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First report of black leaf streak disease in banana caused by Pseudocercospora fijiensis on Mauritius island. Vally V., Jouen Emmanuel, Pécheur Max Jean Bernard, Carval Dominique, De Lapeyre de Bellaire Luc, Teycheney Pierre-Yves, Roussel Véronique, Fabre Sandrine, Pages Christine, Adreit Henri, Carlier Jean, Rieux Adrien. 2024. Plant Disease, 108 (3), p. 802

Comportements et attentes des consommateurs vis-à-vis des variétés de haricots à Maurice. Aujayeb Vashist, Bélières Jean-François, Jouen Emmanuel, Lutchoomun Satyabhama, Sunassee Sandeeren. 2023. Réduit : CIRAD-FAREI, 22 p.

Comportements et attentes des consommateurs vis-à-vis des variétés de pomme de terre à Maurice. Aujayeb Vashist, Bélières Jean-François, Jouen Emmanuel, Lutchoomun Satyabhama, Sunassee Sandeeren. 2023. Réduit : FAREI-CIRAD, 21 p.

Les semences dans la filière haricots à Maurice. Bélières Jean-François, Sunassee Sandeeren, Jouen Emmanuel, Aujayeb Vashist, Lutchoomun Satyabhama. 2023. Réduit : CIRAD-FAREI, 62 p.

Les semences dans la filière pomme de terre à Maurice. Bélières Jean-François, Sunassee Sandeeren, Jouen Emmanuel, Aujayeb Vashist, Lutchoomun Satyabhama. 2023. Réduit : FAREI-CIRAD, 70 p.

Loop-mediated isothermal amplification assays for rapid detection of Ralstonia solanacearum species complex and phylotype I in solanaceous crops. Robène Isabelle, Maillot-Lebon Véronique, Pecrix Yann, Ravelomanantsoa Santatra, Massé Delphine, Jouen Emmanuel, Rasoamanana Hasina, Fenelon Babbitha, Javegny Stéphanie, Seguin Marc, Lebon Sylvain, Poussier Stéphane, Pruvost Olivier. 2023. PhytoFrontiers, 3 (3) : 582-593.

Method and kits for detecting SARS viral infection in a biological sample. Robene Isabelle, Jouen Emmanuel, Hascoat Jérémy, Cetre-Sossah Catherine, Reynaud Bernard, Lebon Marie-Véronique, Fenelon Babbitha. 2022. Genève : OMPI, 40 p. N° de dépôt européen : 21305779. 7, N° de brevet européen : EP4101934 A1, N° de dépôt international : PCT/EP2022/065485, N° de brevet international : WO2022/258658 A1

A duplex quantitative real-time PCR assay for the detection and quantification of Xanthomonas phaseoli pv. dieffenbachiae from diseased and latently infected anthurium tissue. Jouen Emmanuel, Chiroleu Frédéric, Maillot-Lebon Véronique, Chabirand Aude, Mérion Sabine, Boyer Claudine, Pruvost Olivier, Robène Isabelle. 2019. Journal of Microbiological Methods, 161 : 74-83.

Surveillance and control of cassava diseases in Africa - International meeting results in Pan-African cassava disease network. [SP5-01]. Lett Jean-Michel, Roux Cuvelier Michel, Hamza Abdou Azali, Atta Diallo H., Beach Larry, Brouchoud Henri, Brugidou Christophe, Cuellar W., Delatte Hélène, Dintinger Jacques, Djikeng Apollinaire, Duval Marie-France, Ethel Malika, Gowda Maruthi, Jouen Emmanuel, Koebnik Ralf, Koita Ousmane, Koné Daouda, Kouassi K. Nazaire, Kpemoua Kossi, Kulakow Peter, Lava Kumar P., Legg James, Offei Kouame, Okogbenin Emmanuel, Onyeka Joseph, Poussier Stéphane, Quain D. Marian, Rakotoarisoa Jacqueline, Robène Isabelle, Rwomushanalvan, Sagnia B. Sankung, Sangare Abdourahamane, Sseruwagi Peter, Tiendrebeogo Fidèle, Vernier Philippe, Vernière Christian, Winter Stephan, Zacarias Anabela, Zinga Innocent, Verdier Valérie, Reynaud Bernard, Fauquet Claude. 2016. In : Electronic Proceedings of World Congress on Root and Tuber Crops. Nanning : WCRTC, Résumé, 1 p. World Congress on Root and Tuber Crops. 1, Nanning, Chine, 18 Janvier 2016/22 Janvier 2016.

