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Nombre de documents : 249.

2024

Diverse local calibration approaches for chemometric predictive analysis of large near-infrared spectroscopy (NIRS) multi-product datasets. Yang Xueping, Yang Fuyu, Lesnoff Matthieu, Berzaghi Paolo, Ferragina Alessandro. 2024. Chemometrics and Intelligent Laboratory Systems, 251:105173, 10 p.
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Exploring the 3-dimensional variability of websites' user-stories using triadic concept analysis. Bazin Alexandre, Georges Thomas, Huchard Marianne, Martin Pierre, Tibermacine Chouki. 2024. International Journal of Approximate Reasoning, 173:109248, 14 p.
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Towards reusable building blocks for agent-based modelling and theory development. Berger Uta, Bell Andrew, Barton C. Michael, Chappin Emile, Dreßler Gunnar, Filatova Tatiana, Fronville Thibault, Lee Allen, van Loon E. Emiel, Lorscheid Iris, Meyer Matthias, Müller Birgit, Piou Cyril, Radchuk Viktoriia, Roxburgh Nicholas, Schüler Lennart, Troost Christian, Wijermans Nanda, Williams Tim G., Wimmler Marie-Christin, Grimm Volker. 2024. Environmental Modelling and Software, 175:106003, 12 p.
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2023

Pl@ntNet Crops: Merging citizen science observations and structured survey data to improve crop recognition for agri-food-environment applications. van der Velde Marijn, Goeau Hervé, Bonnet Pierre, d'Andrimont Raphaël, Yordanov M., Affouard Antoine, Claverie M., Czucz B., Elvekjaer N., Martinez-Sanchez L., Rotllan-Puig X., Sima A., Verhegghen Astrid, Joly Alexis. 2023. Environmental Research Letters, 18:025005, 12 p.
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2022

Fragmented landscape generator (flsgen): A neutral landscape generator with control of landscape structure and fragmentation indices. Justeau-Allaire Dimitri, Blanchard Grégoire, Ibanez Thomas, Lorca Xavier, Vieilledent Ghislain, Birnbaum Philippe. 2022. Methods in Ecology and Evolution, 13 (7) : 1412-1420.
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GeMo: A web-based platform for the visualization and curation of genome ancestry mosaics. Summo Marilyne, Comte Aurore, Martin Guillaume, Perelle Pierrick, Weitz Eric M., Droc Gaëtan, Rouard Mathieu. 2022. Database, 2022:baac057 : 1-5.
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Improved forecasting of coffee leaf rust by qualitative modeling: Design and expert validation of the ExpeRoya model. Motisi Natacha, Bommel Pierre, Leclerc Grégoire, Robin Marie-Hélène, Aubertot Jean-Noël, Arias Butron Andrea, Merle Isabelle, Treminio Edwin, Avelino Jacques. 2022. Agricultural Systems, 197:103352, 26 p.
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Towards virtual modelling environments for functional–structural plant models based on Jupyter notebooks: Application to the modelling of mango tree growth and development. Vaillant Jan, Grechi Isabelle, Normand Frédéric, Boudon Frédéric. 2022. In Silico Plants, 4 (1), n.spéc. Functional-structural plant models:diab040, 16 p.
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A chromosome-level, haplotype-phased genome assembly for Vanilla planifolia highlights that partial endoreplication challenges accurate whole genome assembly. Piet Quentin, Droc Gaëtan, Marande William, Sarah Gautier, Bocs Stéphanie, Klopp Christophe, Bourge Mickael, Siljak-Yakovlev Sonja, Bouchez Olivier, Lopez-Roques Céline, Lepers-Andrzejewski Sandra, Bourgois Laurent, Zucca Joseph, Dron Michel, Besse Pascale, Grisoni Michel, Jourda Cyril, Charron Carine. 2022. Plant Communications, 3:100330, 15 p.
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2021

