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Crop domestication in the Asia Pacific Region: A review. Okemo Pauline, Wijesundra Upendra, Nakandala Upuli, Dillon Natalie, Chandora Rahul, Campbell Bradley, Smith Millicent, Hardner Craig, Cadorna Charles A., Martin Guillaume, Yahiaoui Nabila, Garsmeur Olivier, Pompidor Nicolas, D'Hont Angélique, Henry Robert. 2024. Agriculture Communications, 2 (1):100032, 10 p.

Identification of Resistance QTLs to Black Leaf Streak Disease (Due to Pseudocercospora fijiensis) in Diploid Bananas (Musa acuminata). Carreel Françoise, Martin Guillaume, Ravel Sébastien, Roussel Véronique, Pagès Christine, Habas Rémy, Cantagrel Théo, Guiougou Chantal, Delos Jean-Marie Eric, Hervouet Catherine, Mournet Pierre, D'Hont Angélique, Yahiaoui Nabila, Salmon Frédéric. 2024. Horticulturae, 10, n.spéc. Developments in the Genetics and Breeding of Banana Species:608, 18 p.

Painting the diversity of a world's favorite fruit: A next generation catalog of cultivated bananas. Sardos Julie, Cenci Alberto, Martin Guillaume, Breton Catherine, Guignon Valentin, Van Den Houwe Ines, Mendez Yaleidis, Sachter-Smith Gabriel, Chase Rachel, Ruas Max, Rivallan Ronan, Paofa Janet, Wigmore William J., Hunter David Tilafono, D'Hont Angélique, Yahiaoui Nabila, Jenny Christophe, Perrier Xavier, Roux Nicolas, Rouard Mathieu. 2024. Plants, People, Planet, 21 p.

Screening of triploid banana population under natural and controlled black sigatoka disease for genomic selection. Mbo Nkoulou Luther Fort, Fifen Nkouandou Yacouba, Bille Ngalle Hermine, Cros David, Martin Guillaume, Molo Thierry, Ngombo Eya'a Clement, Essome Charles, Zandjanakou-Tachin Martine, Dégbey Hervé, Bell Joseph Martin, Achigan-Dako Enoch G.. 2024. Plant Disease, 108 (7) : 2006-2016.

Analysis of genetic diversity and agronomic variation in banana sub-populations for genomic selection under drought stress in Southern Benin. Fort Mbo Nkoulou Luther, Archange Tchinda Ninla Lauriane, Cros David, Martin Guillaume, Ndiang Zenadou, Houegban Jordan, Bille Ngalle Hermine, Martin Bell Joseph, Achigan-Dako Enoch G.. 2023. Gene, 859:147210, 12 p.

Genetic mapping, candidate gene identification and marker validation for host plant resistance to the race 4 of Fusarium oxysporum f. sp. cubense using Musa acuminata ssp. malaccensis. Chen Andrew, Sun Jiaman, Viljoen Altus, Mostert Diane, Xie Yucong, Mangila Leroy, Bothma Sheryl, Lyons Rebecca, Hribova Eva, Christelová Pavla, Uwimana Brigitte, Amah Delphine, Pearce Stephen, Chen Ning, Batley Jacqueline, Edwards David P., Dolezel Jaroslav, Crisp Peter, Brown Allan F., Martin Guillaume, Yahiaoui Nabila, D'Hont Angélique, Coin Lachlan, Swennen Rony, Aitken Elizabeth A. B.. 2023. Pathogens, 12 (6), n.spéc. Current Research on Fusarium:820, 27 p.

Identification of a major QTL-Controlling resistance to the subtropical race 4 of Fusarium oxysporum f. sp. cubense in Musa acuminata ssp. malaccensis. Chen Andrew, Sun Jiaman, Martin Guillaume, Gray Lesley-Ann, Hribova Eva, Christelová Pavla, Yahiaoui Nabila, Rounsley Steve, Lyons Rebecca, Batley Jacqueline, Chen Ning, Hamill Sharon, Rai Subash K., Coin Lachlan, Uwimana Brigitte, D'Hont Angélique, Dolezel Jaroslav, Edwards David P., Swennen Rony, Aitken Elizabeth A. B.. 2023. Pathogens, 12 (2), n.spéc. Current Research on Fusarium:289, 13 p.

Interspecific introgression patterns reveal the origins of worldwide cultivated bananas in New Guinea. Martin Guillaume, Cottin Aurélien, Baurens Franc-Christophe, Labadie Karine, Hervouet Catherine, Salmon Frédéric, Paulo De La Reberdière Nilda, Van Den Houwe Ines, Sardos Julie, Aury Jean-Marc, D'Hont Angélique, Yahiaoui Nabila. 2023. Plant Journal, 113 (4) : 802-818.

Shared pedigree relationships and transmission of unreduced gametes in cultivated banana. Martin Guillaume, Baurens Franc-Christophe, Labadie Karine, Hervouet Catherine, Salmon Frédéric, Marius Franck, Paulo-de-la-Reberdiere Nilda, Van Den Houwe Ines, Aury Jean-Marc, D'Hont Angélique, Yahiaoui Nabila. 2023. Annals of Botany, 131 (7) : 1149-1161.

Visualizing and inferring chromosome segregation in the pedigree of an improved banana cultivar (gold finger) with genome ancestry mosaic painting. Cenci Alberto, Martin Guillaume, Breton Catherine, D'Hont Angélique, Yahiaoui Nabila, Sardos Julie, Rouard Mathieu. 2023. Horticulturae, 9 (12), n.spéc. Developments in the Genetics and Breeding of Banana Species:1330, 11 p.

