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Complete genome sequence of Bradyrhizobium sp. strain ORS3257, an efficient nitrogen-fixing bacterium isolated from cowpea in Senegal. Le Quéré Antoine, Gully Djamel, Teulet Albin, Navarro Elisabeth, Gargani Daniel, Fardoux Joël, Cruveiller Stéphane, Neyra Marc, Giraud Eric, Krasova-Wade Tatiana. 2019. Microbiology Resource Announcements, 8 (3):e01449, 2 p.

Mise en évidence d'une dégradation naturelle de la chlordécone avec libération dans l'environnement de produits de transformation chlorés. Della-Negra Oriane, Muselet Delphine, Chaussonnerie Sébastien, Mottes Charles, Rangon Luc, Chevallier Marion, Barbance Agnes, Fouteau Stéphanie, Vuilleumier Stéphane, Imfeld Gwenaël, Woignier Thierry, Saaidi Pierre-Loïc, Le Paslier Denis. 2019. . Montpellier : s.n., 2 p. Congrès du Groupe Français de recherche sur les Pesticides. 49, Montpellier, France, 21 Mai 2019/24 Mai 2019.

The Wolbachia mobilome in Culex pipiens includes a putative plasmid. Reveillaud Julie, Bordenstein Sarah R., Cruaud Corinne, Shaiber Alon, Esen Özcan C., Weill Mylène, Makoundou Patrick, Lolans Karen, Watson Andrea R., Rakotoarivony Ignace, Bordenstein Seth R., Eren A. Murat. 2019. Nature Communications, 10 (1):1051, 11 p.

Transcriptome profiles of nod factor-independent symbiosis in the tropical legume Aeschynomene evenia. Gully Djamel, Czernic Pierre, Cruveiller Stéphane, Mahé Frédéric, Longin Cyrille, Vallenet David, François Philippe, Nidelet Sabine, Rialle Stéphanie, Giraud Eric, Arrighi Jean-François, DasGupta Maitrayee, Cartieaux Fabienne. 2018. Scientific Reports, 8:10934, 12 p.

Deciphering the Theobroma cacao self-incompatibility system: from genomics to diagnostic markers for self-compatibility. Lanaud Claire, Fouet Olivier, Legavre Thierry, Lopes Uilson Vanderlei, Sounigo Olivier, Eyango Marie Claire, Mermaz Benoit, da Silva Marcos Ramos, Loor Solorzano Rey Gaston, Argout Xavier, Gyapay Gabor, Ebaiarrey Herman Ebai, Colonges Kelly, Sanier Christine, Rivallan Ronan, Mastin Géraldine, Cryer Nicholas, Boccara Michel, Verdeil Jean-Luc, Efombagn Mousseni Ives Bruno, Peres Gramacho Karina, Clément Didier. 2017. Journal of Experimental Botany, 68 (17) : 4775-4790.

Exploration of the T. cacao genome sequence to decipher the incompatibility system of Theobroma cacao and to identify diagnostic markers. Lanaud Claire, Fouet Olivier, Legavre Thierry, Lopes Uilson Vanderlei, Sounigo Olivier, Eyango Marie Claire, Mermaz Benoit, da Silva Marcos Ramos, Loor Solorzano Rey Gaston, Argout Xavier, Gyapay Gabor, Ebaiarrey Herman Ebai, Colonges Kelly, Sanier Christine, Rivallan Ronan, Mastin Géraldine, Cryer Nicholas, Boccara Michel, Efombagn Mousseni Ives Bruno, Gramacho Karina Peres, Clément Didier. 2017. In : Proceedings of the first International Symposium on Cocoa Research ISCR 2017. ICCO. Lima : ICCO, 11 p. International Symposium on Cocoa Research – ISCR 2017 : Promoting Advances in Research to Enhance the Profitability of Cocoa Farming. 1, Lima, Pérou, 13 Novembre 2017/17 Novembre 2017.

In planta comparative transcriptomics of host-adapted strains of Ralstonia solanacearum. Ailloud Florent, Lowe Tiffany, Robène Isabelle, Cruveiller Stéphane, Allen Caitilyn, Prior Philippe. 2016. PeerJ, 4:e1549, 18 p.

Comparative genomics of 43 strains of Xanthomonas citri pv. citri reveals the evolutionary events giving rise to pathotypes with different host ranges. Gordon Jonathan, Lefeuvre Pierre, Escalon Aline, Barbe Valérie, Cruveiller Stéphane, Gagnevin Lionel, Pruvost Olivier. 2015. BMC Genomics, 16 (1098), 20 p.

Draft genome sequence of Xanthomonas sacchari strain LMG 476. Pieretti Isabelle, Bolot Stéphanie, Carrère Sébastien, Barbe Valérie, Cociancich Stéphane, Rott Philippe, Royer Monique. 2015. Genome Announcements, 3 (2):e00146, 2 p.

BAC sequencing analyses in the hexaploid Spartina maritima (Poaceae): Homoeolog divergence and microsynteny in the grass family. Charron Carine, Rousseau-Gueutin Mathieu, Ferreira de Carvalho Julie, Chelaifa Houda, Boutte Julien, Droc Gaëtan, Fourment Joëlle, Bellec Arnaud, Berges Hélène, Poulain Julie, Couloux Arnaud, Mangenot Sophie, Wincker Patrick, Salmon Armel, D'Hont Angélique, Ainouche Malika Lily. 2014. In : International Conference on Invasive Spartina (ICI-Spartina 2014), July 7-10, 2014, Rennes, France. s.l. : s.n., 1 p. International Conference on Invasive Spartina. 4, Rennes, France, 7 Juillet 2014/10 Juillet 2014.

BAC sequencing analyses in the hexaploid Spartina maritima (Poaceae): Homoeolog divergence and microsynteny in the grass family. Charron Carine, Rousseau-Gueutin Mathieu, Ferreira de Carvalho Julie, Chelaifa Houda, Boutte Julien, Droc Gaëtan, Fourment Joëlle, Bellec Arnaud, Berges Hélène, Poulain Julie, Couloux Arnaud, Mangenot Sophie, Wincker Patrick, Salmon Armel, D'Hont Angélique, Ainouche Malika Lily. 2014. In : Réunion annuelle du Groupe polyploïdie-cytogénétique, Clermont-Ferrand, France, 22-23 mai 2014. s.l. : s.n., Diaporama, (23 vues) Réunion annuelle du groupe polyploïdie-cytogénétique, Clermont-Ferrand, France, 22 Mai 2014/23 Mai 2014.

Genome sequence comparisons reveal interspecific hybridizations and admixture in citrus domestication : [W317]. Gmitter Frederick G. Jr., Wu Guohong Albert, Prochnik Simon, Ollitrault Patrick, Talon Manuel, Machado Marcos Antonio, Morgante Michele, Jaillon Olivier, Rokhsar Daniel S.. 2014. In : Plant and Animal Genomes Conference XXII Conference, San diego, United States, San Diego, United States, January 11-15, 2014. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genome Conference. 22, San Diego, États-Unis, 11 Janvier 2014/15 Janvier 2014.

Sequencing of diverse mandarin, pummelo and orange genomes reveals complex history of admixture during citrus domestication. Wu Guohong Albert, Prochnik Simon, Jenkins Jerry, Salse Jérôme, Hellsten Uffe, Murat Florent, Perrier Xavier, Ruiz Manuel, Scalabrin Simone, Terol Javier F., Takita Marco Aurélio, Labadie Karine, Poulain Julie, Couloux Arnaud, Jabbari Kamel, Cattonaro Frederica, Del Fabbro Cristian, Pinosio Sara, Zuccolo Andrea, Chapman Jarrod, Grimwood Jane, Tadeo Francisco, Estornell Leandro H., Muñoz-Sanz Juan V., Ibáñez Victoria, Herrero-Ortega Amparo, Aleza Pablo, Pérez-Pérez Júlian, Ramón Daniel, Brunel Dominique, Luro François, Chen Chunxian, Farmerie William G., Desany Brian, Kodira Chinnappa, Mohiuddin Mohammed, Harkins Tim, Fredrikson Karin, Burns Paul, Lomsadze Alexandre, Borodovsky Mark, Reforgiato Giuseppe, Freitas-Astúa Juliana, Quetier Francis, Navarro Luis, Roose Mikeal L., Wincker Patrick, Schmutz Jeremy, Morgante Michele, Machado Marcos Antonio, Talon Manuel, Ollitrault Patrick, Gmitter Frederick G. Jr., Rokhsar Daniel S.. 2014. Nature Biotechnology, 32 : 656-662.

