Résultats pour Auteur : "De Lamotte, Frédéric"

RapGreen, an interactive software and web package to explore and analyze phylogenetic trees. Dufayard Jean François, Bocs Stéphanie, Guignon Valentin, Larivière Delphine, Louis Alexandra, Oubda Nicolas, Rouard Mathieu, Ruiz Manuel, De Lamotte Frédéric. 2021. NAR Genomics and Bioinformatics, 3 (3):lqab088, 6 p.

Comprehensive classification of the plant non-specific lipid transfer protein superfamily towards its sequence–structure–function analysis. Fleury Cécile, Gracy Jérôme, Gautier Marie-Françoise, Pons Jean-Luc, Dufayard Jean François, Labesse Gilles, Ruiz Manuel, De Lamotte Frédéric. 2019. PeerJ, 7:e7504, 34 p.

The South Green portal: A comprehensive resource for tropical and Mediterranean crop genomics. Guignon Valentin, Hueber Yann, Rouard Mathieu, Bocs Stéphanie, Couvin David, De Lamotte Frédéric, Droc Gaëtan, Dufayard Jean François, El Hassouni Nordine, Farcy Cédric, Gkanogiannis Anestis, Hamelin Chantal, Larivière Delphine, Martin Guillaume, Ortega Enrique, Pitollat Bertrand, Pointet Stéphanie, Ruiz Manuel, Gautier Sarah, Summo Marilyne, This Dominique, Ravel Sébastien, Larmande Pierre, Monat Cécile, Sabot François, Tando Ndomassi, Tranchant-Dubreuil Christine, Sempere Guilhem, Dereeper Alexis. 2016. Current Plant Biology, 7-8 : 6-9.

Lipid transfer proteins in coffee: isolation of Coffea orthologs, Coffea arabica homeologs, expression during coffee fruit development and promoter analysis in transgenic tobacco plants. Cotta Michelle G., Barros Leila M.G., De Almeida Juliana D., De Lamotte Frédéric, Barbosa Eder A., Vieira Natalia Gomes, Alves Gabriel Sergio Costa, Vinecky Felipe, Andrade Alan Carvalho, Marraccini Pierre. 2014. Plant Molecular Biology, 85 (1-2) : 11-31.

Positional cloning of the rice male sterility gene ms-IR36, widely used in the inter-crossing phase of recurrent selection schemes. Frouin Julien, Filloux Denis, Taillebois James E., Grenier Cécile, Montes Fabienne, De Lamotte Frédéric, Verdeil Jean-Luc, Courtois Brigitte, Ahmadi Nourollah. 2014. Molecular Breeding, 33 (3) : 555-567.

Clever generation of rich SPARQL queries from annotated relational schema: Application to Semantic Web Service creation for biological databases. Wollbrett Julien, Larmande Pierre, De Lamotte Frédéric, Ruiz Manuel. 2013. BMC Bioinformatics, 14 (126), 15 p.

Insight into the biology, genetics and evolution of the Centella asiatica polyploid complex in Madagascar. Rakotondralambo Raoseta Soaharin'my Ony, Rodier-Goud Marguerite, Rivallan Ronan, Lussert Alexandra, Danthu Pascal, De Lamotte Frédéric, Ralambofetra Eliane, Ramavovololona Perle, Noyer Jean-Louis, Baurens Franc-Christophe. 2013. Industrial Crops and Products, 47 : 118-125.

Characterization of a cassiicolin-encoding gene from Corynespora cassiicola, pathogen of rubber tree (Hevea brasiliensis). Déon Marine, Bourre Yanice, Gimenez Stéphanie, Berger Angélique, Bieysse Daniel, De Lamotte Frédéric, Poncet Joël, Roussel Véronique, Bonnot François, Oliver Gérald, Franchel Jérôme, Seguin Marc, Leroy Thierry, Roeckel-Drevet Patricia, Pujade-Renaud Valérie. 2012. Plant Science, 185-186 : 227-237.

Single-chain variable fragments antibody specific to Corynespora cassiicola toxin, cassiicolin, reduces necrotic lesion formation in Hevea brasiliensis. Sunderasan E., Kadir Rusni A., Pujade-Renaud Valérie, De Lamotte Frédéric, Yeang Hoong Yeet, Nathan Sheila. 2009. Journal of General Plant Pathology, 75 : 19-26.

Purification and characterization of cassiicolin, the toxin produced by Corynespora cassiicola, causal agent of the leaf fall disease of rubber tree. De Lamotte Frédéric, Duviau Marie-Pierre, Sanier Christine, Thai Robert, Poncet Joël, Bieysse Daniel, Breton Frédéric, Pujade-Renaud Valérie. 2007. Journal of Chromatography. B (849) : 357-362.