Whole blood transcriptome profiles of trypanotolerant and trypanosusceptible cattle highlight a differential modulation of metabolism and immune response during infection by Trypanosoma congolense. Peylhard Moana, Berthier David, Dayo Guiguigbaza-Kossigan, Chantal Isabelle, Sylla Souleymane, Nidelet Sabine, Dubois Emeric, Martin Guillaume, Sempere Guilhem, Flori Laurence, Thevenon Sophie. 2023. Peer Community Journal, 3:e17, 33 p.

The Banana Genome Hub: A community database for genomics in the Musaceae. Droc Gaëtan, Martin Guillaume, Guignon Valentin, Summo Marilyne, Sempere Guilhem, Durant Eloi, Soriano Alexandre, Baurens Franc-Christophe, Cenci Alberto, Breton Catherine, Shah Trushar, Aury Jean-Marc, Ge Xue-Jun, Harrison Pat Heslop, Yahiaoui Nabila, D'Hont Angélique, Rouard Mathieu. 2022. Horticulture Research, 9:uhac221, 10 p.

Detection of dynamic QTLs for traits related to organoleptic quality during banana ripening. Biabiany Stella, Araou Emilie, Cormier Fabien, Martin Guillaume, Carreel Françoise, Hervouet Catherine, Salmon Frédéric, Efile Jean-Claude, Lopez-Lauri Félicie, D'Hont Angélique, Lechaudel Mathieu, Ricci Sébastien. 2022. Scientia Horticulturae, 293:110690, 13 p.

GeMo: A web-based platform for the visualization and curation of genome ancestry mosaics. Summo Marilyne, Comte Aurore, Martin Guillaume, Perelle Pierrick, Weitz Eric M., Droc Gaëtan, Rouard Mathieu. 2022. Database, 2022:baac057 : 1-5.

Genetic control of flowering in greater yam (Dioscorea alata L.). Cormier Fabien, Martin Guillaume, Vignes Hélène, Lachman Laurie, Cornet Denis, Faure Y., Maledon Erick, Mournet Pierre, Arnau Gemma, Chaïr Hâna. 2021. BMC Plant Biology, 21:63, 12 p.

Genetics of nodulation in Aeschynomene evenia uncovers mechanisms of the rhizobium-legume symbiosis. Quilbé Johan, Lamy Léo, Brottier Laurent, Leleux Philippe, Fardoux Joël, Rivallan Ronan, Benichou Thomas, Guyonnet Rémi, Becana Manuel, Villar Irene, Garsmeur Olivier, Hufnagel Barbara, Delteil Amandine, Gully Djamel, Chaintreuil Clémence, Pervent Marjorie, Cartieaux Fabienne, Bourge Mickael, Valentin Nicolas, Martin Guillaume, Fontaine Loïc, Droc Gaëtan, Dereeper Alexis, Farmer Andrew, Libourel Cyril, Nouwen Nico, Gressent Frédéric, Mournet Pierre, D'Hont Angélique, Giraud Eric, Klopp Christophe, Arrighi Jean-François. 2021. Nature Communications, 12:829, 14 p.

Telomere-to-telomere gapless chromosomes of banana using nanopore sequencing. Belser Caroline, Baurens Franc-Christophe, Noël Benjamin, Martin Guillaume, Cruaud Corinne, Istace Benjamin, Yahiaoui Nabila, Labadie Karine, Hribova Eva, Dolezel Jaroslav, Lemainque Arnaud, Wincker Patrick, D'Hont Angélique, Aury Jean-Marc. 2021. Communications Biology, 4:1047, 12 p.

Unravelling the complex story of intergenomic recombination in ABB allotriploid bananas. Cenci Alberto, Sardos Julie, Hueber Yann, Martin Guillaume, Breton Catherine, Roux Nicolas, Swennen Rony, Carpentier Sébastien Christian, Rouard Mathieu. 2021. Annals of Botany, 127 (1) : 7-20.

Chromosome reciprocal translocations have accompanied subspecies evolution in bananas. Martin Guillaume, Baurens Franc-Christophe, Hervouet Catherine, Salmon Frédéric, Delos Jean-Marie Eric, Labadie Karine, Perdereau Aude, Mournet Pierre, Blois Louis, Dupouy Marion, Carreel Françoise, Ricci Sebastien, Lemainque Arnaud, Yahiaoui Nabila, D'Hont Angélique. 2020. Plant Journal, 104 : 1698-1711.

Genome ancestry mosaics reveal multiple and cryptic contributors to cultivated banana. Martin Guillaume, Cardi Céline, Sarah Gautier, Ricci Sebastien, Jenny Christophe, Fondi Emmanuel, Perrier Xavier, Glaszmann Jean-Christophe, D'Hont Angélique, Yahiaoui Nabila. 2020. Plant Journal, 102 (5) : 1008-1025.

Screening diversity and distribution of Copia retrotransposons reveals a specific amplification of BARE1 elements in genomes of the polyploid Hordeum murinum complex. Ourari Malika, Coriton Olivier, Martin Guillaume, Huteau Virginie, Keller Jean, Ainouche Malika Lily, Amirouche Rachid, Ainouche Abdelkader. 2020. Genetica, 148 (2) : 109-123.

Musa balbisiana genome reveals subgenome evolution and functional divergence. Wang Zhuo, Miao Hongxia, Liu Juhua, Xu Biyu, Yao Xiaoming, Xu Chunyan, Zhao Shancen, Fang Xiaodong, Jia Caihong, Wang Jingyi, Zhang Jianbin, Li Jing, Xu Yi, Wang Jiashui, Ma Weihong, Wu Zhixiang, Yu Lili, Yang Yulan, Liu Chun, Guo Yu, Sun Silong, Baurens Franc-Christophe, Martin Guillaume, Salmon Frédéric, Garsmeur Olivier, Yahiaoui Nabila, Hervouet Catherine, Rouard Mathieu, Laboureau Nathalie, Habas Rémy, Ricci Sebastien, Peng Ming, Guo Anping, Xie Jianghui, Li Yin, Ding Zehong, Yan Yan, Tie Weiwei, D'Hont Angélique, Hu Wei, Jin Zhiqiang. 2019. Nature Plants, 5 : 810-821.

