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Integration of GWAS, metabolomics, and sensorial analyses to reveal novel metabolic pathways involved in cocoa fruity aroma GWAS of fruity aroma in Theobroma cacao. Colonges Kelly, Jimenez Juan Carlos, Saltos Alejandra, Seguine Edward, Loor Solorzano Rey Gaston, Fouet Olivier, Argout Xavier, Assemat Sophie, Davrieux Fabrice, Cros Emile, Lanaud Claire, Boulanger Renaud. 2022. Plant Physiology and Biochemistry, 171 : 213-225.

A three-step approach to assess efficacy of alternative chemical treatments to preserve fresh fruit juices: Application to pineapple (Ananas comosus 'Queen Victoria'). Leneveu-Jenvrin Charlène, Aboudia Aouatif, Assemat Sophie, Remize Fabienne. 2022. LWT - Food Science and Technology, 155:112959, 8 p.

Two main biosynthesis pathways involved in the synthesis of the floral aroma of the nacional cocoa variety. Colonges Kelly, Jimenez Juan Carlos, Saltos Alejandra, Seguine Edward, Loor Solorzano Rey Gaston, Fouet Olivier, Argout Xavier, Assemat Sophie, Davrieux Fabrice, Cros Emile, Boulanger Renaud, Lanaud Claire. 2021. Frontiers in Plant Science, 12:681979, 24 p.

Changes of quality of minimally-processed pineapple (Ananas comosus, var. 'Queen Victoria') during cold storage: Fungi in the leading role. Leneveu-Jenvrin Charlène, Quentin Baptiste, Assemat Sophie, Hoarau Mathilde, Meile Jean-Christophe, Remize Fabienne. 2020. Microorganisms, 8 (2), n.spéc. Preservation, Characterization and Exploitation of Microbial Biodiversity of Agri-Food and Environmental Interest:185, 18 p.

Características sensoriales del cacao criollo (Theobroma cacao L.) de Venezuela en función del tratamiento poscosecha. Portillo Elvis, Villasmil Rosa, Portillo A., Grazziani Lucia, Cros Emile, Assemat Sophie, Davrieux Fabrice, Boulanger Renaud. 2014. Revista de la Facultad de Agronomía - LUZ, 29, suppl. 1 : 742-755.

Efecto del tratamiento poscosecha sobre el contenido de teobromina y cafeína en Cacao Criollo (Theobroma cacao L.). Portillo Elvis, Portillo A., Grazziani Lucia, Cros Emile, Assemat Sophie, Davrieux Fabrice, Boulanger Renaud. 2014. Revista de la Facultad de Agronomía - LUZ, 29, suppl. 1 : 801-811.

Near infrared spectroscopy as a new tool to determine cocoa fermentation levels through ammonia nitrogen quantification. Hue Clotilde, Günata Ziya, Bergounhou Audrey, Assemat Sophie, Boulanger Renaud, Sauvage François-Xavier, Davrieux Fabrice. 2014. Food Chemistry, 148 : 240-245.

Diversity of cacao trees in Waslala, Nicaragua: Associations between genotype spectra, product quality and yield potential. Trognitz Bodo, Cros Emile, Assemat Sophie, Davrieux Fabrice, Forestier-Chiron Nelly, Ayestas Eusebio, Kuant Aldo, Scheldeman Xavier, Hermann Michael. 2013. PloS One, 8 (1):e54079, 13 p.

The use of near infrared spectroscopy to determine the fat, caffeine, theobromine and (-)-epicatechin contents in unfermented and sun-dried beans of Criollo cocoa. Alvarez Clímaco, Perez Elevina, Cros Emile, Lares Mary, Assemat Sophie, Boulanger Renaud, Davrieux Fabrice. 2012. Journal of Near Infrared Spectroscopy, 20 (2) : 307-315.

Instrumental and sensory characterization of mango fruit texture. Valente Marc, Ribeyre Fabienne, Self Guy, Berthiot Laurent, Assemat Sophie. 2011. Journal of Food Quality, 34 (6) : 413-424.

