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Prospective scientifique pour la recherche française sur la biodiversité - 2023. Couvet Denis (ed.), Delavaud Aurélie (ed.), Langridge Joseph (ed.), Soubelet Hélène (ed.), Abbadie Luc, Albert Cécile H., Argillier Christine, Barnaud Adeline, Barot Sébastien, Barthélémy Daniel, Bazile Didier, Besnard Aurélien, Billet Philippe, Boisvert Valérie, Bonzom Jean-Marc, Boudet Céline, Claudet Joachim, Courchamp Franck, Crasquin Sylvie, Deuffic Philippe, Dupouey Jean-Luc, Gaba Sabrina, Garrido Francis, Giron David, Goulletquer Philippe, Grandcolas Philippe, Grenouillet Gaël, Hedde Mickaël, Hellal Jennifer, Jactel Hervé, Kéfi Sonia, Kergoat Gael J., Klein Etienne, Le Gall Line, Leboulanger Christophe, Maron Pierre-Alain, Mazé Camille, Morin Xavier, Petit-Michaut Sandrine, Peyrard Nathalie, Plantegenest Manuel, Roche Benjamin, Ronce Ophélie, Rousset F., Sainteny Guillaume, Sarrazin François, Scemama Pierre, Tixier-Boichard Michèle, Wincker Patrick, Young Juliette C., Zeppilli Daniella. 2023. Paris : FRB, 50 p. ISBN 979-10-91015-65-3

The link between Covid-19 and biodiversity: A report commissioned by the French public authorities. Silvain Jean-François (ed.), Goffaux Robin (ed.), Soubelet Hélène (ed.), Sarrazin François (ed.), Abbadie Luc, Albert Cécile H., Arpin Isabelle, Barot Sébastien, Barthélémy Daniel, Bazile Didier, Billet Philippe, Boudet Céline, Charbonnel Nathalie, Charmantier Anne, Dobigny Gauthier, Emperaire Laure, Gaba Sabrina, Gaubert Philippe, Gilot-Fromont Emmanuelle, Grandcolas Philippe, Guégan Jean-François, Jactel Hervé, Laurans Yann, Leblan Vincent, Le Gall Line, Levrel Harold, Morand Serge, Morel Jean-Louis, Moutou François, Pham Jean Louis, Plantard Olivier, Pontier Dominique, Roche Benjamin, Roger François, Sainteny Guillaume, Scemama Pierre, Soubeyrand Samuel, Thybaud Eric, Vittecoq Marion, Vourc'h Gwenaël. 2020. Paris : FRB, 54 p.

Architecture des plantes et production végétale : Les apports de la modélisation mathématique. De Reffye Philippe (ed.), Jaeger Marc (ed.), Barthélémy Daniel (ed.), Houllier François (ed.). 2018. Versailles : Ed. Quae, 357 p. (Synthèses : Quae) ISBN 978-2-7592-2620-7

Pl@antNet : Plateforme de production et de partage d'observations botaniques. Le numérique scientifique au service de la société. Bonnet Pierre, Joly Alexis, Goeau Hervé, Knaff R., Lombardo Jean-Christophe, Affouard Antoine, Champ Julien, Dufour-Kowalski Samuel, Chouet Mathias, Molino Jean-François, Boujemaa Nozha, Barthélémy Daniel. 2017. . Montpellier : CIRAD, 1 poster Amphithéâtre "Patrimoine Numérique Scientifique", Montpellier, France, 20 Février 2017/20 Février 2017.

Architecture et croissance des plantes : modélisation et applications. De Reffye Philippe (ed.), Jaeger Marc (ed.), Barthélémy Daniel (ed.), Houllier François (ed.). 2016. Versailles : Ed. Quae, 684 p. (Synthèses : Quae) ISBN 978-2-7592-2622-1