Recombination and large structural variations shape interspecific edible bananas genomes. Baurens Franc-Christophe, Martin Guillaume, Hervouet Catherine, Salmon Frédéric, Yohomé David, Ricci Sebastien, Rouard Mathieu, Habas Rémy, Lemainque Arnaud, Yahiaoui Nabila, D'Hont Angélique. 2019. Molecular Biology and Evolution, 36 (1) : 97-111.

Transcriptome data from three endemic Myrtaceae species from New Caledonia displaying contrasting responses to myrtle rust (Austropuccinia psidii). Soewarto Julia, Hamelin Chantal, Bocs Stéphanie, Mournet Pierre, Vignes Hélène, Berger Angélique, Armero Villanueva Alix Augusto, Martin Guillaume, Dereeper Alexis, Sarah Gautier, Carriconde Fabian, Maggia Laurent. 2019. Data in Brief, 22 : 794-811.

Two large reciprocal translocations characterized in the disease resistance-rich burmannica genetic group of Musa acuminata. Dupouy Marion, Baurens Franc-Christophe, Derouault Paco, Hervouet Catherine, Cardi Céline, Cruaud Corinne, Istace Benjamin, Labadie Karine, Guiougou Chantal, Toubi Lyonel, Salmon Frédéric, Mournet Pierre, Rouard Mathieu, Yahiaoui Nabila, Lemainque Arnaud, Martin Guillaume, D'Hont Angélique. 2019. Annals of Botany, 124 (2) : 319-329.

Chromosome-scale assemblies of plant genomes using nanopore long reads and optical maps. Belser Caroline, Istace Benjamin, Denis Erwan, Dubarry Marion, Baurens Franc-Christophe, Falentin Cyril, Genete Mathieu, Berrabah Wahiba, Chèvre Anne-Marie, Delourme Régine, Deniot Gwenaëlle, Denoeud France, Duffé Philippe, Engelen Stefan, Lemainque Arnaud, Manzanares-Dauleux Maria J., Martin Guillaume, Morice Jérôme, Noël Benjamin, Vekemans Xavier, D'Hont Angélique, Rousseau-Gueutin Mathieu, Barbe Valérie, Cruaud Corinne, Wincker Patrick, Aury Jean-Marc. 2018. Nature Plants, 4 (11) : 879-887.

Naturally occurring variations in the nod-independent model legume Aeschynomene evenia and relatives: A resource for nodulation genetics. Chaintreuil Clémence, Perrier Xavier, Martin Guillaume, Fardoux Joël, Lewis Gwilym P., Brottier Laurent, Rivallan Ronan, Gomez-Pacheco Mario, Bourges Mickaël, Lamy Léo, Thibaud Béatrice, Ramanankierana Heriniaina, Randriambanona Herizo, Vandrot Hervé, Mournet Pierre, Giraud Eric, Arrighi Jean-François. 2018. BMC Plant Biology, 18:54, 15 p.

Three new genome assemblies support a rapid radiation in Musa acuminata (wild banana). Rouard Mathieu, Droc Gaëtan, Martin Guillaume, Sardos Julie, Hueber Yann, Guignon Valentin, Cenci Alberto, Geigle B., Hibbins M.S., Yahiaoui Nabila, Baurens Franc-Christophe, Berry Vinvent, Hahn M.W., D'Hont Angélique, Roux Nicolas. 2018. Genome Biology and Evolution, 10 (12) : 3129-3140.

A mosaic monoploid reference sequence for the highly complex genome of sugarcane. Garsmeur Olivier, Droc Gaëtan, Antonise Rudie, Grimwood Jane, Potier Bernard, Aitken Karen S., Jenkins Jerry, Martin Guillaume, Charron Carine, Hervouet Catherine, Costet Laurent, Yahiaoui Nabila, Healey Adam, Sims David, Cherukuri Yesesri, Sreedasyam Avinash, Kilian Andrzej, Chan Agnes P., Van Sluys Marie-Anne, Swaminathan Kankshita, Town Christopher, Berges Hélène, Simmons Blake, Glaszmann Jean-Christophe, Van der Vossen Edwin, Henry Robert, Schmutz Jeremy, D'Hont Angélique. 2018. Nature Communications, 9:2638, 10 p.

Evolution of the banana genome (Musa acuminata) is impacted by large chromosomal translocations. Martin Guillaume, Carreel Françoise, Coriton Olivier, Hervouet Catherine, Cardi Céline, Derouault Paco, Roques Danièle, Salmon Frédéric, Rouard Mathieu, Sardos Julie, Labadie Karine, Baurens Franc-Christophe, D'Hont Angélique. 2017. Molecular Biology and Evolution, 34 (9), 28 p.

The cacao Criollo genome v2.0: An improved version of the genome for genetic and functional genomic studies. Argout Xavier, Martin Guillaume, Droc Gaëtan, Fouet Olivier, Labadie Karine, Rivals Eric, Aury Jean-Marc, Lanaud Claire. 2017. BMC Genomics, 18:730, 9 p.

