Résultats pour Auteur : "Jacques, Marie Agnès"

Building integrated plant health surveillance: A proactive research agenda for anticipating and mitigating disease and pest emergence. Soubeyrand Samuel, Estoup Arnaud, Cruaud Astrid, Malembic-Maher S., Meynard Charles, Ravigne Virginie, Barbier M., Barrès Benoit, Berthier Karine, Boitard S., Dallot Sylvie, Gaba Sabrina, Grosdidier Marie, Hannachi Mourad, Jacques Marie Agnès, Leclerc M., Lucas P., Martinetti D., Mougel Christophe, Robert Corinne, Roques Alain, Rossi Jean-Pierre, Suffert Frédéric, Abad Pierre, Auger-Rozenberg M.A., Ay Jean-Sauveur, Bardin Marc, Bernard H., Bohan David A., Candresse Thierry, Castagnone-Sereno Philippe, Danchin Etienne G. J., Delmas Chloé E. L., Ezanno Pauline, Fabre Frédéric, Facon Benoît, Gabriel E., Gaudin Jacqueline, Gauffre Bertrand, Gautier Mathieu, Guinat Claire, Lavigne Claire, Lemaire Olivier, Martinez C., Michel L., Moury Benoit, Nam Kiwoong, Nédellec Claire, Ogliastro Mylène, Papaïx Julien, Parisey N., Poggi Sylvain, Radici A., Rasplus Jean-Yves, Reboud Xavier, Robin C., Roche Mathieu, Rusch Adrien, Sauvion Nicolas, Streito Jean-Claude, Verdin Eric, Walker Anne Sophie, Xuereb Anne, Thébaud Gaël, Morris Cindy E.. 2024. CABI Agriculture and Bioscience, 5:72, 29 p.

Celebrating the 20th anniversary of the first Xanthomonas genome sequences - how genomics revolutionized taxonomy, provided insight into the emergence of pathogenic bacteria, enabled new fundamental discoveries and helped developing novel control measures - a perspective from the French network on Xanthomonads. Koebnik Ralf, Cesbron Sophie, Chen Nicolas W.G., Fischer-Le Saux Marion, Hutin Mathilde, Jacques Marie Agnès, Noel Laurent D., Pérez-Quintero Alvaro L., Portier Perrine, Pruvost Olivier, Rieux Adrien, Szurek Boris. 2024. Peer Community Journal, 4:e19, 22 p.

Comparative transcriptomics reveals a highly polymorphic Xanthomonas HrpG virulence regulon. Monnens Thomas Quiroz, Roux Brice, Cunnac Sébastien, Charbit Erika, Carrère Sébastien, Lauber Emmanuelle, Jardinaud Marie-Françoise, Darrasse Armelle, Arlat Mathieu, Szurek Boris, Pruvost Olivier, Jacques Marie Agnès, Gagnevin Lionel, Koebnik Ralf, Noel Laurent D., Boulanger Alice. 2024. BMC Genomics, 25:777, 17 p.

Suspicions of two bridgehead invasions of Xylella fastidiosa subsp. multiplex in France. Dupas Enora, Durand Karine, Rieux Adrien, Briand Martial, Pruvost Olivier, Cunty Amandine, Denancé Nicolas, Donnadieu Cecile, Legendre Bruno, Lopez-Roques Céline, Cesbron Sophie, Ravigné Virginie, Jacques Marie Agnès. 2023. Communications Biology, 6:103, 13 p.

Trends in molecular diagnosis and diversity studies for phytosanitary regulated Xanthomonas. Catara Vittoria, Cubero Jaime, Pothier Joël F., Bosis Eran, Bragard Claude, Dermic̓ Edyta, Holeva Maria C., Jacques Marie Agnès, Petter Françoise, Pruvost Olivier, Robene Isabelle, Studholme David J., Tavares Fernando, Vicente Joana G., Koebnik Ralf, Costa Joana. 2021. Microorganisms, 9 (4), n.spéc. Integrating Science on Xanthomonas and Xylella for Integrated Plant Disease Management:862, 30 p.

