Tomato chlorotic mottle Guyane virus: A novel tomato-infecting bipartite begomovirus from French Guiana

Lett Jean-Michel, De Bruyn Alexandre, Hoareau Murielle, Ouattara Alassane, Claverie Sohini, Dalmon Anne, Laplace Damien, Lefeuvre Pierre, Hostachy Bruno. 2015. Tomato chlorotic mottle Guyane virus: A novel tomato-infecting bipartite begomovirus from French Guiana. Archives of Virology, 160 (11) : 2887-2890.

https://doi.org/10.1007/s00705-015-2558-0

Article de revue ; Article de revue à facteur d'impact

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Quartile : Q3, Sujet : VIROLOGY

Résumé : This is the first description of the complete genome sequence of a new bipartite begomovirus isolated from tomato (Solanum lycopersicum) in French Guiana, for which we propose the tentative name “tomato chlorotic mottle Guyane virus” (ToCMoGFV). DNA-A and -B nucleotide sequences of ToCMoGFV are only distantly related to known New World begomoviruses. They share the highest nucleotide sequence identity of 80 % with the Brazilian isolates of macroptilium yellow spot virus (MacYSV) and 73 % with soybean chlorotic spot virus (SBCSV). Phylogenetic analysis demonstrated that this novel virus belongs to a new lineage of New World bipartite begomoviruses. The discovery of this new virus confirms the high genetic diversity of begomoviruses in Latin America.

Mots-clés Agrovoc : virus des végétaux, espèce nouvelle, phylogénie, génome, adn, séquence nucléotidique, génie génétique, Solanum lycopersicum, taxonomie, identification, begomovirus