The evolutionary fate of the chloroplast and nuclear rps16 genes as revealed through the sequencing and comparative analyses of four novel legume chloroplast genomes from Lupinus. Keller J., Rousseau-Gueutin Mathieu, Martin Guillaume, Morice Jérôme, Boutte Julien, Coissac E., Ourari M., Ainouche Malika Lily, Salmon Armel, Cabello-Hurtado F., Ainouche Abdelkader. 2017. DNA Research, 24 (4) : 343-358.

Improvement of the banana Musa acuminata reference sequence using NGS data and semi-automated bioinformatics methods. Martin Guillaume, Baurens Franc-Christophe, Droc Gaëtan, Rouard Mathieu, Cenci Alberto, Kilian Andrzej, Hastie Alex, Dolezelova M., Aury Jean-Marc, Alberti Adriana, Carreel Françoise, D'Hont Angélique. 2016. BMC Genomics, 17 (243), 12 p.

The South Green portal: A comprehensive resource for tropical and Mediterranean crop genomics. Guignon Valentin, Hueber Yann, Rouard Mathieu, Bocs Stéphanie, Couvin David, De Lamotte Frédéric, Droc Gaëtan, Dufayard Jean François, El Hassouni Nordine, Farcy Cédric, Gkanogiannis Anestis, Hamelin Chantal, Larivière Delphine, Martin Guillaume, Ortega Enrique, Pitollat Bertrand, Pointet Stéphanie, Ruiz Manuel, Gautier Sarah, Summo Marilyne, This Dominique, Ravel Sébastien, Larmande Pierre, Monat Cécile, Sabot François, Tando Ndomassi, Tranchant-Dubreuil Christine, Sempere Guilhem, Dereeper Alexis. 2016. Current Plant Biology, 7-8 : 6-9.

A gene-based map of the Nod factor-independent Aeschynomene evenia sheds new light on the evolution of nodulation and legume genomes. Chaintreuil Clémence, Rivallan Ronan, Bertioli David J., Klopp Christophe, Gouzy Jérôme, Courtois Brigitte, Leleux Philippe, Martin Guillaume, Rami Jean-François, Gully Djamel, Parrinello Hugues, Severac Dany, Patrel Delphine, Fardoux Joël, Ribière William, Boursot Marc, Cartieaux Fabienne, Czernic Pierre, Ratet Pascal, Mournet Pierre, Giraud Eric, Arrighi Jean-François. 2016. DNA Research, 23 (4) : 365-376.

The chloroplast genome of the hexaploid Spartina maritima (Poaceae, Chloridoideae): Comparative analyses and molecular dating. Rousseau-Gueutin Mathieu, Bellot Sidonie, Martin Guillaume, Boutte Julien, Chelaifa Houda, Lima Oscar, Michon-Coudouel Sophie, Naquin Delphine, Salmon Armel, Ainouche K., Ainouche Malika Lily. 2015. Molecular Phylogenetics and Evolution, 93 : 5-16.

Cost-effective enrichment hybridization capture of chloroplast genomes at deep multiplexing levels for population genetics and phylogeography studies. Mariac Cédric, Scarcelli Nora, Pouzadou Juliette, Barnaud Adeline, Billot Claire, Faye Adama, Kougbeadjo Ayite, Maillol Vincent, Martin Guillaume, Sabot François, Santoni Sylvain, Vigouroux Yves, Couvreur Thomas. 2014. Molecular Ecology Resources, 14 (6) : 1103-1113.

The first complete chloroplast genome of the Genistoid legume Lupinus luteus: evidence for a novel major lineage-specific rearrangement and new insights regarding plastome evolution in the legume family. Martin Guillaume, Rousseau-Gueutin Mathieu, Cordonnier Solenn, Lima Oscar, Michon-Coudouel Sophie, Naquin Delphine, de Carvalho Julie Ferreira, Ainouche Malika Lily, Salmon Armel, Ainouche Abdelkader. 2014. Annals of Botany, 113 (7) : 1197-1210.

The complete chloroplast genome of banana (Musa acuminata, Zingiberales): Insight into plastid monocotyledon evolution. Martin Guillaume, Baurens Franc-Christophe, Cardi Céline, Aury Jean-Marc, D'Hont Angélique. 2013. PloS One, 8 (6):e67350, 10 p.

The repetitive content in lupin genomes. Ainouche Abdelkader, Paris Aurore, Giraud Delphine, Keller Jean, Raimondeau Pauline, Mahé Frédéric, Neuman Pavel, Novak Petr, Macas Jiri, Ainouche Malika Lily, Salmon Armel, Martin Guillaume. 2020. In : The lupin genome. Singh Karam B. (ed.), Kamphuis Lars G. (ed.), Nelson Matthew N. (ed.). Cham : Springer, 161-186. (Compendium of Plant Genomes) ISBN 978-3-030-21269-8

The intertwined chloroplast and nuclear genome coevolution in plants. Rousseau-Gueutin Mathieu, Keller J., Ferreira de Carvalho Julie, Ainouche Abdelkader, Martin Guillaume. 2018. In : Plant Growth and Regulation - Alterations to Sustain Unfavorable Conditions. London : InTechOpen, 61-84.

The South Green Bioinformatics platform, a comprehensive resource for crop genomics. Ruiz Manuel, Dereeper Alexis, Droc Gaëtan, Sarah Gautier, Tranchant-Dubreuil Christine, Dufayard Jean François, Guignon Valentin, Hamelin Chantal, De Lamotte Frédéric, Larmande Pierre, Sabot François, Sempere Guilhem, Summo Marilyne, Pitollat Bertrand, This Dominique, Bocs Stéphanie, Hueber Yann, El Hassouni Nordine, Martin Guillaume, Gkanogiannis Anestis, Ravel Sébastien, Monat Cécile, Tando Ndomassi, Rouard Mathieu. 2017. In : Proceedings X-Meeting 2017. s.l. : s.n., 1 p. International Conference of the AB3. 13, São Pedro, Brésil, 4 Octobre 2017/6 Octobre 2017.