Formación del aroma del cacao Criollo (Theobroma cacao L.) en función del tratamiento poscosecha en Venezuela. Portillo Elvis, Labarca María, Grazziani Lucia, Cros Emile, Assemat Sophie, Davrieux Fabrice, Boulanger Renaud, Marcano Maria. 2009. UDO Agricola, 9 (2) : 458-468.

Le vocabulaire du chocolat. Barel Michel, Assemat Sophie. 2007. Chocolat et Confiserie Magazine (423) : 54-60. Atelier d'Analyse Sensorielle des Chocolats, Aix-en-Provence, France, 16 Septembre 2007/18 Septembre 2007.

Bean quality traits and sensory evaluation of wild Guianan cocoa populations (Theobroma cacao L.). Assemat Sophie, Lachenaud Philippe, Ribeyre Fabienne, Davrieux Fabrice, Pradon Jean-Louis, Cros Emile. 2005. Genetic Resources and Crop Evolution, 52 (7) : 911-917.

Comparative organoleptic evaluations of cocoa (Theobroma cacao L.) accessions from the International Clone Trial by three sensory panels over two years. Sukha Darin A., Seguine E.S., Assemat Sophie, Butler David R., Cilas Christian, Ribeyre Fabienne, Seni Gilles, Cros Emile, Davrieux Fabrice, Eskes Albertus. 2011. In : Collaborative and participatory approaches to cocoa variety improvement : final report of the CFC/ICCO/Biodiversity international project on "Cocoa productivity and quality improvement: a participatory approach" (2004-2010). Eskes Albertus (ed.). CFC, Bioversity International, ICCO. Amsterdam : CFC, 128-141. (CFC Technical paper, 59) ISBN 978-92-9043-884-7

Genetic bases of fruity notes (fresh and dried) of the Nacional cocoa variety. Colonges Kelly, Jimenez Juan Carlos, Saltos Alejandra, Seguin Edward, Solorzano Rey Loor, Fouet Olivier, Argout Xavier, Assemat Sophie, Davrieux Fabrice, Morillo Eduardo, Boulanger Renaud, Cros Emile, Lanaud Claire. 2021. In : Progress in flavour research 2021. Proceedings of the 16th Weurman Flavour Research Symposium. Guichard Elisabeth (ed.), Le Quéré Jean-Luc (ed.). INRAE, CSGA. Dijon : INRAE-CSGA, 359-364. ISBN 978-2-7592-3622-0 Weurman Flavour Research Symposium. 16, Dijon, France, 4 Mai 2021/6 Mai 2021.

Adaptation du processus de fermentation aux contraintes locales: Application au cacao du Sambirano de Madagascar. Davrieux Fabrice, Rakotomalala Jean-Jacques, Assemat Sophie, Raherinandrasana N.L., Staub I., Descroix Frédéric. 2017. In : Proceedings of the first International Symposium on Cocoa Research ISCR 2017. ICCO. Lima : ICCO, 7 p. International Symposium on Cocoa Research – ISCR 2017 : Promoting Advances in Research to Enhance the Profitability of Cocoa Farming. 1, Lima, Pérou, 13 Novembre 2017/17 Novembre 2017.

Application de l'Analyse sensorielle dans le Développement des Filières AA du Sud. Assemat Sophie. 2013. In : Journées scientifiques qualiREG. 3ème édition. QualiREG. QualiREG Food Symposium. Qualité des produits alimentaires en océan Indien.. Réseau QualiREG, CIRAD. s.l. : s.n., Résumé, 6. Journées scientifiques QualiREG. 3, Saint-Pierre, Réunion, 19 Novembre 2013/21 Novembre 2013.

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Characterisation of the imperial college selections according to their biochemical composition, aroma volatile fingerprints and sensorial profiles. Sukha Darin A., Davrieux Fabrice, Boulanger Renaud, Assemat Sophie, Alter Pascaline, Butler David R.. 2010. In : 16th International Cocoa Research Conference. Proceedings : towards rational cocoa production and efficient use ofr a sustainable world cocoa economy = 16e Conférence internationale sur la recherche cacaoyère.Actes ; 16 Conferencia Internacional de Pesquisas em Cacau. Actas ; 16 Conferencia Internacional de investigacion en cacao. Actas : vers une économie cacaoyère durable : quelles stratégies d'approche ? ; para uma produção racional de cacau e o seu uso eficiente para uma economia mundial sustentada do cacau ; hacia una produccion racional y un uso eficiente del cacao para la sustentabilitd. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, 813-821. ISBN 978-065-959-5 Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 16, Bali, Indonésie, 16 Novembre 2009/21 Novembre 2009.

Characterization of cocoa clones from different origins for purine contents predicted by NIRS. Davrieux Fabrice, Assemat Sophie, Boulanger Renaud, Sukha Darin A., Eskes Albertus, Paulin Didier, Cros Emile. 2010. In : 16th International Cocoa Research Conference. Proceedings : towards rational cocoa production and efficient use ofr a sustainable world cocoa economy = 16e Conférence internationale sur la recherche cacaoyère.Actes ; 16 Conferencia Internacional de Pesquisas em Cacau. Actas ; 16 Conferencia Internacional de investigacion en cacao. Actas : vers une économie cacaoyère durable : quelles stratégies d'approche ? ; para uma produção racional de cacau e o seu uso eficiente para uma economia mundial sustentada do cacau ; hacia una produccion racional y un uso eficiente del cacao para la sustentabilitd. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, 823-829. ISBN 978-065-959-5 Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 16, Bali, Indonésie, 16 Novembre 2009/21 Novembre 2009.

Comparison between fresh bean volatile compound composition of Criollo and Trinitario cocoa type of Venezuela. Boulanger Renaud, Portillo Elvis, Assemat Sophie, Davrieux Fabrice, Cros Emile. 2010. In : 15th International Cocoa Research Conference : cocoa productivity, quality, profitability, human health and the environment = 15e Conférence internationale sur la recherche cacaoyère : Productivité, qualité, rentabilité du cacao, santé humaine et environnement ; 15 Conferencia Internacional de Pesquisas em Cacau. Cacau : produtividade, qualidade, rentabilidade, saude humanna e amb. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, 1165-1170. Conférence internationale sur la recherche cacaoyère. 15, San José, Costa Rica, 9 Octobre 2006/14 Octobre 2006.

Determining fermentation levels and flavan-3-ol contents in dried cocoa by near infrared spectroscopy. Davrieux Fabrice, Boulanger Renaud, Assemat Sophie, Portillo Elvis, Cros Emile. 2010. In : 15th International Cocoa Research Conference : cocoa productivity, quality, profitability, human health and the environment = 15e Conférence internationale sur la recherche cacaoyère : Productivité, qualité, rentabilité du cacao, santé humaine et environnement ; 15 Conferencia Internacional de Pesquisas em Cacau. Cacau : produtividade, qualidade, rentabilidade, saude humanna e amb. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, 1521-1528. Conférence internationale sur la recherche cacaoyère. 15, San José, Costa Rica, 9 Octobre 2006/14 Octobre 2006.

Dry heat treatment: an alternative to methyl bromide use in cocoa warehouse moth control. Davrieux Fabrice, Babin Régis, Assemat Sophie, Rouzière André, Reynes Max, Bastide Philippe, Petithuguenin Philippe. 2010. In : 15th International Cocoa Research Conference : cocoa productivity, quality, profitability, human health and the environment = 15e Conférence internationale sur la recherche cacaoyère : Productivité, qualité, rentabilité du cacao, santé humaine et environnement ; 15 Conferencia Internacional de Pesquisas em Cacau. Cacau : produtividade, qualidade, rentabilidade, saude humanna e amb. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, 1087-1093. Conférence internationale sur la recherche cacaoyère. 15, San José, Costa Rica, 9 Octobre 2006/14 Octobre 2006.

Improvement of the general cocoa flavour development diagram : influence of drying on Criollo cocoa flavour. Portillo Elvis, Graziani Lucia, Boulanger Renaud, Assemat Sophie, Davrieux Fabrice, Cros Emile. 2010. In : 15th International Cocoa Research Conference : cocoa productivity, quality, profitability, human health and the environment = 15e Conférence internationale sur la recherche cacaoyère : Productivité, qualité, rentabilité du cacao, santé humaine et environnement ; 15 Conferencia Internacional de Pesquisas em Cacau. Cacau : produtividade, qualidade, rentabilidade, saude humanna e amb. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, 1157-1163. Conférence internationale sur la recherche cacaoyère. 15, San José, Costa Rica, 9 Octobre 2006/14 Octobre 2006.

Influence of post-harvest processing on flavour quality of cocoa Trinitario of Venezuela. Boulanger Renaud, Michodjehoun-Mestres Laetitia, Assemat Sophie, Portillo Elvis, Davrieux Fabrice, Cros Emile. 2010. In : 15th International Cocoa Research Conference : cocoa productivity, quality, profitability, human health and the environment = 15e Conférence internationale sur la recherche cacaoyère : Productivité, qualité, rentabilité du cacao, santé humaine et environnement ; 15 Conferencia Internacional de Pesquisas em Cacau. Cacau : produtividade, qualidade, rentabilidade, saude humanna e amb. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, 1341-1345. Conférence internationale sur la recherche cacaoyère. 15, San José, Costa Rica, 9 Octobre 2006/14 Octobre 2006.

Détermination de l'origine géographique du cacao par spectrométrie proche infrarouge : estudio preliminar. Davrieux Fabrice, Assemat Sophie, Boulanger Renaud, Cros Emile. 2005. In : 14th International Cocoa Research Conference. Proceedings : rumo a uma economia sustentavel do cacau - quais as estrategias para este fim ? = 14th International Cocoa Research Conference. Proccedings ; 14e Conférence internationale sur la recherche cacaoyère. Actes ; 14 Conferencia Internacional de Pesquisas em Cacau. Atas ; 14 Conferencia Internacional de Investigacion en Cacao. Actas : towards a sustainable cocoa economy - what strategies to this end ? ; vers une économie cacaoyère durable : quelles stratégies d'approche ? ; rumo a uma economia sustentavel do cacau - quais as estrategias para este fim ? ; hacia una economia sustentable del ca. CEPLAC, CRIG, MCB. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, 1047-1052. ISBN 978-065-959-5 Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 14, Accra, Ghana, 13 Octobre 2003/18 Octobre 2003.

Détermination de la teneur en purines du cacao par spectrométrie proche infrarouge. Davrieux Fabrice, Assemat Sophie, Boulanger Renaud, Cros Emile. 2005. In : 14th International Cocoa Research Conference. Proceedings : rumo a uma economia sustentavel do cacau - quais as estrategias para este fim ? = 14th International Cocoa Research Conference. Proccedings ; 14e Conférence internationale sur la recherche cacaoyère. Actes ; 14 Conferencia Internacional de Pesquisas em Cacau. Atas ; 14 Conferencia Internacional de Investigacion en Cacao. Actas : towards a sustainable cocoa economy - what strategies to this end ? ; vers une économie cacaoyère durable : quelles stratégies d'approche ? ; rumo a uma economia sustentavel do cacau - quais as estrategias para este fim ? ; hacia una economia sustentable del ca. CEPLAC, CRIG, MCB. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, 861-867. ISBN 978-065-959-5 Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 14, Accra, Ghana, 13 Octobre 2003/18 Octobre 2003.

