Résultats pour Auteur : "Larmande, Pierre"

Benchmarking database systems for Genomic Selection implementation. Nti-Addae Yaw, Matthews Dave, Ulat Victor Jun, Syed Raza, Sempere Guilhem, Petel Adrien, Renner Jon, Larmande Pierre, Guignon Valentin, Jones Elizabeth, Robbins Kelly. 2019. Database, 2019:baz096, 10 p.

BrAPI—an application programming interface for plant breeding applications. Selby Peter, Abbeloos Rafael, Backlund Jan Erik, Basterrechea Salido Martin, Bauchet Guillaume, Benites-Alfaro Omar E., Birkett Clay, Calaminos Viana C., Carceller Pierre, Cornut Guillaume, Vasques Costa Bruno, Edwards Jeremy D., Finkers Richard, Yanxin Gao Star, Ghaffar Mehmood, Glaser Philip, Guignon Valentin, Hok Puthick, Kilian Andrzej, König Patrick, Lagare Jack Elendil B., Lange Matthias, Laporte Marie-Angélique, Larmande Pierre, LeBauer David S., Lyon David A., Marshall David S., Matthews Dave, Milne Iain, Mistry Naymesh, Morales Nicolas, Mueller Lukas, Neveu Pascal, Papoutsoglou Evangelia, Pearce Brian, Perez-Masias Ivan, Pommier Cyril, Ramírez-González Ricardo H., Rathore Abhishek, Raquel Angel Manica, Raubach Sebastian, Rife Trevor, Robbins Kelly, Rouard Mathieu, Sarma Chaitanya, Scholz Uwe, Sempere Guilhem, et al.. 2019. Bioinformatics, 35 (20) : 4147-4155.

Gigwa v2—Extended and improved genotype investigator. Sempere Guilhem, Petel Adrien, Rouard Mathieu, Frouin Julien, Hueber Yann, De Bellis Fabien, Larmande Pierre. 2019. GigaScience, 8 (5), 9 p.

Rice Galaxy: An open resource for plant science. Juanillas Venice, Dereeper Alexis, Beaume Nicolas, Droc Gaëtan, Dizon Joshua, Mendoza John Robert, Perdon Jon Peter, Mansueto Locedie, Triplett Lindsay R., Lang Jillian M., Zhou Gabriel, Ratharanjan Kunalan, Plale Beth, Haga Jason, Leach Jan E., Ruiz Manuel, Thomson Michael J., Alexandrov Nickolai, Larmande Pierre, Kretzschmar Tobias, Mauleon Ramil P.. 2019. GigaScience, 8 (5) : 1-14.

AgroPortal: A vocabulary and ontology repository for agronomy. Jonquet Clément, Toulet Anne, Arnaud Elizabeth, Aubin Sophie, Dzalé Yeumo Esther, Emonet Vincent, Graybeal John, Laporte Marie-Angélique, Musen Mark A., Pesce Valeria, Larmande Pierre. 2018. Computers and Electronics in Agriculture, 144 : 126-143.

Agronomic linked data (AgroLD): A knowledge-based system to enable integrative biology in agronomy. Venkatesan Aravind, Tagny Ngompé Gildas, El Hassouni Nordine, Chentli Imene, Guignon Valentin, Jonquet Clément, Ruiz Manuel, Larmande Pierre. 2018. PloS One, 13 (11):e0198270, 17 p.

Scientific workflows for computational reproducibility in the life sciences: Status, challenges and opportunities. Cohen-Boulakia Sarah, Belhajjame Khalid, Collin Olivier, Chopard Jérôme, Froidevaux Christine, Gaignard Alban, Hinsen Konrad, Larmande Pierre, Le Bras Yvan, Lemoine Frédéric, Mareuil Fabien, Ménager Hervé, Pradal Christophe, Blanchet Christophe. 2017. Future Generation Computer Systems, 75 : 284-298.

Gigwa—Genotype investigator for genome-wide analyses. Sempere Guilhem, Philippe Florian, Dereeper Alexis, Ruiz Manuel, Sarah Gautier, Larmande Pierre. 2016. GigaScience, 5 (25), 9 p.