Toward a reference sequence of the gene-rich part of the highly polypoid sugarcane genome. Garsmeur Olivier, Potier Bernard, Aitken Karen S., Droc Gaëtan, Berkman Paul, Charron Carine, Martin Guillaume, Harrison Bandie, Van der Vossen Edwin, Henry Robert, D'Hont Angélique. 2014. In : 5th IAPSIT International Sugar Conference (IS-2014) onThe Green Technologies for Sustainable growth of Sugar Industry in Developing Countries, November 25-28, 2014, Nanning, China. Yang-Rui Li, G.P. Rao, S. Solomon, Li-Tao Yang, Zhong Liu, Wei-Zhong He,. Naming : IAPSIT, Résumé, 15. IAPSIT International Sugar Conference IS-2014. 5, Nanning, Chine, 25 Novembre 2014/28 Novembre 2014.

Variation of morphological and yield traits in a banana (Musa acuminata) breeding program of triploid populations: lessons for selection procedures and criteria. Toniutti Lucile, Rio Simon, Martin Guillaume, Hoarau Jean-Yves, Salmon Frédéric. 2023. In : Proceeding of the International Symposium on Breeding and Effective Use of Biotechnology and Molecular Tools in Horticultural Crops. Bus Vincent (ed.), Causse Mathilde (ed.). ISHS. Louvain : ISHS, 539-546. (Acta Horticulturae, 1362) ISBN 978-94-6261-361-4 International Horticultural Congress (IHC 2022): International Symposium on Breeding and Effective Use of Biotechnology and Molecular Tools in Horticultural Crops. 31, Angers, France, 14 Août 2022/20 Août 2022.

Haplotype reconstruction attempt to characterize structural variations in heterozygous banana genomes. Martin Guillaume, Hervouet Catherine, Ricci Sébastien, Lemainque Arnaud, Baurens Franc-Christophe, D'Hont Angélique. 2018. In : Abstract Book DynaGev 2018. Réseau scientifique DYNAGEV. Rennes : INRA, Résumé, 1 p. Colloque annuel DynaGeV : Dynamique des génomes végétaux. 4, Rennes, France, 21 Juin 2018/22 Juin 2018.

Mosaic genome structures of interspecific banana cultivars shed a new light on banana domestication. Baurens Franc-Christophe, Martin Guillaume, Salmon Frédéric, Lemainque Arnaud, Yahiaoui Nabila, D'Hont Angélique. 2018. In : Abstract Book Dynagev 2018. Réseau scientifique DYNAGEV. Rennes : INRA, Résumé, 1 p. Colloque annuel DynaGeV : Dynamique des génomes végétaux. 4, Rennes, France, 21 Juin 2018/22 Juin 2018.

South Green, une plateforme de bioinformatique tournée vers l'agriculture dans les pays du sud. Ravel Sébastien, Bocs Stéphanie, Brousseau Louise, De Lamotte Frédéric, Dereeper Alexis, Droc Gaëtan, Dufayard Jean François, Guignon Valentin, Hamelin Chantal, Larmande Pierre, Mahé Frédéric, Martin Guillaume, Orjuela-Bouniol Julie, Pitollat Bertrand, Rouard Mathieu, Ruiz Manuel, Sabot François, Sarah Gautier, Sempere Guilhem, Summo Marilyne, Tando Ndomassi, Tranchant-Dubreuil Christine. 2018. In : JOBIM 2018 Abstracts. SFBI, GdR BiM, IFB, AMU, INSERM, CNRS. Marseille : SFBI, 418-420. Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM 2018), Marseille, 3 Juillet 2018/6 Juillet 2018.

The Cacao Criollo Genome v2.0 : An improved version of the genome for genetic and functional genomic studies. [W098]. Argout Xavier, Martin Guillaume, Droc Gaëtan, Labadie Karine, Rivals Eric, Aury Jean-Marc, Lanaud Claire. 2017. In : Proceedings Plant and Animal Genome XXV Conference. San Diego : PAG, 1 p. Plant and Animal Genome Conference. 25, San Diego, États-Unis, 14 Janvier 2017/18 Janvier 2017.

Characterization of a large reciprocal chromosomal translocation in banana (Musa acuminata) and its impact on chromosomal segregation using NGS. [W064]. Martin Guillaume, Carreel Françoise, Coriton Olivier, Hervouet Catherine, Cardi Céline, Roques Danièle, Rouard Mathieu, Sardos Julie, Baurens Franc-Christophe, D'Hont Angélique. 2017. In : Proceedings Plant and Animal Genome XXV Conference. San Diego : PAG, Résumé, 1 p. Plant and Animal Genome Conference. 25, San Diego, États-Unis, 14 Janvier 2017/18 Janvier 2017.

A Reference Sequence of the Monoploid Genome of Sugarcane. [W889]. Garsmeur Olivier, Aitken Karen S., Potier Bernard, Grimwood Jane, Charron Carine, Droc Gaëtan, Berkman Paul, Martin Guillaume, Berges Hélène, Van der Vossen Edwin, Simmons Blake, Schmutz Jeremy, Henry Robert, D'Hont Angélique. 2017. In : Proceedings Plant and Animal Genome XXV Conference. San Diego : PAG, 1 p. Plant and Animal Genome Conference. 25, San Diego, États-Unis, 14 Janvier 2017/18 Janvier 2017.