Description and phylogenetic placement of Beauveria hoplocheli sp. nov. used in the biological control of the sugarcane white grub, Hoplochelus marginalis, on Reunion Island. Robène-Soustrade Isabelle, Jouen Emmanuel, Pastou Didier, Payet-Hoarau Magali, Goble Tarryn, Linderme Daphné, Lefeuvre Pierre, Calmes Cédric, Reynaud Bernard, Nibouche Samuel, Costet Laurent. 2015. Mycologia, 107 (6) : 1221-1232.

Development and validation of a real-time quantitative PCR assay to detect Xanthomonas axonopodis pv. allii from onion seed. Robène Isabelle, Perret Marion, Jouen Emmanuel, Escalon Aline, Maillot Marie-Véronique, Chabirand Aude, Moreau Aurélie, Laurent Annie, Chiroleu Frédéric, Pruvost Olivier. 2015. Journal of Microbiological Methods, 114 : 78-86.

Comparative and collaborative studies for the validation of a nested PCR for the detection of Xanthomonas axonopodis pv. dieffenbachiae from Anthurium samples. Chabirand Aude, Jouen Emmanuel, Pruvost Olivier, Chiroleu Frédéric, Hostachy Bruno, Bergsma-Vlami Maria, Bianchi G., Cozzolino L., Elphinstone J., Holeva Maria C., Manole F., Martini P., Matouskova H., Minatchy Janice, Op de Beeck G., Poliakoff Françoise, Sigillo L., Siverio de la Rosa F., Van Vaerenbergh J., Laurentie M., Robène-Soustrade Isabelle. 2014. Plant Pathology, 63 (1) : 20-30.

Surveillance and control of cassava diseases in Africa. Lett Jean-Michel, Roux Cuvelier Michel, Hamza Abdou Azali, Atta Diallo H., Beach Larry, Brouchoud Henri, Brugidou Christophe, Cuellar W., Delatte Hélène, Dintinger Jacques, Djikeng Apollinaire, Duval Marie-France, Ethel Malika, Gowda Maruthi, Jouen Emmanuel, Koebnik Ralf, Koita Ousmane, Koné Daouda, Kouassi K. Nazaire, Kpemoua Kossi, Kulakow Peter, Lava Kumar P., Legg James, Offei Kouame, Okogbenin Emmanuel, Onyeka Joseph, Poussier Stéphane, Quain D. Marian, Rakotoarisoa Jacqueline, Robène Isabelle, Rwomushanalvan, Sagnia B. Sankung, Sangare Abdourahamane, Sseruwagi Peter, Tiendrebeogo Fidèle, Vernier Philippe, Vernière Christian, Winter Stephan, Zacarias Anabela, Zinga Innocent, Verdier Valérie, Reynaud Bernard, Fauquet Claude. 2014. In : International workshop : Surveillance and control of cassava diseases in Africa, Saint Pierre, Réunion, 10-13 June 2014. CIRAD, IRD, GCP21. Saint Pierre : CIRAD-IRD, 1 poster International Workshop "Surveillance and control of cassava diseases in Africa", Saint Pierre, Réunion, 10 Juin 2014/13 Juin 2014.

MultiLocus Sequence Analysis- and Amplified Fragment Length Polymorphism-based characterization of xanthomonads associated with bacterial spot of tomato and pepper and their relatedness to Xanthomonas species. Hamza Abdou Azali, Robène-Soustrade Isabelle, Jouen Emmanuel, Lefeuvre Pierre, Chiroleu Frédéric, Fisher-Le Saux Marion, Gagnevin Lionel, Pruvost Olivier. 2012. Systematic and Applied Microbiology, 35 (3) : 183-190.

PCR-based assays for detecting Xanthomonas axonopodis pv. allii in onion seed. Robène-Soustrade Isabelle, Perret Marion, Jouen Emmanuel, Chabirand Aude, Pruvost Olivier. 2012. In : QBOL-EPPO Conference on DNA Barcoding and diagnostic methods for plant pests, Haarlem, Netherlands, May 21-25, 2012. s.l. : s.n., Résumé, 36. QBOL-EPPO Conference on DNA Barcoding and Diagnosti Methods for Plant Pests, Haarlem, Pays-Bas, 21 Mai 2012/25 Mai 2012.

