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Number of items: 46.

2020

Development and comparative validation of genomic-driven PCR-based assays to detect Xanthomonas citri pv. citri in citrus plants. Robène Isabelle, Maillot-Lebon Véronique, Chabirand Aude, Moreau Aurélie, Becker Nathalie, Moumène Amal, Rieux Adrien, Campos Paola, Gagnevin Lionel, Gaudeul Myriam, Baider Claudia, Chiroleu Frédéric, Pruvost Olivier. 2020. BMC Microbiology, 20:296, 13 p.
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2019

Another night at the museum: searching for traces of plant viruses using the virion-associated nucleic acid metagenomics approach. [P.21]. Julian Charlotte, Filloux Denis, Rieux Adrien, Lefeuvre Pierre, Lett Jean-Michel, Becker Nathalie, Gagnevin Lionel, Trinder-Smith Terry H., Hartnady Penelope, Martin Darren Patrick, Roumagnac Philippe. 2019. In : Livre des résumés des 17 ème Rencontres de virologie végétale. INRA, CIRAD, CNRS, SFP, SFV. Aussois : INRA, Résumé, p. 80. Rencontres de Virologie Végétale (RVV 2019). 17, Aussois, France, 27 January 2019/31 January 2019.
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Deciphering the invasive history of a bacterial crop pathogen in the Southern Indian Ocean islands: insights from historical herbarium specimens. Campos Paola, Groot Crego Clara, Boyer Karine, Gaudeul Myriam, Baider Claudia, Pruvost Olivier, Gagnevin Lionel, Becker Nathalie, Rieux Adrien. 2019. In : Book of abstracts posters of the third international conference on Island ecology, evolution and conservation. Flores Olivier (ed.), Ah-Peng Claudine (ed.), Wilding Nicholas (ed.). Université de la Réunion. Saint-Denis : Université de la Réunion, Résumé, p. 71. International conference on Island ecology, evolution and conservation. 3, Saint-Denis, Réunion, 8 July 2019/13 July 2019.
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First report of black Sigatoka disease in banana caused by Mycosphaerella fijiensis on Reunion Island. Rieux Adrien, Hostachy Bruno, De Lapeyre de Bellaire Luc, Martin Y., Maratchia G., Dupuis A.S., Loos Renaud, Jeandel Céline, Hubert Jacqueline. 2019. New Disease Reports, 39:12 : p. 12.
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Night at the museum: Contribution of small RNA from historical herbarium specimens in the reconstruction of evolutionary histories of geminiviruses. Lett Jean-Michel, Scussel Sarah, Campos Paola, Filloux Denis, Roumagnac Philippe, Harkins Gordon William, Martin Darren Patrick, Roumagnac Philippe, Martin Darren Patrick, Lefeuvre Pierre, Rieux Adrien, Becker Nathalie. 2019. In : Livre des résumés des 17 ème Rencontres de virologie végétale. INRA, CIRAD, CNRS, SFP, SFV. Aussois : INRA, Résumé, p. 52. Rencontres de Virologie Végétale (RVV 2019). 17, Aussois, France, 27 January 2019/31 January 2019.
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Night at the museum: Contribution of small RNA from historical herbarium specimens in the reconstruction of evolutionary histories of geminiviruses. Rieux Adrien, Campos Paola, Scussel Sarah, Duvermy Arnaud, Filloux Denis, Roumagnac Philippe, Martin Darren Patrick, Becker Nathalie, Lett Jean-Michel. 2019. In : Programme and abstracts of the 9th International Germinivirus Symposium (IGS 2019) and the 7th ssDNA Comparative virology workshop. University of California. Davis : University of California, Résumé, p. 36. International Geminivirus Symposium. 9, Davis, États-Unis, 9 November 2019/13 November 2019.
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2018