South Green bioinformatics platform: Update 2015. Armero A., Baurens Franc-Christophe, Bocs Stéphanie, Breil A., De Lamotte Frédéric, Dereeper Alexis, Droc Gaëtan, Dufayard Jean François, El Hassouni Nordine, Farcy Cédric, Garsmeur Olivier, Guignon Valentin, Hamelin Chantal, Hueber Yann, Kougbeadjo Ayite, Larivière Delphine, Larmande Pierre, Lorenzo Jonathan, Martin Guillaume, Monat Cécile, Ndomassi T., Ortega Abboud Enrique, Pitollat Bertrand, Ravel Sébastien, Ranwez Vincent, Rouard Mathieu, Ruiz E., Sabot François, Sarah Gautier, Sempere Guilhem, Summo Marilyne, This Dominique, Tranchant-Dubreuil Christine, Vallier Félix. 2015. In : Plant Genomics Congress. Global Engage. Londres : Global Engage, 51. Plant Genomics Congress. 3, Londres, Royaume-Uni, 11 Mai 2015/12 Mai 2015.

Toward a reference sequence of the sugarcane genome. [MO04]. Garsmeur Olivier, Charron Carine, Potier Bernard, Aitken Karen S., Berkman Paul, Droc Gaëtan, Martin Guillaume, Van der Vossen Edwin, Henry Robert, D'Hont Angélique. 2015. In : Pushing the frontiers of sugarcane improvement. ISSCT. Saint-Gilles : ISSCT, Résumé, 42. Germplasm and Breeding ISSCT Workshop. 11, Saint-Gilles, Réunion, 1 Juin 2015/5 Juin 2015.

Detection of dynamic QTLs for traits related to organoleptic quality during banana ripening. Biabiany Stella, Araou Emilie, Cormier Fabien, Martin Guillaume, Carreel Françoise, Hervouet Catherine, Salmon Frédéric, Efile Jean-Claude, Lopez-Lauri Félicie, D'Hont Angélique, Lechaudel Mathieu, Ricci Sebastien. 2022. . ISHS. Angers : ISHS, 1 p International Horticultural Congress (IHC 2022). 31, Angers, France, 14 Août 2022/20 Août 2022.

The South Green Genome Hubs. Droc Gaëtan, Argout Xavier, Bocs Stéphanie, Comte Aurore, Dereeper Alexis, Dufayard Jean François, Garsmeur Olivier, Gkanogiannis Anestis, Guignon Valentin, Hamelin Chantal, Lopez David, Oubda Nicolas, Martin Guillaume, Ravel Sébastien, Ruiz Manuel, Summo Marilyne, Thomas Coline, Tranchant-Dubreuil Christine, Rouard Mathieu. 2020. . SFBI, IFB, GDR-BIM. Montpellier : SFBI, 1 p. Journées ouvertes de biologie, informatique et mathématique (JOBIM 2020), Montpellier, France, 30 Juin 2020/3 Juillet 2020.

South Green bioinformatic resources for tropical and Mediterranean crops. Rouard Mathieu, Bocs Stéphanie, Breton Catherine, Comte Aurore, De Lamotte Frédéric, Dereeper Alexis, Droc Gaëtan, Dufayard Jean François, Guignon Valentin, Hamelin Chantal, Larmande Pierre, Lopez David, Mahé Frédéric, Martin Guillaume, Orjuela-Bouniol Julie, Pitollat Bertrand, Ravel Sébastien, Ruiz Manuel, Sabot François, Sarah Gautier, Sempere Guilhem, Summo Marilyne, Tando Ndomassi, Tranchant-Dubreuil Christine. 2020. . SFBI, IFB, GDR-BIM. Montpellier : SFBI, 1 p. Journées ouvertes de biologie, informatique et mathématique (JOBIM 2020). 20, Montpellier, France, 30 Juin 2020/3 Juillet 2020.

Banana genomes are shaped by admixture and large structural variations. P1031. Martin Guillaume, Baurens Franc-Christophe, Dupouy Marion, Yahiaoui Nabila, D'Hont Angélique. 2018. . Montpellier : ESEB, 1 p. Joint Congress on Evolutionary Biology. 2, Montpellier, France, 19 Août 2018/22 Août 2018.

Local Ancestry lnference approaches to unravel plant genome mosaic: a simulation-based evaluation. Cottin Aurélien, Penaud Benjamin, Martin Guillaume, Dos Santos J., Curk Franck, D'Hont Angélique, Glaszmann Jean-Christophe, Yahiaoui Nabila, Gautier Mathieu. 2018. . Montpellier : ESEB, Résumé, 1 p. Joint Congress on Evolutionary Biology, Montpellier, France, 19 Août 2018/22 Août 2018.

Insight into the hybrid mosaic structure of cultivated banana genomes. Martin Guillaume, Cardi Céline, Sarah Gautier, Jourda Cyril, Ricci Sebastien, Jenny Christophe, Perrier Xavier, D'Hont Angélique, Glaszmann Jean-Christophe, Yahiaoui Nabila. 2017. In : Plant Genome Evolution 2017. Sitges : s.n., 1 p. Plant Genome Evolution 2017, Sitges, Espagne, 1 Octobre 2017/3 Octobre 2017.

South Green bioinformatics platform : Plateforme collaborative de bioinformatique verte héraultaise. Bocs Stéphanie, Couvin David, De Lamotte Frédéric, Dereeper Alexis, Droc Gaëtan, Dufayard Jean François, El Hassouni Nordine, Farcy Cédric, Gkanogiannis Anestis, Guignon Valentin, Hamelin Chantal, Hueber Yann, Larivière Delphine, Larmande Pierre, Martin Guillaume, Monat Cécile, Ortega Abboud Enrique, Pitollat Bertrand, Pointet Stéphanie, Ravel Sébastien, Rouard Mathieu, This Patrice, Tranchant-Dubreuil Christine. 2017. . Montpellier : CIRAD, 1 poster Amphithéâtre "Patrimoine Numérique Scientifique", Montpellier, France, 20 Février 2017/20 Février 2017.