Horizontal gene transfer plays a major role in the pathological convergence of Xanthomonas lineages on common bean. Chen Nicolas W.G., Serres-Giardi Laurana, Ruh Mylène, Briand Martial, Bonneau Sophie, Darrasse Armelle, Barbe Valérie, Gagnevin Lionel, Koebnik Ralf, Jacques Marie Agnès. 2018. BMC Genomics, 19:606, 20 p.

High-quality draft genome sequences of two Xanthomonas pathotype strains infecting aroid plants. Robène Isabelle, Bolot Stéphanie, Pruvost Olivier, Arlat Mathieu, Noel Laurent D., Carrère Sébastien, Jacques Marie Agnès, Koebnik Ralf, Gagnevin Lionel. 2016. Genome Announcements, 4 (5):e00902-16, 2 p.

Using ecology, physiology, and genomics to understand host specificity in Xanthomonas. Jacques Marie Agnès, Arlat Mathieu, Boulanger Alice, Boureau Tristan, Carrère Sébastien, Cesbron Sophie, Chen Nicolas W.G., Cociancich Stéphane, Darrasse Armelle, Denancé Nicolas, Fischer-Le-Caux Marion, Gagnevin Lionel, Koebnik Ralf, Lauber Emmanuelle, Noel Laurent D., Pieretti Isabelle, Portier Perrine, Pruvost Olivier, Rieux Adrien, Robène Isabelle, Royer Monique, Szurek Boris, Verdier Valérie, Vernière Christian. 2016. Annual Review of Phytopathology, 54 : 163-187.

Draft Genome Sequence of Xanthomonas translucens pv. graminis Pathotype Strain CFBP 2053. Pesce Céline, Bolot Stéphanie, Berthelot Edwige, Bragard Claude, Cunnac Sébastien, Fischer-Le Saux Marion, Portier Perrine, Arlat Mathieu, Gagnevin Lionel, Jacques Marie Agnès, Noel Laurent D., Carrère Sébastien, Koebnik Ralf. 2015. Genome Announcements, 3 (5):ee01174, 15 p.

Genomics and transcriptomics of Xanthomonas campestris species challenge the concept of core type III effectome. Roux Brice, Bolot Stéphanie, Guy Endrick, Denancé Nicolas, Lautier Martine, Jardinaud Marie-Françoise, Fischer-Le-Caux Marion, Portier Perrine, Jacques Marie Agnès, Gagnevin Lionel, Pruvost Olivier, Lauber Emmanuelle, Arlat Mathieu, Carrère Sébastien, Koebnik Ralf, Noel Laurent D.. 2015. BMC Genomics, 16 (975), 19 p.

High-Quality Draft Genome Sequence of the Xanthomonas translucens pv. cerealis Pathotype Strain CFBP 2541. Pesce Céline, Bolot Stéphanie, Cunnac Sébastien, Portier Perrine, Fischer-Le-Caux Marion, Jacques Marie Agnès, Gagnevin Lionel, Arlat Mathieu, Noel Laurent D., Carrère Sébastien, Bragard Claude, Koebnik Ralf. 2015. Genome Announcements, 3 (1):e0157414, 2 p.

Draft genome sequence of Xanthomonas axonopodis pv. allii strain CFBP 6369. Gagnevin Lionel, Bolot Stéphanie, Gordon Jonathan, Pruvost Olivier, Vernière Christian, Robène Isabelle, Arlat Mathieu, Noel Laurent D., Carrère Sébastien, Jacques Marie Agnès, Koebnik Ralf. 2014. Genome Announcements, 2 (4):e00727, 2 p.

Draft genome sequence of the flagellated Xanthomonas fuscans subsp. fuscans strain CFBP 4884. Indiana Arnaud, Briand Martial, Arlat Mathieu, Gagnevin Lionel, Koebnik Ralf, Noel Laurent D., Portier Perrine, Darrasse Armelle, Jacques Marie Agnès. 2014. Genome Announcements, 2 (5):e00966, 2 p.