Pl@ntNet, une plate-forme innovante d'agrégation et partage d'observations botaniques. Barthélémy Daniel, Boujemaa Nozha, Molino Jean-François, Joly Alexis, Goeau Hervé, Bakic Vera, Selmi Souheil, Champ Julien, Carré Jennifer, Chouet Mathias, Peronnet Aurélien, Vignau Christel, Dufour-Kowalski Samuel, Affouard Antoine, Barbe Julien, Bonnet Pierre. 2016. In : Botanists of the twenty-first century: roles, challenges and opportunities = Quels botanistes pour le 21e siècle ? Métiers, enjeux et opportunités. Rakotoarisoa Noëline R. (ed.), Blackmore Stephen (ed.), Riera Bernard (ed.). Paris : UNESCO, 191-197. ISBN 978-92-3-100120-8 UNESCO International Conference: Botanists of the twenty-first century, Paris, France, 22 Septembre 2014/25 Septembre 2014.

Plant identification: man vs. machine. LifeCLEF 2014 plant identification challenge. Bonnet Pierre, Joly Alexis, Goeau Hervé, Champ Julien, Vignau Christel, Molino Jean-François, Barthélémy Daniel, Boujemaa Nozha. 2016. Multimedia Tools and Applications, 75 (3) : 1647-1665.

Retrospective analysis of plant architecture: an extended definition of dendrochronology. Heuret Patrick, Caraglio Yves, Sabatier Sylvie-Annabel, Barthélémy Daniel, Nicolini Eric-André. 2016. In : Tropical ecology and society reconciliating conservation and sustainable use of biodiversity. Program and abstracts. Plinio Sist (ed.), Stéphanie Carrière (ed.), Pia Parolin (ed.), Pierre-Michel Forget (ed.). ATBC. Storrs : ATBC, Résumé, p. 118. Annual Meeting of the Association for Tropical Biology and Conservation (ATBC 2016), Montpellier, France, 19 Juin 2016/23 Juin 2016.

Trait coordination, mechanical behaviour and growth form plasticity of Amborella trichopoda under variation in canopy openness. Trueba Santiago, Isnard Sandrine, Barthélémy Daniel, Olson Mark E.. 2016. AoB Plants, 8:plw068, 18 p.

Understanding plant growth dynamics: links between morpho-anatomical structure and phenology. Caraglio Yves, Barthélémy Daniel, Edelin Claude, Nicolini Eric-André, Heuret Patrick. 2016. In : Tropical ecology and society reconciliating conservation and sustainable use of biodiversity. Program and abstracts. Plinio Sist (ed.), Stéphanie Carrière (ed.), Pia Parolin (ed.), Pierre-Michel Forget (ed.). ATBC. Storrs : ATBC, Résumé, p. 116. Annual Meeting of the Association for Tropical Biology and Conservation (ATBC 2016), Montpellier, France, 19 Juin 2016/23 Juin 2016.

An image-based Plant identification platform for thousands of species. Bonnet Pierre, Joly Alexis, Champ Julien, Goeau Hervé, Dufour-Kowalski Samuel, Affouard Antoine, Lombardo Jean-Christophe, Wang Sen, Carrée Jennifer, Molino Jean-François, Boujemaa Nozha, Barthélémy Daniel. 2016. In : Tropical ecology and society reconciliating conservation and sustainable use of biodiversity. Program and abstracts. Plinio Sist (ed.), Stéphanie Carrière (ed.), Pia Parolin (ed.), Pierre-Michel Forget (ed.). ATBC. Storrs : ATBC, Résumé, p. 346. Annual Meeting of the Association for Tropical Biology and Conservation (ATBC 2016), Montpellier, France, 19 Juin 2016/23 Juin 2016.

A look inside the Pl@ntNet experience. The good, the bias and the hope. Joly Alexis, Bonnet Pierre, Goeau Hervé, Barbe Julien, Selmi Souheil, Champ Julien, Dufour-Kowalski Samuel, Affouard Antoine, Carré Jennifer, Molino Jean-François, Boujemaa Nozha, Barthélémy Daniel. 2016. Multimedia Systems, 22 (6) : 751-766.

Botanique. Louppe Dominique, Barthélémy Daniel. 2015. In : Mémento du forestier tropical. Mille Gilles (ed.), Louppe Dominique (ed.). Versailles : Ed. Quae, 299-314. ISBN 978-2-7592-2340-4

Guide illustré de la flore de Patagonie. Barthélémy Daniel, Brion Cécilia, Puntieri Javier G.. 2015. Marseille : IRD, 239 p. (Guides illustrés / IRD) ISBN 978-2-7099-1873-2

DataManager, un système novateur de gestion et d'échange de données botaniques distribuées. Dufour-Kowalski Samuel, Chouet Mathias, Affouard Antoine, Milcent Jean-Pascal, Duché Grégoire, Liens Benjamin, Bonnet Pierre, Le Bourgeois Thomas, Joly Alexis, Goeau Hervé, Barthélémy Daniel, Molino Jean-François. 2014. In : Conférence internationale : Quels botanistes pour le XXIème siècle? Métiers, enjeux, opportunités, 22-25 septembre 2014, Paris, France. UNESCO. s.l. : s.n., 1 p. Conférence internationale : Quels botanistes pour le XXIème siècle? Métiers, enjeux, opportunités, Paris, France, 22 Septembre 2014/25 Septembre 2014.

Effect of light on the growth and photosynthesis of an invasive shrub in its native range. Svriz Maya, Damasceno Cynthia Maria B, Lediuk Karen D., Varela Santiago A., Barthélémy Daniel. 2014. AoB Plants, 6 (plu033), 33 p.

Interactive plant identification based on social image data. Joly Alexis, Goeau Hervé, Bonnet Pierre, Bakic Vera, Barbe Julien, Selmi Souheil, Yahiaoui Itheri, Carré Jennifer, Mouysset Elise, Molino Jean-François, Boujemaa Nozha, Barthélémy Daniel. 2014. Ecological Informatics, 23 : 22-34.

LifeCLEF plant identification task 2014. Goeau Hervé, Joly Alexis, Bonnet Pierre, Selmi Souheil, Molino Jean-François, Barthélémy Daniel, Boujemaa Nozha. 2014. In : Working Notes for CLEF 2014 Conference, Sheffield, United Kingdom, September 15-18, 2014. Linda Cappellato, Nicola Ferro, Martin Halvey, Wessel Kraaij (eds.). s.l. : CEUR-WS, 585-597. (CEUR Workshop Proceedings, 1180) Conference and Labs of the Evaluation Forum, Sheffield, Royaume-Uni, 15 Septembre 2014/18 Septembre 2014.

Pl@ntNet's participation at LifeCLEF 2014 plant identifiation task. Goeau Hervé, Joly Alexis, Yahiaoui Itheri, Bakic Vera, Verroust-Blondet Anne, Bonnet Pierre, Barthélémy Daniel, Boujemaa Nozha, Molino Jean-François. 2014. In : Working Notes for CLEF 2014 Conference, Sheffield, United Kingdom, September 15-18, 2014. Linda Cappellato, Nicola Ferro, Martin Halvey, Wessel Kraaij (eds.). s.l. : CEUR-WS, 724-737. (CEUR Workshop Proceedings, 1180) Conference and Labs of the Evaluation Forum, Sheffield, Royaume-Uni, 15 Septembre 2014/18 Septembre 2014.

Bud and shoot structure may relate to the distribution area of South American Proteaceae tree species. Magnin Amaru, Grosfeld Javier, Barthélémy Daniel, Puntieri Javier G.. 2012. Flora, 207 (8) : 599-606.

Retrospective analysis of tree architecture in silver fir (Abies alba Mill.): ontogenetic trends and responses to environmental variability. Taugourdeau Olivier, Dauzat Jean, Griffon Sébastien, Sabatier Sylvie-Annabel, Caraglio Yves, Barthélémy Daniel. 2012. Annals of Forest Science, 69 (6) : 713-721.

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The genus Cecropia: A biological clock to estimate the age of recently disturbed areas in the neotropics. Zalamea Paul-Camilo, Heuret Patrick, Sarmiento Carolina, Rodríguez Manuel, Berthouly Anne, Guitet Stéphane, Nicolini Eric-André, Delnatte César, Barthélémy Daniel, Stevenson Pablo R.. 2012. PloS One, 7 (8):e42643, 7 p.

Crown fragmentation assessment in tropical trees : Method, insights and perspectives. Rutishauser Ervan, Barthélémy Daniel, Blanc Lilian, Nicolini Eric-André. 2011. Forest Ecology and Management, 261 (3) : 400-407.

Morphogenetic gradients in silver firs (Abies alba Mill.) and their plasticity. Taugourdeau Olivier, Sabatier Sylvie-Annabel, Caraglio Yves, Barthélémy Daniel. 2011. In : IBC2011. XVIII International Botanical Congress, 23-30 July 2011, Melbourne, Australia. s.l. : s.n., Résumé, 560. International Botanical Congress. 18, Melbourne, Australie, 23 Juillet 2011/30 Juillet 2011.

The Pl@ntnet project: plant computational identification and collaborative information system. Barthélémy Daniel, Boujemaa Nozha, Mathieu Daniel, Jean-François M., Joly Alexis, Mouysset Elise. 2011. In : IBC2011. XVIII International Botanical Congress, 23-30 July 2011, Melbourne, Australia. s.l. : s.n., Résumé, 577. International Botanical Congress. 18, Melbourne, Australie, 23 Juillet 2011/30 Juillet 2011.

Plant architecture : From concepts to applications. Barthélémy Daniel, Caraglio Yves, Charles-Dominique Tristan, Edelin Claude, Heuret Patrick, Meyer-Berthaud Brigitte, Nicolini Eric-André, Rey Hervé, Sabatier Sylvie-Annabel, Taugourdeau Olivier. 2011. In : IBC2011. XVIII International Botanical Congress, 23-30 July 2011, Melbourne, Australia. s.l. : s.n., Résumé, 560-561. International Botanical Congress. 18, Melbourne, Australie, 23 Juillet 2011/30 Juillet 2011.

The plant-ant Camponotus schmitzi helps its carnivorous host-plant Nepenthes bicalcarata to catch its prey. Bonhomme Vincent, Gounand Isabelle, Alaux Christine, Jousselin Emmanuelle, Barthélémy Daniel, Gaume Laurence. 2011. Journal of Tropical Ecology, 27 (1) : 15-24.

Influences des pièges sur la réitération et la sexualité des utriculaires aquatiques : cas d'Utricularia gibba et U. stellaris (Lentibulariaceae). Ranarijaona Hery Lisy Tiana, Nantenaina Donald A., Andrianasetra Georges S., Barthélémy Daniel, Caraglio Yves, Edelin Claude. 2010. Malagasy Nature, 4 : 17-31.

Pl@ntNet, un réseau collaboratif et une plateforme informatique dédiés à la compilation et au partage d'outils et de connaissances en botanique. Barthélémy Daniel, Boujemaa Nozha, Mathieu Daniel, Molino Jean-François. 2010. In : Biodiversité. Des sciences pour les humains et la nature = Biodiversity. Science for humans and nature. Dorthe Chantal (ed.), Morand Serge (ed.). Agropolis. Montpellier : Agropolis International, 71. (Les dossiers d'Agropolis International, 13)

Retrospective analysis of fir sapling growth vs. light interception. Taugourdeau Olivier, Dauzat Jean, Griffon Sébastien, De Coligny François, Sabatier Sylvie, Caraglio Yves, Barthélémy Daniel. 2010. In : Proceedings of the 6th International Workshop on Functional-Structural Plant Models, FSPM 2010, September 12-17, 2010, University of California, Davis (USA). Dejong Thedore M. (ed.), Da Silva David (ed.). University of California-Department of Plant Sciences. Davis : University of California, 103-105. International Workshop on Functional-Structural Plant Models. 6, Davis, États-Unis, 12 Septembre 2010/17 Septembre 2010.

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AmapSim: A structural whole-plant simulator based on botanical knowledge and designed to host external functional models. Barczi Jean-François, Rey Hervé, Caraglio Yves, De Reffye Philippe, Barthélémy Daniel, Qiaoxue Dong, Fourcaud Thierry. 2008. Annals of Botany, 101 (8) : 1125-1138.

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Interactive simulation of plant architecture based on a dual-scale automaton model. Zhao X., De Reffye Philippe, Barthélémy Daniel, Hu Bao-Gang. 2003. In : Plant growth modeling and applications. Proceedings PMA03 : The First International symposium on plant growth modeling, simulation, visualization and their applications, Beijing, China, October 13-16, 2003. Hu Bao-Gang (ed.), Jaeger Marc (ed.). Institut d'automatique-LIAMA, Chinese Agriculture University. Pékin : Tsinghua University Press, 144-153. ISBN 7-302-07140-3 International Symposium on Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and their Applications (PMA03). 1, Pékin, Chine, 13 Octobre 2003/16 Octobre 2003.

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Bud content and its relation to shoot size and structure in Nothofagus pumilio (Poepp. et Endl.) Krasser (Nothofagaceae). Souza Maria S., Puntieri Javier G., Barthélémy Daniel, Brion Cécilia. 2000. Annals of Botany, 85 : 547-555.

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Preformation, neoformation, and shoot structure in Nothofagus dombeyi (Nothofagaceae). Puntieri Javier G., Souza Maria S., Barthélémy Daniel, Brion Cécilia, Nunez Martin, Mazzini Camilo. 2000. Canadian Journal of Botany, 78 : 1044-1054.

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Cypress : a practical handbook. Ducrey M. (ed.), Barthélémy Daniel (ed.), Pichot Christian (ed.), Giannini R. (ed.), Raddi P. (ed.), Roques Alain (ed.), Sales Luis J. (ed.), Thibaut Bernard (ed.), Teissier Du Cros E.. 1999. Florence : Studio Leonardo, 139 p. ISBN 88-87585-01-6

Growth dynamics and morphology of annual shoots, according to their architectural position, in young Cedrus atlantica (Endl.) Manetti ex Carrière (Pinaceae). Sabatier Sylvie-Annabel, Barthélémy Daniel. 1999. Annals of Botany, 84 : 387-392.

Il cipresso : manuale technico. Ducrey M. (ed.), Barthélémy Daniel (ed.), Pichot Christian (ed.), Giannini R. (ed.), Raddi P. (ed.), Roques Alain (ed.), Sales Luis J. (ed.), Thibaut Bernard (ed.), Teissier Du Cros E.. 1999. Florence : Studio Leonardo, 139 p. ISBN 88-87585-00-8

Le cyprès : guide pratique. Teissier Du Cros E., Ducrey M., Barthélémy Daniel, Pichot Christian, Giannini R., Raddi P., Roques Alain, Sales Luis J., Thibaut Bernard. 1999. Florence : Studio Leonardo, 136 p. ISBN 88-87585-02-4

Los cipreses : un manual practico. Ducrey M. (ed.), Barthélémy Daniel (ed.), Pichot Christian (ed.), Giannini R. (ed.), Raddi P. (ed.), Roques Alain (ed.), Sales Luis J. (ed.), Thibaut Bernard (ed.), Teissier Du Cros E.. 1999. Florence : Studio Leonardo, 139 p. ISBN 88-87585-03-2

Morfologia de las unidades estructurales y modo de desarrollo basico de especies patagonicas de Nothofagus (Fagaceae). Barthélémy Daniel, Puntieri Javier, Brion Cécilia, Raffaele Estela, Marino Jorgelina, Martinez Pascal. 1999. Boletín de la Sociedad Argentina de Botánica, 34 (1-2) : 29-38.

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Una aproximacion a la arquitectura vegetal: conceptos, objetivos y metodologia. Tourn G.M., Barthélémy Daniel, Grosfeld Javier. 1999. Boletín de la Sociedad Argentina de Botánica, 34 (1-2) : 85-99.

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Essai sur la simulation des relations fonctionnelles entre parties racinaire, partie caulinaire et croissance en épaisseur des axes chez les végétaux. De Reffye Philippe, Barthélémy Daniel, Blaise Frédéric, Fourcaud Thierry, Houllier François. 1995. In : L'arbre : résumés = The tree : Abstracts. CNRS. Talence : CNRS, Résumé, 36. Colloque international sur l'arbre. 3, Montpellier, France, 11 Septembre 1995/16 Septembre 1995.