Bioinformatic approaches based on SNP to characterize ancestral mosaic genome structures of cultivated banana. Martin Guillaume, Cottin Aurélien, Baurens Franc-Christophe, Labadie Karine, Aury Jean-Marc, D'Hont Angélique, Yahiaoui Nabila. 2022. . INRAE. Orléans : INRAE, 1 p. Colloque INRAE Genomics, Orléans, France, 16 Mai 2022/18 Mai 2022.

The complex story of intergenomic recombination in ABB allotriploid bananas. [W099]. Cenci Alberto, Sardos Julie, Martin Guillaume, Breton Catherine, Roux Nicolas, Swennen Rony, Carpentier Sébastien Christian, Rouard Mathieu. 2020. In : Abstracts workshops of the PAG XXVIII. San Diego : PAG, Résumé, 43-44. Plant and Animal Genome. 28, San Diego, États-Unis, 11 Janvier 2020/15 Janvier 2020.

Genome ancestry mosaics reveal multiple and cryptic contributors to cultivated banana. Martin Guillaume, Cardi Céline, Sarah Gautier, Ricci Sébastien, Jenny Christophe, Fondi Emmanuel, Perrier Xavier, Glaszmann Jean-Christophe, D'Hont Angélique, Yahiaoui Nabila. 2019. . Bordeaux : INRA, Résumé, 1 p. Colloque annuel DynaGeV : Dynamique des génomes végétaux. 5, Bordeaux, France, 14 Novembre 2019/15 Novembre 2019.

Distribution in the Musa diversity of two large chromosomal translocations using re-sequencing data. Dupouy Marion, Martin Guillaume, Hervouet Catherine, Salmon Frédéric, Lemainque Arnaud, Baurens Franc-Christophe, D'Hont Angélique. 2018. In : Abstract Book Dynagev 2018. Réseau scientifique DYNAGEV. Rennes : INRA, Résumé, 1 p. Colloque annuel DynaGeV : Dynamique des génomes végétaux, Rennes, France, 21 Juin 2018/22 Juin 2018.

Mosaic genome structure and chromosome segregation in polyploid interspecific plantain bananas and derived breeding accessions [W077]. Baurens Franc-Christophe, Martin Guillaume, Hervouet Catherine, Njembele J. Célestin, Habas Rémy, Salmon Frédéric, Ricci Sebastien, Rouard Mathieu, Yahiaoui Nabila, D'Hont Angélique. 2018. In : Proceedings Plant and Animal Genome XXVI Conference. PAG. San Diego : PAG, Résumé, 1 p. Plant and Animal Genomes Conference. 26, San Diego, États-Unis, 13 Janvier 2018/17 Janvier 2018.

A reference sequence of the monoploid genome of sugarcane. [W950]. Garsmeur Olivier, Droc Gaëtan, Grimwood Jane, Potier Bernard, Aitken Karen S., Jenkins Jerry, Charron Carine, Martin Guillaume, Van der Vossen Edwin, Kilian Andrzej, Berges Hélène, Simmons Blake, Schmutz Jeremy, D'Hont Angélique. 2018. In : Proceedings Plant and Animal Genome XXVI Conference. PAG. San Diego : PAG, Résumé, 1 p. Plant and Animal Genomes Conference. 26, San Diego, États-Unis, 13 Janvier 2018/17 Janvier 2018.

Characterization of two large chromosomal translocations in Musa acuminata ssp. burmannicoides "Calcutta4". Dupouy Marion, Martin Guillaume, Derouault Paco, Hervouet Catherine, Cardi Céline, Salmon Frédéric, Toubi Lyonel, Labadie Karine, Baurens Franc-Christophe, D'Hont Angélique. 2017. In : Abstract Book Dynagev 2017. Réseau scientifique DYNAGEV. Montpellier : INRA, Résumé, 19. Colloque annuel DynaGeV : Dynamique des génomes végétaux. 3, Montpellier, France, 8 Juin 2017/9 Juin 2017.

Evaluation of methodologies for the characterization of plant mosaic genomes. Cottin Aurélien, Penaud Benjamin, Martin Guillaume, Santos Joao, Curk Franck, D'Hont Angélique, Ruiz Manuel, Glaszmann Jean-Christophe, Yahiaoui Nabila, Gautier Mathieu. 2017. In : Abstract Book Dynagev 2017. Réseau scientifique DYNAGEV. Montpellier : INRA, Résumé, 17. Colloque annuel DynaGeV : Dynamique des génomes végétaux. 3, Montpellier, France, 8 Juin 2017/9 Juin 2017.

Evolution of the banana genome is impacted by large chromosomal translocations. Martin Guillaume, Carreel Françoise, Coriton Olivier, Hervouet Catherine, Cardi Céline, Derouault Paco, Roques Danièle, Salmon Frédéric, Rouard Mathieu, Sardos Julie, Labadie Karine, Baurens Franc-Christophe, D'Hont Angélique. 2017. . Montpellier : INRA, Résumé, 1 p. Workshop DynaGeV : Dynamique des Génomes Végétaux. 3, Montpellier, France, 8 Juin 2017/9 Juin 2017.