The South Green portal: A comprehensive resource for tropical and Mediterranean crop genomics. Guignon Valentin, Hueber Yann, Rouard Mathieu, Bocs Stéphanie, Couvin David, De Lamotte Frédéric, Droc Gaëtan, Dufayard Jean François, El Hassouni Nordine, Farcy Cédric, Gkanogiannis Anestis, Hamelin Chantal, Larivière Delphine, Martin Guillaume, Ortega Enrique, Pitollat Bertrand, Pointet Stéphanie, Ruiz Manuel, Gautier Sarah, Summo Marilyne, This Dominique, Ravel Sébastien, Larmande Pierre, Monat Cécile, Sabot François, Tando Ndomassi, Tranchant-Dubreuil Christine, Sempere Guilhem, Dereeper Alexis. 2016. Current Plant Biology, 7-8 : 6-9.

Une architecture orientée services pour l'extraction de connaissances dans la base de données liées AgroLD. Tagny Ngompé Gildas, Venkatesan Aravind, El Hassouni Nordine, Ruiz Manuel, Larmande Pierre. 2016. Ingénierie des Systèmes d'Information, 21 (5-6), Le web de données : publication, liage et capitalisation : 133-157.

Clever generation of rich SPARQL queries from annotated relational schema: Application to Semantic Web Service creation for biological databases. Wollbrett Julien, Larmande Pierre, De Lamotte Frédéric, Ruiz Manuel. 2013. BMC Bioinformatics, 14 (126), 15 p.

In-depth molecular and phenotypic characterization in a rice insertion line library facilitates gene identification through reverse and forward genetics approaches. Lorieux Mathias, Blein Mélisande, Lozano Jaime, Bouniol Matthieu, Droc Gaëtan, Diévart Anne, Perin Christophe, Mieulet Delphine, Lanau Nadège, Bes Martine, Rouvière Claire, Gay Céline, Piffanelli Pietro, Larmande Pierre, Michel Corinne, Barnola Isabelle, Biderre-Petit Corinne, Sallaud Christophe, Perez Pascual, Bourgis Fabienne, Ghesquière Alain, Gantet Pascal, Tohmé Joe, Morel Jean-Benoit, Guiderdoni Emmanuel. 2012. Plant Biotechnology Journal, 10 (5) : 555-568.

OryGenesDB 2008 update: Database interoperability for functional genomics of rice. Droc Gaëtan, Perin Christophe, Fromentin Sébastien, Larmande Pierre. 2009. Nucleic Acids Research, 37, suppl. 1, D992-D995

Oryza Tag Line, a phenotypic mutant database for the genoplante rice insertion line library. Larmande Pierre, Gay Céline, Lorieux Mathias, Perin Christophe, Bouniol Matthieu, Droc Gaëtan, Sallaud Christophe, Perez Pascual, Barnola Isabelle, Biderre-Petit Corinne, Martin Jérôme, Morel Jean-Benoit, Johnson Alexander A.T., Bourgis Fabienne, Ghesquière Alain, Ruiz Manuel, Courtois Brigitte, Guiderdoni Emmanuel. 2008. Nucleic Acids Research, 36 : 1022-1027.

OryGenesDB: A database for rice reverse genetics. Droc Gaëtan, Ruiz M., Larmande Pierre, Pereira Andy, Piffanelli Pietro, Morel Jean-Benoit, Dievart Anne, Courtois Brigitte, Guiderdoni Emmanuel, Perin Christophe. 2006. Nucleic Acids Research, 34 : 736-740.

High throughput T-DNA insertion mutagenesis in rice : A first step towards in silico reverse genetics. Sallaud Christophe, Gay Céline, Larmande Pierre, Bes Martine, Piffanelli Pietro, Piegu Benoît, Droc Gaëtan, Regad Farid, Bourgeois Emmanuelle, Meynard Donaldo, Perin Christophe, Sabau Xavier, Ghesquière Alain, Glaszmann Jean-Christophe, Delseny Michel, Guiderdoni Emmanuel. 2004. Plant Journal, 39 (3) : 450-464.

A new cacao linkage map based on codominant markers : development and integration of 201 new microsatellite markers. Pugh Tatiana, Fouet Olivier, Risterucci Ange-Marie, Brottier Philippe, Abouladze M., Delettrez Claire, Courtois Brigitte, Clément Didier, Larmande Pierre, N'Goran Jeanne A.K., Lanaud Claire. 2004. Theoretical and Applied Genetics, 108 (6) : 1151-1161.

Highly efficient production and characterization of T-DNA plants for rice (Oryza sativa L.) functional genomics. Sallaud Christophe, Meynard Donaldo, Van Boxtel Jos, Gay Céline, Bes Martine, Brizard Jean-Paul, Larmande Pierre, Ortega D., Raynal Monique, Portefaix Murielle, Ouwerkerk Pieter B.F., Rueb S., Delseny Michel, Guiderdoni Emmanuel. 2003. Theoretical and Applied Genetics, 106 : 1396-1408.

AgroLD: A knowledge graph database for plant functional genomics. Larmande Pierre, Tagny Ngompé Gildas, Venkatesan Aravind, Ruiz Manuel. 2022. In : Plant bioinformatics: methods and protocols. Edwards David (ed.). Cham : Springer, 527-540. (Methods in Molecular Biology, 2443) ISBN 978-1-0716-2066-3

Managing high-density genotyping data with Gigwa. Sempere Guilhem, Larmande Pierre, Rouard Mathieu. 2022. In : Plant Bioinformatics: methods and protocols. Edwards David (ed.). Cham : Springer-Humana Press, 415-427. (Methods in Molecular Biology, 2443, 2443) ISBN 978-1-0716-2066-3

Managing and exploring large genotyping data with Gigwa. Sempere Guilhem, Petel Adrien, Rouard Mathieu, Larmande Pierre, Hueber Yann, Frouin Julien, De Bellis Fabien. 2019. . PAG. San Diego : PAG, Résumé, 2 p. Plant and Animal Genome Conference (PAG). 27, San Diego, États-Unis, 12 Janvier 2019/16 Janvier 2019.

The South Green Bioinformatics platform, a comprehensive resource for crop genomics. Ruiz Manuel, Dereeper Alexis, Droc Gaëtan, Sarah Gautier, Tranchant-Dubreuil Christine, Dufayard Jean François, Guignon Valentin, Hamelin Chantal, De Lamotte Frédéric, Larmande Pierre, Sabot François, Sempere Guilhem, Summo Marilyne, Pitollat Bertrand, This Dominique, Bocs Stéphanie, Hueber Yann, El Hassouni Nordine, Martin Guillaume, Gkanogiannis Anestis, Ravel Sébastien, Monat Cécile, Tando Ndomassi, Rouard Mathieu. 2017. In : Proceedings X-Meeting 2017. s.l. : s.n., 1 p. International Conference of the AB3. 13, São Pedro, Brésil, 4 Octobre 2017/6 Octobre 2017.

AgroLD: un graphe de connaissances pour la caractérisation des mécanismes moléculaires complexes impactant le phénome des plantes. Larmande Pierre, Tagny Ngompé Gildas, Ruiz Manuel. 2019. In : Journées francophones d'ingénierie des connaissances IC PFIA 2019. AFIA. Toulouse : AFIA, Résumé, 217-219. Journées francophones d'Ingénierie des Connaissances (IC 2019). 30, Toulouse, France, 2 Juillet 2019/4 Juillet 2019.

South Green, une plateforme de bioinformatique tournée vers l'agriculture dans les pays du sud. Ravel Sébastien, Bocs Stéphanie, Brousseau Louise, De Lamotte Frédéric, Dereeper Alexis, Droc Gaëtan, Dufayard Jean François, Guignon Valentin, Hamelin Chantal, Larmande Pierre, Mahé Frédéric, Martin Guillaume, Orjuela-Bouniol Julie, Pitollat Bertrand, Rouard Mathieu, Ruiz Manuel, Sabot François, Sarah Gautier, Sempere Guilhem, Summo Marilyne, Tando Ndomassi, Tranchant-Dubreuil Christine. 2018. In : JOBIM 2018 Abstracts. SFBI, GdR BiM, IFB, AMU, INSERM, CNRS. Marseille : SFBI, 418-420. Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM 2018), Marseille, 3 Juillet 2018/6 Juillet 2018.

AgroPortal: an ontology repository for agronomy. Jonquet Clément, Toulet Anne, Emonet Vincent, Larmande Pierre. 2017. In : Conference proceedings of 2017 EFITA WCCA congress: European conference dedicated to the future use of ICT in the agri-food sector, bioresource and biomass sector. EFITA, WCCA. Montpellier : IRSTEA, 223. ISBN 978-2-85362-686-6 European Federation for Information in Agriculture, Food and Environment (EFITA 2017), Montpellier, France, 2 Juillet 2017/6 Juillet 2017.

The Agronomic Linked Data (AgroLD) Project. [P0322]. Larmande Pierre, Ruiz Manuel, El Hassouni Nordine, Venkatesan Aravind. 2017. In : Proceedings Plant and Animal Genome XXV Conference. San Diego : PAG, 1 p. Plant and Animal Genome Conference. 25, San Diego, États-Unis, 14 Janvier 2017/18 Janvier 2017.

The Agronomic Linked Data (AgroLD) project. El Hassouni Nordine, Ruiz Manuel, Toulet Anne, Jonquet Clément, Larmande Pierre. 2017. In : Conference proceedings of 2017 EFITA WCCA congress: European conference dedicated to the future use of ICT in the agri-food sector, bioresource and biomass sector. EFITA, WCCA. Montpellier : IRSTEA, 221. ISBN 978-2-85362-686-6 European Federation for Information in Agriculture, Food and Environment (EFITA 2017), Montpellier, France, 2 Juillet 2017/6 Juillet 2017.

Gigwa - Genotype Investigator for Genome-Wide Analyses. [P0442]. Ruiz Manuel, Sempere Guilhem, Petel Adrien, Dereeper Alexis, Gautier Sarah, Larmande Pierre. 2017. In : Proceedings Plant and Animal Genome XXV Conference. San Diego : PAG, 1 p. Plant and Animal Genome Conference. 25, San Diego, États-Unis, 14 Janvier 2017/18 Janvier 2017.

Interoperability and interpretation of phenotyping data: use of plant ontologies. Arnaud Elizabeth, Ansell P., Sirault X., Cooper Laurel, Jaiswal Pankaj, Pommier Cyril, Larmande Pierre, Ruiz Manuel. 2015. In : Recent progress in drought tolerance: from genetics to modelling conference handbook. Tardieu F. (ed.), Draye X. (ed.), Charcosset A. (ed.), Hammer G. (ed.), Usadel B. (ed.), Tuberosa R. (ed.), Welker C. (ed.), Boerner A. (ed.), Simic D.(ed.), Boller B. (ed.). Eucarpia, INRA. Montpellier : INRA-Transfert, Résumé, 96. EUCARPIA Conference "Recent progress in drought tolerance: from genetics to modelling", Montpellier, France, 8 Juin 2015/9 Juin 2015.

South Green bioinformatics platform: Update 2015. Armero A., Baurens Franc-Christophe, Bocs Stéphanie, Breil A., De Lamotte Frédéric, Dereeper Alexis, Droc Gaëtan, Dufayard Jean François, El Hassouni Nordine, Farcy Cédric, Garsmeur Olivier, Guignon Valentin, Hamelin Chantal, Hueber Yann, Kougbeadjo Ayite, Larivière Delphine, Larmande Pierre, Lorenzo Jonathan, Martin Guillaume, Monat Cécile, Ndomassi T., Ortega Abboud Enrique, Pitollat Bertrand, Ravel Sébastien, Ranwez Vincent, Rouard Mathieu, Ruiz E., Sabot François, Sarah Gautier, Sempere Guilhem, Summo Marilyne, This Dominique, Tranchant-Dubreuil Christine, Vallier Félix. 2015. In : Plant Genomics Congress. Global Engage. Londres : Global Engage, 51. Plant Genomics Congress. 3, Londres, Royaume-Uni, 11 Mai 2015/12 Mai 2015.

Towards efficient data integration and knowledge management in the Agronomic domain. Venkatesan Aravind, El Hassouni Nordine, Philippe Florian, Pommier Cyril, Quesneville Hadi, Ruiz Manuel, Larmande Pierre. 2015. In : Actes APIA. AFIA. Rennes : AFIA, 117-124. Conférence sur les Applications Pratiques de l'Intelligence Artificielle. 1, Rennes, France, 2 Juillet 2015/3 Juillet 2015.

A new codominant marker-based cocoa linkage map : development and intergration of new microsatellite markers into cocoa linkage map. A new cocoa reference map. Pugh Tatiana, Fouet Olivier, Risterucci Ange-Marie, Brottier Philippe, Abouladze M., Delettrez Claire, Courtois Brigitte, Clément Didier, Larmande Pierre, N'Goran Jeanne A.K., Lanaud Claire. 2005. In : 14th International Cocoa Research Conference. Proceedings : rumo a uma economia sustentavel do cacau - quais as estrategias para este fim ? = 14th International Cocoa Research Conference. Proccedings ; 14e Conférence internationale sur la recherche cacaoyère. Actes ; 14 Conferencia Internacional de Pesquisas em Cacau. Atas ; 14 Conferencia Internacional de Investigacion en Cacao. Actas : towards a sustainable cocoa economy - what strategies to this end ? ; vers une économie cacaoyère durable : quelles stratégies d'approche ? ; rumo a uma economia sustentavel do cacau - quais as estrategias para este fim ? ; hacia una economia sustentable del ca. CEPLAC, CRIG, MCB. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, 153-160. ISBN 978-065-959-5 Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 14, Accra, Ghana, 13 Octobre 2003/18 Octobre 2003.

A high density cocoa genetic map enriched with microsatellite markers. Lanaud Claire, Larmande Pierre, Risterucci Ange-Marie, Fargeas Dominique. 2001. In : 13th International Cocoa Research Conference. Proceedings : Towards the effective and optimum promotion of cocoa through research and development = 13e Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. Actes ; 13 Conferencia Internacional de Pesquisas em Cacau. Atas ; 13 Conferencia Internacional de Investigacion en Cacao. Actas : Vers la promotion efficace et optimum du cacao par la recherche et le développement ; Para um melhor e efetivo desenvolvimento do cacau atraves da pesquisa e do aperfeicoamento ; En pos de una promocion optima y efectiva del cacao mediante la investigacion y. MCB. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, 256-265. ISBN 983-40740-0-X Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 13, Kota Kinabalu, Malaisie, 9 Octobre 2000/14 Octobre 2000.

AgroLD: A Knowledge Graph Database for plant functional genomics. Larmande Pierre, Tando Ndomassi, Pitollat Bertrand, Guignon Valentin, Rouard Mathieu, Droc Gaëtan, Ruiz Manuel. 2021. . Paris : Société Française de Bio-Informatique, Résumé, 43. Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM 2021), Paris, France, 6 Juillet 2021/9 Juillet 2021.

South Green bioinformatic resources for tropical and Mediterranean crops. Rouard Mathieu, Bocs Stéphanie, Breton Catherine, Comte Aurore, De Lamotte Frédéric, Dereeper Alexis, Droc Gaëtan, Dufayard Jean François, Guignon Valentin, Hamelin Chantal, Larmande Pierre, Lopez David, Mahé Frédéric, Martin Guillaume, Orjuela-Bouniol Julie, Pitollat Bertrand, Ravel Sébastien, Ruiz Manuel, Sabot François, Sarah Gautier, Sempere Guilhem, Summo Marilyne, Tando Ndomassi, Tranchant-Dubreuil Christine. 2020. . SFBI, IFB, GDR-BIM. Montpellier : SFBI, 1 p. Journées ouvertes de biologie, informatique et mathématique (JOBIM 2020). 20, Montpellier, France, 30 Juin 2020/3 Juillet 2020.

South Green bioinformatics platform : Plateforme collaborative de bioinformatique verte héraultaise. Bocs Stéphanie, Couvin David, De Lamotte Frédéric, Dereeper Alexis, Droc Gaëtan, Dufayard Jean François, El Hassouni Nordine, Farcy Cédric, Gkanogiannis Anestis, Guignon Valentin, Hamelin Chantal, Hueber Yann, Larivière Delphine, Larmande Pierre, Martin Guillaume, Monat Cécile, Ortega Abboud Enrique, Pitollat Bertrand, Pointet Stéphanie, Ravel Sébastien, Rouard Mathieu, This Patrice, Tranchant-Dubreuil Christine. 2017. . Montpellier : CIRAD, 1 poster Amphithéâtre "Patrimoine Numérique Scientifique", Montpellier, France, 20 Février 2017/20 Février 2017.

Genotype investigator for Genome Wide Analysis (GIGwA) [P1111]. Larmande Pierre, Sempere Guilhem, Philippe Florian, Dereeper Alexis, Ruiz Manuel, Sarah Gautier. 2015. In : Plant and Animal Genomes Conference XXIII Conference, San diego, United States, San Diego, United States, January 10-14, 2015. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genome Conference. 23, San Diego, États-Unis, 10 Janvier 2015/14 Janvier 2015.

Facilitating efficient knowledge management and discovery in the Agronomic Sciences. Venkatesan Aravind, Larmande Pierre, Jonquet Clément, Ruiz Manuel, Valduriez Patrick. 2014. . Amsterdam : Research Data Alliance, 1 poster Plenary Meeting: Agricultural Data Interoperability Interest Group. 4, Amsterdam, Pays-Bas, 22 Septembre 2014/24 Septembre 2014.

Semantic annotation workflow using bio-ontologies. Castanier E., Jonquet Cécile, Melzi S., Larmande Pierre, Ruiz Manuel, Valduriez Patrick. 2014. . Montpellier : CGIAR, 1 poster Workshop on Crop Ontology and Phenotyping Data Interoperability, Montpellier, France, 31 Mars 2014/4 Avril 2014.

Towards a multi-scale and formalized representation of protein sequence-structure-function relationships: The nsLTP family as a case of study. Fleury Cécile, Gautier Marie-Françoise, Larmande Pierre, Pérès Sabine, De Lamotte Frédéric, Molina Franck, Ruiz Manuel. 2010. In : Journées ouvertes biologie informatique mathématique (JOBIM), Montpellier, France, 07-09 septembre 2010. s.l. : s.n., 1 p. Journées ouvertes biologie informatique mathématique, Montpellier, France, 7 Septembre 2010/9 Septembre 2010.

A personalized, integrated system for rice functional genomics. Larmande Pierre, Fromentin Sébastien, Droc Gaëtan. 2007. In : 5th International Symposium of Rice Functional Genomics, Tsukuba, Japan, October 15-17, 2007. s.l. : s.n., 1 p. International symposium of Rice Functional Genomics. 5, Tsukaba, Japon, 15 Octobre 2007/17 Octobre 2007.

A personalized, integrated system for rice functional genomics. Fromentin Sébastien, Droc Gaëtan, Larmande Pierre. 2007. In : Workshops Network Tools and Applications in Biology (NETTAB), Pisa, Italy, June, 12-15 2007. s.l. : s.n., 1 p. NETTAB 2007 (Network Tools and Applications in Biology), Pise, Italie, 12 Juin 2007/15 Juin 2007.

OryGenesDB: A database for rice reverse genetics : [P355]. Droc Gaëtan, Ruiz Manuel, Larmande Pierre, Pereira Andy, Piffanelli Pietro, Morel Jean-Benoit, Dievart Anne, Courtois Brigitte, Guiderdoni Emmanuel, Perin Christophe. 2005. In : 5th International Rice Genetics Symposium (A platform for exploring developments in rice genetics and their applications) and 3rd International Symposium of Rice Functional Genomics. Abstract. IRRI. Manila : IRRI, Résumé, 234. International Rice Genetics Symposium. 5, Manille, Philippines, 19 Novembre 2005/23 Novembre 2005.

Development and integration of new microsatellite markers into a cocoa linkage map : a new cocoa reference map [S04-27]. Pugh Tatiana, Fouet Olivier, Risterucci Ange-Marie, Brottier Philippe, Delettrez Claire, Courtois Brigitte, Larmande Pierre, N'Goran Jeanne A.K., Lanaud Claire. 2003. In : 7th International Congress of Plant Molecular Biology, ISPMB 2003, Barcelona (Spain), June 23-28. Book of abstracts. ISPMB. Barcelone : ISPMB Office, Résumé, 64. International Congress of Plant Molecular Biology. 7, Barcelone, Espagne, 23 Juin 2003/28 Juin 2003.

A genome wide library on insertion lines in rice : distribution of T-DNA inserts over the rice genome [S22-21]. Sallaud Christophe, Gay Céline, Larmande Pierre, Bourgeois Emmanuelle, Piegu Benoît, Regad Farid, Bes Martine, Piffanelli Pietro, Perin Christophe, Ghesquière Alain, Delseny Michel, Guiderdoni Emmanuel. 2003. In : 7th International Congress of Plant Molecular Biology, ISPMB 2003, Barcelona (Spain), June 23-28. Book of abstracts. ISPMB. Barcelone : ISPMB Office, Résumé, 320. International Congress of Plant Molecular Biology. 7, Barcelone, Espagne, 23 Juin 2003/28 Juin 2003.

AgroLD: une base de connaissances pour l'étude du phénome des plantes cultivées. Larmande Pierre, Tagny Ngompé Gildas, Ruiz Manuel. 2021. . Association EGC. s.l. : Association EGC, 8 p. Conférence Extraction et gestion des connaissances (EGC 2021). 21, France, 25 Janvier 2021/29 Janvier 2021.

AgroLD: a Linked Data platform to understand plant genotype-phenotype interactions. Larmande Pierre, Tagny Ngompé Gildas, Ruiz Manuel. 2019. . INRA. Paris : INRA, Résumé, 1 p. International Symposium on Integrative Bioinformatics 2019 (IB 2019), Paris, France, 18 Septembre 2019/20 Septembre 2019.

GOBii, a scalable genomics data management system with rapid data extract times and integration with downstream genomic selection analysis pipelines. Nti-Addae Yaw, Ulat Victor Jun, Matthews Dave, Sempere Guilhem, Guignon Valentin, Larmande Pierre, Renner Jon, Petel Adrien, Jones Elizabeth, Robbins Kelly. 2019. . PAG. San Diego : PAG, Résumé Plant and Animal Genome Conference (PAG). 27, San Diego, États-Unis, 12 Janvier 2019/16 Janvier 2019.

AGROLD: A knowledge graph database for rice functional genomics. Larmande Pierre, El Hassouni Nordine, Venkatesan Aravind, Ruiz Manuel. 2018. . ISFG, Tokyo University of Agriculture, JSB. Tokyo : ISRFG, Résumé, 1 p. International Symposium on Rice Functional Genomics (ISRFG 2018). 16, Tokyo, Japon, 5 Septembre 2018/7 Septembre 2018.

Agronomic Linked Data (AgroLD): a Knowledge-based System to Enable Integrative Biology in Agronomy. Larmande Pierre, El Hassouni Nordine, Venkatesan Aravind, Jonquet Clément, Ruiz Manuel. 2018. In : JOBIM 2018 Abstracts. SFBI, GdR BiM, IFB, AMU, INSERM, CNRS. Marseille : SFBI, Résumé, 542-543. Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM 2018), Marseille, 3 Juillet 2018/6 Juillet 2018.

Data standards for plant phenotyping: MIAPPE and its implementations [W785]. Pommier Cyril, Cornut Guillaume, Letellier Thomas, Michotey Célia, Neveu Pascal, Ruiz Manuel, Larmande Pierre, Kersey Paul J., Cwiek Hanna, Krajewski Pawel, Coppens Frederik, Finkers Richard, Laporte Marie-Angélique, Faria Daniel, Miguel Célia M., Chavez Ines, Adam-Blondon Anne-Françoise, Costa Bruno. 2018. In : Proceedings Plant and Animal Genome XXVI Conference. PAG. San Diego : PAG, Résumé, 1 p. Plant and Animal Genomes Conference. 26, San Diego, États-Unis, 13 Janvier 2018/17 Janvier 2018.

Gigwa - Genotype Investigator for Genome-Wide Analyses. Sempere Guilhem, Petel Adrien, Dereeper Alexis, Ruiz Manuel, Larmande Pierre. 2018. In : JOBIM 2018 Abstracts. SFBI, GdR BiM, IFB, AMU, INSERM, CNRS. Marseille : SFBI, Résumé, 251-252. Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM 2018), Marseille, 3 Juillet 2018/6 Juillet 2018.