Shifting the paradigm from pathogens to pathobiome: new concepts in the light of meta-omics. Vayssier-Taussat Muriel, Albina Emmanuel, Citti Christine, Cosson Jean François, Jacques Marie Agnès, Lebrun Marc-Henri, Le Loir Yves, Ogliastro Mylène, Petit Marie-Agnès, Roumagnac Philippe, Candresse Thierry. 2014. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 4 (29), 7 p.

Draft genome sequence of the Xanthomonas cassavae type strain CFBP 4642. Bolot Stéphanie, Munoz Bodnar Alejandra, Cunnac Sébastien, Ortiz Erika, Szurek Boris, Noel Laurent D., Arlat Mathieu, Jacques Marie Agnès, Gagnevin Lionel, Portier Perrine, Fischer-Le Saux Marion, Carrère Sébastien, Koebnik Ralf. 2013. Genome Announcements, 1 (4):e00679, 13 p.

Evolutionary history of the plant pathogenic bacterium Xanthomonas axonopodis. Mhedbi-Hajri Nadia, Hajri Ahmed, Boureau Tristan, Darrasse Armelle, Durand Karine, Brin Christelle, Fisher-Le Saux Marion, Manceau Charles, Poussier Stéphane, Pruvost Olivier, Lemaire Christophe, Jacques Marie Agnès. 2013. PloS One, 8 (3):e58474, 15 p.

Genome and transcriptome analysis to reveal adaptation to new environments and hosts. Gagnevin Lionel, Roux Bernard, Bolot Stéphanie, Carrère Sébastien, Charbit E., Cunnac Sébastien, Jacques Marie Agnès, Noel Laurent D., Arlat Mathieu, Koebnik Ralf. 2013. Phytopathology, 103 (6), suppl. S2 : S2.170-S2.171. APS-MSA Conference, Austin, États-Unis, 10 Août 2013/14 Août 2013.

Genome sequence of Xanthomonas fuscans subsp. fuscans strain 4834-R reveals that flagellar motility is not a general feature of xanthomonads. Darrasse Armelle, Carrère Sébastien, Barbe Valérie, Boureau Tristan, Arrieta-Ortiz Mario L., Bonneau Sophie, Briand Martial, Brin Christelle, Cociancich Stéphane, Durand Karine, Fouteau Stéphanie, Gagnevin Lionel, Guérin Fabien, Guy Endrick, Indiana Arnaud, Koebnik Ralf, Lauber Emmanuelle, Munoz Alejandra, Noel Laurent D., Pieretti Isabelle, Poussier Stéphane, Pruvost Olivier, Robène-Soustrade Isabelle, Rott Philippe, Royer Monique, Serres-Giardi Laurana, Szurek Boris, Van Sluys Marie-Anne, Verdier Valérie, Vernière Christian, Arlat Mathieu, Manceau Charles, Jacques Marie Agnès. 2013. BMC Genomics, 14 (761), 30 p.

Genomic survey of pathogenicity determinants and VNTR markers in the cassava bacterial pathogen Xanthomonas axonopodis pv. manihotis strain CIO151. Arrieta-Ortiz Mario L., Rodríguez-R Luis Miguel, Pérez-Quintero Alvaro L., Poulin Lucie, Díaz Ana C., Arias Rojas Nathalia, Trujillo Cesar, Restrepo Benavides Mariana, Bart Rebecca, Boch Jen, Boureau Tristan, Darrasse Armelle, David Perrine, Dugé de Bernonville Thomas, Fontanilla Paula, Gagnevin Lionel, Guérin Fabien, Jacques Marie Agnès, Lauber Emmanuelle, Lefeuvre Pierre, Medina Cesar, Medina Edgar, Montenegro Nathaly, Munoz Alejandra, Noel Laurent D., Ortiz Quiñoes Juan F., Osorio Daniela, Pardo Carolina, Patil Prabhu B., Poussier Stéphane, Pruvost Olivier, Robène-Soustrade Isabelle, Ryan Robert P., Tabima Javier, Urrego Morales Osacar G., Vernière Christian, Carrère Sébastien, Verdier Valérie, Szurek Boris, Restrepo Silvia, López Camilo, Koebnik Ralf, Bernal Adriana Jimena. 2013. PloS One, 8 (11):e79704, 18 p.