Adaptation of genetically monomorphic bacteria: evolution of copper resistance through multiple horizontal gene transfers of complex and versatile mobile genetic elements. Richard Damien, Ravigné Virginie, Rieux Adrien, Facon Benoît, Boyer Claudine, Boyer Karine, Grygiel Pierre, Javegny Stéphanie, Terville Marie Annabelle, Canteros B.I., Robene Isabelle, Vernière Christian, Chabirand Aude, Pruvost Olivier, Lefeuvre Pierre. 2018. In : 13èmes Rencontres Plantes-Bactéries - Book of Abstracts. SFP, INRA, CNRS. Paris : SFP, Résumé, p. 21. Rencontres Plantes-Bactéries. 13, Aussois, France, 29 January 2018/2 February 2018.
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Antibiorésistance: un modèle pour une approche "One Health" intégrant la santé des plantes. Roger François, Rieux Adrien. 2018. . RFSV, RMT. Paris : RFSV, pp. 9-10. Seminaire RFSV - La santé végétale dans le concept One Health : quelle contribution ?, Paris, France, 3 October 2018/3 October 2018.
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Coexistence of multiple endemic and pandemic lineages of the rice blast pathogen. Gladieux Pierre, Ravel Sébastien, Rieux Adrien, Cros-Arteil Sandrine, Adreit Henri, Milazzo Joëlle, Thierry Maud, Fournier Elisabeth, Terauchi Ryohei, Tharreau Didier. 2018. Mbio, 9 (2):e01806, 17 p.
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Molecular epidemiology of bacterial wilt in the Madagascar highlands caused by Andean (Phylotype IIB-1) and African (Phylotype III) brown rot strains of the Ralstonia solanacearum species complex. Ravelomanantsoa Santatra, Vernière Christian, Rieux Adrien, Costet Laurent, Chiroleu Frédéric, Arribat Sandrine, Cellier Gilles, Pruvost Olivier, Poussier Stéphane, Robène Isabelle, Guérin Fabien, Prior Philippe. 2018. Frontiers in Plant Science, 8:2258, 17 p.
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" Night at the museum ": filling the gaps in the history of emergence of crop pathogenic bacteria using herbarium material. Rieux Adrien, Roumagnac Philippe, Szurek Boris, Gaudeul Myriam, Becker Nathalie, Gagnevin Lionel. 2018. In : 13èmes Rencontres Plantes-Bactéries - Book of Abstracts. SFP, INRA, CNRS. Paris : SFP, Résumé, p. 18. Rencontres Plantes-Bactéries. 13, Aussois, France, 29 January 2018/2 February 2018.
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Recent Asian origin of chytrid fungi causing global amphibian declines. O'Hanlon Simon J., Rieux Adrien, Farrer Rhys A., Rosa Gonçalo M., Waldman Bruce, Bataille Arnaud, Kosch Tiffany A., Murray Kris A., Brankovics Balázs, Fumagalli Matteo, Martin Michael, Wales Nathan, Alvarado-Rybak Mario, Bates Kieran A., Berger Lee, Böll Susanne, Brookes Lola, Clare Frances, Courtois Elodie A., Cunningham Andrew A., Doherty-Bone Thomas M., Ghosh Pria, Gower David J., Hintz William E., Höglund Jacob, Jenkinson Thomas S., Lin Chun-Fu, Laurila Anssi, Loyau Thomas, Martel An, Meurling Sara, Miaud Claude, Minting Pete, Pasmans Frank, Schmeller Dirk S., Schmidt Benedikt R., Shelton Jennifer M. G., Skerratt Lee F., Smith Freya, Soto-Azat Claudio, Spagnoletti Matteo, Tessa Giulia, Toledo Luís Felipe, Valenzuela-Sánchez Andrés, Verster Ruhan, Vörös Judit, Webb Rebecca J., Wierzbicki Claudia, Wombwell Emma, Zamudio Kelly R., Aanensen David M., James Timothy Y., Gilbert M. Thomas P., Weldon Ché, Bosch Jaime, Balloux François, Garner Trenton W. J., Fisher Matthew C.. 2018. Science, 360 (6389) : pp. 621-627.
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Spatial genetic structure of Xanthomonas citri pv. citri at microgeographical scales through culture-independent microsatellite genotyping in a tropical disease endemicity setting. Pruvost Olivier, Boyer Karine, Ravigné Virginie, Richard Damien, Rieux Adrien, Lefeuvre Pierre, Vernière Christian. 2018. In : 13èmes Rencontres Plantes-Bactéries - Book of Abstracts. SFP, INRA, CNRS. Paris : SFP, Résumé, p. 114. Rencontres Plantes-Bactéries. 13, Aussois, France, 29 January 2018/2 February 2018.
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The global distribution and spread of the mobilized colistin resistance gene mcr-1. Wang Ruobing, van Dorp Lucy, Shaw Liam P., Bradley Phelim, Wang Qi, Wang Xiaojuan, Jin Longyang, Zhang Qing, Liu Yuqing, Rieux Adrien, Dorai-Schneiders Thamarai, Weinert Lucy Anne, Iqbal Zamin, Didelot Xavier, Wang Hui, Balloux François. 2018. Nature Communications, 9 (1):1179, 9 p.
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2017