Evolution of the banana genome is impacted by large chromosomal translocations. Martin Guillaume, Carreel Françoise, Coriton Olivier, Hervouet Catherine, Cardi Céline, Derouault Paco, Roques Danièle, Salmon Frédéric, Rouard Mathieu, Sardos Julie, Labadie Karine, Baurens Franc-Christophe, D'Hont Angélique. 2017. . Giessen : s.n., Résumé, 1 p. International Symposium on Genomics of Plant Genetic Resources (GPGR4). 4, Giessen, Allemagne, 3 Septembre 2017/7 Septembre 2017.

Genome structure and chromosome segregation in triploid interspecific plantain bananas (AAB) and breeding accessions (AAAB). Baurens Franc-Christophe, Martin Guillaume, Rouard Mathieu, Salmon Frédéric, Njembele J. Célestin, Habas Rémy, Ricci Sebastien, D'Hont Angélique. 2017. . Giessen : s.n., Résumé, 1 p. International Symposium on Genomics of Plant Genetic Resources (GPGR4). 4, Giessen, Allemagne, 3 Septembre 2017/7 Septembre 2017.

Large chromosomal structural variations between M. acuminata and M balbisiana and their consequences on chromosome recombination and segregation in a AAAB polyploidy context. Baurens Franc-Christophe, Martin Guillaume, Rouard Mathieu, Salmon Frédéric, Njembele J. Célestin, Habas Rémy, Ricci Sébastien, D'Hont Angélique. 2017. In : Abstract Book Dynagev 2017. Réseau scientifique DYNAGEV. Montpellier : INRA, Résumé, 20. Colloque annuel DynaGeV : Dynamique des génomes végétaux. 3, Montpellier, France, 8 Juin 2017/9 Juin 2017.

The cocoa genome hub, an integrated platform to access the Criollo genome V2. Argout Xavier, Martin Guillaume, Droc Gaëtan. 2017. In : Booklet of abstracts of the first International Symposium on Cocoa Research ISCR 2017. ICCO. Lima : ICCO, Résumé, 214-215. International Symposium on Cocoa Research – ISCR 2017 : Promoting Advances in Research to Enhance the Profitability of Cocoa Farming. 1, Lima, Pérou, 13 Novembre 2017/17 Novembre 2017.

Insight into the mosaic structure of cultivated banana genomes. Martin Guillaume, Cardi Céline, Sarah Gautier, Jourda Cyril, Ricci Sebastien, Jenny Christophe, Perrier Xavier, D'Hont Angélique, Glaszmann Jean-Christophe, Yahiaoui Nabila. 2016. . Paris : INRA, Résumé, 1 p. Workshop DynaGeV : Dynamique des Génomes Végétaux, Paris, France, 7 Juillet 2016/8 Juillet 2016.

Toward a reference sequence of the gene-rich part of the highly polyploid sugarcane genome. [W714]. Garsmeur Olivier, Potier Bernard, Aitken Karen S., Berkman Paul, Droc Gaëtan, Charron Carine, Martin Guillaume, Harrison Bandie, Van der Vossen Edwin, Henry Robert, D'Hont Angélique. 2015. In : Plant and Animal Genomes Conference XXIII Conference, San diego, United States, San Diego, United States, January 10-14, 2015. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genome Conference. 23, San Diego, États-Unis, 10 Janvier 2015/14 Janvier 2015.

Updates on the Musa acuminata reference genome sequence [W074]. D'Hont Angélique, Martin Guillaume, Baurens Franc-Christophe, Droc Gaëtan, Cenci Alberto, Guignon Valentin, Ruas Max, Carreel Françoise, Kilian Andrzej, Aury Jean-Marc, Hastie Alex, Dolezel Jaroslav, Roux Nicolas, Bocs Stéphanie, Rouard Mathieu. 2015. In : Plant and Animal Genomes Conference XXIII Conference, San diego, United States, San Diego, United States, January 10-14, 2015. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genome Conference. 23, San Diego, États-Unis, 10 Janvier 2015/14 Janvier 2015.

Investigating chromosomal structural variations in Musa acuminate using NGS approaches : [W077]. Martin Guillaume, Carreel Françoise, Baurens Franc-Christophe, Cardi Céline, Kilian Andrzej, Rouard Mathieu, Jenny Christophe, D'Hont Angélique. 2014. In : Plant and Animal Genomes Conference XXII Conference, San diego, United States, San Diego, United States, January 11-15, 2014. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genome Conference. 22, San Diego, États-Unis, 11 Janvier 2014/15 Janvier 2014.

Whole genome profiling to generate a core physical map of the gene rich part of the sugarcane genome : [W778]. Garsmeur Olivier, Droc Gaëtan, Woltinge Dennis, Van-Oeveren Jan, Martin Guillaume, Harrison Bandie, Charron Carine, Van der Vossen Edwin, D'Hont Angélique. 2014. In : Plant and Animal Genomes Conference XXII Conference, San diego, United States, San Diego, United States, January 11-15, 2014. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genome Conference. 22, San Diego, États-Unis, 11 Janvier 2014/15 Janvier 2014.

Characterization of large chromosomal structural variations between Musa acuminata sub-species by NGS re-sequencing. Martin Guillaume, Baurens Franc-Christophe, D'Hont Angélique. 2013. In : Polyploïde et cytogénétique, Rennes, France, 16-17 mai 2013. s.l. : s.n., 1 p. Polyploïdie et cytogénétique, Rennes, France, 16 Mai 2013/17 Mai 2013.

Caractérisation des différences de structures chromosomiques dans l'espèce Musa acuminata par re-séquençage ; le cas de l'accession Pahang. Martin Guillaume. 2014. Montpellier : Montpellier SupAgro, 299 p. Thèse de doctorat : Systèmes intégrés en biologie, agronomie, géosciences, hydrosciences, environnement (SIBAGHE). Biologie intégrative des plantes : Montpellier SupAgro Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques