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Journal article

Next generation sequencing elucidates cacao badnavirus diversity and reveals the existence of more than ten viral species. Muller Emmanuelle, Ravel Sébastien, Agret Clément, Abrokwah Francis, Dzahini-Obiatey Henry, Galyuon I., Kouakou K., Jeyaseelan E.C., Allainguillaume Joel, Wetten Andrew. 2018. Virus Research, 244 : pp. 235-251.
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Ortervirales: New virus order unifying five families of reverse-transcribing viruses. Krupovic Mart, Blomberg Jonas, Coffin John M., Dasgupta Indranil, Fan Hung, Geering Andrew D., Gifford Robert, Harrach Balázs, Hull Roger, Johnson Welkin, Kreuze Jan, Lindemann Dirk, Llorens Carlos, Lockhart Benham E.L., Mayer Jens, Muller Emmanuelle, Olszewski Neil E., Pappu Hanu R., Pooggin Mikhail, Richert-Pöggeler Katja R., Sabanadzovic Sead, Sanfaçon Hélène, Schoelz James E., Seal Susan, Stavolone Livia, Stoye Jonathan P., Teycheney Pierre-Yves, Tristem Michael, Koonin Eugene V., Kuhn Jens H.. 2018. Journal of Virology, 92 (12):e00515-18, 5 p.
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Geographical distribution of Cacao swollen shoot virus molecular variability in Ghana. Abrokwah Francis, Dzahini-Obiatey Henry, Galyuon Isaac, Osae-Awuku Francis, Muller Emmanuelle. 2016. Plant Disease, 100 (10) : pp. 2011-2017.
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Occurrence, prevalence and molecular diversity of banana streak viruses in Cuba. Javer-Higginson Elisa, Acina Manbole Isabelle Nina, González José Efrain, Font Caridad, Gonzalez Gloria, Echemendia Ana Lidia, Muller Emmanuelle, Teycheney Pierre-Yves. 2014. European Journal of Plant Pathology, 138 (1) : pp. 157-166.
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The common evolutionary history of badnaviruses and banana. Iskra Caruana Marie-Line, Duroy Pierre-Olivier, Chabannes Matthieu, Muller Emmanuelle. 2014. Infection, Genetics and Evolution, 21 : pp. 83-89.
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The genome of African yam (Dioscorea cayenensis-rotundata complex) hosts endogenous sequences from four distinct badnavirus species. Umber Marie, Filloux Denis, Muller Emmanuelle, Laboureau Nathalie, Galzi Serge, Roumagnac Philippe, Iskra Caruana Marie-Line, Pavis Claudie, Teycheney Pierre-Yves, Seal Susan. 2014. Molecular Plant Pathology, 15 (8) : pp. 790-801.
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A possible scenario for the evolution of Banana streak virus in banana. Iskra Caruana Marie-Line, Chabannes Matthieu, Duroy Pierre-Olivier, Muller Emmanuelle. 2014. Virus Research, 186 : pp. 155-162. International Plant Virus Epidemiology Symposium. 12, Arusha, Tanzanie, 28 January 2013/1 February 2013.
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The prevalence of badnaviruses in West African yams (Dioscorea cayenensis-rotundata) and evidence of endogenous pararetrovirus sequences in their genomes. Seal Susan, Turaki Aliyu, Muller Emmanuelle, Lava Kumar P., Kenyon Lawrence, Filloux Denis, Galzi Serge, Lopez-Montes Antonio, Iskra Caruana Marie-Line. 2014. Virus Research, 186 : pp. 144-145. International Plant Virus Epidemiology Symposium. 12, Arusha, Tanzanie, 28 January 2013/1 February 2013.
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Geographical differentiation of the molecular diversity of cacao swollen shoot virus in Togo. Oro Zokou Franck, Mississo Essivi, Okassa Mireille, Guilhaumon Claire, Fenouillet Catherine, Cilas Christian, Muller Emmanuelle. 2012. Archives of Virology, 157 (3) : pp. 509-514.
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Geographical distribution of Cacao swollen shoot virus Molecular Variability in Côte d'Ivoire. Kouakou Koffie, Kébé Boubacar Ismaël, Kouassi N., Ake Séverin, Cilas Christian, Muller Emmanuelle. 2012. Plant Disease, 96 (10) : pp. 1445-1450.
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Spatiotemporal pattern analysis of Cacao swollen shoot virus in experimental plots in Togo. Oro Zokou Franck, Bonnot François, Ngo Bieng Marie-Ange, Delaitre Eric, Dufour Bernard Pierre, Ametefe Komivi Exonam, Mississo Essivi, Wegbe Komlan, Muller Emmanuelle, Cilas Christian. 2012. Plant Pathology, 61 (6) : pp. 1043-1051.
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High molecular variability of sugarcane bacilliform viruses in Guadeloupe implying the existence of at least three new species. Muller Emmanuelle, Dupuy Virginie, Blondin Laurence, Bauffe Frédérique, Daugrois Jean-Heinrich, Laboureau Nathalie, Iskra Caruana Marie-Line. 2011. Virus Research, 160 (1-2) : pp. 414-419.
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Impact de la maladie virale du swollen shoot du cacaoyer sur la production de cacao en milieu paysan à Bazré (Côte d'Ivoire). Kouakou Koffie, Kébé Boubacar Ismaël, Kouassi N., Anno A.P., Aké S., Muller Emmanuelle. 2011. Journal of Applied Biosciences, 43 : pp. 2947-2957.
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Molecular evidence for the association of a strain of Uganda variant of East African cassava mosaic virus to symptom severity in cassava (Manihot esculenta Crantz) fields in Togo. Adjata K.D., Muller Emmanuelle, Peterschmitt Michel, Traoré Oumar, Gumedzoe M.Y.D.. 2009. American Journal of Biochemistry and Biotechnology, 5 (4) : pp. 196-201.
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Molecular characterization of banana streak acuminata Vietnam virus isolated from Musa acuminata siamea (banana cultivar). Lheureux Fabrice, Laboureau Nathalie, Muller Emmanuelle, Lockhart Benham E.L., Iskra Caruana Marie-Line. 2007. Archives of Virology, 152 : pp. 1409-1416.
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Molecular ecology and emergence of tropical plant viruses. Fargette Denis, Fauquet C., Muller Emmanuelle, Peterschmitt Michel, Thresh J.M.. 2006. Annual Review of Phytopathology, 44 : pp. 235-260.
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Occurrence of cacao swollen shoot virus in Litimé, the main cocoa-producing area of Togo. Cilas Christian, Muller Emmanuelle, Mississo Essivi. 2005. Plant Disease, 89 (8) : p. 913.