Insertion sequence-and tandem repeat-base genotyping techniques for Xanthomonas citri pv. mangiferaeindicae. Pruvost Olivier, Vernière Christian, Vital Karine, Guérin Fabien, Jouen Emmanuel, Chiroleu Frédéric, Ah-You Nathalie, Gagnevin Lionel. 2011. Phytopathology, 101 (7) : 887-893.

Amplified fragment length polymorphism and multilocus sequence analysis-based genotypic relatedness among pathogenic variants of Xanthomonas citri pv. citri and Xanthomonas campestris pv. bilvae. Bui Thi Ngoc Lan, Vernière Christian, Jouen Emmanuel, Ah-You Nathalie, Lefeuvre Pierre, Chiroleu Frédéric, Gagnevin Lionel, Pruvost Olivier. 2010. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 60 (3) : 515-525.

First report of Xanthomonas hortorum pv.carotae causing bacterial leaf blight of carrot in Mauritius. Pruvost Olivier, Boyer Claudine, Robène-Soustrade Isabelle, Jouen Emmanuel, Saison Anne, Hostachy Bruno, Benimadhu S.. 2010. Plant Disease, 94 (8) : 1069.

Genetic and pathological diversity among Xanthomonas strains responsible for bacterial spot on tomato and pepper in the South West Indian Ocean region : [P4-94]. Hamza Abdou Azali, Robène-Soustrade Isabelle, Jouen Emmanuel, Gagnevin Lionel, Lefeuvre Pierre, Chiroleu Frédéric, Boyer Claudine, Pruvost Olivier. 2010. In : Proceedings of the 12th International Conference on Plant Pathogenic Bacteria : programme, abstracts, list of participants. INRA, Université de la Réunion, IRD. s.l. : s.n., Résumé, 160. International Conference on Plant Pathogenic Bacteria. 12, Saint-Denis, Réunion, 7 Juin 2010/11 Juin 2010.

Genetic and pathological diversity among Xanthomonas strains responsible for bacterial spot on tomato and pepper in the Southwest Indian Ocean Region. Hamza Abdou Azali, Robène-Soustrade Isabelle, Jouen Emmanuel, Gagnevin Lionel, Lefeuvre Pierre, Chiroleu Frédéric, Pruvost Olivier. 2010. Plant Disease, 94 (8) : 993-999.

Les Xanthomonas responsable de la gale bactérienne de la tomate et du piment : la classification revisitée. Hamza Abdou Azali, Robène-Soustrade Isabelle, Jouen Emmanuel, Boyer Claudine, Laurent Annie, Vital Karine, Pruvost Olivier. 2010. In : Neuvièmes Rencontres plantes-bactéries, 18-22 janvier 2010, Aussois (France) : résumés. SFP, IRD. Paris : SFP, Résumé, 37. Rencontres plantes-bactéries. 9, Aussois, France, 18 Janvier 2010/22 Janvier 2010.

Pseudomonas aeruginosa outbreak linked to mineral water bottles in a neonatal intensive unit: Fast typing by use of high-resolution melting analysis of a variable-number tandem-repeat locus. Naze Florence, Jouen Emmanuel, Randriamahazo R.T., Simac Catherine, Laurent Philippe, Blériot Audrey, Chiroleu Frédéric, Gagnevin Lionel, Pruvost Olivier, Michault Alain. 2010. Journal of Clinical Microbiology, 48 (9) : 3146-3152.

Validation of a nested PCR assay for detection of Xanthomonas axonopodis pv. dieffenbachiae in anthurium tissue in a European multicenter collaborative trial : [P2-11]. Jouen Emmanuel, Chabirand Aude, Robène-Soustrade Isabelle, Gagnevin Lionel, Chiroleu Frédéric, Saison Anne, Boyer Claudine, Cassam Nathalie, Laurent Annie, Hostachy Bruno, Bergsma-Vlami Maria, Bianchi G., Cozzoli L., Cudejkova M., Elphinstone J., Holeva Maria C., Manole F., Martini P., Minatchy Janice, Op de Beeck G., Sigillo L., Siverio de la Rosa F., Soubelet Hélène, Van Vaerenbergh J., Pruvost Olivier. 2010. In : Proceedings of the 12th International Conference on Plant Pathogenic Bacteria : programme, abstracts, list of participants. INRA, Université de la Réunion, IRD. s.l. : s.n., Résumé, 50. International Conference on Plant Pathogenic Bacteria. 12, Saint-Denis, Réunion, 7 Juin 2010/11 Juin 2010.