The streamlined genome of Phytomonas spp. relative to human pathogenic kinetoplastids reveals a parasite tailored for plants. Porcel Betina M., Denoeud France, Opperdoes Fred, Noël Benjamin, Madoui Mohammed-Amine, Hammarton Tansy, Field Mark, Da Silva Corinne, Couloux Arnaud, Poulain Julie, Katinka Michael, Jabbari Kamel, Aury Jean-Marc, Campbell David A., Cintron Roxana, Dickens Nicolas, Docampo Roberto, Sturm Nancy R., Koumandou Lila, Fabre Sandrine, Flegontov Pavel, Lukes Julius, Michaeli Shula, Mottram Jeremy, Szoor Balazs, Zilberstein Dan, Bringaud Frédéric, Wincker Patrick, Dollet Michel. 2014. PLoS Genetics, 10 (2):e1004007, 24 p.

BAC-end sequences analysis provides first insights into coffee (Coffea canephora P.) genome composition and evolution. Dereeper Alexis, Guyot Romain, Tranchant-Dubreuil Christine, Anthony François, Argout Xavier, De Bellis Fabien, Combes Marie-Christine, Gavory Fréderick, De Kochko Alexandre, Kudrna Dave, Leroy Thierry, Poulain Julie, Rondeau Myriam, Song Xiang, Wing Rod A., Lashermes Philippe. 2013. Plant Molecular Biology, 83 (3) : 177-189.

Genome mining reveals a novel and promising NRPS gene cluster in Xanthomonas albilineans, Xanthomonas oryzae and Xanthomonas translucens. Royer Monique, Koebnik Ralf, Marguerettaz Mélanie, Barbe Valérie, Robin Guillaume P., Brin Christelle, Carrère Sébastien, Gomez Camila, Hügelland Manuela, Völler Ginka H., Noëll Julie, Pieretti Isabelle, Rausch Saskia, Verdier Valérie, Poussier Stéphane, Rott Philippe, Süssmuth Roderich, Cociancich Stéphane. 2013. In : Resumos do 59° Congresso Brasileiro de Genética,16 a 19 de Setembro de 2013, Águas de Lindóia, Brasil. SBG. s.l. : s.n., Résumé, 30. ISBN 978-85-89109-06-2 Congresso Brasileiro de Genética. 59, Aguas de Lindoia, Brésil, 16 Septembre 2013/19 Septembre 2013.

Genome mining reveals the genus Xanthomonas to be a promising reservoir for new bioactive non-ribosomally synthesized peptides. Royer Monique, Koebnik Ralf, Marguerettaz Mélanie, Barbe Valérie, Robin Guillaume P., Brin Christelle, Carrère Sébastien, Gomez Camila, Hügelland Manuela, Völler Ginka H., Noëll Julie, Pieretti Isabelle, Rausch Saskia, Verdier Valérie, Poussier Stéphane, Rott Philippe, Süssmuth Roderich, Cociancich Stéphane. 2013. BMC Genomics, 14 (658), 19 p.

Genome sequence of Xanthomonas fuscans subsp. fuscans strain 4834-R reveals that flagellar motility is not a general feature of xanthomonads. Darrasse Armelle, Carrère Sébastien, Barbe Valérie, Boureau Tristan, Arrieta-Ortiz Mario L., Bonneau Sophie, Briand Martial, Brin Christelle, Cociancich Stéphane, Durand Karine, Fouteau Stéphanie, Gagnevin Lionel, Guérin Fabien, Guy Endrick, Indiana Arnaud, Koebnik Ralf, Lauber Emmanuelle, Munoz Alejandra, Noel Laurent D., Pieretti Isabelle, Poussier Stéphane, Pruvost Olivier, Robène-Soustrade Isabelle, Rott Philippe, Royer Monique, Serres-Giardi Laurana, Szurek Boris, Van Sluys Marie-Anne, Verdier Valérie, Vernière Christian, Arlat Mathieu, Manceau Charles, Jacques Marie Agnès. 2013. BMC Genomics, 14 (761), 30 p.

Three infectious viral species lying in wait in the banana genome. Chabannes Matthieu, Baurens Franc-Christophe, Duroy Pierre-Olivier, Bocs Stéphanie, Vernerey Marie-Stéphanie, Rodier-Goud Marguerite, Barbe Valérie, Gayral Philippe, Iskra Caruana Marie-Line. 2013. Journal of Virology, 87 (15) : 8624-8637.

The three infectious Banana streak virus species present in the banana genome of Pisang Klutuk Wulung (PKW) are allelic. Chabannes Matthieu, Baurens Franc-Christophe, Duroy Pierre-Olivier, Bocs Stéphanie, Vernerey Marie-Stéphanie, Rodier-Goud Marguerite, Barbe Valérie, Gayral Philippe, Iskra Caruana Marie-Line. 2013. In : Polyploïde et cytogénétique, Rennes, France, 16-17 mai 2013. s.l. : s.n., 1 p. Polyploïdie et cytogénétique, Rennes, France, 16 Mai 2013/17 Mai 2013.

Evolutionary history of contagious bovine pleuropneumonia using next generation sequencing of mycoplasma mycoides subsp. mycoides "small colony". Dupuy Virginie, Manso-Silvan Lucia, Barbe Valérie, Thebault Patricia, Dordet-Frisoni Emilie, Citti Christine, Poumarat François, Blanchard Alain, Breton Marc, Sirand-Pugnet Pascal, Thiaucourt François. 2012. PloS One, 7 (10):e46821, 13 p.

Genome evolution of fungal pathogens from Magnaporthe oryzae/grisea clade. Lebrun Marc-Henri, Mallet Ludovic, Guerin Cyprien, Chiapello Hélène, Ortega-Abboud Enrique, Gendrault Annie, Kreplak Jonathan, Kroj Thomas, Couloux Arnaud, Cruaud Corinne, Amselem Joelle, Tharreau Didier, Fournier Elisabeth. 2012. In : IS-MPMI 2012 XV International Congress, program and abstracts, July 29 (Sun.) - August 2 (Thu), 2012. Kyoto, Japan. IS-MPMI. Saint-Paul : IS-MPMI, Résumé, 297. International Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions. 15, Kyoto, Japon, 29 Juillet 2012/2 Août 2012.

Genome mining indicates that the genus Xanthomonas is a promising reservoir for new bioactive non-ribosomally synthesized peptides. Royer Monique, Koebnik Ralf, Marguerettaz Mélanie, Barbe Valérie, Robin Guillaume P., Brin Christelle, Carrère Sébastien, Gomez Camila, Hügelland Manuela, Völler Ginka H., Noëll Julie, Pieretti Isabelle, Rausch Saskia, Verdier Valérie, Poussier Stéphane, Rott Philippe, Süssmuth Roderich, Cociancich Stéphane. 2012. In : COST Action CM0804 Chemistry and Target Identification of Natural Products Workshop, Bucharest, Romania, 22-24 May 2012. s.l. : s.n., 42-43. COST Action CM0804 Chemistry and Target Identification of Natural Products Workshop, Bucarest, Roumanie, 22 Mai 2012/24 Mai 2012.