High-Quality Draft Genome Sequences of Two Xanthomonas citri pv. malvacearum Strains. Cunnac Sébastien, Bolot Stéphanie, Forero Serna Natalia, Ortiz Erika, Szurek Boris, Noel Laurent D., Arlat Mathieu, Jacques Marie Agnès, Gagnevin Lionel, Carrère Sébastien, Nicole Michel, Koebnik Ralf. 2013. Genome Announcements, 1 (4):e00674, 2 p.

High-quality draft genome sequence of Xanthomonas alfalfae subsp. alfalfae strain CFBP 3836. Jacques Marie Agnès, Bolot Stéphanie, Charbit E., Darrasse Armelle, Briand Martial, Arlat Mathieu, Gagnevin Lionel, Koebnik Ralf, Noel Laurent D., Portier Perrine, Carrère Sébastien, Boureau Tristan. 2013. Genome Announcements, 1 (6):e01035, 2 p.

High-quality draft genome sequences of Xanthomonas axonopodis pv. glycines strains CFBP 2526 and CFBP 7119. Darrasse Armelle, Bolot Stéphanie, Serres-Giardi Laurana, Charbit E., Boureau Tristan, Fisher-Le Saux Marion, Briand Martial, Arlat Mathieu, Gagnevin Lionel, Koebnik Ralf, Noel Laurent D., Carrère Sébastien, Jacques Marie Agnès. 2013. Genome Announcements, 1 (6):e01036, 2 p.

Genomic insights into strategies used by Xanthomonas albilineans with its reduced artillery to spread within sugarcane xylem vessels. Pieretti Isabelle, Royer Monique, Barbe Valérie, Carrère Sébastien, Koebnik Ralf, Couloux Arnaud, Darrasse Armelle, Gouzy Jérôme, Jacques Marie Agnès, Lauber Emmanuelle, Manceau Charles, Mangenot Sophie, Poussier Stéphane, Segurens Béatrice, Szurek Boris, Verdier Valérie, Arlat Mathieu, Gabriel Dean W., Rott Philippe, Cociancich Stéphane. 2012. BMC Genomics, 13 (658), 23 p.

Populations of Xanthomonas citri pv mangiferaeindicae from asymptomatic mango leaves are primarily endophytic. Pruvost Olivier, Savelon Caroline, Boyer Claudine, Chiroleu Frédéric, Gagnevin Lionel, Jacques Marie Agnès. 2009. Microbial Ecology, 58 (1) : 170-178.

The complete genome sequence of Xanthomonas albilineans provides new insights into the reductive genome evolution of the xylem-limited Xanthomonadaceae. Pieretti Isabelle, Royer Monique, Barbe Valérie, Carrère Sébastien, Koebnik Ralf, Cociancich Stéphane, Couloux Arnaud, Darrasse Armelle, Gouzy Jérôme, Jacques Marie Agnès, Lauber Emmanuelle, Manceau Charles, Mangenot Sophie, Poussier Stéphane, Segurens Béatrice, Szurek Boris, Verdier Véronique, Arlat Mathieu, Rott Philippe. 2009. BMC Genomics, 10 (616), 15 p.

Plant-pathogenic bacteria as biological weapons. Real threats? Young J.M., Allen Caitilyn, Coutinho Teresa A., Denny T., Elphinstone J., Fegan Max, Gillings M., Gottwald T.R., Graham J.H., Iacobellis N.S., Janse J.D., Jacques Marie Agnès, López María M., Morris Cindy E., Parkinson N., Prior Philippe, Pruvost Olivier, Rodrigues Neto J., Scortichini Marco, Takikawa Y., Upper C.D.. 2008. Phytopathology, 98 (10) : 1060-1065.

The type III secretion system of Xanthomonas fuscans subsp. fuscans is involved in the phyllosphere colonization process and in transmission to seeds of susceptible beans. Darsonval A., Darrasse Armelle, Meyer Damien, Demarty M., Durand Karine, Bureau Charlotte, Manceau Charles, Jacques Marie Agnès. 2008. Applied and Environmental Microbiology, 74 (9) : 2669-2678.

