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Article de revue

Coconut genome assembly enables evolutionary analysis of palms and highlights signaling pathways involved in salt tolerance. Yang Yaodong, Bocs Stéphanie, Fan Haikuo, Armero Alix, Baudouin Luc, Xu Pengwei, Xu Junyang, This Dominique, Hamelin Chantal, Iqbal Amjad, Qadri Rashad, Zhou Lixia, Li Jing, Wu Yi, Ma Zilong, Issali Auguste Emmanuel, Rivallan Ronan, Liu Na, Xia Wei, Peng Ming, Xiao Yong. 2021. Communications Biology, 4:105, 14 p.
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Transcriptome data from three endemic Myrtaceae species from New Caledonia displaying contrasting responses to myrtle rust (Austropuccinia psidii). Soewarto Julia, Hamelin Chantal, Bocs Stéphanie, Mournet Pierre, Vignes Hélène, Berger Angélique, Armero Villanueva Alix Augusto, Martin Guillaume, Dereeper Alexis, Sarah Gautier, Carriconde Fabian, Maggia Laurent. 2019. Data in Brief, 22 : 794-811.
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Impact of Austropuccinia psidii in New Caledonia, a biodiversity hotspot. Soewarto Julia, Carriconde Fabian, Hugot N., Bocs Stéphanie, Hamelin Chantal, Maggia Laurent. 2018. Forest Pathology, 48 (2):e12402, 12 p.
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The South Green portal: A comprehensive resource for tropical and Mediterranean crop genomics. Guignon Valentin, Hueber Yann, Rouard Mathieu, Bocs Stéphanie, Couvin David, De Lamotte Frédéric, Droc Gaëtan, Dufayard Jean François, El Hassouni Nordine, Farcy Cédric, Gkanogiannis Anestis, Hamelin Chantal, Larivière Delphine, Martin Guillaume, Ortega Enrique, Pitollat Bertrand, Pointet Stéphanie, Ruiz Manuel, Gautier Sarah, Summo Marilyne, This Dominique, Ravel Sébastien, Larmande Pierre, Monat Cécile, Sabot François, Tando Ndomassi, Tranchant-Dubreuil Christine, Sempere Guilhem, Dereeper Alexis. 2016. Current Plant Biology, 7-8 : 6-9.
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TropGeneDB, the multi-tropical crop information system updated and extended. Hamelin Chantal, Sempere Guilhem, Jouffe Vincent, Ruiz Manuel. 2013. Nucleic Acids Research, 41 (D1), D1172-D1175
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The banana genome hub. Droc Gaëtan, Larivière Delphine, Guignon Valentin, Yahiaoui Nabila, This Dominique, Garsmeur Olivier, Dereeper Alexis, Hamelin Chantal, Argout Xavier, Dufayard Jean-François, Lengellé Juliette, Baurens Franc-Christophe, Cenci Alberto, Pitollat Bertrand, D'Hont Angélique, Ruiz Manuel, Rouard Mathieu, Bocs Stéphanie. 2013. Database, 2013 (bat035), 14 p.
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Genetic diversity and population structure in a european collection of rice. Courtois Brigitte, Frouin Julien, Greco Rafaella, Bruschi Gianluca, Droc Gaëtan, Hamelin Chantal, Ruiz Manuel, Clément Guy, Evrard Jean-Charles, Van Coppenole Sylvie, Katsantonis Dimitrios, Oliveira Margarida, Negrão Sonia, Matos Celina, Cavigiolo Stefano, Lupotto Elisabetta, Piffanelli Pietro, Ahmadi Nourollah. 2012. Crop Science, 52 (4) : 1663-1675.
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Molecular characterization of the European rice collection in view of association mapping. Courtois Brigitte, Greco Rafaella, Bruschi Gianluca, Frouin Julien, Ahmadi Nourollah, Droc Gaëtan, Hamelin Chantal, Ruiz Manuel, Evrard Jean-Charles, Katsantonis Dimitrios, Oliveira Margarida, Negrão Sonia, Cavigiolo Stefano, Lupotto Elisabetta, Piffanelli Pietro. 2011. Plant Genetic Resources, 9 (2) : 233-235.
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Preliminary results on the production of heart of coconut in Vanuatu. Effect of the planting density on the yield. Labouisse Jean-Pierre, Sileye Tiata, Hamelin Chantal, Bonneau Xavier, Rouzière André. 2009. CORD. Coconut Research and Development, 25 (1) : 25-33.
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Rice root genetic architecture: Meta-analysis from a drought QTL database. Courtois Brigitte, Ahmadi Nourollah, Khowaja Farhkanda S., Price Adam H., Rami Jean-François, Frouin Julien, Hamelin Chantal, Ruiz Manuel. 2009. Rice, 2 (2-3) : 115-128.
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New observations on the resistance of coconut cultivars to tropical cyclones in Vanuatu. Labouisse Jean-Pierre, Sileye Tiata, Hamelin Chantal. 2007. CORD. Coconut Research and Development, 23 (2) : 28-38.
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Coconut (Cocos nucifera L.) genetic improvement in Vanuatu : overview of research achievements from 1962 to 2002. Part 2: Improvement of the Vanuatu Tall by hybridization. Labouisse Jean-Pierre, Sileye Tiata, Morin Jean-Paul, Hamelin Chantal, Baudouin Luc, Bourdeix Roland, Rouzière André. 2005. OCL. Oléagineux Corps gras Lipides, 12 (2) : 170-179.
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Coconut (Cocos nucifera L.) genetic improvement in Vanuatu : overview of research achievements form 1962 to 2002. Part 1 : Improvement of the Vanuatu Tall by mass selection. Labouisse Jean-Pierre, Sileye Tiata, Morin Jean-Paul, Hamelin Chantal, Baudouin Luc, Bourdeix Roland, Rouzière André. 2004. OCL. Oléagineux Corps gras Lipides, 11 (4-5) : 354-361.
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COGENT establishes an International Coconut Genetic Resources Database (CGRD). Baudouin Luc, Bourdeix Roland, Bonnot François, Hamelin Chantal, Rouzière André. 2000. COGENT Newsletter (3) : 1-2.

Chapitre d'ouvrage

Data management in genebanks. Chapter 3. Where we need to be to secure diversity and promote use. Bourdeix Roland, Arunachalam Vadivel, Hamelin Chantal, Ruas Max. 2018. In : A global strategy for the conservation and use of coconut genetic resources, 2018-2028. Bourdeix Roland (ed.), Prades Alexia (ed.). Montpellier : Biodiversity International, 164-166. ISBN 978-92-9043-984-4
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Local genebank management systems. Chapter 2. Where we are today. Bourdeix Roland, Arunachalam Vadivel, Hamelin Chantal. 2018. In : A global strategy for the conservation and use of coconut genetic resources, 2018-2028. Bourdeix Roland (ed.), Prades Alexia (ed.). Montpellier : Biodiversity International, 68-69. ISBN 978-92-9043-984-4
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Managing international coconut databases. Chapter 2. Where we are today. Ruas Max, Hamelin Chantal, Bourdeix Roland. 2018. In : A global strategy for the conservation and use of coconut genetic resources, 2018-2028. Bourdeix Roland (ed.), Prades Alexia (ed.). Montpellier : Biodiversity International, 69-71. ISBN 978-92-9043-984-4
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Using TropGeneDB: a database containing data on molecular markers, QTLs, maps, genotypes, and phenotypes for tropical crops. Ruiz Manuel, Sempere Guilhem, Hamelin Chantal. 2017. In : Plant genomics databases: methods and protocols. Van Dijk Aalt D.J. (ed.). New York : Springer [Etats-Unis], 161-172. (Methods in Molecular Biology, 1533) ISBN 978-1-4939-6656-1
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The international coconut genetic resources database. Hamelin Chantal, Bourdeix Roland, Baudouin Luc. 2005. In : Coconut genetic resources. Batugal Pons (ed.), Ramanatha Rao V. (ed.), Oliver Jeffrey T. (ed.). IPGRI, COGENT. Rome : IPGRI, 427-438. ISBN 92-9043-629-8
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Communication invitée

The South Green Bioinformatics platform, a comprehensive resource for crop genomics. Ruiz Manuel, Dereeper Alexis, Droc Gaëtan, Sarah Gautier, Tranchant-Dubreuil Christine, Dufayard Jean François, Guignon Valentin, Hamelin Chantal, De Lamotte Frédéric, Larmande Pierre, Sabot François, Sempere Guilhem, Summo Marilyne, Pitollat Bertrand, This Dominique, Bocs Stéphanie, Hueber Yann, El Hassouni Nordine, Martin Guillaume, Gkanogiannis Anestis, Ravel Sébastien, Monat Cécile, Tando Ndomassi, Rouard Mathieu. 2017. In : Proceedings X-Meeting 2017. s.l. : s.n., 1 p. International Conference of the AB3. 13, São Pedro, Brésil, 4 Octobre 2017/6 Octobre 2017.
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Communication avec actes

South Green, une plateforme de bioinformatique tournée vers l'agriculture dans les pays du sud. Ravel Sébastien, Bocs Stéphanie, Brousseau Louise, De Lamotte Frédéric, Dereeper Alexis, Droc Gaëtan, Dufayard Jean François, Guignon Valentin, Hamelin Chantal, Larmande Pierre, Mahé Frédéric, Martin Guillaume, Orjuela-Bouniol Julie, Pitollat Bertrand, Rouard Mathieu, Ruiz Manuel, Sabot François, Sarah Gautier, Sempere Guilhem, Summo Marilyne, Tando Ndomassi, Tranchant-Dubreuil Christine. 2018. In : JOBIM 2018 Abstracts. SFBI, GdR BiM, IFB, AMU, INSERM, CNRS. Marseille : SFBI, 418-420. Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM 2018), Marseille, 3 Juillet 2018/6 Juillet 2018.
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South Green bioinformatics platform: Update 2015. Armero A., Baurens Franc-Christophe, Bocs Stéphanie, Breil A., De Lamotte Frédéric, Dereeper Alexis, Droc Gaëtan, Dufayard Jean François, El Hassouni Nordine, Farcy Cédric, Garsmeur Olivier, Guignon Valentin, Hamelin Chantal, Hueber Yann, Kougbeadjo Ayite, Larivière Delphine, Larmande Pierre, Lorenzo Jonathan, Martin Guillaume, Monat Cécile, Ndomassi T., Ortega Abboud Enrique, Pitollat Bertrand, Ravel Sébastien, Ranwez Vincent, Rouard Mathieu, Ruiz E., Sabot François, Sarah Gautier, Sempere Guilhem, Summo Marilyne, This Dominique, Tranchant-Dubreuil Christine, Vallier Félix. 2015. In : Plant Genomics Congress. Global Engage. Londres : Global Engage, 51. Plant Genomics Congress. 3, Londres, Royaume-Uni, 11 Mai 2015/12 Mai 2015.
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Collection and ex situ conservation of coffee landraces in Ethiopia. The example of Harerge. Labouisse Jean-Pierre, Bellachew Bayetta, Hamelin Chantal, Kotecha Surendra, Bertrand Benoît. 2007. In : 21st International Conference on Coffee Science, Montpellier (France), 11th - 15th September 2006 = 21ème Colloque scientifique international sur le café ; 21. Internationales Wissenshaftliches Kolloquium über Kaffee ; 21e Coloquio Cientifico Internacional sobre el Café. ASIC. Montpellier : ASIC, 926-930. ISBN 2-900212-20-0 Colloque Scientifique International sur le Café. 21, Montpellier, France, 11 Septembre 2006/15 Septembre 2006.
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Communication par affiche