Adaptation of genetically monomorphic bacteria: evolution of copper resistance through multiple horizontal gene transfers of complex and versatile mobile genetic elements. Richard Damien, Ravigné Virginie, Rieux Adrien, Facon Benoît, Boyer Claudine, Boyer Karine, Grygiel Pierre, Javegny Stéphanie, Terville Marie Annabelle, Canteros B.I., Robene Isabelle, Vernière Christian, Chabirand Aude, Pruvost Olivier, Lefeuvre Pierre. 2017. Molecular Ecology, 26 (7), n.spéc. Microbial Local Adaptation : pp. 2131-2149.
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Deciphering copper resistance in Xanthomonas citri pv. citri. Richard Damien, Ravigné Virginie, Rieux Adrien, Facon Benoît, Boyer Karine, Grygiel Pierre, Javegny Stéphanie, Terville Marie Annabelle, Canteros B.I., Robene Isabelle, Vernière Christian, Chabirand Aude, Pruvost Olivier, Lefeuvre Pierre. 2017. In : 15th Congress of the Mediterranean Phytopathological Union: Plant health sustaining Mediterranean ecosystems Abstracts book. MPU, Universidad de Córdoba. Cordoba : MPU-Universidad de Córdoba, Résumé, p. 55. 15th Congress of the Mediterranean Phytopathological Union, Cordoba, Espagne, 20 June 2017/23 June 2017.
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Fungal adaptation to contemporary fungicide applications: the case of Botrytis cinerea populations from Champagne vineyards (France). Walker Anne Sophie, Ravigné Virginie, Rieux Adrien, Ali S., Carpentier F., Fournier Elisabeth. 2017. Molecular Ecology, 26 (7), n.spéc. Microbial local adaption : pp. 1919-1935.
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Genomic study shows endemic and pandemic rice blast lineages and lineages between rice and setaria infecting gene pools. Session 3. Oral 26. Thierry Maud, Rieux Adrien, Ravel Sophie, Cros-Arteil Sandrine, Adreit Henri, Milazzo Joëlle, Terauchi Ryohei, Loos Renaud, Tharreau Didier, Fournier Elisabeth, Gladieux Pierre. 2017. In : Deepen Knowledge in Plant Pathology for Innovative Agro-Ecology. Book of Abstracts of the 12th European Fondation for Plant Pathology (EFPP) and the 10th French Society for Plant Pathology (SFP). EFPP, SFP. Dunkerque : EFPP-FSP, Résumé, 1 p. European Foundation for Plant Pathology Conference. 12, Dunkerque, France, 29 May 2017/2 June 2017.
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Old Plasmodium DNA from Spain hints at parasite origins. Aranda Carles, Gelabert Pere, Sandoval-Velasco Marcela, Olalde Iñigo, Fregel Rosa, Rieux Adrien, Escosa Raül, Paaijmans Krijn, Mueller Ivo, Gilbert Thomas, Lalueza-Fox Carles. 2017. In : Sove 2017 New technology conquering old vectors?. Miranda Chueca (ed.), Miguel Ángel (ed.), Alten, Bulent (ed.). Palma de Mallorque : SOVE, Résumé, p. 84. ISBN 978-84-697-6086-4 International SOVE congress: New technology conquering old vectors?. 7, Palma de Mallorque, Espagne, 1 October 2017/7 October 2017.
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Tipdatingbeast: An r package to assist the implementation of phylogenetic tip-dating tests using beast. Rieux Adrien, Khatchikian Camilo E.. 2017. Molecular Ecology Resources, 17 (4) : pp. 608-613.
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2016

Inferences from tip-calibrated phylogenies: A review and a practical guide. Rieux Adrien, Balloux François. 2016. Molecular Ecology, 25 (9) : pp. 1911-1924.
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Inferences from tip-calibrated phylogenies: conceptual bases, applications and prospects in plant-pathogenic bacteria. Rieux Adrien, Eldholm Vegard, Spagnoletti Matteo, Balloux François. 2016. In : 12èmes Rencontres Plantes-Bactéries - Book of Abstracts. Paris : SFP, Résumé, p. 43. Rencontres Plantes-Bactéries. 12, Aussois, France, 11 January 2016/15 January 2016.
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Mitochondrial DNA from the eradicated European Plasmodium vivax and P. falciparumfrom 70-year-old slides from the Ebro Delta in Spain. Gelabert Pere, Sandoval-Velasco Marcela, Olalde Iñigo, Fregel Rosa, Rieux Adrien, Escosa Raül, Aranda Carles, Paaijmans Krijn, Mueller Ivo, Gilbert M. Thomas P., Lalueza-Fox Carles. 2016. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 113 (41) : pp. 11495-11500.
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Using ecology, physiology, and genomics to understand host specificity in Xanthomonas. Jacques Marie Agnès, Arlat Mathieu, Boulanger Alice, Boureau Tristan, Carrère Sébastien, Cesbron Sophie, Chen Nicolas W.G., Cociancich Stéphane, Darrasse Armelle, Denancé Nicolas, Fischer-Le-Caux Marion, Gagnevin Lionel, Koebnik Ralf, Lauber Emmanuelle, Noel Laurent D., Pieretti Isabelle, Portier Perrine, Pruvost Olivier, Rieux Adrien, Robène Isabelle, Royer Monique, Szurek Boris, Verdier Valérie, Vernière Christian. 2016. Annual Review of Phytopathology, 54 : pp. 163-187.
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2015

Contemporary fungicide applications sign for selection in Botrytis cinerea populations collected in the Champagne vineyard (France). Walker Anne Sophie, Rieux Adrien, Ravigné Virginie, Fournier Elisabeth. 2015. In : Book of abstract of the 28th Fungal Genetics Conference. Genetics society of America. Pacific Grove : Genetics society of America, Résumé, p. 244. Fungal Genetics Conference. 28, Pacific Grove, États-Unis, 17 March 2015/22 March 2015.
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A novel bioassay to monitor fungicide sensitivity in Mycosphaerella fijiensis. Ngando Essoh Otto Josué, Rieux Adrien, Nguidjo Oscar, Pignolet Luc, Dubois Cécile, Mehl Andréas, Zapater Marie-Françoise, Carlier Jean, De Lapeyre de Bellaire Luc. 2015. Pest Management Science, 71 (3) : pp. 441-451.
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2014

Long-distance wind-dispersal of spores in a fungal plant pathogen: Estimation of anisotropic dispersal kernels from an extensive field experiment. Rieux Adrien, Soubeyrand Samuel, Bonnot François, Klein Etienne, Ngando Essoh Otto Josué, Mehl Andréas, Ravigné Virginie, Carlier Jean, De Lapeyre de Bellaire Luc. 2014. PloS One, 9 (8):e103225, 13 p.
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2013

Estimation of spore dispersal kernel in Mycosphaerella Fijiensis from one-generation disease gradients. Rieux Adrien, Soubeyrand Samuel, Bonnot François, Carlier Jean, Ravigné Virginie, Klein E., Ngando Essoh Otto Josué, Mehl Andréas, De Lapeyre de Bellaire Luc. 2013. In : Proceedings of the 20th international meeting ACORBAT: 40 years sharing science and technology, Fortaleza, Brazil, 9-13 september 2013. eds. Borges A.L. , Lichtemberg L. s.l. : s.n., p. 286. Reunion internacional ACORBAT 2013. 20, Fortaleza, Brésil, 9 September 2013/13 September 2013.
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Estimation of the dispersal of a major pest of maize by cline analysis of a temporary contact zone between two invasive outbreaks. Bermond Gérald, Blin Aurélie, Vercken Elodie, Ravigné Virginie, Rieux Adrien, Mallez Sophie, Morel-Journel Thibaut, Guillemaud Thomas. 2013. Molecular Ecology, 22 (21) : pp. 5368-5381.
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Using neutral cline decay to estimate contemporary dispersal: a generic tool and its application to a major crop pathogen. Rieux Adrien, Lenormand T., Carlier Jean, De Lapeyre de Bellaire Luc, Ravigné Virginie. 2013. Ecology Letters, 16 (6) : pp. 721-730.
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A more reliable biological method to assess fungicide resistance in Mycosphaerella fijiensis. Ngando Essoh Otto Josué, Rieux Adrien, Zapater Marie-Françoise, Mehl Andréas, Ravigné Virginie, Carlier Jean, De Lapeyre de Bellaire Luc. 2013. In : Proceedings of the 20th international meeting ACORBAT: 40 years sharing science and technology, Fortaleza, Brazil, 9-13 september 2013. eds. Borges A.L. , Lichtemberg L. s.l. : s.n., p. 287. Reunion internacional ACORBAT 2013. 20, Fortaleza, Brésil, 9 September 2013/13 September 2013.
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2012

Détection de mutations conférant la résistance aux strobilurines et aux benzimidazoles chez Mycosphaerella fijiensis à partir de l'observation de phénotypes de germination. Ngando Essoh Otto Josué, Rieux Adrien, Mehl Andréas, Carlier Jean, De Lapeyre de Bellaire Luc. 2012. In : 8e colloque de la Société Française de Phytopathologie, 5 au 8 juin 2012,Paris, France : Livre des résumés. Attard Agnès (ed.), Barny Marie-Anne (ed.), Brisset Marie-Noelle (ed.), Cilas Christian (ed.), Dellagi Alia (ed.), Desprez-Loustau Marie-Laure (ed.), Expert Dominique (ed.), Fabre Frédéric (ed.), Fagard Mathilde (ed.), Fudal Isabelle (ed.), Genin Stéphane. SFP, INRA, CNRS. Paris : SFP, Résumé, p. 97. Congrès de la Société française de phytopathologie. 8, Paris, France, 5 June 2012/8 May 2012.
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L'observation de phénotypes de germination permet-elle de détecter efficacement la présence de souches résistantes aux benzimidazoles et aux strobilurines chez Mycosphaerella fijiensis ? Ngando Essoh Otto Josué, Nguidjo Oscar, Dongmo R., Pignolet Luc, Rieux Adrien, Mehl Andréas, Ravigné Virginie, Carlier Jean, De Lapeyre de Bellaire Luc. 2012. In : 8e Colloque de la Société française de phytopathologie, Paris, France, 5-8 juin 2012. Société française de phytopathologie. s.l. : s.n., 1 p. Congrès de la Société française de phytopathologie. 8, Paris, France, 5 June 2012/8 May 2012.
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2011

Dispersal processes underlying the recent pandemic caused by the plant pathogenic fungus Mycosphaerella fijiensis. Carlier Jean, Robert Stéphanie, Rieux Adrien, Halkett Fabien, Zapater Marie-Françoise, De Lapeyre de Bellaire Luc, Abadie Catherine, Ravigné Virginie. 2011. In : 26th Fungal Genetics Conference, Asilomar, USA, March 15-20, 2011. s.l. : s.n., 1 p. Fungal Genetics Conference. 26, Asilomar, États-Unis, 15 March 2011/20 March 2011.
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Etude des processus de dispersion et des flux géniques chez un champignon phytopathogène: le cas de Mycosphaerella fijiensis à l'échelle d'un bassin de production Camerounais. Rieux Adrien. 2011. Montpellier : UM2, 188 p. Thèse de doctorat : Systèmes Intégrés en biologie, agronomie, géosciences, hydrosciences, environnement. Evolution, écologie, ressources génétiques, paléontologie : Université Montpellier 2
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Inferences on pathogenic fungus population structures from microsatellite data: new insights from spatial genetics approaches. Rieux Adrien, Halkett Fabien, De Lapeyre de Bellaire Luc, Zapater Marie-Françoise, Rousset F., Ravigné Virginie, Carlier Jean. 2011. Molecular Ecology, 20 (8) : pp. 1661-1674.
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2010

