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Journal article

Plant identification: man vs. machine. LifeCLEF 2014 plant identification challenge. Bonnet Pierre, Joly Alexis, Goeau Hervé, Champ Julien, Vignau Christel, Molino Jean-François, Barthélémy Daniel, Boujemaa Nozha. 2016. Multimedia Tools and Applications, 75 (3) : pp. 1647-1665.
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A look inside the Pl@ntNet experience. The good, the bias and the hope. Joly Alexis, Bonnet Pierre, Goeau Hervé, Barbe Julien, Selmi Souheil, Champ Julien, Dufour-Kowalski Samuel, Affouard Antoine, Carré Jennifer, Molino Jean-François, Boujemaa Nozha, Barthélémy Daniel. 2016. Multimedia Systems, 22 (6) : pp. 751-766.
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Effect of light on the growth and photosynthesis of an invasive shrub in its native range. Svriz Maya, Damasceno Cynthia Maria B, Lediuk Karen D., Varela Santiago A., Barthélémy Daniel. 2014. AoB Plants, 6 (plu033), 33 p.
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Interactive plant identification based on social image data. Joly Alexis, Goeau Hervé, Bonnet Pierre, Bakic Vera, Barbe Julien, Selmi Souheil, Yahiaoui Itheri, Carré Jennifer, Mouysset Elise, Molino Jean-François, Boujemaa Nozha, Barthélémy Daniel. 2014. Ecological Informatics, 23 : pp. 22-34.
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Bud and shoot structure may relate to the distribution area of South American Proteaceae tree species. Magnin Amaru, Grosfeld Javier, Barthélémy Daniel, Puntieri Javier. 2012. Flora, 207 (8) : pp. 599-606.
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Retrospective analysis of tree architecture in silver fir (Abies alba Mill.): ontogenetic trends and responses to environmental variability. Taugourdeau Olivier, Dauzat Jean, Griffon Sébastien, Sabatier Sylvie-Annabel, Caraglio Yves, Barthélémy Daniel. 2012. Annals of Forest Science, 69 (6) : pp. 713-721.
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The genus Cecropia: A biological clock to estimate the age of recently disturbed areas in the neotropics. Zalamea Paul-Camilo, Heuret Patrick, Sarmiento Carolina, Rodríguez Manuel, Berthouly Anne, Guitet Stéphane, Nicolini Eric-André, Delnatte César, Barthélémy Daniel, Stevenson Pablo R.. 2012. PloS One, 7 (8):e42643, 7 p.
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Crown fragmentation assessment in tropical trees : Method, insights and perspectives. Rutishauser Ervan, Barthélémy Daniel, Blanc Lilian, Nicolini Eric-André. 2011. Forest Ecology and Management, 261 (3) : pp. 400-407.
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The plant-ant Camponotus schmitzi helps its carnivorous host-plant Nepenthes bicalcarata to catch its prey. Bonhomme Vincent, Gounand Isabelle, Alaux Christine, Jousselin Emmanuelle, Barthélémy Daniel, Gaume Laurence. 2011. Journal of Tropical Ecology, 27 (1) : pp. 15-24.
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Influences des pièges sur la réitération et la sexualité des utriculaires aquatiques : cas d'Utricularia gibba et U. stellaris (Lentibulariaceae). Ranarijaona Hery Lisy Tiana, Nantenaina Donald A., Andrianasetra Georges S., Barthélémy Daniel, Caraglio Yves, Edelin Claude. 2010. Malagasy Nature, 4 : pp. 17-31.
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A dynamic model of plant growth with interactions between development and functional mechanisms to study plant structural plasticity related to trophic competition. Mathieu Amélie, Cournède Paul-Henry, Letort Véronique, Barthélémy Daniel, De Reffye Philippe. 2009. Annals of Botany, 103 : pp. 1173-1186.
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AmapSim: A structural whole-plant simulator based on botanical knowledge and designed to host external functional models. Barczi Jean-François, Rey Hervé, Caraglio Yves, De Reffye Philippe, Barthélémy Daniel, Qiaoxue Dong, Fourcaud Thierry. 2008. Annals of Botany, 101 (8) : pp. 1125-1138.
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L'identification des adventices assistée par ordinateur avec le système IDAO. Le Bourgeois Thomas, Bonnet Pierre, Edelin Claude, Grard Pierre, Prosperi Maria-Juliana, Theveny Frédéric, Barthélémy Daniel. 2008. Innovations Agronomiques, 3 : pp. 167-175. Colloque Carrefour de l'innovation agronomique, Dijon, France, 2 December 2008.
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Relative extents of preformation and neoformation in tree shoots : Analysis by a deconvolution method. Guédon Yann, Puntieri Javier G., Sabatier Sylvie-Annabel, Barthélémy Daniel. 2006. Annals of Botany, 98 (4) : pp. 835-844.
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Primary growth and morphological markers of interannual growth limits in Cupressaceae from Patagonia. Grosfeld Javier, Barthélémy Daniel. 2004. Botanical Journal of the Linnean Society, 146 (3) : pp. 285-293.
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Analysing branching pattern in plantations of young red oak trees (Quercus rubra L., Fagaceae). Heuret Patrick, Guédon Yann, Guérard Natacha, Barthélémy Daniel. 2003. Annals of Botany, 91 (4) : pp. 479-492.

Axis differentiation in two South American Nothofagus species (Nothofagaceae). Puntieri Javier G., Souza Maria S., Brion Cécilia, Mazzini Camilo, Barthélémy Daniel. 2003. Annals of Botany, 92 : pp. 589-599.

Clé d'identification des principales familles et des principaux genres à espèces arborées de Guyane. Puig Henri, Barthélémy Daniel, Sabatier Daniel. 2003. Revue Forestière Française, 55 (spec.) : pp. 84-100.
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Periods of organogenesis in mono- and bicyclic annual shoots of Juglans regia L. (Juglandaceae). Sabatier Sylvie-Annabel, Barthélémy Daniel, Ducousso I.. 2003. Annals of Botany, 92 (2) : pp. 231-238.