Genome mining indicates that the genus Xanthomonas is a promising reservoir for new bioactive non-ribosomally synthesized peptides. Royer Monique, Koebnik Ralf, Marguerettaz Mélanie, Barbe Valérie, Robin G., Brind C., Carrère Sébastien, Gomez Camila, Hügelland Manuela, Völler Ginka H., Noëll Julie, Pieretti Isabelle, Rausch Saskia, Verdier Valérie, Poussier Stéphane, Rott Philippe, Süssmuth Roderich, Cociancich Stéphane. 2012. In : 8e colloque de la Société Française de Phytopathologie, 5 au 8 juin 2012,Paris, France : Livre des résumés. Attard Agnès (ed.), Barny Marie-Anne (ed.), Brisset Marie-Noelle (ed.), Cilas Christian (ed.), Dellagi Alia (ed.), Desprez-Loustau Marie-Laure (ed.), Expert Dominique (ed.), Fabre Frédéric (ed.), Fagard Mathilde (ed.), Fudal Isabelle (ed.), Genin Stéphane. SFP, INRA, CNRS. Paris : SFP, Résumé, 44. Congrès de la Société française de phytopathologie. 8, Paris, France, 5 Juin 2012/8 Juin 2012.

Genome mining indicates that the genus Xanthomonas is a promising reservoir for new bioactive non-ribosomally synthesized peptides. Royer Monique, Koebnik Ralf, Marguerettaz Mélanie, Barbe Valérie, Robin P. Guillaume, Brin Christelle, Carrère Sébastien, Gomez Camila, Hügelland Manuela, Völler Ginka H., Noëll Julie, Pieretti Isabelle, Rausch Saskia, Verdier Valérie, Poussier Stéphane, Rott Philippe, Süssmuth Roderich, Cociancich Stéphane. 2012. In : 4th Xanthomonas genomics conference, Angers, France, july 9-12, 2012 : Book of abstracts. Manceau Charles (ed.), Jacques Marie Agnès (ed.), Arlat Mathieu (ed.), Lauber Emmanuelle (ed.), Noel Laurent D. (ed.), Gagnevin Lionel (ed.), Pruvost Olivier (ed.), Rott Philippe (ed.), Royer Monique (ed.), Koebnik Ralf (ed.), Verdier Valérie (ed.). INRA, INRA-LIPM, CIRAD-BIOS-UMR PVBMT, IRD. Paris : INRA, Résumé, 20. Xanthomonas genomics conference 2012. 4, Angers, France, 9 Juillet 2012/12 Juillet 2012.

Genome sequence analysis and comparisons reveal ancestral hybridization and admixture events in the origins of some citrus cultivars : S03O01. Gmitter Frederick G., Ollitrault Patrick, Machado Marcos Antonio, Reforgiato Recupero Giuseppe, Talon Manuel, Roose Mikeal L., Navarro Luis, Wu Guohong Albert, Jaillon Olivier, Morgante Michele, Rokhsar Daniel S.. 2012. In : XII International Citrus Congress : Book of abstract. Navarro Luis (ed.). ISC, IVIA, Fundación agroalimed. Riverside : ISC, Résumé, 61. International Citrus congress "Citrus and health. 12, Valence, Espagne, 18 Novembre 2012/23 Novembre 2012.

Genome sequencing of Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli CFBP4834-R reveals that flagellar motility is not a general feature of xanthomonads. Darrasse Armelle, Carrère Sébastien, Barbe Valérie, Bourreau Tristan, Bernal Adriana Jimena, Bonneau Sophie, Brin Christelle, Cociancich Stéphane, Durand Karine, Fouteau Stéphanie, Gagnevin Lionel, Gouzy Jérôme, Guérin Fabien, Guy Endrick, Indiana Arnaud, Koebnik Ralf, Lauber Emmanuelle, Munoz Alejandra, Noel Laurent D., Pieretti Isabelle, Poussier Stéphane, Pruvost Olivier, Robène-Soustrade Isabelle, Rott Philippe, Royer Monique, Szurek Boris, Van Sluys Marie-Anne, Verdier Valérie, Vernière Christian, Arlat Mathieu, Manceau Charles, Jacques Marie Agnès. 2012. In : 4th Xanthomonas genomics conference, Angers, France, july 9-12, 2012 : Book of abstracts. Manceau Charles (ed.), Jacques Marie Agnès (ed.), Arlat Mathieu (ed.), Lauber Emmanuelle (ed.), Noel Laurent D. (ed.), Gagnevin Lionel (ed.), Pruvost Olivier (ed.), Rott Philippe (ed.), Royer Monique (ed.), Koebnik Ralf (ed.), Verdier Valérie (ed.). INRA, INRA-LIPM, CIRAD-BIOS-UMR PVBMT, IRD. Paris : INRA, Résumé, 13. Xanthomonas genomics conference 2012. 4, Angers, France, 9 Juillet 2012/12 Juillet 2012.

Genomic insights into strategies used by Xanthomonas albilineans with its reduced artillery to spread within sugarcane xylem vessels. Pieretti Isabelle, Royer Monique, Barbe Valérie, Carrère Sébastien, Koebnik Ralf, Couloux Arnaud, Darrasse Armelle, Gouzy Jérôme, Jacques Marie Agnès, Lauber Emmanuelle, Manceau Charles, Mangenot Sophie, Poussier Stéphane, Segurens Béatrice, Szurek Boris, Verdier Valérie, Arlat Mathieu, Gabriel Dean W., Rott Philippe, Cociancich Stéphane. 2012. BMC Genomics, 13 (658), 23 p.

Obtaining the full sequence of the genome of two plants trypanosomatids. Dollet Michel, Fabre Sandrine, Wincker Patrick, Porcel Benoit, Noël Benjamin, Denoeud France, Jabbari Kamel, Aury Jean-Marc, Da Silva Corinne, Couloux Arnaud, Poulain Julie, Bringaud Frédéric, Campbell David A., Cintron Roxana, Dickens Nicolas, Docampo Roberto, Field Mark, Hammarton Tansy, Koumandou Lila, Matthews Keith, Mottram Jeremy, Michaeli Shula, Opperdoes Fred, Szoor Balazs, Sturm Nancy R., Zilberstein Dan. 2012. In : Plant Genomics Seminar, Pont Royal en Provence, France, 3-5 April 2012. GISbV, ANR. s.l. : s.n., 2 p. Plant Genomics Seminar, Pont Royal en Provence, France, 3 Avril 2012/5 Avril 2012.

The banana (Musa acuminata) genome and the evolution of monocotyledonous plants. D'Hont Angélique, Denoeud France, Aury Jean-Marc, Baurens Franc-Christophe, Carreel Françoise, Garsmeur Olivier, Noël Benjamin, Bocs Stéphanie, Droc Gaëtan, Rouard Mathieu, Da Silva Corinne, Jabbari Kamel, Cardi Céline, Poulain Julie, Souquet Marlène, Labadie Karine, Jourda Cyril, Lengellé Juliette, Rodier-Goud Marguerite, Alberti Adriana, Bernard Maria, Correa Margot, Ayyampalayam Saravanaraj, Mckain Michael R, Leebens-Mack Jim, Burgess Diane, Freeling Mike, Mbéguié-A-Mbéguié Didier, Chabannes Matthieu, Wicker Thomas, Panaud Olivier, Barbosa Jose, Hribova Eva, Heslop Harrison Pat, Habas Rémy, Rivallan Ronan, François Philippe, Poiron Claire, Kilian Andrzej, Burthia Dheema, Jenny Christophe, Bakry Frédéric, Brown Spencer, Guignon Valentin, Kema Gert H.J., Dita Miguel A., Waalwijk Cees, Joseph Steeve, Diévart Anne, Jaillon Olivier, Leclercq Julie, Argout Xavier, Lyons Eric, Almeida Ana, Jeridi Mouna, Dolezel Jaroslav, Roux Nicolas, Risterucci Ange-Marie, Weissenbach Jean, Ruiz Manuel, Glaszmann Jean-Christophe, Quetier Francis, Yahiaoui Nabila, Wincker Patrick. 2012. Nature, 488 (7410) : 213-217.