Etude sur les conditions de réintroduction des fongicides systémiques dans les programmes de lutte contre la maladie des raies noires au Cameroun dans la zone de prodcution de la banane dessert d'exportation : rapport narratif final N°9 décembre 2010. De Lapeyre de Bellaire Luc, Ngando Essoh Otto Josué, Rieux Adrien, Carlier Jean, Ravigné Virginie, Zapater Marie-Françoise, Careel Françoise. 2010. Douala : CARBAP, 43 p. N° de rapport : 9
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On the use of temporal variation in neutral genetic clines to estimate gene flow: A case study in a fungal plant pathogen. Rieux Adrien, Carlier Jean, De Lapeyre Luc, Ravigné Virginie. 2010. In : Séminaire pour doctorants "Modèles en écologie évolutive", Montpellier, France, du 31mai au 05 juin 2010. s.l. : s.n., 1 p. Séminaire pour doctorants "Modèles en écologie évolutive", Montpellier, France, 31 May 2010/2 June 2010.
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Optimized genotyping with microsatellite markers in the fungal banana pathogen Mycosphaerella fijiensis (Mycosphaerellaceae). Robert Stéphanie, Rieux Adrien, Argout Xavier, Carlier Jean, Zapater Marie-Françoise. 2010. American Journal of Botany, 97 (12), e130-e132
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An integrated approach to define management strategies of fungicide resistance in populations of the plant pathogenic fungus Mycosphaerella fijiensis : [P02/05]. De Lapeyre de Bellaire Luc, Rieux Adrien, Essoh Ngando Josué, Zapater Marie-Françoise, Carreel Françoise, Ravigné Virginie, Carlier Jean. 2010. In : Premier Colloque national d'écologie scientifique, Montpellier, France, 2-4 septembre 2010. eds Jean-Claude Bertrand, Anne Bonis, Thierry Caquet, Alain Franc, Eric Garnier, Isabelle Olivieri, Christophe Thébaud, Jacques Roy. s.l. : s.n., Résumé, p. 252. Colloque National d'Ecologie Scientifique. 1, Montpellier, France, 2 September 2010/4 September 2010.
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2009

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2008

Flux de gènes au sein d'un paysage agricole chez le champignon Mycosphaerella fijiensis. Rieux Adrien, Halkett Fabien, Ravigné Virginie, Zapater Marie-Françoise, Pignolet Luc, De Lapeyre de Bellaire Luc, Carlier Jean. 2008. In : Journées Jean Chevaugeon, VIIe rencontres de phytopathologie - mycologie de la Societé française de phytopathologie, du 20 au 24 janvier 2008 [Résumés]. Fernandez Diana (ed.), Carlier Jean (ed.). CIRAD, INRA, CNRS, SFP, Bayer cropscience. Montpellier : CIRAD, Résumé, p. 50. Journées Jean Chevaugeon, Rencontres de phytopathologie-mycologie. 7, Aussois, France, 20 January 2008/24 January 2008.

Landscape genetics and gene flow in the banana pathogenic fungus Mycosphaerella fijiensis. Rieux Adrien, Halkett Fabien, Ravigné Virginie, Zapater Marie-Françoise, Pignolet Luc, De Lapeyre de Bellaire Luc, Carlier Jean. 2008. In : 7th International Mycosphaerella and Stagonospora Symposium, August 18-22, 2008, Ascona, Switzeland. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. International Mycosphaerella and Stagonospora Symposium. 7, Ascona, Suisse, 18 August 2008/22 August 2008.
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2007

Landscape genetics and gene flow in the banana pathogenic fungus Mycosphaerella fijiensis. Halkett Fabien, Rieux Adrien, Cogneau-Perineau Sonia, De Lapeyre de Bellaire Luc, Ravigné Virginie, Zapater Marie-Françoise, Pignolet Luc, Carlier Jean. 2007. In : International Meeting on Population and Evolutionary Biology of Fungal Symbionts, Ascona, Switzerland, 29 April - 4 May 2007. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. International Meeting on Population and Evolutionary Biology of Fungal Symbionts, Ascona, Suisse, 29 April 2007/4 May 2007.
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2006

Estimation des flux de gènes chez le champignon phytopathogène Mycosphaerella fijiensis à une échelle locale en fonction du paysage. Rieux Adrien. 2006. Montpellier : UM2, 22 p. Mémoire de master 2 : Ecologie, biodiversité, évolution. Parcours ressources phytogénétiques et interactions biologiques : Université Montpellier 2

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