Early detection of cacao swollen shoot virus using the polymerase chain reaction. Muller Emmanuelle, Jacquot Emmanuel, Yot Pierre. 2001. Journal of Virological Methods, 93 : pp. 15-22.

Classification of plant trypanosomatids (Phytomonas spp.) : parity between random-primer DNA typing and multilocus enzyme electrophoresis. Muller Emmanuelle, Gargani Daniel, Banuls A.L., Tibayrenc Michel, Dollet Michel. 1997. Parasitology, 115 : pp. 403-409.

Characterization of Phytomonas isolated from fruits by electrophoretic isoenzymes and kinetoplast-DNA analysis. Fernandez Becerra C., Osuna A., Muller Emmanuelle, Dollet Michel, Sanchez Moreno Manuel. 1996. FEMS Microbiology Letters, 145 : pp. 463-468.

Variability of kinetoplast DNA from plant trypanosomatids responsible for Hartrot and Marchitez diseases. Muller Emmanuelle, Ahomadegbe J.C., Coulaud D., Gargani Daniel, Fernandez Beccera C., Dollet Michel. 1995. Phytopathology, 85 (9) : pp. 942-947.

Variability in the phloem restricted plant trypanosomes (Phytomonas spp.) associated with wilts of cultivated crops: isoenzyme comparison with the lower trypanosomatids. Muller Emmanuelle, Gargani Daniel, Schaeffer V., Stevens J., Fernandez Becerra C., Sanchez Moreno Manuel, Dollet Michel. 1994. European Journal of Plant Pathology, 100 (6) : pp. 425-434.

Book chapter

Cacao Swollen Shoot Virus (CSSV): History, Biology, and Genome. Muller Emmanuelle. 2016. In : Cacao diseases. A history of old enemies and new encounters. Bryan A. Bailey (ed.), Lyndel W. Meinhardt (ed.). Cham : Springer International Publishing, pp. 337-358. ISBN 978-3-319-24787-8
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Cacao swollen shoot virus. Muller Emmanuelle. 2008. In : Characterization, diagnosis and management of plant viruses. Industrial crops. Rao Govind P. (ed.), Paul Khurana S.M. (ed.), Lenardon Sergio L. (ed.). Houston : Studium Press LLC, pp. 423-444. (Plant pathogens series, 1) ISBN 1-933699-31-0
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Cacao swollen shoot virus. Muller Emmanuelle. 2008. In : Encyclopedia of virology. Mahy B.W.J. (ed.), Van Regenmortel M.H.V. (ed.). Londres : Academic Press, pp. 403-409. ISBN 978-0-12-373935-3

Virus of plant trypanosomes (Phytomonas spp.). Dollet Michel, Marché Sylvie, Gargani Daniel, Muller Emmanuelle, Baltz Théo. 1996. In : Histology, ultrastructure and molecular cytology of plant-microorganism interactions = [Histologie, ultrastructure et cytologie moléculaire des interactions entre plantes et microorganismes]. Nicole M. (ed.), Gianinazzi Pearson V. (ed.). Dordrecht : Kluwer Academic Publishers, pp. 227-236.

Guest paper

The possible BSV and banana evolution story. Caruana Marie-Line, Chabannes Matthieu, Duroy Pierre-Olivier, Muller Emmanuelle. 2013. In : Building bridges between disciplines for sustainable management of plant virus diseases. Lava Kumar P. (ed), Lopez Katherine (ed.), Njuguma Catherine (ed.). ICTVE, IITA. Ibadan : IITA, Résumé, p. 93. ISBN 978-978-8444-08-4 International Plant Virus Epidemiology Symposium. 12, Arusha, Tanzanie, 28 January 2013/1 February 2013.
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Paper with proceedings