Diversity gradients and phylogeographic patterns in Santiria trimera (Burseraceae), a widespread African tree typical of mature rainforests. Koffi K. Guillaume, Hardy Olivier J., Doumenge Charles, Cruaud Corinne, Heuretz Myriam. 2011. American Journal of Botany, 98 (2) : 254-264.

High homologous gene conservation despite extreme autopolyploid redundancy in sugarcane. Garsmeur Olivier, Charron Carine, Bocs Stéphanie, Jouffe Vincent, Samain Sylvie, Couloux Arnaud, Droc Gaëtan, Zini Cyrille, Glaszmann Jean-Christophe, Van Sluys Marie-Anne, D'Hont Angélique. 2011. New Phytologist, 189 (2) : 629-642.

High homologous gene conservation despite extreme autopolyploid redundancy in sugarcane (W315). D'Hont Angélique, Garsmeur Olivier (collab.), Charron Carine (collab.), Zini Cyrille (collab.), Bocs Stéphanie (collab.), Jouffe Vincent (collab.), Samain Sylvie (collab.). 2011. In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XIXth Conference, San Diego, CA (USA), January 15-19, 2011. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genomes Conference. 19, San Diego, États-Unis, 15 Janvier 2011/19 Janvier 2011.

Mycoplasma mycoides, from "mycoides Small Colony" to "capri". A microevolutionary perspective. Thiaucourt François, Manso-Silvan Lucia, Salah Woubit, Barbe Valérie, Vacherie Benoit, Jacob Daniel, Breton Marc, Dupuy Virginie, Lomenech Anne Marie, Blanchard Alain, Sirand-Pugnet Pascal. 2011. BMC Genomics, 12 (114), 19 p.

The complete genome sequence of Xanthomonas albilineans provides insights into pathogenicity of this sugarcane pathogen and allows further assessments of the large diversity within this species. Pieretti Isabelle, Cociancich Stéphane, Barbe Valérie, Carrère Sébastien, Koebnik Ralf, Champoiseau Patrice, Couloux Arnaud, Darrasse Armelle, Gouzy Jérôme, Jacques Marie Agnès, Lauber Emmanuelle, Manceau Charles, Mangenot Sophie, Marguerettaz Mélanie, Poussier Stéphane, Segurens Béatrice, Szurek Boris, Verdier Valérie, Arlat Mathieu, Gabriel Dean W., Rott Philippe, Royer Monique. 2011. In : 5th European Conference on Prokaryotic and Fungal Genomics ProkaGENOMICS 2011, Göttingen, Germany, September 18-21, 2011. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. European Conference on Prokaryotic and Fungal Genomics. 5, Göttingen, Allemagne, 18 Septembre 2011/21 Septembre 2011.

Comparison of seven homoeologous haplotypes (BAC) within the high polyploid sugarcane genome : [Abstract W604]. Charron Carine, Garsmeur Olivier, Jouffe Vincent, Bocs Stéphanie, Samain Sylvie, Couloux Arnaud, Droc Gaëtan, Glaszmann Jean-Christophe, Van Sluys Marie-Anne, D'Hont Angélique. 2010. In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XVIIIth Conference, San Diego, CA (USA), January 09-13, 2010. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genomes Conference. 18, San Diego, États-Unis, 9 Janvier 2010/13 Janvier 2010.

CpDNA-based species identification and phylogeography: Application to African tropical tree species. Duminil Jérôme, Heuretz Myriam, Doucet Jean-Louis, Bourland Nils, Cruaud Corinne, Gavory Fréderick, Doumenge Charles, Navascués Miguel, Hardy Olivier J.. 2010. Molecular Ecology, 19 (24) : 5469-5483.

CpDNA-based species identification and phylogeography: application to a complex of African tropical tree species. Duminil Jérôme, Heuertz Myriam, Doucet Jean-Louis, Bourland Nils, Cruaud Corinne, Doumenge Charles, Navascués Miguel, Hardy Olivier J.. 2010. In : Projet IFORA colloque final de restitution : Colloque Les Iles forestières africaines : modèle d'une nouvelle approche de la dynamique de structuration de la biodiversité, Montpellier, France, 21 et 22 juin 2010. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. Colloque Les Iles forestières africaines : modèle d'une nouvelle approche de la dynamique de structuration de la biodiversité, Montpellier, France, 21 Juin 2010/22 Juin 2010.

Current status of the sequencing project on two plant trypanosomatids (Phytomonas spp.). Dollet Michel, Couloux Arnaud, Noël Benjamin, Aury Jean-Marc, Jaillon Olivier, Fabre Sandrine, Da Silva Corinne, Artiguenave Françoise, Poulain Julie, Wincker Patrick. 2010. In : XIIth International Congress of Parasitology (ICOPA), 15th-20th August 2010, Melbourne, Australia. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. International Congress of Parasitology. 12, Melbourne, Australie, 15 Août 2010/20 Août 2010.

Délimitation et phylogéographie d'un complexe d'espèces ligneuses d'Afrique tropicale. Duminil Jérôme, Heuertz Myriam, Doucet Jean-Louis, Bourland Nils, Cruaud Corinne, Doumenge Charles, Navascués Miguel, Hardy Olivier J.. 2010. In : XIXth AETFAT Congress, Madagascar, April 25-30, 2010. Abstrats = XIXième Congrès AETFAT, Madagascar, 25-30 avril 2010. Résumés. AETFAT. Meise : National Botanic Garden of Belgium, Résumé, 1 p. (Scripta Botanica Belgica : Miscellaneous documentation, 46) ISBN 978-90-72619-82-2 Congrès de l'AETFAT sur la diversité des plantes africaines, systématique et développement durable. 19, Madagascar, 25 Avril 2010/30 Avril 2010.

ESTtik, a semi-automatic cDNA sequence analysis and annotation pipeline including SSR and SNP search tools. Argout Xavier, Ruiz Manuel, Fouet Olivier, Lanaud Claire, Wincker Patrick, Da Silva Corinne, Courtois Brigitte. 2010. In : 15th International Cocoa Research Conference : cocoa productivity, quality, profitability, human health and the environment = 15e Conférence internationale sur la recherche cacaoyère : Productivité, qualité, rentabilité du cacao, santé humaine et environnement ; 15 Conferencia Internacional de Pesquisas em Cacau. Cacau : produtividade, qualidade, rentabilidade, saude humanna e amb. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, 501-506. Conférence internationale sur la recherche cacaoyère. 15, San José, Costa Rica, 9 Octobre 2006/14 Octobre 2006.

Genetic identification and characterisation of new microsatellite markers derived from expressed tag sequences (est) in Theobroma cacao L. Lanaud Claire, Argout Xavier, Fouet Olivier, Jeanneau Mélanie, Loor Rey Gaston, N'Goran Jeanne A.K., Lemainque Arnaud, Legavre Thierry, Sabau Xavier, Wincker Patrick, Da Silva Corinne, Gramacho Karina Peres, Risterucci Ange-Marie. 2010. In : 15th International Cocoa Research Conference : cocoa productivity, quality, profitability, human health and the environment = 15e Conférence internationale sur la recherche cacaoyère : Productivité, qualité, rentabilité du cacao, santé humaine et environnement ; 15 Conferencia Internacional de Pesquisas em Cacau. Cacau : produtividade, qualidade, rentabilidade, saude humanna e amb. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, 519-523. Conférence internationale sur la recherche cacaoyère. 15, San José, Costa Rica, 9 Octobre 2006/14 Octobre 2006.

Genome sequencing project has begun on two plant trypanosomatids (Phytomonas). Dollet Michel, Couloux Arnaud, Noël Benjamin, Aury Jean-Marc, Jaillon Olivier, Fabre Sandrine, Da Silva Corinne, Artiguenave Françoise, Poulain Julie, Wincker Patrick. 2010. In : British Society for Parasitology Spring Meeting and Trypanosomiasis and Leishmaniasis Seminar (BSP CARDIFF 2010), March 29th - April 1st, 2010, Cardiff, United Kingdom. s.l. : s.n., 1 p. British Society for Parasitology Spring Meeting and Trypanosomiasis and Leishmaniasis Seminar, Cardiff, Royaume-Uni, 29 Mars 2010/1 Avril 2010.

Genomes of three tomato pathogens within the Ralstonia solanacearum species complex reveal significant evolutionary divergence. Remenant Benoit, Coupat-Goutaland Bénédicte, Guidot Alice, Cellier Gilles, Wicker Emmanuel, Allen Caitilyn, Fegan Mark, Pruvost Olivier, Elbaz Mounira, Calteau Alexandra, Salvignol Georges, Mornico Damien, Mangenot Sophie, Barbe Valérie, Medigue Claudine, Prior Philippe. 2010. BMC Genomics, 11 (379) : 1-16.

Genomes of three tomato pathogens within the Ralstonia solanacearum species complex reveal significant evolutionary divergence : [O1-03, Abstract]. Remenant Benoit, Coupat-Goutaland Bénédicte, Guidot Alice, Cellier Gilles, Wicker Emmanuel, Allen Caitilyn, Fegan Mark, Pruvost Olivier, Elbaz Mounira, Calteau Alexandra, Salvignol Georges, Mornico Damien, Mangenot Sophie, Barbe Valérie, Medigue Claudine, Prior Philippe. 2010. In : Proceedings of the 12th International Conference on Plant Pathogenic Bacteria : programme, abstracts, list of participants. INRA, Université de la Réunion, IRD. s.l. : s.n., Résumé, 19. International Conference on Plant Pathogenic Bacteria. 12, Saint-Denis, Réunion, 7 Juin 2010/11 Juin 2010.

Large-scale transposon mutagenesis of photosynthetic Bradyrhizobium sp. strain ORS278 reveals new genetic loci putatively important for nod-independent symbiosis with Aeschynomene indica. Bonaldi Katia, Gourion Benjamin, Fardoux Joël, Hannibal Laure, Cartieaux Fabienne, Boursot Marc, Vallenet David, Chaintreuil Clémence, Prin Yves, Nouwen Nico, Giraud Eric. 2010. Molecular Plant-Microbe Interactions, 23 (6) : 760-770.

Preliminary results on linalool synthase expression during seed development and fermentation of Nacional and Trinitario clones. Sabau Xavier, Loor Rey Gaston, Boccara Martine, Fouet Olivier, Jeanneau Mélanie, Argout Xavier, Legavre Thierry, Risterucci Ange-Marie, Wincker Patrick, Da Silva Corinne, Jimenez Juan Carlos, Cros Emile, Boulanger Renaud, Alary Remy, Lanaud Claire. 2010. In : 15th International Cocoa Research Conference : cocoa productivity, quality, profitability, human health and the environment = 15e Conférence internationale sur la recherche cacaoyère : Productivité, qualité, rentabilité du cacao, santé humaine et environnement ; 15 Conferencia Internacional de Pesquisas em Cacau. Cacau : produtividade, qualidade, rentabilidade, saude humanna e amb. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, 507-514. Conférence internationale sur la recherche cacaoyère. 15, San José, Costa Rica, 9 Octobre 2006/14 Octobre 2006.

Séquençage de trois nouvelles souches du complexe d'espèces Ralstonia solanacearum : pangénome et génomique comparative. Remenant Benoit, Coupat-Goutaland Bénédicte, Cellier Gilles, Guidot Alice, Wicker Emmanuel, Mangenot Sophie, Barbe Valérie, Medigue Claudine, Prior Philippe. 2010. In : Neuvièmes Rencontres plantes-bactéries, 18-22 janvier 2010, Aussois (France) : résumés. SFP, IRD. Paris : SFP, Résumé, 32. Rencontres plantes-bactéries. 9, Aussois, France, 18 Janvier 2010/22 Janvier 2010.

A combined analysis of morphological traits, chloroplast and nuclear DNA sequences within Santiria trimear (Burseraceae) suggests several species following the Biological Species Concept. Koffi K. Guillaume, Heuretz Myriam, Doumenge Charles, Onana Jean-Michel, Gavory Fréderick, Hardy Olivier J.. 2010. Plant Ecology and Evolution, 143 (2) : 160-169.

A large est resource for Theobroma cacao including cDNAS isolated from various organs and under various biotic and abiotic stresses. Lanaud Claire, Fouet Olivier, Gramacho Karina Peres, Argout Xavier, Legavre Thierry, Sabau Xavier, Risterucci Ange-Marie, Wincker Patrick, Da Silva Corinne, Loor Rey Gaston, Lopes Uilson Vanderlei, Cascardo Julio Cezar M., Courtois Brigitte, Kuhn David N., Schnell Raymond J., Bailey Bryan, Babin Régis, Sounigo Olivier, Ducamp Michel, Paulin Didier, Deberdt Peninna, Verica Joseph, Guiltinan Mark J., Alemanno Laurence, Machado Regina, Phillips Wilbert, Micheli Fabienne, Da Silva Gesteira Abelmon, Clément Didier, Maximova Siela N., Boccara Michel, Butler David R., Rosenquist Eric, Gilmour Martin, Glaszmann Jean-Christophe. 2010. In : 15th International Cocoa Research Conference : cocoa productivity, quality, profitability, human health and the environment = 15e Conférence internationale sur la recherche cacaoyère : Productivité, qualité, rentabilité du cacao, santé humaine et environnement ; 15 Conferencia Internacional de Pesquisas em Cacau. Cacau : produtividade, qualidade, rentabilidade, saude humanna e amb. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, 185-191. Conférence internationale sur la recherche cacaoyère. 15, San José, Costa Rica, 9 Octobre 2006/14 Octobre 2006.

Evolutionary dynamics of hom(oe)ologous haplotypes (bacs) within the highly polyploid sugarcane genome. Garsmeur Olivier, Charron Carine, Jouffe Vincent, Samain Sylvie, Hervouet Catherine, Van Sluys Marie-Anne, Sidibé-Bocs Stéphanie, D'Hont Angélique. 2009. In : International Conference on Polyploidy, Hybridization and Biodiversity, May 17 - 20, 2009, Saint-Malo, France, program and abstracts. Université de Rennes 1. Rennes : Université de Rennes 1, Résumé, 54. International Conference on Polyploidy, Hybridization and Biodiversity, Saint-Malo, France, 17 Mai 2009/20 Mai 2009.

La séquence complète du génome de Xanthomonas albilineans apporte un éclairage nouveau sur l'évolution des Xanthomonadaceae dont l'habitat est limité au xylème. Pieretti Isabelle, Royer Monique, Barbe Valérie, Carrère Sébastien, Koebnik Ralf, Cociancich Stéphane, Couloux Arnaud, Darrasse Armelle, Gouzy Jérôme, Jacques Marie Agnès, Lauber Emmanuelle, Manceau Charles, Mangenot Sophie, Poussier Stéphane, Segurens Béatrice, Szurek Boris, Verdier Valérie, Arlat Mathieu, Rott Philippe. 2009. In : Phytopathologie 2009. 7ème Colloque National de la Société Française de Phytopathologie, 8 au 11 Juin 2009, Lyon, France : livre des résumés. SFP, Université Claude Bernard Lyon 1. Paris : SFP, Résumé, 90. Colloque National de la Société Française de Phytopathologie. 7, Lyon, France, 8 Juin 2009/11 Juin 2009.