The South Green Genome Hubs. Droc Gaëtan, Argout Xavier, Bocs Stéphanie, Comte Aurore, Dereeper Alexis, Dufayard Jean François, Garsmeur Olivier, Gkanogiannis Anestis, Guignon Valentin, Hamelin Chantal, Lopez David, Oubda Nicolas, Martin Guillaume, Ravel Sébastien, Ruiz Manuel, Summo Marilyne, Thomas Coline, Tranchant-Dubreuil Christine, Rouard Mathieu. 2020. . SFBI, IFB, GDR-BIM. Montpellier : SFBI, 1 p. Journées ouvertes de biologie, informatique et mathématique (JOBIM 2020), Montpellier, France, 30 Juin 2020/3 Juillet 2020.
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South Green bioinformatic resources for tropical and Mediterranean crops. Rouard Mathieu, Bocs Stéphanie, Breton Catherine, Comte Aurore, De Lamotte Frédéric, Dereeper Alexis, Droc Gaëtan, Dufayard Jean François, Guignon Valentin, Hamelin Chantal, Larmande Pierre, Lopez David, Mahé Frédéric, Martin Guillaume, Orjuela-Bouniol Julie, Pitollat Bertrand, Ravel Sébastien, Ruiz Manuel, Sabot François, Sarah Gautier, Sempere Guilhem, Summo Marilyne, Tando Ndomassi, Tranchant-Dubreuil Christine. 2020. . SFBI, IFB, GDR-BIM. Montpellier : SFBI, 1 p. Journées ouvertes de biologie, informatique et mathématique (JOBIM 2020). 20, Montpellier, France, 30 Juin 2020/3 Juillet 2020.
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South Green bioinformatics platform : Plateforme collaborative de bioinformatique verte héraultaise. Bocs Stéphanie, Couvin David, De Lamotte Frédéric, Dereeper Alexis, Droc Gaëtan, Dufayard Jean François, El Hassouni Nordine, Farcy Cédric, Gkanogiannis Anestis, Guignon Valentin, Hamelin Chantal, Hueber Yann, Larivière Delphine, Larmande Pierre, Martin Guillaume, Monat Cécile, Ortega Abboud Enrique, Pitollat Bertrand, Pointet Stéphanie, Ravel Sébastien, Rouard Mathieu, This Patrice, Tranchant-Dubreuil Christine. 2017. . Montpellier : CIRAD, 1 poster Amphithéâtre "Patrimoine Numérique Scientifique", Montpellier, France, 20 Février 2017/20 Février 2017.
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Banana genome hub. Droc Gaëtan, Larivière Delphine, Guignon Valentin, Yahiaoui Nabila, This Dominique, Garsmeur Olivier, Dereeper Alexis, Hamelin Chantal, Argout Xavier, Dufayard Jean-François, Lengellé Juliette, Baurens Franc-Christophe, Cenci Alberto, Pitollat Bertrand, D'Hont Angélique, Ruiz Manuel, Rouard Mathieu, Bocs Stéphanie. 2013. In : 6th International Biocuration Conference, Cambridge, Royaume-Uni, april 07-10 2013. s.l. : s.n., 1 p. International Biocuration Conference. 6, Cambridge, Royaume-Uni, 7 Avril 2013/10 Avril 2013.
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Rice drought tolerance QTLs: Meta-analysis improves resolution to a few candidate gene level. Courtois Brigitte, Ahmadi Nourollah, Khowaja Farhkanda S., Price Adam H., Rami Jean-François, Frouin Julien, Hamelin Chantal, Ruiz Manuel. 2009. In : 6th International Rice Genetics Symposium, Manila, Philippines, 06-19 November 2009. s.l. : s.n., 1 p. International Rice Genetics Symposium. 6, Manille, Philippines, 6 Novembre 2009/19 Novembre 2009.
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TropGENE-DB, a multi-tropical crop information system. Poster 14. Hamelin Chantal, Ruiz Manuel, Argout Xavier. 2007. In : 4th International Workshop on Data Integration in the Life Sciences : poster abstracts. s.l. : s.n., Résumé, 17. International Workshop on Data Integration in the Life Science. 4, Philadelphia, États-Unis, 27 Juin 2007/29 Juin 2007.
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Communication sans actes