A next generation sequencing approach to elucidate CSSV species profiles. Muller Emmanuelle, Wetten Andrew, Allainguillaume Joel, Abrokwah Francis, Kouakou Koffie, Dzahini-Obiatey Henry. 2017. In : Proceedings of the first International Symposium on Cocoa Research ISCR 2017. ICCO. Lima : ICCO, 14 p. International Symposium on Cocoa Research – ISCR 2017 : Promoting Advances in Research to Enhance the Profitability of Cocoa Farming. 1, Lima, Pérou, 13 November 2017/17 November 2017.
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Study on the origin of cacao swollen shoot virus and its dispersal on cacao trees in West Africa. Muller Emmanuelle, Abrokwah Francis, Kouakou Koffie, Dzahini-Obiatey Henry. 2016. In : Building bridges between disciplines for sustainable management of plant virus diseases. INRA, Université d'Avignon. Avignon : INRA, Résumé, p. 115. International Plant Virus Epidemiology Symposium. 13, Avignon, France, 6 June 2016/10 June 2016.
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Characterisation of badnaviruses and endogenous pararetroviruses in West African yam breeding lines. Turaki Aliyu, Lava Kumar P., Lopez-Montes Antonio, Seal Susan, Muller Emmanuelle, Galzi Serge, Filloux Denis, Iskra Caruana Marie-Line. 2013. In : Building bridges between disciplines for sustainable management of plant virus diseases. Lava Kumar P. (ed), Lopez Katherine (ed.), Njuguma Catherine (ed.). ICTVE, IITA. Ibadan : IITA, p. 63. ISBN 978-978-8444-08-4 International Plant Virus Epidemiology Symposium. 12, Arusha, Tanzanie, 28 January 2013/1 February 2013.
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Dynamics of cocoa swollen shoot disease in Togo from satellite images and field observations at regional and local levels. Oro Zokou Franck, Delaitre Eric, Wegbe Komlan, Mississo Essivi, Muller Emmanuelle, Dufour Bernard Pierre, Cilas Christian. 2010. In : Proceedings of Agro 2010 : the XIth ESA Congress, August 29th - September 3rd, 2010, Montpellier, France. Wery Jacques (ed.), Shili-Touzi I. (ed.), Perrin A. (ed.). Montpellier : Agropolis international, pp. 151-152. ISBN 978-2-909613-01-7 ESA Congress. 11, Montpellier, France, 29 August 2010/3 September 2010.
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Variabilité moléculaire du virus du swollen shoot du cacaoyer (CSSV) en lien avec de nouveaux foyers au Togo et en Côte d'Ivoire ; validation d'un diagnostic polyvalent du virus : validation d'un diagnostic polyvalent du virus. Muller Emmanuelle, Kouakou Koffie, Kébé Ismael S., Mississo Angèle, Oro Zokou Franck, Cilas Christian. 2010. In : 16th International Cocoa Research Conference. Proceedings : towards rational cocoa production and efficient use ofr a sustainable world cocoa economy = 16e Conférence internationale sur la recherche cacaoyère.Actes ; 16 Conferencia Internacional de Pesquisas em Cacau. Actas ; 16 Conferencia Internacional de investigacion en cacao. Actas : vers une économie cacaoyère durable : quelles stratégies d'approche ? ; para uma produção racional de cacau e o seu uso eficiente para uma economia mundial sustentada do cacau ; hacia una produccion racional y un uso eficiente del cacao para la sustentabilitd. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, Résumé, pp. 707-710. ISBN 978-065-959-5 Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 16, Bali, Indonésie, 16 November 2009/21 November 2009.
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Variabilité du virus du cacao swollen shoot (CSSV) : clonage et analyse de quatre nouvelles séquences entières. Muller Emmanuelle, Sackey Sammy, Mississo Angèle. 2005. In : 14th International Cocoa Research Conference. Proceedings : rumo a uma economia sustentavel do cacau - quais as estrategias para este fim ? = 14th International Cocoa Research Conference. Proccedings ; 14e Conférence internationale sur la recherche cacaoyère. Actes ; 14 Conferencia Internacional de Pesquisas em Cacau. Atas ; 14 Conferencia Internacional de Investigacion en Cacao. Actas : towards a sustainable cocoa economy - what strategies to this end ? ; vers une économie cacaoyère durable : quelles stratégies d'approche ? ; rumo a uma economia sustentavel do cacau - quais as estrategias para este fim ? ; hacia una economia sustentable del ca. CEPLAC, CRIG, MCB. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, pp. 653-661. ISBN 978-065-959-5 Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 14, Accra, Ghana, 13 October 2003/18 October 2003.

Mise au point d'un diagnostic précoce du cacao swollen shoot virus (CSSV). Muller Emmanuelle, Jacquot Emmanuel, Mississo Angèle, Sackey Sammy, Alemanno Laurence, Yot Pierre. 2001. In : 13th International Cocoa Research Conference. Proceedings : Towards the effective and optimum promotion of cocoa through research and development = 13e Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. Actes ; 13 Conferencia Internacional de Pesquisas em Cacau. Atas ; 13 Conferencia Internacional de Investigacion en Cacao. Actas : Vers la promotion efficace et optimum du cacao par la recherche et le développement ; Para um melhor e efetivo desenvolvimento do cacau atraves da pesquisa e do aperfeicoamento ; En pos de una promocion optima y efectiva del cacao mediante la investigacion y. MCB. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, pp. 529-535. ISBN 983-40740-0-X Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 13, Kota Kinabalu, Malaisie, 9 October 2000/14 October 2000.
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Mise au point d'une méthode d'acquisition de trypanosomes (Phytomonas spp.) cultivés in vitro" par Lincus croupius (Pentatomidae). Dollet Michel, Gargani Daniel, Muller Emmanuelle, Vezian Katia. 1997. In : Conférence internationale sur les ravageurs en agriculture = Fourth international conference on pests in agriculture. Tome 1, 2 and 3$ENG. ANPP. Paris : ANPP, pp. 887-893. (Annales) ISBN 2-905550-70-8 Conférence internationale sur les ravageurs en agriculture. 4, Montpellier, France, 6 January 1997/8 January 1997.