The complete genome sequence of Xanthomonas albilineans provides new insights into the reductive genome evolution of the xylem-limited Xanthomonadaceae. Pieretti Isabelle, Royer Monique, Barbe Valérie, Carrère Sébastien, Koebnik Ralf, Cociancich Stéphane, Couloux Arnaud, Darrasse Armelle, Szurek Boris, Verdier Véronique, Arlat Mathieu, Rott Philippe. 2009. In : Abstracts of the XIV International Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions, July 19-23, 2009, Quebec City, Canada. IS-MPMI. Saint-Paul : IS-MPMI, Résumé, 1 p. International Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions. 14, Québec, Canada, 19 Juillet 2009/23 Juillet 2009.

The complete genome sequence of Xanthomonas albilineans provides new insights into the reductive genome evolution of the xylem-limited Xanthomonadaceae. Pieretti Isabelle, Royer Monique, Barbe Valérie, Carrère Sébastien, Koebnik Ralf, Cociancich Stéphane, Couloux Arnaud, Darrasse Armelle, Gouzy Jérôme, Jacques Marie Agnès, Lauber Emmanuelle, Manceau Charles, Mangenot Sophie, Poussier Stéphane, Segurens Béatrice, Szurek Boris, Verdier Véronique, Arlat Mathieu, Rott Philippe. 2009. BMC Genomics, 10 (616), 15 p.

"Candidatus cloacamonas acidaminovorans": Genome sequence reconstruction provides a first glimpse of a new bacterial division. Pelletier Eric, Kreimeyer Annett, Bocs Stéphanie, Rouy Zoe, Gyapay Gabor, Chouari Rakia, Rivière Delphine, Ganesan Akila, Daegelen Patrick, Sghir Abdelghani, Cohen Georges N., Medigue Claudine, Weissenbach Jean, Le Paslier Denis. 2008. Journal of Bacteriology, 190 (7) : 2572-2579.

Characterization of microsatellite markers in mandarin orange (Citrus reticulata Blanco). Froelicher Yann, Dambier Dominique, Bassene Jean Baptiste, Costantino Gilles, Lotfy Samia, Didout Christophe, Beaumont Vincent, Brottier Philippe, Risterucci Ange-Marie, Luro François, Ollitrault Patrick. 2008. Molecular Ecology Resources, 8 (1) : 119-122.

The International Cocoa Genome Sequencing Consortium (ICGS): a coordinated strategy to sequence and analyse Theobroma cacao genome [Draft]. Lanaud Claire, Argout Xavier, Fouet Olivier, Allègre Mathilde, Sidibé-Bocs Stéphanie, Ruiz Manuel, Kudrna Dave, Ssa Jetty, Wing Rod A., Clément Didier, Gramacho Karina Peres, Tahi G.Mathias, Brunel Dominique, Bérard Aurélie, Boccara Michel, Udall Joshua, Guiltinan Mark J., Infante D., Costet Pierre, Zang D., Risterucci Ange-Marie, Legavre Thierry, Sabau Xavier, Wincker Patrick. 2008. In : Seventh Plant Genomics European Meetings (Plant GEM), 24-27 September 2008, Albena, Bulgaria. s.l. : s.n., 1-16. Plant Genomics European Meetings. 7, Albena, Bulgarie, 24 Septembre 2008/27 Septembre 2008.

La séquence du génome de Xanthomonas albilineans dévoile des particularités surprenantes chez cette bactérie pathogène de la canne à sucre. Pieretti Isabelle, Royer Monique, Barbe Valérie, Carrère Sébastien, Koebnik Ralf, Cociancich Stéphane, Couloux Arnaud, Darrasse Armelle, Gouzy Jérôme, Jacques Marie Agnès, Lauber Emmanuelle, Manceau Charles, Mangenot Sophie, Poussier Stéphane, Segurens Béatrice, Szurek Boris, Verdier Véronique, Arlat Mathieu, Rott Philippe. 2008. In : 8èmes Rencontres plantes-bactéries,14-18 janvier 2008, Aussois, France. s.l. : s.n., 11. Rencontres plantes-bactéries. 8, Aussois, France, 14 Janvier 2008/18 Janvier 2008.

Microsatellite markers for the fungal banana pathogens, Mycosphaerella fijiensis, Mycosphaerella musicola and Mycosphaerella eumusae. Zapater Marie-Françoise, Duchemin Myriam, Dussart Jean-François, Brottier Philippe, Carlier Jean. 2008. Molecular Ecology Resources, 8 (5) : 1121-1125.

Sex determination and sex chromosome evolution in the Platyfish Xiphophorus maculatus. Böhne Astrid, Schultheis Christina, Galiana-Arnoux Delphine, Schmidt Cornelia, Zhou Qingchun, Froschauer Alexander, Selz Yvonne, Ozouf-Costaz Catherine, Segurens Béatrice, Couloux Arnaud, Bernard-Samain Sylvie, Chilmonczyk Stefan, Brunet Frédéric, Baroiller Jean-François, D'Cotta Helena, et al.. 2008. Sexual Development, 2, Résumé : 289.

Towards the understanding of the cocoa transcriptome: Production and analysis of an exhaustive dataset of ESTs of Theobroma cacao L. generated from various tissues and under various conditions. Argout Xavier, Fouet Olivier, Wincker Patrick, Gramacho Karina Peres, Legavre Thierry, Sabau Xavier, Risterucci Ange-Marie, Da Silva Corinne, Cascardo Julio Cezar M., Allègre Mathilde, Kuhn David N., Verica Joseph, Courtois Brigitte, Loor Rey Gaston, Babin Régis, Sounigo Olivier, Ducamp Michel, Guiltinan Mark J., Ruiz Manuel, Alemanno Laurence, Machado Regina, Phillips Wilbert, Schnell Raymond J., Gilmour Martin, Rosenquist Eric, Butler David R., Maximova Siela N., Lanaud Claire. 2008. BMC Genomics, 9 (512), 19 p.

Transferability of the EST-SSRs developed on Nules clementine (Citrus clementina Hort ex Tan) to other Citrus species and their effectiveness for genetic mapping. Luro François, Costantino Gilles, Terol Javier F., Argout Xavier, Allario Thierry, Wincker Patrick, Talon Manuel, Ollitrault Patrick, Morillon Raphaël. 2008. BMC Genomics, 9 (287) : 1-13.

A first step in the understanding of the cocoa transcriptome: Analysis of an exhaustive dataset of ESTs on Theobroma cacao generated from various tissues and under various conditions. Argout Xavier, Fouet Olivier, Wincker Patrick, Gramacho Karina Peres, Legavre Thierry, Sabau Xavier, Risterucci Ange-Marie, Da Silva Corinne, Loor Solorzano Rey Gaston, Cascardo Julio Cezar M., Courtois Brigitte, Kuhn David N., Schnell Rey J., Babin Régis, Sounigo Olivier, Ducamp Michel, Verica Joseph, Guiltinan Mark J., Alemanno Laurence, Machado Regina, Phillips Wilbert, Maximova Siela N., Lanaud Claire. 2008. In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XVIth Conference, San Diego, CA (USA), January 12-16, 2008. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genomes Conference. 16, San Diego, États-Unis, 12 Janvier 2008/16 Janvier 2008.

The mosaic genomes of two phtosynthetic Bradyrhizobium strains do not contain canonical nodulation genes. Giraud Eric, Moulin Lionel, Avarre Jean-Christophe, Jaubert Marianne, Barbe Valérie, Béna Gilles, Cartiaux F., De Lajudie Philippe, Dreyfus Bernard, Elmerich D., Fardoux Joël, Hannibal Laure, Kojadinovic Mila, Lajus Aurélie, Mangenot Sophie, Medigue Claudine, Pignol David, Prin Yves, Rouy Zoe, Stacey Gary, Vallenet David, Vermeglio André, Vuillet Laurie, Sadowsky Michael. 2008. In : Biological nitrogen fixation : towards poverty alleviation through sustainable agriculture. Proceedings of the 15th International Nitrogen Fixation Congress and the 12th International Conference of the African Association for Biological Nitrogen Fixation. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. International Congress on Nitrogen Fixation. 15, Cape Town, Afrique du Sud, 21 Janvier 2007/26 Janvier 2007.

Evidence for the dispersal of a unique lineage from Asia to America and Africa in the sugarcane fungal pathogen Ustilago scitaminea. Raboin Louis-Marie, Selvi Athiappan, Oliveira Karine Miranda, Paulet Florence, Calatayud Caroline, Zapater Marie-Françoise, Brottier Philippe, Luzaran Rosalyn, Garsmeur Olivier, Carlier Jean, D'Hont Angélique. 2007. Fungal Genetics and Biology, 44 (1) : 64-76.

Large-scale characterization of Tos17 insertion sites in a rice T-DNA mutant library. Piffanelli Pietro, Droc Gaëtan, Mieulet Delphine, Lanau Nadège, Bes Martine, Bourgeois Emmanuelle, Rouvière Claire, Gavory Fréderick, Cruaud Corinne, Ghesquière Alain, Guiderdoni Emmanuel. 2007. Plant Molecular Biology, 65 (5) : 587-601.

Legumes symbioses : Absence of Nod genes in photosynthetic bradyrhizobia. Giraud Eric, Moulin Lionel, Vallenet David, Barbe Valérie, Cytryn Eddie, Avarre Jean-Christophe, Jaubert Marianne, Simon Damien, Cartieaux Fabienne, Prin Yves, Béna Gilles, Hannibal Laure, Fardoux Joël, Kojadinovic Mila, Vuillet Laurie, Lajus Aurélie, Cruveiller Stéphane, Rouy Zoe, Mangenot Sophie, Segurens Béatrice, Dossat Carole, Franck William L., Chang Woo-Suk, Saunders Elizabeth, Bruce David, Richardson Paul, Normand Philippe, Dreyfus Bernard, Pignol David, Stacey Gary, Emerich David, Vermeglio André, Medigue Claudine, Sadowsky Michael. 2007. Science, 316 (5829) : 1307-1312.

A large EST resource for theobroma cacao L. Lanaud Claire, Fouet Olivier, Gramacho Karina Peres, Argout Xavier, Legavre Thierry, Sabau Xavier, Risterucci Ange-Marie, Wincker Patrick, Da Silva Corinne, Loor Solorzano Rey Gaston, Cascardo Julio Cezar M., Courtois Brigitte, Kuhn David N., Schnell Rey J., Babin Régis, Sounigo Olivier, Ducamp Michel, Deberdt Peninna, Verica Joseph, Guiltinan Mark J., Alemanno Laurence, Machado Regina, Philips Wilbert, Maximova Siela N., Rosenquist Eric, Gilmour Martin, Glaszmann Jean-Christophe. 2007. In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XVth Conference, San Diego, CA (USA), January 13-17, 2007. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genomes Conference. 15, San Diego, États-Unis, 13 Janvier 2007/17 Janvier 2007.

Analysis of Ustilago scitaminea genetic diversity using microsatellite markers provides evidence of selfing and dispersal of a unique lineage over America and Africa. Raboin Louis-Marie, Selvi Athiappan, Miranda Oliveira K., Paulet Florence, Calatayud Caroline, Zapater Marie-Françoise, Brottier Philippe, Garsmeur Olivier, Carlier Jean, D'Hont Angélique. 2006. In : VIIIth ISSCT Pathology Workshop Petit-Bourg, Guadeloupe (FWI), 23-27 January 2006, programme and abstracts. Daugrois Jean-Heinrich. ISSCT, CIRAD-CA. Réduit : ISSCT, Résumé ISSCT Pathology Workshop. 8, Petit-Bourg, Guadeloupe, 23 Janvier 2006/27 Janvier 2006.

Development of DNA microsatellite markers in tropical yam (Dioscorea sp.). Tostain Serge, Scarcelli Nora, Brottier Philippe, Marchand Jean-Leu, Pham Jean Louis, Noyer Jean-Louis. 2006. Molecular Ecology Notes, 6 (1) : 173-175.

Microsatellite markers in Carica papaya L. : isolation, characterization and transferability to Vasconcellea species. Ocampo Perez John Albeiro, Dambier Dominique, Ollitrault Patrick, Coppens D'Eeckenbrugge Géo, Brottier Philippe, Froelicher Yann, Risterucci Ange-Marie. 2006. Molecular Ecology Notes, 6 (1) : 212-217.

Polymorphism and position analysis of dinucleotide and trinucleotide microsatellite sequences detected in citrus clementine cv. EST sequences. Luro François, Argout Xavier, Costantino Gilles, Froelicher Yann, Terol Javier F., Agusti Javier, Alos Enriqueta, Andres Fernando, Brumos Javier, Carillo J.A., Cercos Manuel, Colmenero Jose M., Conejero Vicente, Conesa Ana, Iglesias Domingo, Legaz Francisco, Navarro Luis, Soler Guillermo, Tadeo Francisco, Talon Manuel, Courtois Brigitte, Dossat Carole, Wincker Patrick, Ollitrault Patrick, Morillon Raphaël. 2006. In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XIVth Conference, San Diego, CA (USA), January 14-18, 2006. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genomes Conference. 14, San Diego, États-Unis, 14 Janvier 2006/18 Janvier 2006.

Analysis of citrus ESTs from standard and normalized full length cDNA libraries. Terol Javier F., Agusti Javier, Alos Enriqueta, Andres Fernando, Argout Xavier, Brumos Javier, Carrillo Jose A., Cercos Manuel, Colmenero Jose M., Conejero Vicente, Conesa Ana, Courtois Brigitte, Dossat Carole, Iglesias Domingo, Legaz Francisco, Morillon Raphaël, Navarro Luis, Ollitrault Patrick, Soler Guillermo, Tadeo Francisco, Wincker Patrick, Talon Manuel. 2005. In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XIIIth Conference, San Diego, CA (USA), January 15-19, 2005. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genomes Conference. 13, San Diego, États-Unis, 15 Janvier 2005/19 Janvier 2005.

Development of microsatellite markers in papaya: Isolation, characterization and cross amplification in mountain papayas. Ocampo Perez John Albeiro, Dambier Dominique, Ollitrault Patrick, Coppens D'Eeckenbrugge Géo, Brottier Philippe, Risterucci Ange-Marie. 2005. Proceedings of the Interamerican Society for Tropical Horticulture, 48 : 90-93. Annual Meeting of the Interamerican Society for Tropical Horticulture. 50, Limon, Costa Rica, 7 Octobre 2004/11 Octobre 2004.

Microsatellite-based high density linkage map in oil palm (Elaeis guineensis Jacq.). Billotte Norbert, Marseillac Nicolas, Risterucci Ange-Marie, Adon Benjamin, Brottier Philippe, Baurens Franc-Christophe, Singh Rajinder, Herran Ana, Asmady H., Billot Claire, Amblard Philippe, Durand-Gasselin Tristan, Courtois Brigitte, Asmono D., Cheah Suan-Choo, Rohde Wolfgang, Ritter Enrique, Charrier André. 2005. Theoretical and Applied Genetics, 110 (4) : 754-765.