A multiplex quantitative real time PCR to detect Xanthomonas axonopodis pv.allii from onion seeds : [P2-26]. Escalon Aline, Robène-Soustrade Isabelle, Jouen Emmanuel, Pruvost Olivier. 2010. In : Proceedings of the 12th International Conference on Plant Pathogenic Bacteria : programme, abstracts, list of participants. INRA, Université de la Réunion, IRD. s.l. : s.n., Résumé, 65. International Conference on Plant Pathogenic Bacteria. 12, Saint-Denis, Réunion, 7 Juin 2010/11 Juin 2010.

A new type of strain of Xanthomonas euvesicatoria causing bacterial spot of tomato and pepper in Grenada. Hamza Abdou Azali, Robène-Soustrade Isabelle, Boyer Claudine, Laurent Annie, Jouen Emmanuel, Wicker Emmanuel, Prior Philippe, Pruvost Olivier. 2010. Plant Disease, 94 (10) : 1264.

First report in the Seychelles of Xanthomonas axonopodis genetic cluster 9.2 causing bacterial leaf spot of avocado. Pruvost Olivier, Robène-Soustrade Isabelle, Ah-You Nathalie, Jouen Emmanuel, Boyer Claudine, Wuster Gilles, Hostachy Bruno, Napoles César, Dogley William. 2009. Plant Disease, 93 (6), Résumé : 672.

First report of Xanthomonas cucurbitae causing bacterial leaf spot of watermelon in the Seychelles. Pruvost Olivier, Robène-Soustrade Isabelle, Ah-You Nathalie, Jouen Emmanuel, Boyer Claudine, Wuster Gilles, Hostachy Bruno, Napoles César, Dogley William. 2009. Plant Disease, 93 (6), Résumé : 671.

Polyphasic characterization of xanthomonads pathogenic to members of the Anacardiaceae and their relatedness to species of Xanthomonas. Ah-You Nathalie, Gagnevin Lionel, Grimont Patrick A. D., Brisse Sylvain, Nesme Xavier, Chiroleu Frédéric, Bui Thi Ngoc Lan, Jouen Emmanuel, Lefeuvre Pierre, Vernière Christian, Pruvost Olivier. 2009. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 59 (2) : 306-318.

A new semi-selective medium for isolation of Xanthomonas axonopodis pv. dieffenbachiae, the etiological agent of anthurium bacterial blight. Laurent Philippe, Chabirand Aude, Jouen Emmanuel, Robène-Soustrade Isabelle, Gagnevin Lionel, Hostachy Bruno, Pruvost Olivier. 2009. Letters in Applied Microbiology, 49 (2) : 210-216.

First report in Mauritius of bacterial leaf blight of Syngonium caused by Xanthomonas campestris pv. syngonii. Jouen Emmanuel, Robène-Soustrade Isabelle, Gagnevin Lionel, Pruvost Olivier, Benimadhu S.. 2008. Plant Disease, 92 (6), Résumé : 980.

First report of Xanthomonas cucurbitae causing bacterial leaf spot of Pumpkin on Réunion Island. Pruvost Olivier, Robène-Soustrade Isabelle, Ah-You Nathalie, Jouen Emmanuel, Boyer Claudine, Waller F., Hostachy Bruno. 2008. Plant Disease, 92 (11), Résumé : 1591.

First report of bacterial blight of Anthurium andreanum in Poland. Pulawska J., Kordyla-Bronka M., Jouen Emmanuel, Robène-Soustrade Isabelle, Gagnevin Lionel, Pruvost Olivier, Sobiczewski P., Orlikowski L.. 2008. Plant Pathology, 57 (4), Résumé : 775.