The international rice informatics consortium bioinformatics resources. Mauleon Ramil P., McNally Kenneth L., Mansueto Locedie, Chebotarov Dmytro, Hendrix Barboza Lord, Juanillas Venice, Larmande Pierre, Droc Gaëtan, Ruiz Manuel, Dereeper Alexis, Sackville Hamilton N. Ruaraidh, Alexandrov Nickolai, Leung Hei, Wing Rod A.. 2018. . ISFG, Tokyo University of Agriculture, JSB. Tokyo : ISRFG, Résumé, 1 p. International Symposium on Rice Functional Genomics (ISRFG 2018). 16, Tokyo, Japon, 5 Septembre 2018/7 Septembre 2018.

Enabling knowledge management in the agronomic domain. W448. Larmande Pierre, Venkatesan Aravind, Ruiz Manuel, Sempere Guilhem, Valduriez Patrick. 2015. . San Diego : s.n., Résumé, 1 p. Plant and Animal Genome Conference. 23, San Diego, États-Unis, 10 Janvier 2015/14 Janvier 2015.

The south green bioinformatics platform : [P988]. Rouard Mathieu, Dereeper Alexis, Droc Gaëtan, Sarah Gautier, Dufayard Jean-François, Guignon Valentin, Hamelin Chantal, Homa Félix, De Lamotte Frédéric, Larmande Pierre, Larivière Delphine, Sabot François, Sempere Guilhem, Summo Marilyne, Pitollat Bertrand, Pointet Stéphanie, This Dominique, Bocs Stéphanie, Ruiz Manuel. 2014. In : Plant and Animal Genomes Conference XXII Conference, San diego, United States, San Diego, United States, January 11-15, 2014. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genome Conference. 22, San Diego, États-Unis, 11 Janvier 2014/15 Janvier 2014.

Role of Galaxy in a bioinformatic plant breeding platform. Maillol Vincent, Bacilieri Roberto, Bocs Stéphanie, Boursiquot Jean-Michel, Carrier Gregory, Dereeper Alexis, Droc Gaëtan, Fleury Cécile, Larmande Pierre, Le Cunff Loïc, Péros Jean-Pierre, Pitollat Bertrand, Ruiz Manuel, Sarah Gautier, Sempere Guilhem, Summo Marilyne, This Patrice, Dufayard Jean-François. 2012. In : Galaxy Community Conference GCC2012, Chicago, Etats-Unis, July 25-27 2012. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. Galaxy Community Conference, Chicago, États-Unis, 25 Juillet 2012/27 Juillet 2012.

The rice functional genomics (refuge) platform, an international hosting platform for elucidating gene function using rice as a model system. Mieulet Delphine, Mayonnove Pauline, Portfaix Murielle, Larmande Pierre, Gantet Pascal, Ghesquière Alain, Guiderdoni Emmanuel. 2010. In : 28th International Rice Research Conference, Climate Change and Rice Agriculture, November 08-12, 2010, Hanoi, Vietnam. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. International Rice Research Conference. 28, Hanoi, Viet Nam, 8 Novembre 2010/12 Novembre 2010.

Orylink: A personalized integrated system for functional genomic analysis : [Abstract CP842]. Droc Gaëtan, Perin Christophe, Fromentin Sébastien, Larmande Pierre. 2009. In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XVII Conference, San Diego, CA (USA), January 10-14, 2009. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genomes Conference. 17, San Diego, États-Unis, 10 Janvier 2009/14 Janvier 2009.

Applying reverse genetics strategies to rice mutant resources for deciphering developmental and adaptive processes. [P2-07]. Dievart Anne, Perin Christophe, Brasileiro Ana Christina Miranda, Gantet Pascal, Breitler Jean-Christophe, Larmande Pierre, Lorieux Mathias, Droc Gaëtan, Pereira Andy, Guiderdoni Emmanuel. 2007. In : 5th International Symposium of Rice Functional Genomics, Tsukuba, Japan, October 15-17, 2007. s.l. : s.n., Résumé, 2 p. International symposium of Rice Functional Genomics. 5, Tsukaba, Japon, 15 Octobre 2007/17 Octobre 2007.

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