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2024 taxonomy update for the family Circoviridae. Varsani Arvind, Harrach Balázs, Roumagnac Philippe, Benkő Mária, Breitbart Mya, Delwart Eric, Franzo Giovanni, Kazlauskas Darius, Rosario Karyna, Segalés Joaquim, Dunay Emily, Rukundo Joshua, Goldberg Tony L., Fehér Enikő, Kaszab Eszter, Bányai Krisztián, Krupovic Mart. 2024. Archives of Virology, 169:176, 23 p.
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A Bayesian analysis of birth pulse effects on the probability of detecting Ebola virus in fruit bats. Pleydell David R.J., Ndong Bass Innocent, Mba Djondzo Flaubert Auguste, Meta Djomsi Dowbiss, Kouanfack Charles, Peeters Martine, Cappelle Julien. 2024. Peer Community Journal, 4:e39, 27 p.
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The role of mammals in Avian Influenza: A review. ENETWILD Consortium, Occhibove Flavia, Knauf Sascha, Sauter-Louis Carola, Staubach Christoph, Allendorf Valerie, Anton Alina, Barron Sophia, Bergmann Hannes, Bröjer Caroline, Buzan Elena, Cerny Jiri, Denzin Nicolai, Gethöffer Friederike, Globig Anja, Gethmann Jörn M., Gonzálvez Moisés, Garcia-Bocanegra Ignacio, Harder Timm C., Jori Ferran, Keuling Oliver, Neimanis Aleksija, Neumann Heise Joaquin, Pastori Ilaria, Parreira Perin Patricia, Rijks Jolianne, Schulz Katja, Trogu Tiziana, Plis Kamila, Vada Rachele, Vercher Gauthier, Wischnewski Natalie, Zanet Stefania, Ferroglio Ezio. 2024. EFSA Supporting Publications, 21 (3):8692E, 54 p.
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Benchmarking of virome metagenomic analysis approaches using a large, 60+ members, viral synthetic community. Schönegger Deborah, Moubset Oumaima, Margaria Paolo, Menzel Wulf, Winter Stephan, Roumagnac Philippe, Marais Armelle, Candresse Thierry. 2023. Journal of Virology, 97 (11), 20 p.
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Caractérisation de déterminants biologiques et moléculaires de l'invasion d'un recombinant du Tomato yellow leaf curl virus sur des tomates résistantes Ty-1. Jammes Margaux. 2023. Montpellier : Institut Agro Montpellier, 201 p. Thèse de doctorat : Mécanismes des interactions parasitaires pathogènes et symbiotiques : Institut Agro Montpellier
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Constitutive proteins of lumpy skin disease virion assessed by next-generation proteomics. Schlosser-Perrin Léo, Holzmuller Philippe, Fernandez Bernard, Miotello Guylaine, Dahmani Noureddine, Neyret Aymeric, Bertagnoli Stéphane, Armengaud Jean, Caufour Philippe. 2023. Journal of Virology, 97 (10), 32 p.
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Environmental spillover of emerging viruses: Is it true? Gavotte Laurent, Gaucherel Cédric, Frutos Roger. 2023. Environmental Research, 233:116416, 8 p.
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Metagenomics reveals the structure of Mastrevirus-host interaction network within an agro-ecosystem. Claverie Sohini, Hoareau Marie Murielle, Ben Chehida Sélim, Filloux Denis, Varsani Arvind, Roumagnac Philippe, Martin Darren Patrick, Lett Jean-Michel, Lefeuvre Pierre. 2023. Virus Evolution, 9 (2):vead043, 15 p.
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One health approach at the heart of the French Committee for monitoring and anticipating health risks. Lefrançois Thierry, Lina Bruno, Caille Yvanie, Carrat Fabrice, Cauchemez Simon, Contenti Julie, Degrées du Loû Annabel, Druet-Faivre Léa, Fontenille Didier, Giraudoux Patrick, Heard Mélanie, De Lamballerie Xavier, Le Grand Roger, Lescure François-Xavier, Loyer Véronique, Malvy Denis, Offerle Céline, Raude Jocelyn, Saint-Lary Olivier, Slama Rémy, Autran Brigitte. 2023. Nature Communications, 14:7540, 4 p.
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Spatial scale influences the distribution of viral diversity in the eukaryotic virome of the mosquito Culex pipiens. Gil Patricia, Exbrayat Antoni, Loire Etienne, Rakotoarivony Ignace, Charriat Florian, Morel Come, Baldet Thierry, Boisseau Michel, Marie Albane, Francés Benoit, L'Ambert Grégory, Bessat Mohamed, Otify Yehia, Goffredo Maria, Mancini Giuseppe, Busquets Núria, Birnberg Lotty, Talavera Sandra, Aranda Carles, Ayari Emna, Mejri Selma, Sghaier Soufien, Bennouna Amal, El Rhaffouli Hicham, Balenghien Thomas, Chlyeh Ghita, Fassi Fihri Ouafaa, Reveillaud Julie, Simonin Yannick, Eloit Marc, Gutierrez Serafin. 2023. Virus Evolution, 9 (2):vead054, 14 p.
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The genome of a bunyavirus cannot be defined at the level of the viral particle but only at the scale of the viral population. Yvon Michel, German Thomas L., Ullman Diane E., Dasgupta Ranjit, Parker Maxwell H., Ben-Mahmoud Sulley, Verdin Eric, Gognalons Patrick, Ancelin Aurélie, Laï Kee Him Joséphine, Girard Justine, Vernerey Marie-Stéphanie, Fernandez Emmanuel, Filloux Denis, Roumagnac Philippe, Bron Patrick, Michalakis Yannis, Blanc Stéphane. 2023. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 120 (48):e2309412120, 10 p.
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Editorial: DNA virus and host plant interactions from antagonism to endogenization. Richert-Pöggeler Katja R., Iskra Caruana Marie-Line, Kishima Yuji. 2022. Frontiers in Plant Science, 13, 3 p.
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Origin of COVID-19: dismissing the Mojiang mine theory and the laboratory accident narrative. Frutos Roger, Javelle Emilie, Barberot Celine, Gavotte Laurent, Tissot-Dupont Herve, Devaux Christian. 2022. Environmental Research, 204 (Part B):112141, 5 p.
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There is no "origin" to SARS-CoV-2. Frutos Roger, Pliez Olivier, Gavotte Laurent, Devaux Christian. 2022. Environmental Research:112173, 10 p.
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Virome and nrEVEome diversity of Aedes albopictus mosquitoes from La Reunion Island and China. Palatini Umberto, Alfano Niccolo, Lejarazu Carballar Rebeca, Chen Xiao-Guang, Delatte Hélène, Bonizzoni Mariangela. 2022. Virology Journal, 19:190, 12 p.
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The novel hamster-adapted SARS-CoV-2 Delta variant may be selectively advantaged in humans. Fantini Jacques, Devaux Christian, Yahi Nouara, Frutos Roger. 2022. Journal of Infection, 84 (5) : 53-54.
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Editorial: Peste des Petits Ruminants (PPR): Generating evidence to support eradication efforts. Roger François, Fournié Guillaume, Binot Aurélie, Wieland Barbara, Kock Richard, Diallo Adama, Caron Alexandre, Jones Bryony Anne. 2021. Frontiers in Veterinary Science, 7:636509, 3 p.
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ICTV Virus Taxonomy Profile: Geminiviridae 2021. Fiallo-Olivé Elvira, Lett Jean-Michel, Martin Darren Patrick, Roumagnac Philippe, Varsani Arvind, Zerbini F. Murilo, Navas-Castillo Jesús. 2021. Journal of General Virology, 102 (12), 2 p.
