quelles stratégies d'approche ? ; para uma produção racional de cacau e o seu uso eficiente para uma economia mundial sustentada do cacau ; hacia una produccion racional y un uso eficiente del cacao para la sustentabilitd. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, 173-178. ISBN 978-065-959-5 Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 16, Bali, Indonésie, 16 Novembre 2009/21 Novembre 2009.

Adding value to T. cacao germplasm collections combining GWAS and genome sequence analysis. W118. Lanaud Claire, Santos Alejandra, Jimenez Juan Carlos, Lemainque Arnaud, Pavek Sylvana, Argout Xavier, Fouet Olivier, Seguine Edward, Assemat Sophie, Davrieux Fabrice, Boulanger Renaud, Cros Emile, Loor Rey Gaston. 2012. In : Plant and Animal Genome XX conference, San diego, USA, January 14-18 2012,. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. Plant and Animal Genome conference. 20, San Diego, États-Unis, 14 Janvier 2012/18 Janvier 2012.

Nouveaux éclairages sur l'origine sauvage et les évènements de domestication de la variété du cacao fin nacional Theobroma Cacao L. d'équateur et l'expédition de collecte de nouvelles ressources génétiques. Loor Rey Gaston, Fouet Olivier, Lemainque Arnaud, Pavek Sylvana, Jeanneau Mélanie, Argout Xavier, Risterucci Ange-Marie, Boccara Michel, Lachenaud Philippe, Alter Pascaline, Rosenquist Eric, Courtois Brigitte, Cros Emile, Boulanger Renaud, Amores Fredy, Vasco Alfonso, Medina M., Lanaud Claire. 2012. In : 17th Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère : Résumés = 17th International Cocoa Research Conference ; 17th Conferencia Internacional De Investigaçao Sobre 0 Cacau ; 17th Conferencia International de Investigacion en Cacao. Lagos : Alliance des Pays Producteurs de Cacao, Résumé, 141. Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 17, Yaoundé, Cameroun, 15 Octobre 2012/20 Octobre 2012.

Origin and domestication of the Nacional cacao variety from Ecuador and collecting expedition of new related genetic resources. W121. Loor Rey Gaston, Fouet Olivier, Lemainque Arnaud, Pavek Sylvana, Risterucci Ange-Marie, Courtois Brigitte, Boccara Michel, Argout Xavier, Lachenaud Philippe, Rosenquist Eric, Cros Emile, Boulanger Renaud, Amores Fredy, Vasco Alfonso, Lanaud Claire. 2012. In : Plant and Animal Genome XX conference, San Diego, USA, January 14-18 2012,. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. Plant and Animal Genome conference. 20, San Diego, États-Unis, 14 Janvier 2012/18 Janvier 2012.