Evolutionary trajectories in plant-associated Pseudomonas and Xanthomonas strains. Scortichini Marco (ed.), Arnold Dawn (ed.), Pruvost Olivier (ed.), Jacques Marie Agnès (ed.), Bernal Adriana Jimena (ed.). 2020. Lausanne : Frontiers Media, 172 p. (Frontiers Research Topics) ISBN 978-2-88963-700-3

4th Xanthomonas genomics conference, Angers, France, july 9-12, 2012 : Book of abstracts. Manceau Charles (ed.), Jacques Marie Agnès (ed.), Arlat Mathieu (ed.), Lauber Emmanuelle (ed.), Noel Laurent D. (ed.), Gagnevin Lionel (ed.), Pruvost Olivier (ed.), Rott Philippe (ed.), Royer Monique (ed.), Koebnik Ralf (ed.), Verdier Valérie (ed.). 2012. Paris : INRA, 85 p. Xanthomonas genomics conference 2012. 4, Angers, France, 9 Juillet 2012/12 Juillet 2012.

Transcription activator like effectors are involved in the host adaptation of Xanthomonas strains responsible for common bacterial blight of bean. Ruh Mylène, Bonneau Sophie, Foucher J., Préveaux A., Gagnevin Lionel, Szurek Boris, Noel L., Jacques Marie Agnès, Chen Nicolas W.G.. 2017. In : FEMS 2017 - 7th Congress of European Microbiologists. Abstract book. FEMS. Valencia : FEMS, Résumé, 1 p. Congress of European Microbiologists (FEMS 2017). 7, Valencia, Espagne, 9 Juillet 2017/13 Juillet 2017.

Recherche de déterminants de la spécificité d'hôte chez X. axonopodis pv. Phaseoli : Session 2- Evolution et plasticité des génomes bactériens. Serres-Giardi Laurana, Chen Nicolas W.G., Briand Martial, Darrasse Armelle, Gagnevin Lionel, Koebnik Ralf, Noel Laurent D., Jacques Marie Agnès. 2014. In : 11èmes Rencontres Plantes-Bactéries, Aussois, France, 3-7 février 2014. SFP ; INRA ; CNRS ; IRD ; CIRAD. Paris : SFP, Résumé, 29. Rencontres plantes-bactéries. 11, Aussois, France, 3 Février 2014/7 Février 2014.

A novel molecular typing system for plant-pathogenic xanthomonas : [N° 43]. Munoz Bodnar Alejandra, Durand Karine, Vernière Christian, Pruvost Olivier, Jacques Marie Agnès, Verdier Valérie, Koebnik Ralf. 2010. In : Neuvièmes Rencontres plantes-bactéries, 18-22 janvier 2010, Aussois (France) : résumés. SFP, IRD. Paris : SFP, Résumé, 109. Rencontres plantes-bactéries. 9, Aussois, France, 18 Janvier 2010/22 Janvier 2010.

Genome sequencing of Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli CFBP4834-R reveals that flagellar motility is not a general feature of xanthomonads. Darrasse Armelle, Carrère Sébastien, Barbe Valérie, Bourreau Tristan, Bernal Adriana Jimena, Bonneau Sophie, Brin Christelle, Cociancich Stéphane, Durand Karine, Fouteau Stéphanie, Gagnevin Lionel, Gouzy Jérôme, Guérin Fabien, Guy Endrick, Indiana Arnaud, Koebnik Ralf, Lauber Emmanuelle, Munoz Alejandra, Noel Laurent D., Pieretti Isabelle, Poussier Stéphane, Pruvost Olivier, Robène-Soustrade Isabelle, Rott Philippe, Royer Monique, Szurek Boris, Van Sluys Marie-Anne, Verdier Valérie, Vernière Christian, Arlat Mathieu, Manceau Charles, Jacques Marie Agnès. 2012. In : 4th Xanthomonas genomics conference, Angers, France, july 9-12, 2012 : Book of abstracts. Manceau Charles (ed.), Jacques Marie Agnès (ed.), Arlat Mathieu (ed.), Lauber Emmanuelle (ed.), Noel Laurent D. (ed.), Gagnevin Lionel (ed.), Pruvost Olivier (ed.), Rott Philippe (ed.), Royer Monique (ed.), Koebnik Ralf (ed.), Verdier Valérie (ed.). INRA, INRA-LIPM, CIRAD-BIOS-UMR PVBMT, IRD. Paris : INRA, Résumé, 13. Xanthomonas genomics conference 2012. 4, Angers, France, 9 Juillet 2012/12 Juillet 2012.