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Novel circular DNA virus identified in Opuntia discolor (Cactaceae) that codes for proteins with similarity to those of geminiviruses. Fontenele Rafaela S, Köhler Matias, Majure Lucas C., Avalos‐Callero Jesús A., Argüello‐Astorga Gerardo R., Font Fabián, Vidal Andreza H., Roumagnac Philippe, Kraberger Simona, Martin Darren Patrick, Lefeuvre Pierre, Varsani Arvind. 2021. Journal of General Virology, 102 (11), 7 p.
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Virus et chercheurs sous le soleil de Montpellier. Editorial. Gosselin-Grenet Anne-Sophie, Servan de Almeida Renata, Roumagnac Philippe, Ayouba Ahidjo, Simonin Yannick, Nisole Sébastien. 2021. Virologie, 25 (1), suppl. : 3-5.
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Differential vector competence of Ornithodoros soft ticks for African swine fever virus: What if it involves more than just crossing organic barriers in ticks? Pereira De Oliveira Rémi, Hutet Evelyne, Lancelot Renaud, Paboeuf Frédéric, Duhayon Maxime, Boinas Fernando, Pérez de León Adalberto A., Filatov Sehrii, Le Potier Marie-Frédérique, Vial Laurence. 2020. Parasites and Vectors, 13:618, 15 p.
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ICTV Virus Taxonomy Profile: Caulimoviridae. Teycheney Pierre-Yves, Geering Andrew D., Dasgupta Indranil, Hull Roger, Kreuze Jan, Lockhart Benham E.L., Muller Emmanuelle, Olszewski Neil E., Pappu Hanu R., Pooggin Mikhail, Richert-Pöggeler Katja R., Schoelz James E., Seal Susan, Stavolone Livia, Umber Marie, ICTV Report Consortium. 2020. Journal of General Virology, 101 (10) : 1025-1026.
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In vitro shared transcriptomic responses of Aedes aegypti to arboviral infections: Example of dengue and Rift Valley fever viruses. Licciardi Séverine, Loire Etienne, Cardinale Eric, Gislard Marie, Dubois Emeric, Cetre-Sossah Catherine. 2020. Parasites and Vectors, 13 (1):395, 10 p.
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Variation in the susceptibility of urban Aedes mosquitoes infected with a densovirus. Perrin Aurélie, Gosselin-Grenet Anne-Sophie, Rossignol Marie, Ginibre Carole, Scheid Bethsabée, Lagneau Christophe, Chandre Fabrice, Baldet Thierry, Ogliastro Mylène, Bouyer Jérémy. 2020. Scientific Reports, 10:18654, 10 p.
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Diverse and variable virus communities in wild plant populations revealed by metagenomic tools. Susi Hanna, Filloux Denis, Frilander Mikko J., Roumagnac Philippe, Laine Anna-Liisa. 2019. PeerJ, 7:e6140, 24 p.
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Les complexes d'espèces virales. Muller Emmanuelle. 2019. Montpellier : Université de Montpellier, 54 p. Habilitation à diriger des recherches : Université de Montpellier
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A multicellular way of life for a multipartite virus. Sicard Anne, Pirolles Elodie, Gallet Romain, Vernerey Marie-Stéphanie, Yvon Michel, Urbino Cica, Peterschmitt Michel, Gutierrez Serafin, Michalakis Yannis, Blanc Stéphane. 2019. eLife, 8:e43599, 14 p.
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Complete genome sequence of a lineage II Peste des Petits Ruminants virus from Sierra Leone. Dundon William G., Adombi Caroline Mélanie, Kanu Saidu, Loitsch Angelika, Cattoli Giovanni, Diallo Adama. 2018. Genome Announcements, 6 (1):e01417-17, 2 p.
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Le virus Usutu : soyons vigilants. Foulongne Vincent, Clé Marion, Gutierrez Serafin, Vande Perre Philippe, Salinas Sara, Simonin Yannick. 2018. Virologie, 22 (5) : 233-236.
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Nanovirus‐alphasatellite complex identi ed in Vicia cracca in the Rhône delta region of France. Gallet Romain, Kraberger Simona, Filloux Denis, Galzi Serge, Fontes Hugo, Martin Darren Patrick, Varsani Arvind, Roumagnac Philippe. 2018. Archives of Virology, 163 (3) : 695-700.
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Next generation sequencing elucidates cacao badnavirus diversity and reveals the existence of more than ten viral species. Muller Emmanuelle, Ravel Sébastien, Agret Clément, Abrokwah Francis, Dzahini-Obiatey Henry, Galyuon I., Kouakou K., Jeyaseelan E.C., Allainguillaume Joel, Wetten Andrew. 2018. Virus Research, 244 : 235-251.
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Capulavirus and Grablovirus: Two new genera in the family Geminiviridae. Varsani Arvind, Roumagnac Philippe, Fuchs Marc, Navas-Castillo Jesús, Moriones Enrique, Idris Ali, Briddon Rob W., Rivera-Bustamante Rafael, Zerbini F. Murilo, Martin Darren Patrick. 2017. Archives of Virology, 162 (6) : 1819-1831.
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Exploiting genetic information to trace plant virus dispersal in landscapes. Picard Coralie, Dallot Sylvie, Brunker Kirstyn, Berthier Karine, Roumagnac Philippe, Soubeyrand Samuel, Jacquot Emmanuel, Thébaud Gaël. 2017. Annual Review of Phytopathology, 55 : 139-160.
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A G-protein-coupled chemokine receptor: A putative insertion site for a multi-pathogen recombinant capripoxvirus vaccine strategy. Cetre-Sossah Catherine, Dickmu Simon, Kwiatek Olivier, Albina Emmanuel. 2017. Journal of Immunological Methods, 448 : 112-115.
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ICTV virus taxonomy profile: Geminiviridae. Zerbini F. Murilo, Briddon Rob W., Idris Ali, Martin Darren Patrick, Moriones Enrique, Navas-Castillo Jesús, Rivera-Bustamante Rafael, Roumagnac Philippe, Varsani Arvind. 2017. Journal of General Virology, 98 : 131-133.
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Occurrence of a novel mastrevirus in sugarcane germplasm collections in Florida, Guadeloupe and Réunion. Boukari Wardatou, Alcala-Briseño Ricardo I., Kraberger Simona, Fernandez Emmanuel, Filloux Denis, Daugrois Jean-Heinrich, Comstock Jack C., Lett Jean-Michel, Martin Darren Patrick, Varsani Arvind, Roumagnac Philippe, Polston Jane E., Rott Philippe. 2017. Virology Journal, 14:146, 8 p.
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Occurrence of cassava brown streak disease and associated Cassava brown streak virus and Ugandan cassava brown streak virus in the Comoros Islands. Azali H.A., Maillot Véronique, Cassam Nathalie, Chesneau Thomas, Soulezelle Juliette, Scussel Sarah, Abdoul Karime A.L., Hostachy Bruno, Reynaud Bernard, Roux-Cuvelier Michel, Robène Isabelle, Lett Jean-Michel. 2017. New Disease Reports, 36 : p. 19.
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Risk factors for MERS coronavirus infection in dromedary camels in Burkina Faso, Ethiopia, and Morocco, 2015. Miguel Eve, Chevalier Véronique, Ayelet Gelagay, Ben Bencheikh M.N., Boussini H., Chu Daniel K.W., El Berbri I., Fassi Fihri Ouafaa, Faye Bernard, Fekadu G., Grosbois Vladimir, Ng B.C., Perera Ranawaka A.P.M., So T., Traoré Amadou, Roger François, Peiris Malik. 2017. Eurosurveillance, 22 (13):30498, 10 p.
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A la découverte des agents pathogènes et microorganismes des tiques de la Caraïbe par séquençage de nouvelle génération et PCR microfluidique en temps réel. Gondard Mathilde. 2017. Champs-sur-Marne : Université Paris-Est, 286 p. Thèse de doctorat : Sciences de la vie et de la santé : Université Paris-Est
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Cacao Swollen Shoot Virus (CSSV): History, Biology, and Genome. Muller Emmanuelle. 2016. In : Cacao diseases. A history of old enemies and new encounters. Bryan A. Bailey (ed.), Lyndel W. Meinhardt (ed.). Cham : Springer International Publishing, 337-358. ISBN 978-3-319-24787-8
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Diverse circular replication-associated protein encoding viruses circulating in invertebrates within a lake ecosystem. Dayaram Anisha, Galatowitsch Mark L., Argüello-Astorga Gerardo, van Bysterveldt Katherine, Kraberger Simona, Stainton Daisy, Harding Jon S., Roumagnac Philippe, Martin Darren Patrick, Lefeuvre Pierre, Varsani Arvind. 2016. Infection, Genetics and Evolution, 39 : 304-316.
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Geographical distribution of Cacao swollen shoot virus molecular variability in Ghana. Abrokwah Francis, Dzahini-Obiatey Henry, Galyuon Isaac, Osae-Awuku Francis, Muller Emmanuelle. 2016. Plant Disease, 100 (10) : 2011-2017.
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How endogenous plant pararetroviruses shed light on Musa evolution. Duroy Pierre-Olivier, Perrier Xavier, Laboureau Nathalie, Jacquemoud-Collet Jean-Pierre, Iskra Caruana Marie-Line. 2016. Annals of Botany, 117 (4) : 625-641.
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Impact and epidemiological investigations into the incursion and spread of peste des petits ruminants in the Comoros Archipelago: An increased threat to surrounding Islands. Cetre-Sossah Catherine, Kwiatek Olivier, Faharoudine Abdourahime, Soulé Miradje, Moutroifi Y.O., Vrel Marie-Astrid, Salami Habib, Rassoul S., Asnaoui M., Moindjie Y., Albina Emmanuel, Libeau Geneviève, Cardinale Eric. 2016. Transboundary and Emerging Diseases, 63 (4) : 452-459.
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Metagenomic-based screening and molecular characterization of cowpea-infecting viruses in Burkina Faso. Palanga Essowé, Filloux Denis, Martin Darren Patrick, Fernandez Emmanuel, Gargani Daniel, Ferdinand Romain, Zabré Jean, Bouda Zakaria, Neya Bouma, Sawadogo Mahamadou, Traoré Oumar, Peterschmitt Michel, Roumagnac Philippe. 2016. PloS One, 11 (10):e0165188, 21 p.
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The strange lifestyle of multipartite viruses. Sicard Anne, Michalakis Yannis, Gutiérrez Serafin, Blanc Stéphane. 2016. PLoS Pathogens, 12 (11):e1005819, 19 p.
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Biology, etiology, and control of virus diseases of banana and plantain. Lava Kumar P., Selvarajan Ramasamy, Iskra Caruana Marie-Line, Chabannes Matthieu, Hanna Rachid. 2015. In : Control of Plant Virus Diseases Vegetatively-Propagated Crops. by Gad Loebenstein and Nikolaos I. Katis. New-York : Academic Press, 229-269. (Advances in Virus Research) ISBN 978-0-12-802762-2
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Diversité, évolution et contrôle des virus des plantes tropicales : l'ennemi peut aussi venir de l'intérieur. Caruana Marie-Line. 2015. Montpellier : Université de Montpellier 2, 73 p. Habilitation à diriger des recherches : Université Montpellier 2
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Genetic diversity of human rhinoviruses in Cambodia during a three-year period reveals novel genetic types. Naughtin Monica, Rith Sareth, Sentilhes Anne-Charlotte, Vong Sirenda, Joffret Marie-Line, Cornillot Emmanuel, Deubel Vincent, Delpeyroux Francis, Frutos Roger, Buchy Philippe. 2015. Infection, Genetics and Evolution, 35 : 42-49.
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Identification of novel Bromus- and Trifolium-associated circular DNA viruses. Kraberger Simona, Farkas Kata, Bernardo Pauline, Booker Cameron, Argüello-Astorga Gerardo, Mesleard François, Martin Darren Patrick, Roumagnac Philippe, Varsani Arvind. 2015. Archives of Virology, 160 (5) : 1303-1311.
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La peste des petits ruminants : La PPR. Charbonnier Georgette, Laveissière Géraldine, Lancelot Renaud (collab.), Lefrançois Thierry (collab.), Libeau Geneviève (collab.), Minet Cécile (collab.), Domenech Joseph (collab.). 2015. Montpellier : CIRAD, 90 p. (Les savoirs partagés) ISBN 978-2-87614-698-3
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Mapping genetic determinants of viral traits with FST and quantitative trait locus (QTL) approaches. Doumayrou Juliette, Thébaud Gaël, Vuillaume Florence, Peterschmitt Michel, Urbino Cica. 2015. Virology, 484 : 346-353.
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Monitoring the dynamics of emergence of a non-canonical recombinant of Tomato yellow leaf curl virus and displacement of its parental viruses in tomato. Belabess Zineb, Dallot Sylvie, El Montaser S., Granier Martine, Majde M., Tahiri Abdessalem, Blenzar Abdelali, Urbino Cica, Peterschmitt Michel. 2015. Virology, 486 : 291-306.
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Plant virus metagenomics: Advances in virus discovery. Roossinck Marilyn J., Martin Darren Patrick, Roumagnac Philippe. 2015. Phytopathology, 105 (6) : 716-727.
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Rapid accumulation and low degradation: Key parameters of Tomato yellow leaf curl virus persistence in its insect vector Bemisia tabaci. Becker Nathalie, Rimbaud Loup, Chiroleu Frédéric, Reynaud Bernard, Thébaud Gaël, Lett Jean-Michel. 2015. Scientific Reports, 5 (17696), 10 p.
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Rodents and risk in the Mekong Delta of Vietnam: Seroprevalence of selected zoonotic viruses in rodents and humans. Van Cuong Nguyen, Carrique-Mas Juan, Be Hien Vo, Ngoc An Nguyen, Tri Tue Ngo, Lam Anh Nguyet, Hong Anh Pham, The Phuc Nguyen, Baker Stephen, Voutilainen Liina, Jääskejäinen Anne, Huhtamo Eili, Utriainen Mira, Sironen Tarja, Vaheri Antti, Henttonen Heikki, Vapalahti Olli, Chaval Yannick, Morand Serge, Bryant Juliet. 2015. Vector Borne and Zoonotic Diseases, 15 (1) : 65-72.
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Technical guidelines for the safe movement of Musa germplasm. Thomas J.E. (ed.), Sharman M. (collab.), Lassois Ludivine (collab.), Massart Sébastien (collab.), De Clerck Caroline (collab.), Caruana Marie-Line (collab.), Chabannes Matthieu (collab.), Teycheney Pierre-Yves (collab.), Lava Kumar P. (collab.), Van Den Houwe Ines (collab.), Roux Nicolas (collab.). 2015. Milan : Bioversity International, 60 p. ISBN 978-92-9255-034-9
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The genomes of many yam species contain transcriptionally active endogenous geminiviral sequences that may be functionally expressed. Filloux Denis, Murrell Sasha, Koohapitagtam M., Golden Michael, Julian Charlotte, Galzi Serge, Uzest Marilyne, Rodier-Goud Marguerite, D'Hont Angélique, Vernerey Marie-Stéphanie, Wilkin P., Peterschmitt Michel, Winter Stephan, Murrell Ben, Martin Darren Patrick, Roumagnac Philippe. 2015. Virus Evolution, 1 (1), 17 p.
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A 3-year serological and virological cattle follow-up in Madagascar highlands suggests a non-classical transmission route of Rift Valley fever virus. Nicolas Gaëlle, Durand Benoit, Rakotoarimanana Tafika Tojofaniry, Lacote Sandra, Chevalier Véronique, Marianneau Philippe. 2014. American Journal of Tropical Medicine and Hygiene, 90 (2) : 265-266.
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Appearances can be deceptive: Revealing a hidden viral infection with deep sequencing in a plant quarantine Context. Candresse Thierry, Filloux Denis, Muhire Brejnev, Julian Charlotte, Galzi Serge, Fort Guillaume, Bernardo Pauline, Daugrois Jean-Heinrich, Fernandez Emmanuel, Martin Darren Patrick, Varsani Arvind, Roumagnac Philippe. 2014. PloS One, 9 (7):e102945, 13 p.
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Bluetongue, Schmallenberg - what is next? Culicoides-borne viral diseases in the 21st Century. Koenraadt Constantianus J.M., Balenghien Thomas, Carpenter Simon, Ducheyne Els, Elbers Armin R.W., Fife Mark, Garros Claire, Ibáñez-Justicia Adolfo, Kampen Helge, Losson Bertrand, Van Der Poel Wim H.M., De Regge Nick, Van Rijn Piet A., Sanders Christopher, Schaffner Francis, Sloet van Oldruitenborgh-Oosterbaan Marianne M., Takken Willem, Werner D., Seelig Frederik. 2014. BMC Veterinary Research, 10 (77), 7 p.
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Diversité génétique, évolution et dissémination des bégomovirus africains dans les îles du sud-ouest de l'océan Indien. De Bruyn Alexandre. 2014. Saint-Denis : Université de la Réunion, 240 p. Thèse de doctorat : Sciences. Biologie moléculaire : Université de la Réunion
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Diversité moléculaire du CSSV (Cocoa swollen shoot virus) et épidémiologie de la maladie du swollen shoot du cacaoyer (Theobroma cacao L.) en Côte d'Ivoire. Kouakou Koffie. 2014. Abidjan : Université Félix Houphouët Boigny, 141 p. Thèse de doctorat : Phytovirologie : Université Félix Houphouët Boigny
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Diversité, évolution et émergence des phytovirus à transmission vectorielle : la chronique des géminivirus. Lett Jean-Michel. 2014. Saint-Denis : Université de la Réunion, 85 p. Habilitation à diriger des recherches : Université de la Réunion
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Ecologie, diversité, et découverte de phytovirus à l'échelle de deux agro-écosystèmes dans un cadre spatio-temporel à l'aide de la géo-métagénomique. Bernardo Pauline. 2014. Montpellier : UM2, 278 p. Thèse de doctorat : Microbiologie parasitologie : Université Montpellier 2
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First report of cassava brown streak disease and associated Ugandan cassava brown streak virus in Mayotte Island. Roux-Cuvelier Michel, Teyssedre David, Chesneau Thomas, Jeffray C., Massé Delphine, Jade Katia, Abdoul Karime A.L., Hostachy Bruno, Reynaud Bernard, Legg James, Lett Jean-Michel. 2014. New Disease Reports, 30 : p. 28.
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Identification of an unclassified paramyxovirus in Coleura afra: A potential case of host specificity. Maganga Gaël Darren, Bourgarel Mathieu, Obame Nkoghe Judicael, N'Dilimabaka Nadine, Drosten Christian, Paupy Christophe, Morand Serge, Drexler Jan Felix, Leroy Eric M.. 2014. PloS One, 9 (12):e115588, 13 p.
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Molecular characterization of yam virus X, a new potexvirus infecting yams (Dioscorea spp) and evidence for the existence of at least three distinct potexviruses infecting yams. Acina Manbole Isabelle Nina, Bonheur Lydiane, Svanella-Dumas Laurence, Filloux Denis, Gomez Rose-Marie, Faure Chantal, Lange David, Anzala Fabiola, Pavis Claudie, Marais Armelle, Roumagnac Philippe, Candresse Thierry, Teycheney Pierre-Yves. 2014. Archives of Virology, 159 (12) : 3421-3426.
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Molecular evolution of peste des petits ruminants virus. Muniraju Murali, Munir Muhammad, Parthiban AravindhBabu R., Banyard Ashley C., Bao Jingyue, Wang Zhiliang, Ayebazibwe Chrisostom, Ayelet Gelagay, El Harrak Mehdi, Mahapatra Mana, Libeau Geneviève, Batten Carrie, Parida Satya. 2014. Emerging Infectious Diseases, 20 (12) : 2023-2033.
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Multiples fonctions des usines virales : l'exemple du virus de la mosaïque du chou-fleur (Cauliflower mosaic virus). Bak Aurélie, Blanc Stéphane, Gargani Daniel, Martinière Alexandre, Drucker Martin. 2014. Virologie, 18 (4) : 201-210.
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Peste des petits ruminants virus. Diallo Adama, Libeau Geneviève. 2014. In : Manual of security sensitive microbes and toxins. Ed. Dongyou Liu. Boca Raton : CRC Press, 703-714. ISBN 978-1-4665-5396-5
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Development of a cost-effective method for capripoxvirus genotyping using snapback primer and dsDNA intercalating dye. Gelaye Esayas, Lamien Charles Euloge, Silber Roland, Tuppurainen Eeva, Grabherr Reingard, Diallo Adama. 2013. PloS One, 8 (10):e75971, 10 p.
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Ecologie des arbovirus au Sénégal : exemple du virus de la fièvre West Nile dans le Delta du fleuve Sénégal et le Ferlo. Fall Assane Gueye. 2013. Dakar : UCAD, 117 p. Thèse de doctorat : Entomologie : Université Cheikh Anta Diop
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High prevalence of hepatitis E in humans and pigs and evidence of genotype-3 virus in swine, Madagascar. Temmam Sarah, Besnard Lydia, Andriamandimby Soa Fy, Foray Coralie, Rasamoelina-Andriamanivo Harentsoaniaina, Héraud Jean Michel, Cardinale Eric, Dellagi Koussay, Pavio Nicole, Pascalis Hervé, Porphyre Vincent. 2013. American Journal of Tropical Medicine and Hygiene, 88 (2) : 329-338.
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How much can diptera-borne viruses persist over unfavourable seasons? Charron Maud, Balenghien Thomas, Seegers Henri, Langlais Michel, Ezanno Pauline. 2013. PloS One, 8 (9):e74213, 12 p.
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Métagénomique virale et pathologie Une histoire récente. Bernardo Pauline, Albina Emmanuel, Eloit Marc, Roumagnac Philippe. 2013. MS - Médecine Sciences, 29 (5) : 501-508.
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Programme de la 14e édition des Rencontres de la Virologie Végétale. Marais Armelle, Revers Frédéric. 2013. Aussois : INRA, 129 p. Rencontres de Virologie Végétale. 14, Aussois, France, 13 Janvier 2013/17 Janvier 2013.
