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Draft genome sequence of an alphaproteobacterium associated with the Mediterranean sponge Oscarella lobularis

Jourda Cyril, Santini Sébastien, Rocher Caroline, Le Bivic André, Claverie Jean-Michel. 2015. Draft genome sequence of an alphaproteobacterium associated with the Mediterranean sponge Oscarella lobularis. Genome Announcements, 3 (5):e00977-15, 2 p.

Article de revue ; Article de recherche ; Article de revue à comité de lecture
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2015_Jourda_bacteria_OLMN.pdf

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Url - jeu de données - Entrepôt autre : http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/LFTY00000000

Résumé : While sequencing DNA purified from the homoscleromorph sponge Oscarella lobularis, we detected a large number of reads with strong similarity to available alphaproteobacteria gene sequences of family Rhodobacteraceae. Here, we present the genome sequence of this putative sponge symbiont that we propose to designate as “Candidatus Rhodobacter lobularis.”

Mots-clés Agrovoc : séquence nucléotidique, génome, phylogénie, Rhodobacter, séquence d'adn, génomique, adn, symbiote

Mots-clés géographiques Agrovoc : mer Méditerranée

Mots-clés libres : Bacteria, Genome, Symbiont, Sponge, Marine

Classification Agris : L10 - Génétique et amélioration des animaux
M40 - Écologie aquatique

Champ stratégique Cirad : Hors axes (2014-2018)

Auteurs et affiliations

  • Jourda Cyril, CIRAD-BIOS-UMR PVBMT (REU) ORCID: 0000-0002-7799-3501
  • Santini Sébastien, CNRS (FRA)
  • Rocher Caroline, CNRS (FRA)
  • Le Bivic André, CNRS (FRA)
  • Claverie Jean-Michel, CNRS (FRA)

Source : Cirad-Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/578050/)

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