Periods of organogenesis in shoots of Nothofagus dombeyi (Mirb.) Oersted (Nothofagaceae). Puntieri Javier G., Barthélémy Daniel, Mazzini Camilo, Brion Cécilia. 2002. Annals of Botany, 89 : pp. 115-124.

Synchronization of growth, branching and flowering processes in the South American tropical tree Cecropia obtusa (Cecropiaceae). Heuret Patrick, Barthélémy Daniel, Guédon Yann, Coulmier Xavier, Tancre Juliette. 2002. American Journal of Botany, 89 (7) : pp. 1180-1187.

Trunk and main-branch development in Nothofagus pumilio (Nothofagaceae) : a retrospective analysis of tree growth. Passo A., Puntieri Javier G., Barthélémy Daniel. 2002. Canadian Journal of Botany, 80 : pp. 763-772.

Dioecy in Fitzroya cupressoides (Molina) I.M. Johnst. and Pilgerodendron uviferum (D. Don) Florin (Cupressaceae). Grosfeld Javier, Barthélémy Daniel. 2001. Comptes Rendus de l'Académie des Sciences. Série 3, Sciences de la Vie, 324 : pp. 245-250.

Influence de la compétition herbacée sur la croissance et l'architecture de jeunes Chênes rouges d'Amérique (Quercus rubra L.) en plantation. Guérard Natacha, Barthélémy Daniel, Cabanettes A., Courdier Florence, Trichet Patrick, Willm Jérôme. 2001. Annals of Forest Science, 58 (4) : pp. 395-410.

Pattern analysis in branching and axillary flowering sequences. Guédon Yann, Barthélémy Daniel, Caraglio Yves, Costes Evelyne. 2001. Journal of Theoretical Biology, 212 : pp. 481-520.

Variaciones en el tamano y la composicion de las yemas de Nothofagus pumilio y N. dombeyi (Fagaceae). Puntieri Javier G., Brion Cécilia, Barthélémy Daniel, Souza Maria S.. 2001. Darwiniana, 39 (1-2) : pp. 1-10.

Annual shoot-growth in Nothofagus antarctica (G. Forster) Oersted (Nothogagaceae) from northern Patagonia. Stecconi Marina, Puntieri Javier, Barthélémy Daniel. 2000. Trees, 14 : pp. 289-296.

Bud content and its relation to shoot size and structure in Nothofagus pumilio (Poepp. et Endl.) Krasser (Nothofagaceae). Souza Maria S., Puntieri Javier G., Barthélémy Daniel, Brion Cécilia. 2000. Annals of Botany, 85 : pp. 547-555.

Modelling architecture and growth patterns of Posidonia oceanica. Molenaar Heike, Barthélémy Daniel, De Reffye Philippe, Meinesz Alexandre, Mialet Isabelle. 2000. Aquatic Botany, 66 : pp. 85-99.

Preformation, neoformation, and shoot structure in Nothofagus dombeyi (Nothofagaceae). Puntieri Javier G., Souza Maria S., Barthélémy Daniel, Brion Cécilia, Nunez Martin, Mazzini Camilo. 2000. Canadian Journal of Botany, 78 : pp. 1044-1054.

Taille et architecture chez de jeunes noyers hybrides. Sabatier Sylvie-Annabel, Barthélémy Daniel, Becquey J., Perrier S.. 2000. Forêt Entreprise (132) : pp. 54-58.

Allongement et morphologie de pousses annuelles issues de greffe chez le noyer commun, Juglans regia L. cv. Lara (Juglandaceae). Sabatier Sylvie-Annabel, Barthélémy Daniel, Ducousso I., Germain E.. 1999. Canadian Journal of Botany, 77 : pp. 1595-1603.

Morfologia de las unidades estructurales y modo de desarrollo basico de especies patagonicas de Nothofagus (Fagaceae). Barthélémy Daniel, Puntieri Javier, Brion Cécilia, Raffaele Estela, Marino Jorgelina, Martinez Pascal. 1999. Boletín de la Sociedad Argentina de Botánica, 34 (1-2) : pp. 29-38.

Morphological and architectural features of young Nothofagus pumilio (Poepp. & Endl.) Krasser (Fagaceae). Puntieri Javier, Raffaele Estela, Martinez Pascal, Barthélémy Daniel, Brion Cécilia. 1999. Botanical Journal of the Linnean Society (130) : pp. 395-410.

Una aproximacion a la arquitectura vegetal: conceptos, objetivos y metodologia. Tourn G.M., Barthélémy Daniel, Grosfeld Javier. 1999. Boletín de la Sociedad Argentina de Botánica, 34 (1-2) : pp. 85-99.

Annual-shoot growth and branching patterns in Nothofagus dombeyi (Fagaceae). Puntieri Javier, Barthélémy Daniel, Martinez Pascal, Raffaele Estela, Brion Cécilia. 1998. Canadian Journal of Botany, 76 : pp. 673-685.

Comparative morphology of annual shoots in seedlings of five Nothofagus species from Argentinian Patagonia. Raffaele Estela, Puntieri Javier, Martinez Pascal, Marino Jorgelina, Brion Cécilia, Barthélémy Daniel. 1998. Comptes Rendus de l'Académie des Sciences. Série 3, Sciences de la Vie, 321 (4) : pp. 305-311.
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Modalités d'allongement et morphologie des pousses annuelles chez le noyer commun, Juglans regia L. "Lara" (Juglandaceae). Sabatier Sylvie, Barthélémy Daniel, Ducousso I., Germain E.. 1998. Canadian Journal of Botany, 76 : pp. 1253-1264.

A functional model of tree growth and tree architecture. De Reffye Philippe, Fourcaud Thierry, Blaise Frédéric, Barthélémy Daniel, Houllier François. 1997. Silva Fennica, 31 (3) : pp. 297-311.

Sobre la presencia de Rubus radicans (Rosaceae) en la Argentina y sus differencias con Rubus geoides. Brion Cécilia, Barthélémy Daniel. 1996. Boletín de la Sociedad Argentina de Botánica, 32 (1-2) : pp. 134-135.

Le développement architectural du noyer commun Juglans regia L. (Juglandaceae). Barthélémy Daniel, Sabatier Sylvie-Annabel, Pascal O.. 1995. Forêt Entreprise (103) : pp. 61-68.