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Virus factories of Cauliflower Mosaic Virus are virion reservoirs that engage actively in vector transmission. Bak Aurélie, Gargani Daniel, Macia Jean Luc, Malouvet Enrick, Vernerey Marie-Stéphanie, Blanc Stéphane, Drucker Martin. 2013. Journal of Virology, 87 (22) : 12207-12215.
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Transmission of pandemic influenza H1N1 (2009) in Vietnamese swine in 2009-2010. Trévennec Karen, Leger Lucas, Lyazrhi Faouzi, Baudon Eugénie, Cheung Chung Yan, Roger François, Peiris Malik, Garcia Jean-Michel. 2012. Influenza and Other Respiratory Viruses, 6 (5) : 348-357.
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A novel maize-infecting mastrevirus from La Réunion Island. Pande Daniel, Kraberger Simona, Lefeuvre Pierre, Lett Jean-Michel, Shepherd Dionne Natalie, Varsani Arvind, Martin Darren Patrick. 2012. Archives of Virology, 157 (8) : 1617-1621.
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Comparative analysis of avian influenza virus diversity in poultry and humans during a highly pathogenic avian influenza A (H7N7) virus outbreak. Jonges Marcel, Bataille Arnaud, Enserink Remko, Meijer Adam, Fouchier Ron A.M., Stegeman Arjan, Koch Guus, Koopmans Marion. 2011. Journal of Virology, 85 (20) : 10598-10604.
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Evolutionary time-scale of the begomoviruses : evidence from integrated sequences in the Nicotiana genome. Lefeuvre Pierre, Harkins Gordon William, Lett Jean-Michel, Briddon Rob W., Chase Mark W., Moury Benoit, Martin Darren Patrick. 2011. PloS One, 6 (5):e19193, 10 p.
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Recombination in Eukaryotic single stranded DNA viruses. Martin Darren Patrick, Biagini Philippe, Lefeuvre Pierre, Golden Michael, Roumagnac Philippe, Varsani Arvind. 2011. Viruses, 3 (9) : 1699-1738.
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Swine influenza surveillance in East and Southeast Asia : A systematic review. Trévennec Karen, Cowling Benjamin John, Peyre Marie-Isabelle, Baudon Eugénie, Martineau Guy-Pierre, Roger François. 2011. Animal Health Research Reviews, 12 (2) : 213-223.
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Tomatoes showing yellow leaf curl symptoms in the island of Grenada exhibit an infection with Tomato yellow leaf curl virus either alone or in combination with potato yellow mosaic virus. Lett Jean-Michel, Péréfarres Frédéric, Hoareau Murielle, Lefeuvre Pierre, De Bruyn Alexandre, Dottin M., Prior Philippe, Wicker Emmanuel, Umaharan Pathmanathan. 2011. New Disease Reports, 24 : 19.
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Use of the Capripoxvirus homologue of Vaccinia virus 30kDa RNA polymerase subunit (RPO30) gene as a novel diagnostic and genotyping target : Development of a classical PCR method to differentiate Goat poxvirus from Sheep poxvirus. Lamien Charles Euloge, Le Goff Christian, Silber Roland, Wallace David B., Gulyaz Vely, Tuppurainen Eeva, Madani Hafsa, Caufour Philippe, Adam Tajelser, El Harrak Mehdi, Luckins Antony George, Albina Emmanuel, Diallo Adama. 2011. Veterinary Microbiology, 149 (1-2) : 30-39.
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Anatomy of bluetongue virus serotype 8 epizootic wave, France, 2007-2008. Durand Benoit, Zanella Gina, Biteau-Coroller Fabienne, Locatelli Caroline, Baurier Florence, Simon Cécile, Le Dréan Eric, Delaval José, Prengère Eric, Beauté Véronique, Guis Hélène. 2010. Emerging Infectious Diseases, 16 (12) : 1861-1868.
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Des parasites humains aux virus animaux, une histoire de vecteurs. Cetre-Sossah Catherine. 2010. Montpellier : UM2, 127 p. Habilitation à diriger des recherches : Université Montpellier 2
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L'émergence virale : Dossier présenté en vue d'obtenir le diplôme. Peterschmitt Michel. 2010. Montpellier : UM2, 70 p. Habilitation à diriger des recherches : Université Montpellier 2
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Molecular diversity of cotton leaf curl Gezira virus isolates and their satellite DNAs associated with okra leaf curl disease in Burkina Faso. Tiendrebeogo Fidèle, Lefeuvre Pierre, Hoareau Murielle, Villemot Julie, Konaté Gnissa, Traoré Alfred S., Barro Nicolas, Traore Valentin S.E., Reynaud Bernard, Traoré Oumar, Lett Jean-Michel. 2010. Virology Journal, 7, 10 p.
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Detection, incidence and diversity of Banana streak viruses, Banana mild mosaic virus and Banana virus X in Guadeloupe. Péréfarres Frédéric, Le Provost Grégoire, Acina Isabelle Nina, Lockhart Benham E.L., Ata Allah Dghim, Iskra Caruana Marie-Line, Candresse Thierry, Teycheney Pierre-Yves. 2009. In : Proceedings of the international symposium on recent advances in banana crop protection for sustainable production and improved livelihoods, White River, South Africa, September 10-14, 2007. Jones David R. (ed.), Van den Bergh Inge (ed.). ISHS. Louvain : ISHS [Belgique], 205-212. (Acta Horticulturae, 828) ISBN 978-90-6605-488-2 International Symposium on recent advances in banana crop protection for sustainable production and improved livelihoods. 1, White River, Afrique du Sud, 10 Septembre 2007/14 Septembre 2007.
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How to control and prevent the spread of banana streak disease when the origin could be viral sequences integrated in banana genome? Iskra Caruana Marie-Line, Gayral Philippe, Galzi Serge, Laboureau Nathalie. 2009. In : Proceedings of the international symposium on recent advances in banana crop protection for sustainable production and improved livelihoods, White River, South Africa, September 10-14, 2007. Jones David R. (ed.), Van den Bergh Inge (ed.). ISHS. Louvain : ISHS [Belgique], 77-84. (Acta Horticulturae, 828) ISBN 978-90-6605-488-2 International Symposium on recent advances in banana crop protection for sustainable production and improved livelihoods. 1, White River, Afrique du Sud, 10 Septembre 2007/14 Septembre 2007.
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Widely conserved recombination patterns among single-stranded DNA viruses. Lefeuvre Pierre, Lett Jean-Michel, Varsani Arvind, Martin Darren Patrick. 2009. Journal of Virology, 83 (6) : 2697-2707.
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Evolution des pararétrovirus endogènes de plantes : le cas des séquences intégrées du Banana streak virus chez le bananier (Musa sp.). Gayral Philippe. 2008. Montpellier : UM2, 250 p. Thèse de doctorat : Biologie de l'évolution et écologie : Université Montpellier 2
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Recent advances in research on sugarcane yellow leaf virus, the causal agent of sugarcane yellow leaf. Rott Philippe, Mirkov T.Erik, Schenck S., Girard Jean-Claude. 2008. Sugar Cane International, 26 (3) : 18-22.