Virus of plant trypanosomes (Phypanosomes spp). Dollet Michel, Marché Sylvie, Gargani Daniel, Muller Emmanuelle, Baltz Théo. 1994. In : Histologie, ultrastructure et cytologie moléculaire des interactions plantes-micro-organismes, Montpellier, 30 novembre, 1 et 2 décembre 1994. Boher Bernard, Dollet Michel, Geiger Jean-Paul, Gianinazzi Pearson Vivienne, Mourichon Xavier, Nicole Michel, Nottéghem Jean-Loup, Ruel Katia. SFP, ORSTOM. s.l. : s.n., 1 p. Rencontre SFP-ORSTOM, Montpellier, France, 30 November 1994/2 December 1994.

Poster

Next Generation Sequencing elucidates cacao badnavirus diversity and reveals the existence of nine viral species associated with cacao swollen shoot disease. [P.46]. Muller Emmanuelle, Wetten Andrew, Allainguillaume Joel, Abrokwah Francis, Kouakou Koffie, Dzahini-Obiatey Henry. 2019. In : Livre des résumés des 17 ème Rencontres de virologie végétale. INRA, CIRAD, CNRS, SFP, SFV. Aussois : INRA, Résumé, p. 105. Rencontres de Virologie Végétale (RVV 2019). 17, Aussois, France, 27 January 2019/31 January 2019.
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A scenario of co-evolution between badnaviruses and Musa sp.. [P.22]. Caruana Marie-Line, Duroy Pierre-Olivier, Laboureau Nathalie, Galzi Serge, Chabannes Matthieu, Muller Emmanuelle. 2015. In : 15èmes Rencontres de Virologie Végétale, Aussois, France, 18-22 janvier 2015. CIRAD ; IRD. s.l. : s.n., Résumé, p. 80. Rencontres de virologie végétale. 15, Aussois, France, 18 January 2015/22 January 2015.
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Towards a better characterization of endogenous badnavirus sequences of yams (Dioscorea spp.). Umber Marie, Laboureau Nathalie, Muller Emmanuelle, Roumagnac Philippe, Iskra Caruana Marie-Line, Pavis Claudie, Teycheney Pierre-Yves, Filloux Denis. 2013. In : 14èmes Rencontres de virologie végétale (RVV 2013) : Aussois, France, 13-17 janvier 2013. Marais Armelle (ed.), Revers Frédéric (ed.). SFP, INRA. Paris : SFP, Résumé, p. 99. Rencontres de Virologie Végétale. 14, Aussois, France, 13 January 2013/17 January 2013.
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Origin of the emergence of badnavirusessuch as Cacao swollen shoot virus (CSSV)and Banana streak virus (BSV). Muller Emmanuelle, Kouakou Koffie, Cilas Christian, Iskra Caruana Marie-Line. 2011. In : 4th Plant Virus Ecology Network Workshop (PVEN), Montpellier, France, May 30 to June 1, 2011. s.l. : s.n., 1 p. Plant Virus Ecology Network Workshop. 4, Montpellier, France, 30 May 2011/1 June 2011.
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Importance de l'origine endogène du BSV dans l'émergence et le maintien d'épidémies. Laboureau Nathalie, Iskra Caruana Marie-Line, Blondin Laurence, Muller Emmanuelle. 2007. In : 11 èmes Rencontres de virologie végétale, Aussois, 28 janvier au 1er février 2007. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. Rencontres de virologie végétale. 11, Aussois, France, 28 January 2007/1 February 2007.
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Incidence et variabilité du Sugarcane bacilliform virus (SCBV) en Guadeloupe. Muller Emmanuelle, Laboureau Nathalie, Dupuy Virginie, Caruana Marie-Line, Daugrois Jean-Heinrich, Bauffe Frédérique. 2005. In : Résumés des 10èmes Rencontres de virologie végétale, Aussois du 6 au 10 mars 2005. Brault Véronique, Ziegler-Graff Véronique. Strasbourg : CNRS, Résumé, 1 p. Rencontres de virologie végétale. 10, Aussois, France, 6 March 2005/10 March 2005.
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Early detection of cacao swollen shoot virus (CSSV). Muller Emmanuelle, Jacquot Emmanuel, Mississo Angèle, Sackey Sammy, Alemanno Laurence, Yot Pierre. 2000. In : 13ème Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. Alliance des pays producteurs de cacao. Montpellier : CIRAD, 1 p. Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 13, Kota Kinabalu, Malaisie, 9 October 2000/14 October 2000.