Evolution de la qualité du cacao au cours du stockage en atmosphère contrôlée simulant les conditions portuaires. Assemat Sophie, Cros Emile, Davrieux Fabrice, Fourny Gérard. 2005. In : 14th International Cocoa Research Conference. Proceedings : rumo a uma economia sustentavel do cacau - quais as estrategias para este fim ? = 14th International Cocoa Research Conference. Proccedings ; 14e Conférence internationale sur la recherche cacaoyère. Actes ; 14 Conferencia Internacional de Pesquisas em Cacau. Atas ; 14 Conferencia Internacional de Investigacion en Cacao. Actas : towards a sustainable cocoa economy - what strategies to this end ? ; vers une économie cacaoyère durable : quelles stratégies d'approche ? ; rumo a uma economia sustentavel do cacau - quais as estrategias para este fim ? ; hacia una economia sustentable del ca. CEPLAC, CRIG, MCB. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, 1111-1117. ISBN 978-065-959-5 Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 14, Accra, Ghana, 13 Octobre 2003/18 Octobre 2003.

Influence du mode de préparation du café vert robusta sur sa composition chimique et ses qualités organoleptiques. Guyot Bernard, Gueule Dominique, Assemat Sophie, Tchana Esther, Pomathios L.. 1995. In : Seizième colloque scientifique international sur le café, Kyoto (Japon), 9-14 avril 1995 = Sixteenth international scientific colloquium on coffee. ASIC. Paris : ASIC, 267-277. ISBN 2-900212-15-4 Colloque Scientifique International sur le Café. 16, Kyoto, Japon, 9 Avril 1995/14 Avril 1995.

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Adding value to T. cacao germplasm collections combining GWAS and genome sequence analysis. W118. Lanaud Claire, Santos Alejandra, Jimenez Juan Carlos, Lemainque Arnaud, Pavek Sylvana, Argout Xavier, Fouet Olivier, Seguine Edward, Assemat Sophie, Davrieux Fabrice, Boulanger Renaud, Cros Emile, Loor Rey Gaston. 2012. In : Plant and Animal Genome XX conference, San diego, USA, January 14-18 2012,. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. Plant and Animal Genome conference. 20, San Diego, États-Unis, 14 Janvier 2012/18 Janvier 2012.

Eléments d'information sur les effets de l'environnement aromatique de la pulpe de cacao pendant la fermentation sur le profil d'arôme des chocolats. Eskes Albertus, Ahnert Dario, Carrion Luis Garcia, Seguine Edward, Assemat Sophie, Guarda D., Garcia P.R.. 2012. In : 17th Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère : Résumés = 17th International Cocoa Research Conference ; 17th Conferencia Internacional De Investigaçao Sobre 0 Cacau ; 17th Conferencia International de Investigacion en Cacao. Lagos : Alliance des Pays Producteurs de Cacao, Résumé, 91. Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 17, Yaoundé, Cameroun, 15 Octobre 2012/20 Octobre 2012.

Estimation de la qualité de la fermentation du cacao par spectroscopie NIRS par le biais de la quantification de l'azote ammoniacal. Hue Clotilde, Davrieux Fabrice, Assemat Sophie, Boulanger Renaud, Kapitan Gnimdu André, Costet Pierre, Günata Ziya. 2012. In : 17th Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère : Résumés = 17th International Cocoa Research Conference ; 17th Conferencia Internacional De Investigaçao Sobre 0 Cacau ; 17th Conferencia International de Investigacion en Cacao. Lagos : Alliance des Pays Producteurs de Cacao, Résumé, 98. Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 17, Yaoundé, Cameroun, 15 Octobre 2012/20 Octobre 2012.

Evidence on the effect of the cocoa pulp flavour environment during fermentation on the flavour profile of chocolates. Eskes Albertus, Ahnert Dario, Garcia Carrion Luis, Seguine Edward, Assemat Sophie, Guarda D., Garcia R Patricia. 2012. In : 17th Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère, Yaounde, Cameroun, 15 - 20 Octobre 2012. COPAL. s.l. : s.n., 20 p. Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 17, Yaoundé, Cameroun, 15 Octobre 2012/20 Octobre 2012.