Grand rangement chez Xanthomonas campestris pv. mangiferaeindicae : trois pathovars, deux espèces. Ah-You Nathalie, Gagnevin Lionel, Grimont Patrick A. D., Brisse Sylvain, Nesme Xavier, Chiroleu Frédéric, Bui Thi Ngoc Lan, Jouen Emmanuel, Lefeuvre Pierre, Vernière Christian, Pruvost Olivier. 2008. In : 8èmes Rencontres plantes-bactéries,14-18 janvier 2008, Aussois, France. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. Rencontres plantes-bactéries. 8, Aussois, France, 14 Janvier 2008/18 Janvier 2008.

Real-time PCR for detection and quantification of Xanthomonas axonopodis pv. dieffenbachiae on Anthurium. Péréfarres Frédéric, Jouen Emmanuel, Soustrade Isabelle, Gagnevin Lionel, Laurent Annie, Pruvost Olivier. 2008. Journal of Plant Pathology, 90 (2), suppl., Résumé, S2.306 International Congress of Plant Pathology. 9, Turin, Italie, 24 Août 2008/29 Août 2008.

Reclassification of Xanthomonads associated with anacardiaceae into two species and three pathovars. Ah-You Nathalie, Gagnevin Lionel, Grimont Patrick A. D., Brisse Sylvain, Nesme Xavier, Chiroleu Frédéric, Bui Thi Ngoc Lan, Jouen Emmanuel, Lefeuvre Pierre, Vernière Christian, Pruvost Olivier. 2008. Journal of Plant Pathology, 90 (2), suppl., Résumé, S2.352 International Congress of Plant Pathology. 9, Turin, Italie, 24 Août 2008/29 Août 2008.

First report in New Caledonia of bacterial blight of anthurium caused by Xanthomonas axonopodis pv. diffenbachiae. Jouen Emmanuel, Laurent Philippe, Robène-Soustrade Isabelle, Gagnevin Lionel, Pruvost Olivier, Hostachy Bruno, Gâteblé Gildas, Amice Rémy, Imbert Frédéric. 2007. Plant Disease, 91 (4), Résumé : 462.

Pathological variations within Xanthomonas campestris pv. mangiferaeindicae support its separation into three distinct pathovars that can be distinguished by amplified fragment length polymorphism. Ah-You Nathalie, Gagnevin Lionel, Chiroleu Frédéric, Jouen Emmanuel, Rodrigues Neto J., Pruvost Olivier. 2007. Phytopathology, 97 (12) : 1568-1577.

Le dépérissement bactérien de l'anthurium (Anthurium andreanum) provoqué par Xanthomonas axonopodis pv. dieffenbachiae : mise au point d'une BIO-nested PCR pour la certification. Laurent Philippe, Robène-Soustrade Isabelle, Legrand Delphine, Gagnevin Lionel, Jouen Emmanuel, Pruvost Olivier. 2006. In : 7èmes Rencontres plantes-bactéries, 20-23 mars 2006, Aussois, France. Résumés. SFP. Angers : INRA, Résumé, 94. Rencontres plantes-bactéries. 7, Aussois, France, 20 Mars 2006/24 Mars 2006.

Specific detection of Xanthomonas axonopodis pv. dieffenbachiae in anthurium (Anthurium andreanum) tissues by nested PCR. Robène-Soustrade Isabelle, Laurent Philippe, Gagnevin Lionel, Jouen Emmanuel, Pruvost Olivier. 2006. Applied and Environmental Microbiology, 72 (2) : 1072-1078.

Protection des plantes - Epidémiologie des maladies bactériennes et virales. Costet Laurent, Pruvost Olivier, Gagnevin Lionel, Laurent Philippe, Jouen Emmanuel, Humeau Laurence, Roumagnac Philippe, Soustrade Isabelle, Elbaz Mounira, Luisetti Jacques, Delatte Hélène, Lett Jean-Michel, Laurent Philippe. 2004. In : Rapport annuel 2003 CIRAD Réunion. De Taffin Gabriel (ed.). CIRAD-Délégation de la Réunion. Saint-Denis : CIRAD, 52-58.

Mise au point et évaluation de deux techniques de typage moléculaire de Xanthomonas pv mangiferaindicae agent pathogène de la maladie des taches noires du manguier (Mangifera indica L.). Jouen Emmanuel. 2003. Paris : Université Pierre et Marie Curie, 52 p. Mémoire DESS : Gestion de la biodiversité . Méthodologie d'étude et de valorisation des ressources génétiques : Université Pierre et Marie Curie