Paper without proceedings

Next generation sequencing approach to elucidate CSSV species profiles. Muller Emmanuelle, Wetten Andrew, Allainguillaume Joel, Abrokwah Francis Kwame, Kouakou Koffie, Dzahini-Obiatey Henry. 2018. . COST-DIVAS. Liège : COST-DIVA, Résumé, 1 p. Final Meeting of COST-DIVAS Action: HTS Technologies for the study and diagnostic of plant viruses, Liège, Belgique, 26 November 2018/30 November 2018.
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Understanding the origin and spread of the complex of viral species responsible for cocoa swollen shoot disease. Muller Emmanuelle, Abrokwah Francis, Kouakou Koffie, Dzahini-Obiatey Henry. 2016. . State College : Penn State University, Résumé, 1 p. Symposium Frontiers in Science and Technology for Cacao Quality, Productivity and Sustainability, State College, États-Unis, 31 May 2016/2 June 2016.
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Improved diagnostic tools for the detection badnaviruses in yams unveil the existence of endogenous sequences of extant badnavirus species in yams. [O.36]. Umber Marie, Filloux Denis, Muller Emmanuelle, Laboureau Nathalie, Galzi Serge, Gomez Rose-Marie, Roumagnac Philippe, Caruana Marie-Line, Pavis Claudie, Teycheney Pierre-Yves. 2015. In : 15èmes Rencontres de Virologie Végétale, Aussois, France, 18-22 janvier 2015. CIRAD ; IRD. s.l. : s.n., Résumé, p. 51. Rencontres de virologie végétale. 15, Aussois, France, 18 January 2015/22 January 2015.
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Study on the origin of cacao swollen shoot virus and its dispersal on cacao trees in West Africa [W112]. Muller Emmanuelle, Abrokwah Francis, Kouakou Koffie, Mississo Essivi, Iskra Caruana Marie-Line, Dzahini-Obiatey Henry. 2015. In : Plant and Animal Genomes Conference XXIII Conference, San diego, United States, San Diego, United States, January 10-14, 2015. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genome Conference. 23, San Diego, États-Unis, 10 January 2015/14 January 2015.
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Geographical distribution of Cacao Swollen Shoot Virus molecular variability in West Africa : [W122]. Muller Emmanuelle, Kouakou Koffie, Abrokwah Francis, Dzahini-Obiatey Henry, Mississo Essivi, Iskra Caruana Marie-Line, Cilas Christian. 2014. In : Plant and Animal Genomes Conference XXII Conference, San diego, United States, San Diego, United States, January 11-15, 2014. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genome Conference. 22, San Diego, États-Unis, 11 January 2014/15 January 2014.
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Sequential integrations of badnaviruses into the M. acuminata and M. balbisiana genomes. Gabriel Marc, Chabannes Matthieu, Iskra Caruana Marie-Line, Muller Emmanuelle. 2013. In : 14èmes Rencontres de virologie végétale (RVV 2013) : Aussois, France, 13-17 janvier 2013. Marais Armelle (ed.), Revers Frédéric (ed.). SFP, INRA. Paris : SFP, Résumé, p. 44. Rencontres de Virologie Végétale. 14, Aussois, France, 13 January 2013/17 January 2013.
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Analyse spatio-temporelle de la progression du Cacao Swollen Shoot Virus à l'échelle de parcelles cacaoyères. Oro Zokou Franck, Muller Emmanuelle, Bonnot François, Dufour Bernard Pierre, Wegbe Komlan, Cilas Christian. 2012. In : 17th Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère, Yaounde, Cameroun, 15 - 20 Octobre 2012. COPAL. s.l. : s.n., 5 p. Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 17, Yaoundé, Cameroun, 15 October 2012/20 October 2012.
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Distribution géographique de la variabilité moléculaire du virus swollen shoot du cacaoyer (CSSV) en Afrique de l'ouest. Kouakou Koffie, Dzahini-Obiatey Henry, Kébé Ismael S., Mississo Angèle, Orod F., Cilas Christian, Muller Emmanuelle. 2012. In : 17th Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère, Yaounde, Cameroun, 15 - 20 Octobre 2012. COPAL. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 17, Yaoundé, Cameroun, 15 October 2012/20 October 2012.
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Dégats et influence du swollen shoot sur quelques paramètres de production de cacao en zones infectées en Côte d'Ivoire. Kouakou Koffie, Kébé Boubacar Ismaël, N'Guessan Kouadio Florent, Ake Séverin, Muller Emmanuelle. 2012. In : 17th Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère : Résumés = 17th International Cocoa Research Conference ; 17th Conferencia Internacional De Investigaçao Sobre 0 Cacau ; 17th Conferencia International de Investigacion en Cacao. Lagos : Alliance des Pays Producteurs de Cacao, Résumé, p. 205. Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 17, Yaoundé, Cameroun, 15 October 2012/20 October 2012.
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Structuration géographique de la variabilité moléculaire du virus du swollen shoot du cacaoyer (CSSV) en Afrique de l'Ouest. Kouakou Koffie, Dzahini-Obiatey Henry, Kébé Ismael S., Mississo Angèle, Oro F., Cilas Christian, Caruana Marie-Line, Muller Emmanuelle. 2012. In : 8e colloque de la Société Française de Phytopathologie, 5 au 8 juin 2012,Paris, France : Livre des résumés. Attard Agnès (ed.), Barny Marie-Anne (ed.), Brisset Marie-Noelle (ed.), Cilas Christian (ed.), Dellagi Alia (ed.), Desprez-Loustau Marie-Laure (ed.), Expert Dominique (ed.), Fabre Frédéric (ed.), Fagard Mathilde (ed.), Fudal Isabelle (ed.), Genin Stéphane. SFP, INRA, CNRS. Paris : SFP, Résumé, p. 24. Congrès de la Société française de phytopathologie. 8, Paris, France, 5 June 2012/8 May 2012.
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Compréhension de l'origine des nouveaux foyers de Cacao swollen shoot virus (cssv) au Togo et en Côte d'Ivoire. Muller Emmanuelle, Kouakou Koffie, Kébé Ismael S., Mississo Angèle, Oro Zokou Franck, Fenouillet Catherine, Cilas Christian. 2011. In : 13èmes Rencontres de virologie végétale (RVV 2011), Aussois, France, 16-20 janvier 2011. SFP. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. Rencontres de virologie végétale. 13, Aussois, France, 16 January 2011/20 January 2011.
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Origine de la biodiversité des séquences BSV détectées en Afrique de l'Est. Muller Emmanuelle, Iskra Caruana Marie-Line. 2010. In : 5ème Colloque du réseau évolution virale, 30 septembre - 1er octobre 2010, Montpellier, France. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. Colloque du réseau évolution virale. 5, Montpellier, France, 30 September 2010/1 October 2010.
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Approches phylogénétiques de la taxonomie du genre badnavirus. Muller Emmanuelle. 2009. In : 12èmes Rencontres de virologie végétale, Aussois du 18 au 22 janvier 2009. Brault Véronique (ed.), Ziegler-Graff Véronique (ed.), Revers Frédéric (ed.). SFP. Paris : CNRS, Résumé, p. 55. Rencontres de virologie végétale. 12, Aussois, France, 18 January 2009/22 January 2009.
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Prevalence of BSV resulting from an endogenous origin in the outbreak and maintain of the banana streak disease. Laboureau Nathalie, Iskra Caruana Marie-Line, Blondin Laurence, Muller Emmanuelle. 2007. In : First ISHS : ProMusa ProMusa Symposium: Recent advances in banana crop protection for sustainable production and improved livelihoods, White River, South Africa, 10-14 september 2007. ISHS. Montpellier : Cirad, Résumé, 1 p. International Symposium on recent advances in banana crop protection for sustainable production and improved livelihoods. 1, White River, Afrique du Sud, 10 September 2007/14 September 2007.
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Detection, diversity and integration of yam badnaviruses. Seal Sue E., Kenyon Lawrence, Lebas Bénédicte, Muller Emmanuelle, Caruana Marie-Line, Marchand Jean-Leu. 2003. In : Advances in plant virology : A three day International conference at CIRAD, Montpellier, France on 29 September - 1 October 2003. AAB, CIRAD-AMIS, INRA, ENSAM, IRD. Warwick : AAB, Résumé, 1 p. International Conference : Advances in Plant Virology, Montpellier, France, 29 September 2003/1 October 2003.