The complete genome sequence of Xanthomonas albilineans provides insights into pathogenicity of this sugarcane pathogen and allows further assessments of the large diversity within this species. Pieretti Isabelle, Cociancich Stéphane, Barbe Valérie, Carrère Sébastien, Koebnik Ralf, Champoiseau Patrice, Couloux Arnaud, Darrasse Armelle, Gouzy Jérôme, Jacques Marie Agnès, Lauber Emmanuelle, Manceau Charles, Mangenot Sophie, Marguerettaz Mélanie, Poussier Stéphane, Segurens Béatrice, Szurek Boris, Verdier Valérie, Arlat Mathieu, Gabriel Dean W., Rott Philippe, Royer Monique. 2011. In : 5th European Conference on Prokaryotic and Fungal Genomics ProkaGENOMICS 2011, Göttingen, Germany, September 18-21, 2011. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. European Conference on Prokaryotic and Fungal Genomics. 5, Göttingen, Allemagne, 18 Septembre 2011/21 Septembre 2011.

La séquence complète du génome de Xanthomonas albilineans apporte un éclairage nouveau sur l'évolution des Xanthomonadaceae dont l'habitat est limité au xylème. Pieretti Isabelle, Royer Monique, Barbe Valérie, Carrère Sébastien, Koebnik Ralf, Cociancich Stéphane, Couloux Arnaud, Darrasse Armelle, Gouzy Jérôme, Jacques Marie Agnès, Lauber Emmanuelle, Manceau Charles, Mangenot Sophie, Poussier Stéphane, Segurens Béatrice, Szurek Boris, Verdier Valérie, Arlat Mathieu, Rott Philippe. 2009. In : Phytopathologie 2009. 7ème Colloque National de la Société Française de Phytopathologie, 8 au 11 Juin 2009, Lyon, France : livre des résumés. SFP, Université Claude Bernard Lyon 1. Paris : SFP, Résumé, 90. Colloque National de la Société Française de Phytopathologie. 7, Lyon, France, 8 Juin 2009/11 Juin 2009.

A novel molecular typing system for pathogenic xanthomonads. Munoz Bodnar Alejandra, Durand Karine, Vernière Christian, Pruvost Olivier, Jacques Marie Agnès, Verdier Valérie, Koebnik Ralf. 2009. In : Xanthomonas Genomics Conference 2009, Pingree Park, USA, July 13-15 2009. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. Xanthomonas Genomics Conference 2009, Pingree Park, États-Unis, 13 Juillet 2009/15 Juillet 2009.

La séquence du génome de Xanthomonas albilineans dévoile des particularités surprenantes chez cette bactérie pathogène de la canne à sucre. Pieretti Isabelle, Royer Monique, Barbe Valérie, Carrère Sébastien, Koebnik Ralf, Cociancich Stéphane, Couloux Arnaud, Darrasse Armelle, Gouzy Jérôme, Jacques Marie Agnès, Lauber Emmanuelle, Manceau Charles, Mangenot Sophie, Poussier Stéphane, Segurens Béatrice, Szurek Boris, Verdier Véronique, Arlat Mathieu, Rott Philippe. 2008. In : 8èmes Rencontres plantes-bactéries,14-18 janvier 2008, Aussois, France. s.l. : s.n., 11. Rencontres plantes-bactéries. 8, Aussois, France, 14 Janvier 2008/18 Janvier 2008.