Use of cpSSRs for the characterisation of yam phylogeny in Benin

Chaïr Hâna, Perrier Xavier, Agbangla Clément, Marchand Jean-Leu, Dainou O., Noyer Jean-Louis. 2005. Use of cpSSRs for the characterisation of yam phylogeny in Benin. Genome (Ottawa), 48 : 674-684.

Liste HCERES des revues (en SHS) : oui

Thème(s) HCERES des revues (en SHS) : Psychologie-éthologie-ergonomie

Résumé : Le complexe d'espèces Dioscorea cayenensis - Dioscorea rotundata est l'igname la plus cultivée de l'Afrique de l'ouest. Il a été décrit comme résultant de la domestication, par les paysans africains, de formes sauvages d'ignames appartenant à la section Enanthiophyllum. Dans le but de répondre à des interrogations concernant l'évolution de l'igname et d'essayer de compléter les connaissances sur les relations phylogéniques entre les espèces cultivées et les espèces sauvages au Bénin, nous avons étudié la variation du nombre de répétitions de motifs simples de l'ADN chloroplastique (cpSSR) dans 148 accessions d'igname élaborées pour couvrir la diversité génétique présente dans le pays. Dioscorea cayenensis et D. rotundata ont montré le même haplotype. Le morphotype "abyssinica" est subdivisé en 2 haplotypes. L'un des deux partage son haplotype avec le complexe d'espèces Dioscorea cayenensis - Dioscorea rotundata et les morphotypes praehensilis, suggérant qu'ils pourraient appartenir à la même espèce. Les relations entre les sections Lasiophyton, Macrocapaea, Opsophyton et Enanthiophyllum sont plus clarifiées et au sein de la section Enanthiophyllum des modifications taxonomiques sont proposées. Dioscorea minutiflora, D. smilacifolia et D. burkilliana pourraient être considérées comme appartenant au même groupe génétique et probablement à la même espèce.

Mots-clés Agrovoc : Dioscorea, génome, chloroplaste, taxonomie, microsatellite, Dioscorea cayenensis, Dioscorea rotundata, igname, phylogénie, espèce, adn, ressource génétique

Mots-clés géographiques Agrovoc : Bénin

Mots-clés complémentaires : Enanthiophyllum

Classification Agris : F30 - Génétique et amélioration des plantes
F70 - Taxonomie végétale et phytogéographie

Champ stratégique Cirad : Axe 1 (2005-2013) - Intensification écologique

Auteurs et affiliations

• Chaïr Hâna, CIRAD-FLHOR-UPR Multiplication végétative (BEN)
• Perrier Xavier, CIRAD-FLHOR-UPR Multiplication végétative (FRA) ORCID: 0000-0002-0092-003X
• Agbangla Clément, UAC (BEN)
• Marchand Jean-Leu, CIRAD-FLHOR-UPR Multiplication végétative (FRA)
• Dainou O., UAC (BEN)
• Noyer Jean-Louis, CIRAD-AMIS-UMR PIA (FRA) ORCID: 0000-0002-7389-5621

Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/528465/)

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