Evolution de la teneur en flavonoïdes du cacao criollo du Vénézuela en fonction du traitement post-récolte. Portillo Elvis, Grazziani Lucia, Cros Emile, Assemat Sophie, Davrieux Fabrice, Boulanger Renaud. 2012. In : 17th Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère : Résumés = 17th International Cocoa Research Conference ; 17th Conferencia Internacional De Investigaçao Sobre 0 Cacau ; 17th Conferencia International de Investigacion en Cacao. Lagos : Alliance des Pays Producteurs de Cacao, Résumé, 93. Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 17, Yaoundé, Cameroun, 15 Octobre 2012/20 Octobre 2012.

Sélection de variétés de cacaoyers cultivés à Bahia, au Brésil, pour améliorer la qualité des produits obtenus. Sampaio Rosa, Efraim Priscilla, Reis de Andrade Silva Adriana, Assemat Sophie, Bastide Philippe, Forestier-Chiron Nelly, Costet Pierre, Bonnat Stéphane, Luccas Valdecir, Pires José Luis. 2012. In : 17th Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère : Résumés = 17th International Cocoa Research Conference ; 17th Conferencia Internacional De Investigaçao Sobre 0 Cacau ; 17th Conferencia International de Investigacion en Cacao. Lagos : Alliance des Pays Producteurs de Cacao, Résumé, 136. Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 17, Yaoundé, Cameroun, 15 Octobre 2012/20 Octobre 2012.

The cocoa of excellence and international cocoa awards initiatives: rewarding diversity and excellence in producing high-quality cocoa origins. Eskes Albertus, Assemat Sophie, Jeantet François, Seguine Edward, Sukha Darin A., Weise Stephan, Thiriet Janis, Rond Julien, Laliberté Brigitte, Barel Michel, Cros Emile, Forestier-Chiron Nelly, Hard Kristen. 2012. In : 17th Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère, Yaounde, Cameroun, 15 - 20 Octobre 2012. COPAL. s.l. : s.n., 11 p. Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 17, Yaoundé, Cameroun, 15 Octobre 2012/20 Octobre 2012.

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Fiches variétales mangues. Jessu Doralice, Sinatamby Muriel, Assemat Sophie, Normand Frédéric. 2017. Saint Pierre : CIRAD-PERSYST-UPR HortSys, 10 p.

Mission en Nouvelle Calédonie. Stage de formation à l'expertise café. Perriot Jean-Jacques, Assemat Sophie. 1990. Montpellier : CIRAD-IRCC, 42 p.

Preliminary insight into the biochemical composition, aroma volatile fingerprints and sensorial profiles of the Imperial College Selections over two crop years. Sukha Darin A., Davrieux Fabrice, Boulanger Renaud, Alter Pascaline, Assemat Sophie, Bharath Sarah, Ali Naailah, Butler David R.. 2010. In : Cocoa Research Unit. Annual report 2009. UWI-CRU. St Augustine : UWI, 67-75.

Preliminary results from chemical analyses of selected cacao (Theobroma cacao L.) accessions: trainig experiences at CIRAD. Sukha Darin A., Cros Emile, Assemat Sophie, Davrieux Fabrice, Butler David R.. 2002. In : Cocoa Research Unit. Annual report 2001. UWI-CRU. St Augustine : UWI, 55-61.

Rapport d'activité du Cirad. Réunion - Océan indien 2015 - 2021. Jeuffrault Eric (ed.), Baldet Thierry, Cardinale Eric, Tran Annelise, Squarzoni Cécile, Reynaud Bernard, Nibouche Samuel, Talibart Nicolas, Grisoni Michel, Jourda Cyril, Robene Isabelle, Delatte Hélène, Rouget Mathieu, Normand Frédéric, Assemat Sophie, Mottes Charles, Huat Joël, Grechi Isabelle, Ratnadass Alain, Soler Alain, Vayssières Jonathan, Ripoche Aude, Versini Antoine, Todoroff Pierre, Christina Mathias, Mialet Isabelle, Porphyre Vincent, Cerdan Claire, Soria Christian, Negri Mathilde, Salinier Jérémy, Miralles Maëva, Sadaillan Jean Marc. 2022. Saint-Denis : CIRAD, 51 p.