Variation of sugar cane yellow leaf disease status in the French West Indies. Daugrois Jean-Heinrich, Edon-Jock Carine, Fernandez Emmanuel, Girard Jean-Claude, Rott Philippe. 2008. In : Advances and challenges in sugarcane biotechnology and plant pathology : proceedings : Joint ISSCT IX Plant Pathology and VI Molecular Biology Workshop, Cali, Colombia, 23-27 june 2008. ISSCT ; CENICANA. Cali : ISSCT, Résumé, 1 p. ISSCT Plant Pathology Workshop. 9, Cali, Colombie, 23 Juin 2008/27 Juin 2008.

Avoidance of protein fold disruption in natural virus recombinants. Lefeuvre Pierre, Lett Jean-Michel, Reynaud Bernard, Martin Darren Patrick. 2007. PLoS Pathogens, 3 (11) : 1782-1789.
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Evolution of hazardous integrations of Banana streak virus in the genome of the wild banana (Musa balbisiana). Gayral Philippe, Laboureau Nathalie, Iskra Caruana Marie-Line. 2007. In : 11th Evolutionary Biology Meeting, September 18-21, 2007, Marseilles. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. Evolutionary Biology Meeting. 11, Marseille, France, 18 Septembre 2007/21 Septembre 2007.
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Integrations of Banana streak virus sequences in the genome of the banana Musa balbisiana : Endogenous viruses of host genes? Gayral Philippe, Laboureau Nathalie, Iskra Caruana Marie-Line. 2007. In : 11th Congress of the European Society for Evolutionary Biology, Uppsala, Sweden, August 20-25, 2007. ESEB. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. Congress of the European Society for Evolutionary Biology. 11, Uppsala, Suède, 20 Août 2007/25 Août 2007.
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Molecular characterization of a pathogenic integration of the Golfinger Gf species of banana streak virus in the genome of Musa balbisiana. Gayral Philippe, Laboureau Nathalie, Iskra Caruana Marie-Line. 2007. In : First ISHS : ProMusa ProMusa Symposium: Recent advances in banana crop protection for sustainable production and improved livelihoods, White River, South Africa, 10-14 september 2007. ISHS. Montpellier : Cirad, Résumé, 1 p. International Symposium on recent advances in banana crop protection for sustainable production and improved livelihoods. 1, White River, Afrique du Sud, 10 Septembre 2007/14 Septembre 2007.
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Prevalence of BSV resulting from an endogenous origin in the outbreak and maintain of the banana streak disease. Laboureau Nathalie, Iskra Caruana Marie-Line, Blondin Laurence, Muller Emmanuelle. 2007. In : First ISHS : ProMusa ProMusa Symposium: Recent advances in banana crop protection for sustainable production and improved livelihoods, White River, South Africa, 10-14 september 2007. ISHS. Montpellier : Cirad, Résumé, 1 p. International Symposium on recent advances in banana crop protection for sustainable production and improved livelihoods. 1, White River, Afrique du Sud, 10 Septembre 2007/14 Septembre 2007.
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Recent advances in research on sugarcane yellow leaf virus, the causal agent of sugarcane yellow leaf. Rott Philippe, Mirkov T.Erik, Schenck S., Girard Jean-Claude. 2007. In : ISSCT 2007: 26th Congress of the International Society of Sugar Cane Technologists Congress, 29 juillet - 2 août 2007, Durban, South Africa. ISSCT. Réduit : ISSCT, 968-977. ISBN 1-920017-01-1 ISSCT Congress. 26, Durban, Afrique du Sud, 29 Juillet 2007/2 Août 2007.