A new codominant marker-based cocoa linkage map : development and intergration of new microsatellite markers into cocoa linkage map. A new cocoa reference map. Pugh Tatiana, Fouet Olivier, Risterucci Ange-Marie, Brottier Philippe, Abouladze M., Delettrez Claire, Courtois Brigitte, Clément Didier, Larmande Pierre, N'Goran Jeanne A.K., Lanaud Claire. 2005. In : 14th International Cocoa Research Conference. Proceedings : rumo a uma economia sustentavel do cacau - quais as estrategias para este fim ? = 14th International Cocoa Research Conference. Proccedings ; 14e Conférence internationale sur la recherche cacaoyère. Actes ; 14 Conferencia Internacional de Pesquisas em Cacau. Atas ; 14 Conferencia Internacional de Investigacion en Cacao. Actas : towards a sustainable cocoa economy - what strategies to this end ? ; vers une économie cacaoyère durable : quelles stratégies d'approche ? ; rumo a uma economia sustentavel do cacau - quais as estrategias para este fim ? ; hacia una economia sustentable del ca. CEPLAC, CRIG, MCB. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, 153-160. ISBN 978-065-959-5 Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 14, Accra, Ghana, 13 Octobre 2003/18 Octobre 2003.

The sequence of rice chromosomes 11 and 12, rich in disease resistance genes and recent gene duplications. Choisne Nathalie, Demange Nadia, Samain Sylvie, D'Hont Angélique, et al.. 2005. BMC Biology, 3 (20), 18 p.

Characterization of polymorphic microsatellite markers for Microcyclus ulei, causal agent of South American leaf blight of rubber trees. Le Guen Vincent, Rodier-Goud Marguerite, Troispoux Valérie, Xiong Tou Chen, Brottier Philippe, Billot Claire, Seguin Marc. 2004. Molecular Ecology Notes, 4 (1) : 122-124.

Genetic diversity of taro (Colocasia esculenta (L.) Schott) assessed by SSR markers. Noyer Jean-Louis, Billot Claire, Brottier Philippe, Quéro Garcia José, Lebot Vincent. 2004. In : Third Taro Symposium, 21-23 May 2003, Nadi, Fiji Islands : proceedings of an international scientific meeting. Guarino Luigi (ed.), Taylor Mary B. (ed.), Osborn Tom (ed.). SPC, IPGRI. Suva : SPC, 174-180. ISBN 982-00-0027-0 Taro Symposium. 3, Nadi, Fidji, 21 Mai 2003/23 Mai 2003.

Nuclear microsatellite markers for the date palm (Phoenix dactylifera L.) : Characterization and utility across the genus Phoenix and in other palm genera. Billotte Norbert, Marseillac Nicolas, Brottier Philippe, Noyer Jean-Louis, Jacquemoud-Collet Jean-Pierre, Moreau C., Couvreur Thomas, Chevallier Marie-Hélène, Pintaud Jean-Christophe, Risterucci Ange-Marie. 2004. Molecular Ecology Notes, 4 (2) : 256-258.

Wide coverage of the tetraploid cotton genome using newly developed microsatellite markers. Nguyen Trung-Bieu, Giband Marc, Brottier Philippe, Risterucci Ange-Marie, Lacape Jean-Marc. 2004. Theoretical and Applied Genetics, 109 (1) : 167-175.

A new cacao linkage map based on codominant markers : development and integration of 201 new microsatellite markers. Pugh Tatiana, Fouet Olivier, Risterucci Ange-Marie, Brottier Philippe, Abouladze M., Delettrez Claire, Courtois Brigitte, Clément Didier, Larmande Pierre, N'Goran Jeanne A.K., Lanaud Claire. 2004. Theoretical and Applied Genetics, 108 (6) : 1151-1161.

A new set of microsatellite markers for the peach palm (Bactris gasipaes Kunth); characterization and across-taxa utility within the tribe Cocoeae. Billotte Norbert, Couvreur Thomas, Marseillac Nicolas, Brottier Philippe, Perthuis Bernard, Vallejo M., Noyer Jean-Louis, Jacquemoud-Collet Jean-Pierre, Risterucci Ange-Marie, Pintaud Jean-Christophe. 2004. Molecular Ecology Notes, 4 (4) : 580-582.

Development and integration of new microsatellite markers into a cocoa linkage map : a new cocoa reference map [S04-27]. Pugh Tatiana, Fouet Olivier, Risterucci Ange-Marie, Brottier Philippe, Delettrez Claire, Courtois Brigitte, Larmande Pierre, N'Goran Jeanne A.K., Lanaud Claire. 2003. In : 7th International Congress of Plant Molecular Biology, ISPMB 2003, Barcelona (Spain), June 23-28. Book of abstracts. ISPMB. Barcelone : ISPMB Office, Résumé, 64. International Congress of Plant Molecular Biology. 7, Barcelone, Espagne, 23 Juin 2003/28 Juin 2003.

Development of single tagged microsatellite sequence (STMS) for networking management of citrus germplasm [S29-24]. Froelicher Yann, Dambier Dominique, Luro François, Costantino Gilles, Lotfy Samia, Didout Christophe, Beaumont Vincent, Brottier Philippe, Risterucci Ange-Marie, Ollitrault Patrick. 2003. In : 7th International Congress of Plant Molecular Biology, ISPMB 2003, Barcelona (Spain), June 23-28. Book of abstracts. ISPMB. Barcelone : ISPMB Office, Résumé, 411. International Congress of Plant Molecular Biology. 7, Barcelone, Espagne, 23 Juin 2003/28 Juin 2003.

Reference and SSR multi-parent linkage maps for molecular breeding in oil palm (Elaeis guineensis Jacq.). Billotte Norbert, Marseillac Nicolas, Risterucci Ange-Marie, Asmady H., Herran Ana, Singh Rajinder, Sniady Volker, Amblard Philippe, Durand-Gasselin Tristan, Brottier Philippe, Courtois Brigitte, Cheah Suan-Choo, Rohde Wolfgang, Ritter Enrique. 2003. In : Sustainable forestry, wood products and biotechnology, International Congress Biofor' 02, Victoria-Gasteiz, November, 11 to 14, 2002 = Aplicacion de la biotecnologia a la genetica forestal, Congreso Internacional Biofor' 02, Vitoria-Gasteiz, 11-14 de Noviembre de 2002. Espinel Santiago (ed.), Barredo Yolanda (ed.), Ritter Enrique (ed.). BIOFOR. Vitoria-Gasteiz : DFA Press, 421-426. International Scientific Congress Biofor'02 - Sustainable Forestry, Wood products and Biotechnology. 4, Vitoria-Gasteiz, Espagne, 11 Novembre 2002/14 Novembre 2002.

Environnement génomique du gène d'avirulence AvrLm1 chez Leptosphaeria maculans. Attard Agnès, Kühn Marie-Line, Cattolico Laurence, Meyer Michel, Balesdent Marie-Hélène, Rouxel Thierry. 2002. In : Journées Jean Chevaugeon : IVe rencontres de phytopathologie - mycologie du 13 au 17 mars 2002. [Résumés]. CIRAD-MIDEC, INRA, CNRS, SFP. Montpellier : CIRAD, Résumé, 1 p. Journées Jean Chevaugeon, Rencontres de phytopathologie-mycologie. 4, Aussois, France, 13 Mars 2002/17 Mars 2002.

Potential use of SSR markers for Coffea spp. genetic mapping. Dufour Magali, Hamon Perla, Noirot Michel, Risterucci Ange-Marie, Brottier Philippe, Vico V., Leroy Thierry. 2001. In : Dix-neuvième colloque scientifique international sur le café. Actes = 19th International scientific colloquium on coffee. Proceedings ; 19. Internationales wissenschaftliches Kolloquium über Kaffee ; 19° Coloquio cientifico internacional sobre el cafe. ASIC. Paris : ASIC, 1 Cd-Rom ISBN 2-900212-18-9 Colloque scientifique international sur le café. 19, Trieste, Italie, 14 Mai 2001/18 Mai 2001.

DMRT1 expression during gonadal differentiation and spermatogenesis in the rainbow trout, Oncorhynchus mykiss. Marchand O., Govoroun Marina, D'Cotta Helena, McMeel O.M., Lareyre Jean-Jaccques, Bernot A., Laudet Vincent, Guiguen Yann. 2000. Biochimica and Biophysica Acta, N. Gene structure and Expression, 1493 (1-2) : 180-187.