Diversité génétique des Badnavirus. Muller Emmanuelle, Laboureau Nathalie, Harper G., Seal Sue E., Daugrois Jean-Heinrich, Teycheney Pierre-Yves. 2003. In : 9ème Rencontres de virologie végétale, 2 au 6 février 2006, Aussois. Pierre Yot ; CNRS. Strasbourg : CNRS, p. 85. Rencontres de virologie végétale. 9, Aussois, France, 2 February 2003/6 February 2003.

Four new full sequences of cacao swollen shoot virus: A PCR full length cloning strategy and a variability analysis. Muller Emmanuelle, Sackey Sammy. 2003. In : Advances in plant virology : A three day International conference at CIRAD, Montpellier, France on 29 September - 1 October 2003. AAB, CIRAD-AMIS, INRA, ENSAM, IRD. Warwick : AAB, Résumé, 1 p. International Conference : Advances in Plant Virology, Montpellier, France, 29 September 2003/1 October 2003.

Variabilité du virus du Swollen shoot (CSSV): clonage et analyse de quatre nouvelles séquences entières. Muller Emmanuelle, Sackey Sammy. 2003. In : 9ème Rencontres de virologie végétale, 2 au 6 février 2006, Aussois. Pierre Yot ; CNRS. Strasbourg : CNRS, Résumé, p. 17. Rencontres de virologie végétale. 9, Aussois, France, 2 February 2003/6 February 2003.

Genetic diversity of badnaviruses and its impact on germplasm movement. Teycheney Pierre-Yves, Muller Emmanuelle, Seal Susan, Harper G., Kenyon Lawrence, Iskra Caruana Marie-Line. 2002. In : The world of microbes : XIIth International Congress of Virology, Paris, 27th July to 1st August 2002. SFM, IUMS. Paris : EDK, Résumé, p. 195. International Congress of Virology. 11, Paris, France, 27 July 2002/1 August 2002.

Research on viroid-like sequences at CIRAD. Muller Emmanuelle, Dollet Michel. 1997. In : Viroid-like sequences of coconut = [Séquences de type viroïde du cocotier]. Diekmann M. (ed.); ACIAR; IPGRI; COGENT. Rome : IPGRI, pp. 30-38. Meeting viroid-like sequences of coconut, Kajang, Malaisie, 21 April 1997/23 April 1997.

Molecular tools applied to plant trypanosomes. Dollet Michel, Muller Emmanuelle, Marché Sylvie, Gargani Daniel, Banuls A.L., Tibayrenc Michel. 1996. In : International workshop on molecular epidemiology and evolutionary genetics of pathogenic microorganisms = [Atelier international sur l'épidémiologie moléculaire et le développement génétique de microorganismes pathogènes]. US Department of Health and Human. Atlanta : CDC, p. 27. International Workshop on Molecular Epidemiology and Evolutionary Genetics of Pathogenic Microorganisms, Atlanta, États-Unis, 17 June 1996/19 June 1996.

Sleeping sickness of oil palm in South America. Dollet Michel, Muller Emmanuelle, Gargani Daniel. 1996. In : Proceedings of the 1996 PORIM International Palm Oil Congress : competitiveness for the 21st Century. Agriculture Conference. Darus Ariffin (ed.), Wahid Mohd Basri (ed.), Rajanaidu Nookiah (ed.), Hj Tayeb Dolmat (ed.), Paranjothy K. (ed.), Cheah Suan-Choo (ed.), Chang Kwong Choong (ed.), Ravigadevi S. (ed.). PORIM. Kuala Lumpur : PORIM, pp. 379-390. PORIM International Palm Oil Congress, Kuala Lumpur, Malaisie, 23 September 1996/28 September 1996.