The exploration of the pathosystem BSV/Musa sp. : How does it work? Gayral Philippe, Lheureux Fabrice, Noa-Carrazana Juan Carlos, Lescot Magali, Piffanelli Pietro, Carreel Françoise, Jenny Christophe, Iskra Caruana Marie-Line. 2007. In : First Biosafenet Seminar, 6-8 June 2007, Venice, Italy. ICGEB. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. Biosafenet Seminar. 1, Venise, Italie, 6 Juin 2007/8 Juin 2007.
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Vanilla mosaic virus isolates from French Polynesia and the Cook Islands are Dasheen mosaic virus strains that exclusively infect vanilla. Farreyrol Karin, Pearson Michael N., Grisoni Michel, Cohen Daniel, Beck David. 2006. Archives of Virology, 151 (5) : 905-919.
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Advances in plant virology : A three day International conference at CIRAD, Montpellier, France on 29 September - 1 October 2003. AAB - GBR, CIRAD-AMIS - FRA, INRA - FRA, ENSAM [Ecole nationale supérieure agronomique de Montpellier] - FRA, IRD - FRA. 2003. Warwick : AAB, 66 p. International Conference : Advances in Plant Virology, Montpellier, France, 29 Septembre 2003/1 Octobre 2003.

Development of a dual recombinant vaccine to protect small ruminants against peste-des-petits-ruminants virus and capripoxvirus infections. Berhe G., Minet Cécile, Le Goff Christian, Barrett Thomas, Ngangnou A., Grillet Colette, Libeau Geneviève, Fleming M., Black D.N., Diallo Adama. 2003. Journal of Virology, 77 (2) : 1571-1577.
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Virologie : menace fantôme sur le bananier. Teycheney Pierre-Yves, Caruana Marie-Line. 2003. In : La science au présent 2003 : une année d'actualité scientifique et technique. Giuseppe Annoscia, Yves Gautier. Paris : Encyclopaedia Universalis, 83.

Contribution à l'étude de la mosaïque de la canne à sucre : variabilité du pouvoir pathogène du Sugarcane mosaic virus originaire du Cameroun et du Congo, caractérisation d'isolats viraux d'Asie. Mazarin Candy. 2001. Montpellier : UM2, 37 p. Mémoire DEA : Ressources phytogénétiques et interactions biologiques : Université Montpellier 2
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Séquence du génome d'un clone infectieux de maize streak virus (MSV) de la Réunion, génétiquement distinct des isolats africains. Peterschmitt Michel, Granier Martine, Frutos Roger, Isnard Muriel, Reynaud Bernard. 1995. In : Agronomie = ISSN 0249-5627. (1995)vol.15 : s.n., 497. Conférence sur les maladies virales des poacées en Europe. 7, Versailles, France, 15 Mai 1995/18 Mai 1995.

Laboratoire de Phytovirologie des Régions Chaudes CIRAD-ORSTOM, rapport d'activité n° 5. 1990-1991. CIRAD - FRA, ORSTOM [Institut français de recherche scientifique pour le développement en coopération] - FRA, CIRAD-LPRC - FRA. 1992. Montpellier : CIRAD, 54 p.

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Rapport de mission à la Réunion du 18 au 23 avril 1989. Rouanet Guy. 1989. Montpellier : CIRAD-IRAT, 7 p.

Les agrumes: défense des cultures. Dynamique des populations, lutte biologique, virologie. Mademba-Sy François. 1988. In : National Institute of Higher Education Research Sciences and Technology. - Martinique : CIRAD-IRFA, 1988. s.l. : s.n., 100-104.

Rapport d'activité. Année 1987 IEMVT. CIRAD-IEMVT - FRA. 1988. Maisons-Alfort : CIRAD-IEMVT, 101 p.
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Présence de trois virus chez Sesamia calamistis Hampson (Lépidoptère Agrotidae) à l'Ile de la Réunion. Jacquemard Philippe, Croizier G., Amargier A., Veyrunes J.C., Croizier L., Bordat Dominique, Vercambre Bernard. 1985. L'Agronomie Tropicale (1975), 40 (1) : 66-71.

Présentation des laboratoires de la Direction du Développement de l'Economie Rurale. Desoutter D., Gourdon Frédéric, Grimaud Patrice. 1985. Revue d'Elevage et de Médecine Vétérinaire de Nouvelle-Calédonie (7) : 57-65.

Etude d'une souche du virus de la mosaïque de la canne à sucre 1ère partie. Baudin Pierre. 1977. L'Agronomie Tropicale (1975), 32 (1) : 66-96.

Compte-rendu de la réunion franco-allemande sur l'élevage tropical. GERDAT-IEMVT - FRA. 1973. Maisons-Alfort : GERDAT-IEMVT, 26 p.

Liste des études effectuées par l'IEMVT, en Afrique Centrale. GERDAT-IEMVT - FRA. 1973. Maisons-Alfort : GERDAT-IEMVT, 114 p.

Compte-rendu de la réunion franco-allemande sur l'élevage tropical. GERDAT-IEMVT - FRA. 1972. Maisons-Alfort : GERDAT-IEMVT, 26 p.

Formules et techniques de préparation des milieux de culture cellulaire. Nguyen Ba Vy. 1972. Maisons-Alfort : GERDAT-IEMVT, 18 p.

Service de Virologie : Peste bovine, maladies pestiformes, péripneumonie, Pneumopathies des petits ruminants. Provost Alain, Borredon Christian, Quéval Rémy, Bertin François. 1972. In : Rapport annuel 1971. N'Djamena : Laboratoire de Farcha, 52-122.

Sixième conférence internationale de l'organisation des virologistes des citrus. Swaziland, du 21 au 28 août 1972. Vogel Robert, Cassin Jacques, Bové Joseph M., Blondel L., Laville Etienne. 1972. Fruits, 27 (12) : 887-894. Conférence Internationale de l'Organisation des Virologistes des Citrus. 6, Swaziland, 21 Août 1972/28 Août 1972.
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La maladie nodulaire cutanée des bovidés. Bourdin Pierre. 1971. Paris : L'expansion, 100 p.

Manuel vétérinaire des agents techniques de l'élevage tropical. Larrat R., Pagot Jean, Vandenbussche J.. 1971. Paris : SEAE, 521 p.
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Rapport annuel 1970. GERDAT - TCD. 1970. Maisons-Alfort : GERDAT-IEMVT, 430 p.

Rapport annuel 1970 du Laboratoire de l'Elevage de Niamey (Niger). GERDAT - NER. 1970. Maisons-Alfort : GERDAT-IEMVT, 57 p.

Rapport sur le fonctionnement du LNERV pour l'année 1970. GERDAT - SEN. 1970. Maisons-Alfort : GERDAT-IEMVT, 193 p.

Rapport d'activité de l'IEMVT. Année 1968. IEMVT - FRA. 1969. Maisons-Alfort : IEMVT, 155 p.

Rapport annuel 1968 des Services Vétérinaires de Côte d'Ivoire. IEMVT - CIV. 1968. Abidjan : Services Vétérinaires, 118 p.

Rapport annuel 1968 du Laboratoire Central J. Carougeau. Madagascar. IEMVT - MDG. 1968. Tananarive : IEMVT, 129 p.

Rapport annuel 1968 du Laboratoire de Farcha Tchad. IEMVT - TCD. 1968. Fort-Lamy : IEMVT, 505 p.

Rapport Annuel du Laboratoire de Farcha (Tchad) 1967- 1. Recherches et productions. IEMVT - TCD. 1967. Fort-Lamy : Laboratoire de Farcha, 480 p.

Rapport d'activité Annuel 1967 de l'IEMVT. IEMVT - FRA. 1967. Maisons-Alfort : IEMVT, 143 p.

A propos de l'immunisation croisée : maladie de Carré - peste bovine. Remarques introduites par l'application du calcul en unités néoprobits. Goret P., Béranger A., Provost Alain. 1963. Revue d'Elevage et de Médecine Vétérinaire des Pays Tropicaux, 16 (1) : 19-21.
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Inauguration et conférence sur "les problèmes alimentaires et la pathologie animale en milieu tropical". Mornet Paul. 1955. Revue d'Elevage et de Médecine Vétérinaire des Pays Tropicaux, 8 (2-3) : 109-135.
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