The Banana Genome Hub : [W079]. Droc Gaëtan, Larivière Delphine, Guignon Valentin, Yahiaoui Nabila, This Dominique, Garsmeur Olivier, Dereeper Alexis, Hamelin Chantal, Argout Xavier, Dufayard Jean-François, Lengellé Juliette, Baurens Franc-Christophe, Cenci Alberto, Pitollat Bertrand, D'Hont Angélique, Ruiz Manuel, Rouard Mathieu, Bocs Stéphanie. 2014. In : Plant and Animal Genomes Conference XXII Conference, San diego, United States, San Diego, United States, January 11-15, 2014. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genome Conference. 22, San Diego, États-Unis, 11 Janvier 2014/15 Janvier 2014.
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The south green bioinformatics platform : [P988]. Rouard Mathieu, Dereeper Alexis, Droc Gaëtan, Sarah Gautier, Dufayard Jean-François, Guignon Valentin, Hamelin Chantal, Homa Félix, De Lamotte Frédéric, Larmande Pierre, Larivière Delphine, Sabot François, Sempere Guilhem, Summo Marilyne, Pitollat Bertrand, Pointet Stéphanie, This Dominique, Bocs Stéphanie, Ruiz Manuel. 2014. In : Plant and Animal Genomes Conference XXII Conference, San diego, United States, San Diego, United States, January 11-15, 2014. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genome Conference. 22, San Diego, États-Unis, 11 Janvier 2014/15 Janvier 2014.
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Molecular marker redundancy check and construction of a high density genetic map of tetraploid cotton. Lacape Jean-Marc, Fang David D., Luo Feng, Hamelin Chantal, Droc Gaëtan, Rami Jean-François, Garsmeur Olivier, Blenda Anna. 2012. In : International Cotton Genome Initiative Research Conference (ICGI 2010), Raleigh, USA, 9-12 October 2012. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. International Cotton Genome Initiative Research Conference, Raleigh, États-Unis, 9 Octobre 2012/12 Octobre 2012.
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Towards a bioinformatics platform for the Musa research community : [Abstract W076]. Rouard Mathieu, Argout Xavier, Bocs Stéphanie, Conte Matthieu, Droc Gaëtan, Guignon Valentin, Hamelin Chantal, Roux Nicolas, Ruiz Manuel. 2010. In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XVIIIth Conference, San Diego, CA (USA), January 09-13, 2010. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genomes Conference. 18, San Diego, États-Unis, 9 Janvier 2010/13 Janvier 2010.
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Meta-analysis of QTLs involved in rice root development using a QTL database. Ahmadi Nourollah, Courtois Brigitte, Khowaja Farhkanda S., Perice A., Frouin Julien, Hamelin Chantal, Ruiz Manuel. 2007. In : International Symposium Root Biology and MAS Strategies for Drought Resistance Imporvement in Rice, Bangalore, India, September 26-29, 2007. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. International Symposium Root Biology and MAS Strategies for Drought Resistance Imporvement in Rice, Bangalore, Inde, 26 Septembre 2007/29 Septembre 2007.
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The international coconut genetic resources database: rationale, progress, constraints and plans for the short and long term. Bourdeix Roland, Baudouin Luc, Bonnot François, Hamelin Chantal. 1998. In : ADB-COGENT Meeting, Kuala Lumpur, Malaysia, October, 28-30, 1998. s.l. : s.n., 9 p. ADB-COGENT meeting, Kuala Lumpur, Malaisie, 28 Octobre 1998/30 Octobre 1998.

Rapport d'expertise

Upgrading international coconut genebanks and evaluating accessions. Terminal Report. (01/11/2011 – 30/05/2012). Bourdeix Roland, Ruas Max, Hamelin Chantal, Johnson Vincent, Martinez Dominique, Sepulveda R.. 2012. Montpellier : Biodiversity International-CIRAD, 34 p.
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Document technique et de recherche

Rundown of CIRAD activities in connection with the CGRD database. Baudouin Luc, Bonnot François, Bourdeix Roland, Hamelin Chantal, Labouisse Jean-Pierre, Rouzière André. 2000. Montpellier : CIRAD-CP, 47 p. N° de rapport : CP_SIC 1208

Activity report 1996. Coconut Genetic Resources Database. Baudouin Luc, Bonnot François, Hamelin Chantal. 1997. Montpellier : CIRAD-CP, 72 p.

Rapport de mission

Rapport de mission au CNRA Côte d'Ivoire, station d'Adiopodoumé du 4 au 14/10/2004. Hamelin Chantal. 2004. Montpellier : CIRAD-CP, 15 p. N° de rapport : CP_SIC 1764

Rapport de mission au Cameroun du 12 au 19 mars 2001 pour le projet FAc recherche - filière hévéa (NRRP / IRAD-Ekona). Hamelin Chantal. 2001. Montpellier : CIRAD-CP, 29 p. N° de rapport : CP_SIC 1341
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