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Etude de la croissance et de la ramification de différentes formes de cyprès : Cupressus sempervirens L. (Cupressaceae). Bouroulet F., Barthélémy Daniel, Ducatillon C., Liminana J.M., De Reffye Philippe. 1995. In : Architecture des arbres fruitiers et forestiers. Bouchon Jean (ed.). INRA. Paris : INRA, 254-272. ISBN 2-7380-0623-X Colloque sur l'architecture des arbres fruitiers et forestiers, Montpellier, France, 23 Novembre 1993/25 Novembre 1993.

Gradients morphologiques et biochimiques chez un noyer hybride (Juglans nigra x Juglans regia). Jay Allemand Christian, Barthélémy Daniel, Sabatier Sylvie-Annabel, Bruant B.. 1995. In : Architecture des arbres fruitiers et forestiers. Bouchon Jean (ed.). INRA. Paris : INRA, 125-138. ISBN 2-7380-0623-X Colloque sur l'architecture des arbres fruitiers et forestiers, Montpellier, France, 23 Novembre 1993/25 Novembre 1993.

Influence de la densité de plantation sur quelques caractéristiques dendrométriques, morphologiques et architecturales de la provenance Istebna II (Pologne) de Picea abies (L.) Karsten (Pinaceae). Colin François, Barthélémy Daniel, Ribeyrolles L.. 1995. In : Architecture des arbres fruitiers et forestiers. Bouchon Jean (ed.). INRA. Paris : INRA, 209-235. ISBN 2-7380-0623-X Colloque sur l'architecture des arbres fruitiers et forestiers, Montpellier, France, 23 Novembre 1993/25 Novembre 1993.

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Modélisation de l'architecture du pin maritime, Pinus pinaster Ait. (Pinaceae) : premiers résultats. Coudurier T., Barthélémy Daniel, Chanson Bernard, Courdier Florence, Loup Caroline. 1995. In : Architecture des arbres fruitiers et forestiers. Bouchon Jean (ed.). INRA. Paris : INRA, 305-321. ISBN 2-7380-0623-X Colloque sur l'architecture des arbres fruitiers et forestiers, Montpellier, France, 23 Novembre 1993/25 Novembre 1993.

Modélisation et simulation de l'architecture des arbres : bilan et perspectives. Barthélémy Daniel, Blaise Frédéric, Fourcaud Thierry, Nicolini Eric-André. 1995. Revue Forestière Française, 47 : 71-96.

Nature de la pousse annuelle chez le noyer commun, Juglans regia L. var. Lara (Juglandaceae) : préformation hivernale et printanière. Sabatier Sylvie-Annabel, Barthélémy Daniel, Ducousso I., Germain E.. 1995. In : Architecture des arbres fruitiers et forestiers. Bouchon Jean (ed.). INRA. Paris : INRA, 109-123. ISBN 2-7380-0623-X Colloque sur l'architecture des arbres fruitiers et forestiers, Montpellier, France, 23 Novembre 1993/25 Novembre 1993.

Premières observations sur la variabilité architecturale de jeunes individus de Cupressus sempervirens L. (Cupressaceae). Ducatillon C., Bouroulet F., Barthélémy Daniel. 1995. In : Architecture des arbres fruitiers et forestiers. Bouchon Jean (ed.). INRA. Paris : INRA, 237-251. ISBN 2-7380-0623-X Colloque sur l'architecture des arbres fruitiers et forestiers, Montpellier, France, 23 Novembre 1993/25 Novembre 1993.

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Parc national de la Marahoué. Etude préalable à un aménagement du parc et de sa zone périphérique. Barthélémy Daniel, Borie Jean-Michel, Couterun P., Bousquet B., Burthey F., Deshayes Michel, Ellsasser Konrad, Ouedraogo Ibrahima, Bedel J.. 1988. Paris : ENGREF, 124 p.

Relation entre la position des complexes réitérés sur un arbre et l'expression de leur floraison : l'exemple de trois espèces tropicales. Barthélémy Daniel. 1986. In : L'arbre. Montpellier : Institut de botanique Colloque international sur l'arbre. 1, Montpellier, France, 9 Septembre 1985/14 Septembre 1985.