Structural analysis of cassiicolin, a host-selective protein toxin from Corynespora cassiicola. Barthe Philippe, Pujade-Renaud Valérie, Breton Frédéric, Gargani Daniel, Thai Robert, Roumestand Christian, De Lamotte Frédéric. 2007. Journal of Molecular Biology, 367 : 89-101.

The South Green Bioinformatics platform, a comprehensive resource for crop genomics. Ruiz Manuel, Dereeper Alexis, Droc Gaëtan, Sarah Gautier, Tranchant-Dubreuil Christine, Dufayard Jean François, Guignon Valentin, Hamelin Chantal, De Lamotte Frédéric, Larmande Pierre, Sabot François, Sempere Guilhem, Summo Marilyne, Pitollat Bertrand, This Dominique, Bocs Stéphanie, Hueber Yann, El Hassouni Nordine, Martin Guillaume, Gkanogiannis Anestis, Ravel Sébastien, Monat Cécile, Tando Ndomassi, Rouard Mathieu. 2017. In : Proceedings X-Meeting 2017. s.l. : s.n., 1 p. International Conference of the AB3. 13, São Pedro, Brésil, 4 Octobre 2017/6 Octobre 2017.

South Green, une plateforme de bioinformatique tournée vers l'agriculture dans les pays du sud. Ravel Sébastien, Bocs Stéphanie, Brousseau Louise, De Lamotte Frédéric, Dereeper Alexis, Droc Gaëtan, Dufayard Jean François, Guignon Valentin, Hamelin Chantal, Larmande Pierre, Mahé Frédéric, Martin Guillaume, Orjuela-Bouniol Julie, Pitollat Bertrand, Rouard Mathieu, Ruiz Manuel, Sabot François, Sarah Gautier, Sempere Guilhem, Summo Marilyne, Tando Ndomassi, Tranchant-Dubreuil Christine. 2018. In : JOBIM 2018 Abstracts. SFBI, GdR BiM, IFB, AMU, INSERM, CNRS. Marseille : SFBI, 418-420. Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM 2018), Marseille, 3 Juillet 2018/6 Juillet 2018.

South Green bioinformatics platform: Update 2015. Armero A., Baurens Franc-Christophe, Bocs Stéphanie, Breil A., De Lamotte Frédéric, Dereeper Alexis, Droc Gaëtan, Dufayard Jean François, El Hassouni Nordine, Farcy Cédric, Garsmeur Olivier, Guignon Valentin, Hamelin Chantal, Hueber Yann, Kougbeadjo Ayite, Larivière Delphine, Larmande Pierre, Lorenzo Jonathan, Martin Guillaume, Monat Cécile, Ndomassi T., Ortega Abboud Enrique, Pitollat Bertrand, Ravel Sébastien, Ranwez Vincent, Rouard Mathieu, Ruiz E., Sabot François, Sarah Gautier, Sempere Guilhem, Summo Marilyne, This Dominique, Tranchant-Dubreuil Christine, Vallier Félix. 2015. In : Plant Genomics Congress. Global Engage. Londres : Global Engage, 51. Plant Genomics Congress. 3, Londres, Royaume-Uni, 11 Mai 2015/12 Mai 2015.

South Green bioinformatic resources for tropical and Mediterranean crops. Rouard Mathieu, Bocs Stéphanie, Breton Catherine, Comte Aurore, De Lamotte Frédéric, Dereeper Alexis, Droc Gaëtan, Dufayard Jean François, Guignon Valentin, Hamelin Chantal, Larmande Pierre, Lopez David, Mahé Frédéric, Martin Guillaume, Orjuela-Bouniol Julie, Pitollat Bertrand, Ravel Sébastien, Ruiz Manuel, Sabot François, Sarah Gautier, Sempere Guilhem, Summo Marilyne, Tando Ndomassi, Tranchant-Dubreuil Christine. 2020. . SFBI, IFB, GDR-BIM. Montpellier : SFBI, 1 p. Journées ouvertes de biologie, informatique et mathématique (JOBIM 2020). 20, Montpellier, France, 30 Juin 2020/3 Juillet 2020.

IRODS Faciliter la gestion des grands jeux de données. Un eplateforme pour étiqueter-trouver-partager. De Lamotte Frédéric, Pitollat Bertrand. 2017. . Montpellier : CIRAD, 1 poster Amphithéâtre "Patrimoine Numérique Scientifique", Montpellier, France, 20 Février 2017/20 Février 2017.