Modélisation et simulation de l'architecture des arbres : bilan et perspectives. Barthélémy Daniel, Blaise Frédéric, Fourcaud Thierry, Nicolini Eric-André. 1995. Revue Forestière Française, 47 : pp. 71-96.

A model simulating above- and below-ground tree architecture with agroforestry applications. De Reffye Philippe, Houllier François, Blaise Frédéric, Barthélémy Daniel, Dauzat Jean, Auclair Daniel. 1995. AgroForestry Systems, 30 (1-2) : pp. 175-197. IUFRO World Congress. 20, Tampere, Finlande, 6 August 1995/12 August 1995.
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Architecture et sénescence des arbres. Barthélémy Daniel, Caraglio Yves, Drénou C., Figureau C.. 1992. Forêt Entreprise (83) : pp. 15-35.

Modélisation et simulation de l'architecture de l'orme du Japon Zelkova serrata (Thunb.) Makino (Ulmaceae) : la notion d'axe de référence. De Reffye Philippe, Dinouard Pierre, Barthélémy Daniel. 1991. Naturalia Monspeliensia. Série Botanique (A7), spéc. : pp. 251-266. Colloque international sur l'arbre. 2, Montpellier, France, 10 September 1990/15 September 1990.
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Modélisation et simulation de l'architecture des arbres. Barthélémy Daniel, Caraglio Yves. 1991. Forêt Entreprise (73) : pp. 28-39.

Some architectural aspects of tree ageing. Barthélémy Daniel, Edelin Claude, Hallé Francis. 1989. Annales des Sciences Forestières, 46, numéro spécial Forest tree physiology, 194s-198s International symposium on forest tree physiology, Nancy, France, 25 September 1988/30 September 1988.

Book

Architecture des plantes et production végétale : Les apports de la modélisation mathématique. De Reffye Philippe (ed.), Jaeger Marc (ed.), Barthélémy Daniel (ed.), Houllier François (ed.). 2018. Versailles : Ed. Quae, 357 p. (Synthèses : Quae) ISBN 978-2-7592-2620-7

Architecture et croissance des plantes : modélisation et applications. De Reffye Philippe (ed.), Jaeger Marc (ed.), Barthélémy Daniel (ed.), Houllier François (ed.). 2016. Versailles : Ed. Quae, 684 p. (Synthèses : Quae) ISBN 978-2-7592-2622-1
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Guide illustré de la flore de Patagonie. Barthélémy Daniel, Brion Cécilia, Puntieri Javier. 2015. Marseille : IRD, 239 p. (Guides illustrés / IRD) ISBN 978-2-7099-1873-2

Plantas de la Patagonia. Barthélémy Daniel, Brion Cécilia, Puntieri Javier. 2008. Buenos Aires : Vazquez Mazzini Ed., 238 p. ISBN 978-987-9132-17-3

Cypress : a practical handbook. Ducrey M. (ed.), Barthélémy Daniel (ed.), Pichot Christian (ed.), Giannini R. (ed.), Raddi P. (ed.), Roques Alain (ed.), Sales Luis J. (ed.), Thibaut Bernard (ed.), Teissier Du Cros E.. 1999. Florence : Studio Leonardo, 139 p. ISBN 88-87585-01-6

Il cipresso : manuale technico. Ducrey M. (ed.), Barthélémy Daniel (ed.), Pichot Christian (ed.), Giannini R. (ed.), Raddi P. (ed.), Roques Alain (ed.), Sales Luis J. (ed.), Thibaut Bernard (ed.), Teissier Du Cros E.. 1999. Florence : Studio Leonardo, 139 p. ISBN 88-87585-00-8

Le cyprès : guide pratique. Teissier Du Cros E., Ducrey M., Barthélémy Daniel, Pichot Christian, Giannini R., Raddi P., Roques Alain, Sales Luis J., Thibaut Bernard. 1999. Florence : Studio Leonardo, 136 p. ISBN 88-87585-02-4

Los cipreses : un manual practico. Ducrey M. (ed.), Barthélémy Daniel (ed.), Pichot Christian (ed.), Giannini R. (ed.), Raddi P. (ed.), Roques Alain (ed.), Sales Luis J. (ed.), Thibaut Bernard (ed.), Teissier Du Cros E.. 1999. Florence : Studio Leonardo, 139 p. ISBN 88-87585-03-2

Les plantes à fleurs, guide morphologique illustré. Bell A.D., Roupsard Olivier, Barthélémy Daniel. 1993. Paris : Masson, 341 p.

Book chapter

Botanique. Louppe Dominique, Barthélémy Daniel. 2015. In : Mémento du forestier tropical. Mille Gilles (ed.), Louppe Dominique (ed.). Versailles : Ed. Quae, pp. 299-314. ISBN 978-2-7592-2340-4
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Crown architecture of valuable broadleaved species. Barthélémy Daniel, Caraglio Yves, Sabatier Sylvie-Annabel. 2009. In : Valuable broadleaved forests in Europe. Spiecker Heinrich (ed.), Hein Sebastian (ed.), Makkonen-Spiecker Kaisu (ed.), Thies Michael (ed.). EFI. Leyde : Brill, pp. 87-101. (European Forest Institute Research Report, 22) ISBN 978-90-04-16795-7
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Modélisation et simulation de l'architecture et de la production végétales. De Reffye Philippe, Barthélémy Daniel, Cournède Paul-Henry, Jaeger Marc. 2008. In : Aux origines des plantes. Des plantes anciennes à la botanique du XXIe siècle. Paris : Fayard, pp. 185-227. ISBN 978-2-213-62836-3
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Plant Growth Models. De Reffye Philippe, Heuvelink Ep, Barthélémy Daniel, Cournède Paul-Henry. 2008. In : Encyclopedia of ecology. Jorgensen Sven Erik (ed.), Fath Brian (ed.). Amsterdam : Elsevier, pp. 2824-2837. ISBN 978-0-08-045405-4
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Architectural variations of Araucaria araucana (Molina) K. Koch (Araucariaceae) in its natural habitat. Grosfeld Javier, Barthélémy Daniel, Brion Antoine. 1999. In : The evolution of plant architecture = [L'évolution de l'architecture des plantes]. Kurmann M.H.(ed.), Hemsley A.R.(ed.). Kew : Royal Botanic Gardens, pp. 109-122.

Biologie, croissance et développement. Barthélémy Daniel, Grosfeld Javier, Bouroulet Hallard F., Ducatillion C.. 1999. In : Le cyprès : guide pratique. Teissier Du Cros E., Ducrey M. (ed.), Barthélémy D. (ed.), Pichot C. (ed.), Giannini R. (ed.), Raddi P. (ed.), Roques A. (ed.), Sales Luis J. (ed.), Thibaut B. (ed.). Florence : Studio Leonardo, pp. 27-34.

L'architettura della chioma del noce comune. Barthélémy Daniel, Mercurio R., Sabatier Sylvie-Annabel. 1997. In : Il noce comune per la produzione legnosa. R. Giannini, R. Mercurio (eds.). Avenue media : Bologna, pp. 57-64.

Canopy architecture. Barthélémy Daniel, Edelin Claude, Hallé Francis. 1991. In : Physiology of trees. Raghavendra A.S. (ed.). New York : Wiley, pp. 1-20.

Proceedings

Modélisation et simulation de l'architecture des végétaux. Bouchon Jean (ed.), De Reffye Philippe (ed.), Barthélémy Daniel (ed.). 1997. Paris : INRA, 435 p. (Science update) ISBN 2-7380-0706-6 Colloque sur l'architecture des arbres fruitiers et forestiers, Montpellier, France, 23 November 1993/25 November 1993.

Paper with proceedings

Pl@ntNet, une plate-forme innovante d'agrégation et partage d'observations botaniques. Barthélémy Daniel, Boujemaa Nozha, Molino Jean-François, Joly Alexis, Goeau Hervé, Bakic Vera, Selmi Souheil, Champ Julien, Carré Jennifer, Chouet Mathias, Peronnet Aurélien, Vignau Christel, Dufour-Kowalski Samuel, Affouard Antoine, Barbe Julien, Bonnet Pierre. 2016. In : Botanists of the twenty-first century: roles, challenges and opportunities = Quels botanistes pour le 21e siècle ? Métiers, enjeux et opportunités. Rakotoarisoa Noëline R. (ed.), Blackmore Stephen (ed.), Riera Bernard (ed.). Paris : UNESCO, pp. 191-197. ISBN 978-92-3-100120-8 UNESCO International Conference: Botanists of the twenty-first century, Paris, France, 22 September 2014/25 September 2014.
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Retrospective analysis of plant architecture: an extended definition of dendrochronology. Heuret Patrick, Caraglio Yves, Sabatier Sylvie-Annabel, Barthélémy Daniel, Nicolini Eric-André. 2016. In : Tropical ecology and society reconciliating conservation and sustainable use of biodiversity. Program and abstracts. Plinio Sist (ed.), Stéphanie Carrière (ed.), Pia Parolin (ed.), Pierre-Michel Forget (ed.). ATBC. Storrs : ATBC, Résumé, p. 118. Annual Meeting of the Association for Tropical Biology and Conservation (ATBC 2016), Montpellier, France, 19 June 2016/23 June 2016.
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Understanding plant growth dynamics: links between morpho-anatomical structure and phenology. Caraglio Yves, Barthélémy Daniel, Edelin Claude, Nicolini Eric-André, Heuret Patrick. 2016. In : Tropical ecology and society reconciliating conservation and sustainable use of biodiversity. Program and abstracts. Plinio Sist (ed.), Stéphanie Carrière (ed.), Pia Parolin (ed.), Pierre-Michel Forget (ed.). ATBC. Storrs : ATBC, Résumé, p. 116. Annual Meeting of the Association for Tropical Biology and Conservation (ATBC 2016), Montpellier, France, 19 June 2016/23 June 2016.
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An image-based Plant identification platform for thousands of species. Bonnet Pierre, Joly Alexis, Champ Julien, Goeau Hervé, Dufour-Kowalski Samuel, Affouard Antoine, Lombardo Jean-Christophe, Wang Sen, Carrée Jennifer, Molino Jean-François, Boujemaa Nozha, Barthélémy Daniel. 2016. In : Tropical ecology and society reconciliating conservation and sustainable use of biodiversity. Program and abstracts. Plinio Sist (ed.), Stéphanie Carrière (ed.), Pia Parolin (ed.), Pierre-Michel Forget (ed.). ATBC. Storrs : ATBC, Résumé, p. 346. Annual Meeting of the Association for Tropical Biology and Conservation (ATBC 2016), Montpellier, France, 19 June 2016/23 June 2016.
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LifeCLEF plant identification task 2014. Goeau Hervé, Joly Alexis, Bonnet Pierre, Selmi Souheil, Molino Jean-François, Barthélémy Daniel, Boujemaa Nozha. 2014. In : Working Notes for CLEF 2014 Conference, Sheffield, United Kingdom, September 15-18, 2014. Linda Cappellato, Nicola Ferro, Martin Halvey, Wessel Kraaij (eds.). s.l. : CEUR-WS, pp. 585-597. (CEUR Workshop Proceedings, 1180) Conference and Labs of the Evaluation Forum, Sheffield, Royaume-Uni, 15 September 2014/18 September 2014.
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Pl@ntNet's participation at LifeCLEF 2014 plant identifiation task. Goeau Hervé, Joly Alexis, Yahiaoui Itheri, Bakic Vera, Verroust-Blondet Anne, Bonnet Pierre, Barthélémy Daniel, Boujemaa Nozha, Molino Jean-François. 2014. In : Working Notes for CLEF 2014 Conference, Sheffield, United Kingdom, September 15-18, 2014. Linda Cappellato, Nicola Ferro, Martin Halvey, Wessel Kraaij (eds.). s.l. : CEUR-WS, pp. 724-737. (CEUR Workshop Proceedings, 1180) Conference and Labs of the Evaluation Forum, Sheffield, Royaume-Uni, 15 September 2014/18 September 2014.
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Conditions for the generation of rhythms in a discrete dynamic system : Case of a functional structural plant growth model. Mathieu Amélie, Cournède Paul-Henry, Barthélémy Daniel, De Reffye Philippe. 2007. In : Plant growth modeling and applications. Proceedings PMA06 : The Second International Symposium on plant growth modeling, simulation, visualization and applications, Beijing, China, November 13-17, 2006. Fourcaud Thierry (ed.), Zhang Xiao-Peng (ed.). Institut d'automatique-LIAMA, IEEE. Los Alamitos : IEEE Computer Society, pp. 26-33. ISBN 0-7695-2851-1 International Symposium on Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and Applications (PMA06). 2, Beijing, Chine, 13 November 2006/17 November 2006.

Botanical background for plant architecture analysis and modeling. Barthélémy Daniel. 2003. In : Plant growth modeling and applications. Proceedings PMA03 : The First International symposium on plant growth modeling, simulation, visualization and their applications, Beijing, China, October 13-16, 2003. Hu Bao-Gang (ed.), Jaeger Marc (ed.). Institut d'automatique-LIAMA, Chinese Agriculture University. Pékin : Tsinghua University Press, pp. 1-20. ISBN 7-302-07140-3 International Symposium on Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and their Applications (PMA03). 1, Pékin, Chine, 13 October 2003/16 October 2003.
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Interactive simulation of plant architecture based on a dual-scale automaton model. Zhao X., De Reffye Philippe, Barthélémy Daniel, Hu Bao-Gang. 2003. In : Plant growth modeling and applications. Proceedings PMA03 : The First International symposium on plant growth modeling, simulation, visualization and their applications, Beijing, China, October 13-16, 2003. Hu Bao-Gang (ed.), Jaeger Marc (ed.). Institut d'automatique-LIAMA, Chinese Agriculture University. Pékin : Tsinghua University Press, pp. 144-153. ISBN 7-302-07140-3 International Symposium on Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and their Applications (PMA03). 1, Pékin, Chine, 13 October 2003/16 October 2003.
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Annual shoot morphology and architecture in persian walnut, Juglans regia L. (Juglandaceae). Sabatier Sylvie-Annabel, Barthélémy Daniel. 2001. In : Proceedings of the Fourth International Walnut Symposium, Bordeaux, France, 13-16 September, 1999. Germain Eric (ed.). ISHS, INRA-UREFV. Wageningen : ISHS, pp. 255-264. (Acta Horticulturae, 544) ISBN 90-6605-983-4 International Walnut Symposium. 4, Bordeaux, France, 13 September 1999/16 September 1999.

Architecture, gradients morphogénétiques et âge physiologique chez les végétaux. Barthélémy Daniel, Caraglio Yves, Costes Evelyne. 1997. In : Modélisation et simulation de l'architecture des végétaux. Bouchon Jean (ed.), De Reffye Philippe (ed.), Barthélémy Daniel (ed.). INRA, CIRAD-GERDAT-AMAP. Paris : INRA, pp. 89-136. (Science update) ISBN 2-7380-0706-6 Colloque sur l'architecture des arbres fruitiers et forestiers, Montpellier, France, 23 November 1993/25 November 1993.

Revue critique des termes relatifs à la croissance et à la ramification des tiges des végétaux vasculaires. Caraglio Yves, Barthélémy Daniel. 1997. In : Modélisation et simulation de l'architecture des végétaux. Bouchon Jean (ed.), De Reffye Philippe (ed.), Barthélémy Daniel (ed.). INRA, CIRAD-GERDAT-AMAP. Paris : INRA, pp. 11-87. (Science update) ISBN 2-7380-0706-6 Colloque sur l'architecture des arbres fruitiers et forestiers, Montpellier, France, 23 November 1993/25 November 1993.

Architecture du cèdre de l'Atlas, Cedrus atlantica (Endl.) Manetti ex Carrière (Pinaceae). Sabatier Sylvie-Annabel, Barthélémy Daniel. 1995. In : Architecture des arbres fruitiers et forestiers. Bouchon Jean (ed.). INRA. Paris : INRA, pp. 157-173. ISBN 2-7380-0623-X Colloque sur l'architecture des arbres fruitiers et forestiers, Montpellier, France, 23 November 1993/25 November 1993.
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Etude de la croissance et de la ramification de différentes formes de cyprès : Cupressus sempervirens L. (Cupressaceae). Bouroulet F., Barthélémy Daniel, Ducatillon C., Liminana J.M., De Reffye Philippe. 1995. In : Architecture des arbres fruitiers et forestiers. Bouchon Jean (ed.). INRA. Paris : INRA, pp. 254-272. ISBN 2-7380-0623-X Colloque sur l'architecture des arbres fruitiers et forestiers, Montpellier, France, 23 November 1993/25 November 1993.

Poster

Pl@antNet : Plateforme de production et de partage d'observations botaniques. Le numérique scientifique au service de la société. Bonnet Pierre, Joly Alexis, Goeau Hervé, Knaff R., Lombardo Jean-Christophe, Affouard Antoine, Champ Julien, Dufour-Kowalski Samuel, Chouet Mathias, Molino Jean-François, Boujemaa Nozha, Barthélémy Daniel. 2017. . Montpellier : CIRAD, 1 poster Amphithéâtre "Patrimoine Numérique Scientifique", Montpellier, France, 20 February 2017/20 February 2017.
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DataManager, un système novateur de gestion et d'échange de données botaniques distribuées. Dufour-Kowalski Samuel, Chouet Mathias, Affouard Antoine, Milcent Jean-Pascal, Duché Grégoire, Liens Benjamin, Bonnet Pierre, Le Bourgeois Thomas, Joly Alexis, Goeau Hervé, Barthélémy Daniel, Molino Jean-François. 2014. In : Conférence internationale : Quels botanistes pour le XXIème siècle? Métiers, enjeux, opportunités, 22-25 septembre 2014, Paris, France. UNESCO. s.l. : s.n., 1 p. Conférence internationale : Quels botanistes pour le XXIème siècle? Métiers, enjeux, opportunités, Paris, France, 22 September 2014/25 September 2014.
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IDAO: A graphical tool for computer-assisted plant identification. Bonnet Pierre, Grard Pierre, Edelin Claude, Le Bourgeois Thomas, Theveny Frédéric, Prosperi Maria-Juliana, Carrara Alain, Barthélémy Daniel. 2009. In : e-Biosphère 09 : International Conference on Biodiversity Informatics, London, England, 01-03 June 2009. s.l. : s.n., 1 p. International Conference on Biodiversity Informatics, Londres, Royaume-Uni, 1 June 2009/2 June 2009.
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Variations in leaf anatomy narrow-leafed ash trees (Fraxinus angustifolia Vahl. spp. angustifolia) in southern France : Influence of shoot type and architectural stage. Ramirez de Arellano Fernando, Nicolini Eric-André, Barthélémy Daniel. 2004. In : Proceedings of the 4th International workshop on functional-structural plant models (FSPM), abstracts of papers and posters, 7-11 June 2004, Montpellier, France. Godin Christophe (ed.), Hanan Jim (ed.), Kurth Winfried (ed.), Lacointe André (ed.), Takenaka Akio (ed.), Prusinkiewicz Przemyslaw (ed.), Dejong Thedore M. (ed.), Beveridge Christine (ed.). CIRAD-AMIS-UMR AMAP. Montpellier : CIRAD-AMAP, p. 48. International Workshop on Functional-Structural Plant Models (FSPM). 4, Montpellier, France, 7 June 2004/11 June 2004.

Paper without proceedings

Value, norms and practices in Plant biodiversity-based research and innovation commons. Louafi Selim, Arnaud Elizabeth, Barthélémy Daniel, Noyer Jean-Louis, Pham Jean Louis. 2012. In : First Thematic Conference on "the Knowledge Commons" (2012 IASC), 12-14th september 2012, Louvain-la-neuve. International Association for the Study of the Commons. s.l. : s.n., Résumé, 3 p. Thematic conference on "the Knowledge Commons"/2012 IASC. 1, Louvain-la-Neuve, Belgique, 12 September 2012/14 September 2012.
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Morphogenetic gradients in silver firs (Abies alba Mill.) and their plasticity. Taugourdeau Olivier, Sabatier Sylvie-Annabel, Caraglio Yves, Barthélémy Daniel. 2011. In : IBC2011. XVIII International Botanical Congress, 23-30 July 2011, Melbourne, Australia. s.l. : s.n., Résumé, p. 560. International Botanical Congress. 18, Melbourne, Australie, 23 July 2011/30 July 2011.
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The Pl@ntnet project: plant computational identification and collaborative information system. Barthélémy Daniel, Boujemaa Nozha, Mathieu Daniel, Jean-François M., Joly Alexis, Mouysset Elise. 2011. In : IBC2011. XVIII International Botanical Congress, 23-30 July 2011, Melbourne, Australia. s.l. : s.n., Résumé, p. 577. International Botanical Congress. 18, Melbourne, Australie, 23 July 2011/30 July 2011.
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Plant architecture : From concepts to applications. Barthélémy Daniel, Caraglio Yves, Charles-Dominique Tristan, Edelin Claude, Heuret Patrick, Meyer-Berthaud Brigitte, Nicolini Eric-André, Rey Hervé, Sabatier Sylvie-Annabel, Taugourdeau Olivier. 2011. In : IBC2011. XVIII International Botanical Congress, 23-30 July 2011, Melbourne, Australia. s.l. : s.n., Résumé, pp. 560-561. International Botanical Congress. 18, Melbourne, Australie, 23 July 2011/30 July 2011.
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Retrospective analysis of fir sapling growth vs. light interception. Taugourdeau Olivier, Dauzat Jean, Griffon Sébastien, De Coligny François, Sabatier Sylvie, Caraglio Yves, Barthélémy Daniel. 2010. In : Proceedings of the 6th International Workshop on Functional-Structural Plant Models, FSPM 2010, September 12-17, 2010, University of California, Davis (USA). Dejong Thedore M. (ed.), Da Silva David (ed.). University of California-Department of Plant Sciences. Davis : University of California, pp. 103-105. International Workshop on Functional-Structural Plant Models. 6, Davis, États-Unis, 12 September 2010/17 September 2010.
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Comparacion de la dinamica de emergencia foliar y desarrollo de macollas en Melica macra y Melica sarmentosa. Jaffuel Sylvie, Barthélémy Daniel, Perreta M.. 2005. . SAB. s.l. : s.n., Résumé, p. 178. Jornadas Argentinas de Botanica. 30, Rosario, Argentine, 6 November 2005/10 November 2005.

Analisis, modelizacion y simulacion informatica de la arquitectura de las plantas : aplicaciones agronomicas y paisajistas. Barthélémy Daniel. 2000. In : Ciudades Arboladas para el Siglo XXI. Ponencias del IV Congreso ISA Europeo y V Espanol de Arboricultura, Valencia, Junio de 2000. International Society of Arboriculture, Asociacion Espanola de Arboricultura. s.l. : s.n., pp. 44-77. Congreso ISA Europeo. 4, Valencia, Espagne, June 2000.

Architecture analysis : A tool for tree life history knowledge. Barthélémy Daniel, Caraglio Yves, Sabatier Sylvie-Annabel. 2000. In : Adaptation and selection of mediterranean Pinus and Cedrus for sustainable afforestation of marginal land : Proceedings of the final conference of the European Union Joint Research Project FAIR CT95-00 97, Mytilene, 2-6 June 2000. Panetsos, K.P. (ed). Thessaloniki : Aristotle University of Thessaloniki, pp. 27-44. ISBN 960-86747-0-0 Conference of the European Union Joint Research Project FAIR, Mytilene, Grèce, 2 June 2000/6 June 2000.

Analyzing spatial structures in forest tree architectures. Guédon Yann, Barthélémy Daniel, Caraglio Yves. 1999. In : Empirical and process-based models for forest tree and stand growth simulation = [Modèles empiriques et mécanistes pour la simulation de la croissance d'arbres et de peuplements forestiers]. Amaro A. (ed.), Tomé M. (ed.). Oeiras : Salamandra, pp. 23-42. Workshop on Empirical and Process-based Models for Forest Tree and Stand Growth Simulation, Oeiras, Portugal, 21 September 1997/27 September 1997.

Mesure et représentation des plantes. Caraglio Yves, Godin Christophe, Costes Evelyne, Barthélémy Daniel. 1998. In : Architecture et modélisation en arboriculture fruitière. INRA, CTIFL, CIRAD, ENSAM. Montpellier : INRA, pp. 22-32. Colloque sur les recherches fruitières. 11, Montpellier, France, 5 March 1998/6 March 1998.
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Structure de scions d'un an de noyer commun, Juglans regia, variété Lara greffés sur trois porte-greffe (Juglans nigra, J. regia, J. nigra x J. regia). Sabatier Sylvie-Annabel, Ducousso I., Guédon Yann, Barthélémy Daniel, Germain E.. 1998. In : Architecture et modélisation en arboriculture fruitière. INRA, CTIFL, CIRAD, ENSAM. Montpellier : INRA, pp. 75-84. Colloque sur les recherches fruitières. 11, Montpellier, France, 5 March 1998/6 March 1998.
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Modélisation et simulation de la croissance d'une architecture végétale : une approche morphogénétique expérimentale. De Reffye Philippe, Houllier François, Blaise Frédéric, Barthélémy Daniel, Dauzat Jean, Auclair Daniel. 1997. In : Tendances nouvelles en modélisation pour l'environnement. Blasco F. Paris : Elsevier, pp. 91-112. Journées du programme environnement, vie et sociétés, Paris, France, 15 January 1996/17 January 1996.

Plant growth simulation based on ecophysiological processes. Influence of architectural modifications on tree growth. Fourcaud Thierry, Blaise Frédéric, De Reffye Philippe, Houllier François, Barthélémy Daniel. 1997. In : Plant biomechanics. Conference proceedings 1: papers = [Biomécaniques des plantes. Actes de la conférence 1 : communications]. University of Reading. Reading : University of Reading, pp. 331-336. Conference on Plant Biomechanics, Royaume-Uni, September 1997.

A physiological approach for tree growth modelling in the software AMAPpara. Fourcaud Thierry, Blaise Frédéric, Barthélémy Daniel, Houllier François, De Reffye Philippe. 1997. In : Proceedings of the workshop : Connection between Silviculture and Wood Quality through Modelling Approaches and Simulation Softwares, Berg en Dal, Afrique du Sud, 26-31 Agust 1996. Nepveu G. (ed.). Nancy : INRA, pp. 321-334. Connection between Silviculture and Wood Quality through Modelling Approaches and Simulation Softwares. 2, Berg en Dal, Afrique du Sud, 26 August 1996/31 August 1996.

Couplage de données radar SIR-C à un modèle architectural de croissance des arbres : évaluation de paramètres forestiers sur la maquette et simulation 3D d'un paysage. Beaudoin A., Castel Thierry, Stach N., Borne Frédéric, Caraglio Yves, Barthélémy Daniel, Durand Patrick Y.. 1996. In : 9ème Congrès de l'Association Québécoise de Télédetection. Association Québécoise de Télédetection. s.l. : s.n., 17 p. Congrès de l'Association Québécoise de Télédetection. 9, Québec, Canada, 30 April 1996/3 May 1996.

La modélisation et la simulation de la croissance d'une architecture végétale : une approche morphogénétique expérimentale. De Reffye Philippe, Houllier François, Blaise Frédéric, Barthélémy Daniel, Dauzat Jean, Auclair Daniel. 1996. In : Tendances nouvelles en modélisation pour l'environnement : actes des Journées du programme environnement, vie et sociétés, Paris, 15-17 janvier 1996. CNRS. Paris : CNRS, pp. 91-121. Journées du programme environnement, vie et sociétés, Paris, France, 15 January 1996/17 January 1996.

Variations phyllotaxiques chez les végétaux. Caraglio Yves, Barthélémy Daniel. 1996. In : Activité Méristématique Caulinaire : de la Cytologie et de la Biologie Moléculaire à la Morphogénèse. 10. Angers : Université d'Angers, 15 p. Activité méristématique caulinaire : de la cytologie et de la biologie moléculaire à la morphogénèse. 10, Angers, France, 16 April 1996/17 April 1996.

Analysis, modeling and simulation of plant architecture. Advances and applications at the bosques Andino-Patagonicos. Puntieri Javier G., Barthélémy Daniel, De Reffye Philippe, Blaise Frédéric, Brion Cécilia. 1995. In : Actas de las IV jornadas forestales patagonias. Tome II = [Actes des IVe journées forestières de Patagonie. Tome II]. Anon. s.l. : s.n., pp. 547-573. Jornadas Forestales Patagonias. 4, San Martin de los Andes, Argentine, October 1995.

Architecture and development sequence of Araucaria araucana in natural forests of Argentina. Grosfeld Javier, Barthélémy Daniel. 1995. In : Actas de las IV jornadas forestales Patagonias. Tome 1 = [Actes des IVe journées forestières de Patagonie. Tome 1 ]. Anon. s.l. : s.n., pp. 12-31. Jornadas Forestales Patagonias. 4, San Martin de los Andes, Argentine, October 1995.

Comparaison de quelques caractéristiques morphologiques des pousses annuelles et des branches de la cime de sept variétés de noyer commun, Juglans regia L. (Juglandaceae). Ducousso I., Sabatier Sylvie-Annabel, Barthélémy Daniel, Germain E.. 1995. In : Architecture des arbres fruitiers et forestiers. Bouchon Jean (ed.). INRA. Paris : INRA, pp. 91-108. ISBN 2-7380-0623-X Colloque sur l'architecture des arbres fruitiers et forestiers, Montpellier, France, 23 November 1993/25 November 1993.

Essai sur la simulation des relations fonctionnelles entre parties racinaire, partie caulinaire et croissance en épaisseur des axes chez les végétaux. De Reffye Philippe, Barthélémy Daniel, Blaise Frédéric, Fourcaud Thierry, Houllier François. 1995. In : L'arbre : résumés = The tree : Abstracts. CNRS. Talence : CNRS, Résumé, p. 36. Colloque international sur l'arbre. 3, Montpellier, France, 11 September 1995/16 September 1995.

Etude de l'effet du milieu sur la croissance, la ramification et l'architecture du cèdre de l'Atlas, Cedrus atlantica (Endl.) Manetti ex Carrière. Masotti V., Barthélémy Daniel, Mialet Isabelle, Sabatier Sylvie-Annabel, Caraglio Yves. 1995. In : Architecture des arbres fruitiers et forestiers. Bouchon Jean (ed.). INRA. Paris : INRA, pp. 175-189. ISBN 2-7380-0623-X Colloque sur l'architecture des arbres fruitiers et forestiers, Montpellier, France, 23 November 1993/25 November 1993.

Gradients morphologiques et biochimiques chez un noyer hybride (Juglans nigra x Juglans regia). Jay Allemand Christian, Barthélémy Daniel, Sabatier Sylvie-Annabel, Bruant B.. 1995. In : Architecture des arbres fruitiers et forestiers. Bouchon Jean (ed.). INRA. Paris : INRA, pp. 125-138. ISBN 2-7380-0623-X Colloque sur l'architecture des arbres fruitiers et forestiers, Montpellier, France, 23 November 1993/25 November 1993.

Influence de la densité de plantation sur quelques caractéristiques dendrométriques, morphologiques et architecturales de la provenance Istebna II (Pologne) de Picea abies (L.) Karsten (Pinaceae). Colin François, Barthélémy Daniel, Ribeyrolles L.. 1995. In : Architecture des arbres fruitiers et forestiers. Bouchon Jean (ed.). INRA. Paris : INRA, pp. 209-235. ISBN 2-7380-0623-X Colloque sur l'architecture des arbres fruitiers et forestiers, Montpellier, France, 23 November 1993/25 November 1993.

Modélisation de l'architecture du pin maritime, Pinus pinaster Ait. (Pinaceae) : premiers résultats. Coudurier T., Barthélémy Daniel, Chanson Bernard, Courdier Florence, Loup Caroline. 1995. In : Architecture des arbres fruitiers et forestiers. Bouchon Jean (ed.). INRA. Paris : INRA, pp. 305-321. ISBN 2-7380-0623-X Colloque sur l'architecture des arbres fruitiers et forestiers, Montpellier, France, 23 November 1993/25 November 1993.

Nature de la pousse annuelle chez le noyer commun, Juglans regia L. var. Lara (Juglandaceae) : préformation hivernale et printanière. Sabatier Sylvie-Annabel, Barthélémy Daniel, Ducousso I., Germain E.. 1995. In : Architecture des arbres fruitiers et forestiers. Bouchon Jean (ed.). INRA. Paris : INRA, pp. 109-123. ISBN 2-7380-0623-X Colloque sur l'architecture des arbres fruitiers et forestiers, Montpellier, France, 23 November 1993/25 November 1993.

Premières observations sur la variabilité architecturale de jeunes individus de Cupressus sempervirens L. (Cupressaceae). Ducatillon C., Bouroulet F., Barthélémy Daniel. 1995. In : Architecture des arbres fruitiers et forestiers. Bouchon Jean (ed.). INRA. Paris : INRA, pp. 237-251. ISBN 2-7380-0623-X Colloque sur l'architecture des arbres fruitiers et forestiers, Montpellier, France, 23 November 1993/25 November 1993.

Premières observations sur l'architecture du cèdre de l'Atlas, Cedrus atlantica (Endl.) Manetti ex Carriere, (Pinaceae). Sabatier Sylvie-Annabel, Barthélémy Daniel. 1994. In : Annales de la Recherche Forestière au Maroc = ISSN 0483-8009. (1994)vol.2 : s.n., pp. 364-379. Séminaire international sur le cèdre de l'Atlas, Ifrane, Maroc, 7 June 1993/11 June 1993.

Architecture et modélisation de l'orme du Japon Zelkova serrata (Thunb.) Maniko (Ulmaceae) : la notion d'axe de référence. De Reffye Philippe, Dinouard Pierre, Barthélémy Daniel. 1990. In : De la forêt cultivée à l'industrie de demain. ARBORA. Bordeaux : ARBORA, pp. 351-352. Sciences et industries du bois, Bordeaux, France, 14 May 1990/15 May 1990.

Architectural concepts for tropical trees. Barthélémy Daniel, Edelin Claude, Hallé Francis. 1989. In : Holm Nielsen L.B. (ed.), Nielsen I.C. (ed.), Balslev H. (ed.). Tropical forests. Botanical dynamics, speciation and diversity. Londres : Academic Press, pp. 89-100. Symposium on Tropical Forests, Aarhus, Danemark, 8 August 1988/10 August 1988.

Relation entre la position des complexes réitérés sur un arbre et l'expression de leur floraison : l'exemple de trois espèces tropicales. Barthélémy Daniel. 1986. In : L'arbre. Montpellier : Institut de botanique Colloque international sur l'arbre. 1, Montpellier, France, 9 September 1985/14 September 1985.

Accreditation to supervise theses

Diversité, variabilité et plasticité de l'architecture des plantes. Barthélémy Daniel. 2001. Montpellier : UM2, 311 p. Habilitation à diriger des recherches : Biologie de l'évolution et écologie : Université Montpellier 2

Technical and research document

Réserve biosphère de la Mare aux Hippopotames. Etude préalable à un aménagement de la réserve et de sa zone périphérique. Couteron Pierre, Barthélémy Daniel, Fournier F., Deshayes Michel, Busson F., Gallner J.P., Bakyomo E., Bedel J.. 1989. Montpellier : ENGREF, 167 p.

Parc national de la Marahoué. Etude préalable à un aménagement du parc et de sa zone périphérique. Barthélémy Daniel, Borie Jean-Michel, Couterun P., Bousquet B., Burthey F., Deshayes Michel, Ellsasser Konrad, Ouedraogo Ibrahima, Bedel J.. 1988. Paris : ENGREF, 124 p.

Mission report

Modélisation de l'architecture et du mode de floraison des bouts pendants de la vanille (Vanilla planifolia) à l'Ile de la Réunion, décembre 1991. Barthélémy Daniel, Blaise Frédéric, Guédon Yann, De Reffye Philippe. 1991. s.l. : CIRAD, 19 p.
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