DNA sequencing of kinetoplast minicircles from plant trypanosomatids responsible for Hartrot disease. Ahomadegbe J.C., Dollet Michel, Muller Emmanuelle, Riou G.. 1995. In : Third Phytomonas workshop. Abstracts. CIRAD-CP. Montpellier : CIRAD-CP, p. 18. Phytomonas workshop. 3, Montpellier, France, 15 May 1995/17 May 1995.

Mechanical and biological transmission of phloem restricted trypanosomatids to oil palm and coconut. Dollet Michel, Muller Emmanuelle, Vezian Katia, Alvanil F., Gargani Daniel. 1995. In : Third Phytomonas workshop. Abstracts. CIRAD-CP. Montpellier : CIRAD-CP, p. 23. Phytomonas workshop. 3, Montpellier, France, 15 May 1995/17 May 1995.

Several different groups between plant trypanosomatids. Muller Emmanuelle, Dollet Michel. 1995. In : Third Phytomonas workshop. Abstracts. CIRAD-CP. Montpellier : CIRAD-CP, p. 32. Phytomonas workshop. 3, Montpellier, France, 15 May 1995/17 May 1995.

Variability in the phloem restricted plant trypanosomes associated with wilts of cultivated crops (isoenzyme analysis, kDNA, RAPD). Muller Emmanuelle, Ahomadegbe J.C., Coulaud D., Stevens J., Gargani Daniel, Tibayrenc Michel, Sanchez Moreno Manuel, Dollet Michel. 1995. In : Third Phytomonas workshop. Abstracts. CIRAD-CP. Montpellier : CIRAD-CP, p. 12. Phytomonas workshop. 3, Montpellier, France, 15 May 1995/17 May 1995.

Virus phloem restricted trypanosomatids (Phytomonas spp.). Dollet Michel, Marché Sylvie, Gargani Daniel, Muller Emmanuelle, Baltz Théo. 1995. In : Third Phytomonas workshop. Abstracts. CIRAD-CP. Montpellier : CIRAD-CP, p. 17. Phytomonas workshop. 3, Montpellier, France, 15 May 1995/17 May 1995.

Les pentatomides vecteurs des trypanosomes associés au Hartrot du cocotier et Marchitez du palmier. Dollet Michel, Alvanil F., Diaz Adriana Pulido, Louvet C., Gargani Daniel, Segur C., Muller Emmanuelle, Julia Jean-François, Calvache H., Renard Jean-Luc, Maldes Jean-Michel. 1994. In : Conférence internationale sur les ravageurs en agriculture = International conference on pests in agriculture. ANPP. Paris : ANPP, pp. 1321-1328. (Annales) Conférence internationale sur les ravageurs en agriculture. 3, Montpellier, France, 7 December 1993/9 December 1993.
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Variability in the genus Phytomonas: isoenzyme analysis of trypanosomatids associated with wilts of cultivated crops. Muller Emmanuelle, Gargani Daniel, Guerrini F., Sanchez Moreno Manuel, Dollet Michel. 1994. In : Troisième Congrès de la SFP Société française de phytopathologie et réuion du Groupe d'écologie microbienne du sol de la SFM Société française de microbiologie. SFP. Paris : SFP, p. 35. Congrès de la Société française de phytopathologie. 3, Dijon, France, 6 December 1993/10 December 1993.

Specificity of phytopathogenic trypanosomes (Phytomonas spp.). Dollet Michel, Ahmadegbe J.C., Gargani Daniel, Marché Sylvie, Guerrini F., Segur C., Baltz Théo, Muller Emmanuelle. 1993. In : International Congress of Plant Pathology. 6. s.l. : s.n. International Congress of Plant Pathology. 6, Montréal, Canada, 28 July 1993/6 August 1993.

Variability in the genus Phytomonas : isoenzyme analysis of phloem-restricted trypanosomatids. Muller Emmanuelle, Gargani Daniel, Guerrini F., Sanchez Moreno Manuel, Dollet Michel. 1993. In : International congress of protozoology = [Congrès international de protozoologie]. German Society of Protozoology. s.l. : s.n., 1 p. International Congress of Protozoology. 9, Berlin, Allemagne, 25 July 1993/31 July 1993.

Thesis

Variabilité et pathogénie des trypanosomes de plantes (Phytomonas sp.). Muller Emmanuelle. 1995. Montpellier : Université de Montpellier 2, 185 p. Thèse de doctorat : Phytopathologie : Université des sciences et techniques du Languedoc

Technical and research document

Research on "Viroid-like molecules" of coconut. Muller Emmanuelle. 1997. Montpellier : CIRAD-CP, 28 p.

STD3 n.TS3-CT92-0077. Phytomonas spp. trypanosomes de plantes. Rapport final d'activités. Dollet Michel (ed.), Muller Emmanuelle (ed.). 1996. Montpellier : CIRAD-CP, 240 p.

Mission report

Section of report

Cacao swollen shoot virus référence CAC-v1. Muller Emmanuelle. 2004. In : Analyses de risque phytosanitaire : appui à la rédaction de la réglementation spécifique aux départements d'outre-mer. Mourichon Xavier, Camou Romain, Ehret Pierre. CIRAD, CEE-POSEIDOM, France-Ministère de l'agriculture et de la pêche. Montpellier : CIRAD, 4 p.