South Green bioinformatics platform : Plateforme collaborative de bioinformatique verte héraultaise. Bocs Stéphanie, Couvin David, De Lamotte Frédéric, Dereeper Alexis, Droc Gaëtan, Dufayard Jean François, El Hassouni Nordine, Farcy Cédric, Gkanogiannis Anestis, Guignon Valentin, Hamelin Chantal, Hueber Yann, Larivière Delphine, Larmande Pierre, Martin Guillaume, Monat Cécile, Ortega Abboud Enrique, Pitollat Bertrand, Pointet Stéphanie, Ravel Sébastien, Rouard Mathieu, This Patrice, Tranchant-Dubreuil Christine. 2017. . Montpellier : CIRAD, 1 poster Amphithéâtre "Patrimoine Numérique Scientifique", Montpellier, France, 20 Février 2017/20 Février 2017.

MS-DMind : multiscale data "minding" for molecular process related to biotic and abiotic stresses: pilot study with the nsLTP superfamily of proteins. Genomique Edition 2008. Ruiz Manuel, Fleury Cécile, De Lamotte Frédéric, Gautier Marie-Françoise, Dufayard Jean-François, Molina Franck. 2012. In : Plant Genomics Seminar, Pont Royal, France, 3-5 avril 2012. s.l. : s.n., 1 p. Plant Genomics Seminar, Pont Royal en Provence, France, 3 Avril 2012/5 Avril 2012.

Rôle de l'amidon synthétase IV chez le riz. Charton Sophie, Serret Julien, Geneix Nathalie, Bouchet B., Gautier Marie-Françoise, De Lamotte Frédéric, Guiderdoni Emmanuel, Planchot Véronique. 2011. In : 3ème Colloque national du réseau français de biologie des graines : Graines 2011, Nantes, France, 27-28 Octobre, 2011. s.l. : s.n., 1 p. Colloque national du réseau français de biologie des graines. 3, Nantes, France, 27 Mars 2011/28 Mars 2011.

Structure-based classification of the plant non-specific lipid transfer protein superfamily towards its functional characterization. Fleury Cécile, Gautier Marie-Françoise, Dufayard Jean-François, Molina Franck, Ruiz Manuel, De Lamotte Frédéric. 2011. In : 10 th European Conference on Computational Biology (ISMB. ECCB 2011), 17-19 july 2011, Vienna, Austria. s.l. : s.n., 1 p. European conference on computational biology. 10, Vienne, Autriche, 17 Juillet 2011/19 Juillet 2011.

Towards a multi-scale and formalized representation of protein sequence-structure-function relationships: The nsLTP family as a case of study. Fleury Cécile, Gautier Marie-Françoise, Larmande Pierre, Pérès Sabine, De Lamotte Frédéric, Molina Franck, Ruiz Manuel. 2010. In : Journées ouvertes biologie informatique mathématique (JOBIM), Montpellier, France, 07-09 septembre 2010. s.l. : s.n., 1 p. Journées ouvertes biologie informatique mathématique, Montpellier, France, 7 Septembre 2010/9 Septembre 2010.

Détermination structurale de la cassiicoline, la toxine glycosylée de Corynespora cassiicola. Barthe Philippe, Pujade-Renaud Valérie, Duviau Marie-Pierre, De Lamotte Frédéric, Roumestand Christian. 2007. In : Congrès du GERM 2007, Alénya, France, 25-30 mars 2007. GERM, INRA, CIRAD, CBS. s.l. : s.n., 1 p. Congrès du GERM 2007. 20, Alénya, France, 25 Mars 2007/30 Mars 2007.

Purification et analyse de structure de la Cassiicoline, déterminant majeur de la pathogénicité de Corynespora cassicola chez l'hévéa. Sanier Christine, Duviau Marie-Pierre, Breton Frédéric, Barthe P., Poncet Joël, Roumestand Christian, De Lamotte Frédéric, Pujade-Renaud Valérie. 2006. In : Journées Jean Chevaugeon : VIe rencontres de phytopathologie - mycologie de la Societé française de phytopathologie du 15 au 19 janvier 2006 [Résumés]. Fernandez Diana (ed.), Carlier Jean (ed.), Tharreau Didier (ed.). CIRAD, INRA, IRD, Bayer cropscience, SFP. Montpellier : CIRAD, Résumé, 113. Journées Jean Chevaugeon, Rencontres de phytopathologie-mycologie. 6, Aussois, France, 15 Janvier 2006/19 Janvier 2006.