Dasheen badnavirus version simplifiée Taro bacilliform virus référence ARA-v2. Muller Emmanuelle. 2004. In : Analyses de risque phytosanitaire : appui à la rédaction de la réglementation spécifique aux départements d'outre-mer. Mourichon Xavier, Camou Romain, Ehret Pierre. CIRAD, CEE-POSEIDOM, France-Ministère de l'agriculture et de la pêche. Montpellier : CIRAD, 4 p.

Dasheen mosaic virus référence ARA-v1. Muller Emmanuelle. 2004. In : Analyses de risque phytosanitaire : appui à la rédaction de la réglementation spécifique aux départements d'outre-mer. Mourichon Xavier, Camou Romain, Ehret Pierre. CIRAD, CEE-POSEIDOM, France-Ministère de l'agriculture et de la pêche. Montpellier : CIRAD, 5 p.

Diagnostic précoce du cacao swollen shoot virus et criblage des cacaoyers pour leur résistance. Muller Emmanuelle. 1999. In : LPRC. Rapport d'activités 1996-1998. Fargette Denis (ed.), Peterschmitt Michel (ed.), Ferrer M. (ed.). CIRAD-LPRC, CIRAD-AMIS. Montpellier : CIRAD, pp. 53-54.

Molécules de type viroïde du cocotier. Muller Emmanuelle, Dollet Michel. 1999. In : LPRC. Rapport d'activités 1996-1998. Fargette Denis (ed.), Peterschmitt Michel (ed.), Ferrer M. (ed.). CIRAD-LPRC, CIRAD-AMIS. Montpellier : CIRAD, pp. 61-62.

Trypanosomatides des plantes. Dollet Michel, Gargani Daniel, Muller Emmanuelle, Tizon E., Vezian Katia, Perthuis Bernard. 1999. In : LPRC. Rapport d'activités 1996-1998. Fargette Denis (ed.), Peterschmitt Michel (ed.), Ferrer M. (ed.). CIRAD-LPRC, CIRAD-AMIS. Montpellier : CIRAD, pp. 55-60.

Laboratoire de Phytovirologie des Régions Chaudes CIRAD-ORSTOM, unité de recherches commune virologie CIRAD. Dollet Michel, Muller Emmanuelle, Gargani Daniel, Vezian Katia, Levasseur B., Perthuis Bernard, Llosa J.. 1996. In : STD3 n.TS3-CT92-0077. Phytomonas spp. trypanosomes de plantes. Rapport final d'activités. Dollet Michel (ed.), Muller Emmanuelle (ed.). CIRAD-CP. Montpellier : CIRAD-CP, 60 p.

Molécules de type viroïde du cocotier. Muller Emmanuelle, Dollet Michel. 1996. In : Rapport d'activités 1994-1995 du LPRC. CIRAD-CP; ORSTOM; LPRC. CIRAD-CP, ORSTOM, CIRAD-LPRC. Montpellier : ORSTOM, pp. 15-16.

Variabilité des trypanosomes de plantes. Muller Emmanuelle, Gargani Daniel, Dollet Michel. 1996. In : Rapport d'activités 1994-1995 du LPRC. CIRAD-CP; ORSTOM; LPRC. CIRAD-CP, ORSTOM, CIRAD-LPRC. Montpellier : ORSTOM, pp. 26-30.

Vection des trypanosomes de plantes. Dollet Michel, Muller Emmanuelle, Gargani Daniel, Vezian Katia. 1996. In : Rapport d'activités 1994-1995 du LPRC. CIRAD-CP; ORSTOM; LPRC. CIRAD-CP, ORSTOM, CIRAD-LPRC. Montpellier : ORSTOM, pp. 31-32.

Phytomonas spp., trypanosomes de plantes recherche sur le métabolisme, la variabilité, la pathogénie et l'épidémiologie pour arriver à des méthodes de lutte non polluantes. Rapport d'avancement des travaux du 1er semestre de la 3è année. Muller Emmanuelle, Gargani Daniel, Perthuis Bernard, Vezian Katia, Dollet Michel. 1995. In : Contrat STD3 n. TS3-CT92-0077. #Phytomonas# spp. trypanosomes de plantes : recherche sur le métabolisme, la variabilité, la pathogénie et l'épidémiologie pour arriver à des méthodes de lutte non polluantes. Rapport d'avancement des travaux du 1er semestre. Paris : CIRAD-CP, 2 p.

Phytomonas spp., trypanosomes de plantes. Rapport d'activités 2è année. STD III TS3-CT92-0077. Muller Emmanuelle, Gargani Daniel, Levasseur B., Perthuis Bernard, Dollet Michel. 1994. In : Contrat STD3 n.TS3-CT92-007. #Phytomonas# spp. trypanosomes de plantes : recherche sur le métabolisme, la variabilité, la pathogénicité et l'épidémiologie pour arriver à des méthodes de lutte non polluantes. Rapport de synthèse 2ème année, 1er octobre 199. Paris : CIRAD-CP, 18 p.

Laboratoire de Phytovirologie des Régions Chaudes CIRAD-ORSTOM Montpellier - FRANCE. Muller Emmanuelle, Levasseur B., Gargani Daniel, Dollet Michel. 1993. In : STD III. TS3-CT92-0077. #Phytomonas# spp., trypanosomes de plantes. Rapport d'activités, 1ère année (01/10/92 au 30/09/93). Dollet Michel. CIRAD-CP. Montpellier : CIRAD-CP, 15 p.

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