La cassiicoline et le pouvoir pathogène de Corynespora cassiicola ; vers la mise en oeuvre d'un test toxinique pour la sélection d'individus tolérants à C. cassiicola chez Hevea brasiliensis. Déon Marine, Tran Dinh Minh, Fumanal Boris, Gimenez Stéphanie, Bieysse Daniel, Oliveira Ricardo R., Breton Frédéric, Clément-Demange André, De Lamotte Frédéric, Seguin Marc, Leroy Thierry, Roeckel-Drevet Patricia, Pujade-Renaud Valérie. 2014. In : Journées Jean Chevaugeon 2014 : résumés des présentations orales. SFP, INRA, CIRAD, Bayer. Paris : SFP, Résumé, 1 p. Journées Jean Chevaugeon, Rencontres de phytopathologie-mycologie. 10, Aussois, France, 27 Janvier 2014/31 Janvier 2014.

Test de sensibilité de variétés clonales d'hévéa aux toxines secrétées par le champignon Corynespora cassiicola. Déon Marine, Tran Dinh Minh, Clément-Demange André, Bieysse Daniel, Oliveira Ricardo R., Breton Frédéric, Massey Stéphanie, De Lamotte Frédéric, Clément-Vidal Anne, Seguin Marc, Pujade-Renaud Valérie. 2014. In : Journées Jean Chevaugeon 2014 : résumés des présentations orales. SFP, INRA, CIRAD, Bayer. Paris : SFP, Résumé, 1 p. Journées Jean Chevaugeon, Rencontres de phytopathologie-mycologie. 10, Aussois, France, 27 Janvier 2014/31 Janvier 2014.

The south green bioinformatics platform : [P988]. Rouard Mathieu, Dereeper Alexis, Droc Gaëtan, Sarah Gautier, Dufayard Jean-François, Guignon Valentin, Hamelin Chantal, Homa Félix, De Lamotte Frédéric, Larmande Pierre, Larivière Delphine, Sabot François, Sempere Guilhem, Summo Marilyne, Pitollat Bertrand, Pointet Stéphanie, This Dominique, Bocs Stéphanie, Ruiz Manuel. 2014. In : Plant and Animal Genomes Conference XXII Conference, San diego, United States, San Diego, United States, January 11-15, 2014. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genome Conference. 22, San Diego, États-Unis, 11 Janvier 2014/15 Janvier 2014.

Déploiement d'une approche métrologique au sein d'une unité de recherche française, Cirad, France. Carasco-Lacombe Catherine, Vignes Hélène, Rivallan Ronan, Mournet Pierre, Turquay Patricia, Carbonneill Philippe, Maghnaoui Najate, Calchera Gilles, De Lamotte Frédéric. 2012. . Marrakech : s.n., Résumé, 1 p. International Metrology Conference CAFMET 2012, Marrakech, Maroc, 23 Avril 2012/27 Avril 2012.

Qualitative comparison of cassiicolin in four strains of Corynespora cassiicola. Pujade-Renaud Valérie, Bourre Yanice, De Lamotte Frédéric, Poncet Julie, Bieysse Daniel. 2008. In : IRRDB Natural Rubber Conference, Kuala Lumpur, Malaysia, 13-14 October 2008. IRRDB. s.l. : s.n., 9 p. IRRDB Natural Rubber Conference, Kuala Lumpur, Malaisie, 13 Octobre 2008/14 Octobre 2008.

Fungal phytotoxins ; story-case of cassiicolin, a new proteinaceous host-selective toxin from Corynespora cassiicola. Pujade-Renaud Valérie, De Lamotte Frédéric, Barthe Philippe, Roumestand Christian. 2007. In : 40th Brazilian phytopathological society meeting, Maringa, Brésil, 13-17 August 2007. Brazilian Phytopathological Society. s.l. : s.n., 7 p. Brazilian phytopahological society meeting. 40, Maringa, Brésil, 13 Août 2007/17 Août 2007.

Purification and structure analysis of Cassiicolin, primary determinant of Corynespora cassiicola pathogenesis on rubber tree. Sanier Christine, Duviau Marie-Pierre, Breton Frédéric, Barthe Philippe, Poncet Joël, Roumestand Christian, De Lamotte Frédéric, Pujade-Renaud Valérie. 2005. In : 12th International Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions, Mérida, Mexico, 14-19 december 2005. IS-MPMI. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. International Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions. 12, Mérida, Mexique, 14 Décembre 2005/19 Décembre 2005.

Libérez la science, un jeu FAIR-play, série Gestion des données. Boussou Cécile, Deboin Marie-Claude, Dedieu Laurence, Auzoux Sandrine, De Lamotte Frédéric, Barthelemy Céline, Doux Gwenaël. 2022. Montpellier : CIRAD, 40 p.

Support de la formation au Plan de Gestion des Données (PGD). Version 3. Corbiere Pauline, Dedieu Laurence, De Lamotte Frédéric. 2020. Montpellier : CIRAD, diaporama (277 vues)