Developing a data collection application for following up the small-scale dairy farms' performance in rural areas. Fouad Karim, Alary Véronique, Dubron A., Bonnet Pascal, Juanès Xavier, Nigm A., Radwan Mohamed Ali Abdallah, Abdelghany Sherif. 2021. Egyptian Journal of Animal Production, 58 (2) : 63-70.
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Graph convolutional and attention models for entity classification in multilayer networks. Zangari Lorenzo, Interdonato Roberto, Calió Antinio, Tagarelli Andrea. 2021. Applied Network Science, 6:87, 36 p.
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RapGreen, an interactive software and web package to explore and analyze phylogenetic trees. Dufayard Jean François, Bocs Stéphanie, Guignon Valentin, Larivière Delphine, Louis Alexandra, Oubda Nicolas, Rouard Mathieu, Ruiz Manuel, De Lamotte Frédéric. 2021. NAR Genomics and Bioinformatics, 3 (3):lqab088, 6 p.
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2020

Efficient execution of scientific workflows in the cloud through adaptive caching. Heidsieck Gaëtan, De Oliveira Daniel, Pacitti Esther, Pradal Christophe, Tardieu François, Valduriez Patrick. 2020. In : Transactions on large-scale data- and knowledge-centered systems XLIV. Hameurlain Abdelkader (ed.), Tjoa A. Min (ed.), Lamarre Philippe (ed.), Zeitouni Karine (ed.). Berlin : Springer, 41-66. (Lecture Notes in Computer Science, 12380) ISBN 978-3-662-62270-4
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A French text-message corpus: 88milSMS. Synthesis and usage. Panckhurst Rachel, Lopez Cédric, Roche Mathieu. 2020. Corpus, 20, 23 p.
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RDP5: A computer program for analyzing recombination in, and removing signals of recombination from, nucleotide sequence datasets. Martin Darren Patrick, Varsani Arvind, Roumagnac Philippe, Botha Gerrit, Maslamoney Suresh, Schwab Tiana, Kelz Zena, Kumar Venkatesh, Murrell Ben. 2020. Virus Evolution, 7 (1):veaa087, 3 p.
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2019

AgriNumA'2019. Résumés des communications. Bonnet Pascal (ed.), Roche Mathieu (ed.), Kirchner Hélène (ed.). 2019. Dakar : CIRAD-INRIA, 23 p. AgriNumA 2019 : Symposium “Agriculture Numérique en Afrique”, Dakar, Sénégal, 28 Avril 2019/30 Avril 2019.
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Rice Galaxy: An open resource for plant science. Juanillas Venice, Dereeper Alexis, Beaume Nicolas, Droc Gaëtan, Dizon Joshua, Mendoza John Robert, Perdon Jon Peter, Mansueto Locedie, Triplett Lindsay R., Lang Jillian M., Zhou Gabriel, Ratharanjan Kunalan, Plale Beth, Haga Jason, Leach Jan E., Ruiz Manuel, Thomson Michael J., Alexandrov Nickolai, Larmande Pierre, Kretzschmar Tobias, Mauleon Ramil P.. 2019. GigaScience, 8 (5) : 1-14.
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2016

Gigwa—Genotype investigator for genome-wide analyses. Sempere Guilhem, Philippe Florian, Dereeper Alexis, Ruiz Manuel, Sarah Gautier, Larmande Pierre. 2016. GigaScience, 5 (25), 9 p.
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2015

Recognition of logical units in log files. Saneifar Hassan, Bonniol Stéphane, Poncelet Pascal, Roche Mathieu. 2015. Intelligent Data Analysis, 19 (2) : 431-448.
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SNiPlay3: A web-based application for exploration and large scale analyses of genomic variations. Dereeper Alexis, Homa Félix, Andres Gwendoline, Sempere Guilhem, Sarah Gautier, Hueber Yann, Dufayard Jean François, Ruiz Manuel. 2015. Nucleic Acids Research, 43 (W1) : W295-W300.
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2014

Quantitative assessment of automatic reconstructions of branching systems obtained from laser scanning. Boudon Frédéric, Preuksakarn Chakkrit, Ferraro Pascal, Diener Julien, Nacry Philippe, Nikinmaa Eero, Godin Christophe. 2014. Annals of Botany, 114 (4) : 853-862.
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2013

Application informatique pour l'élaboration participative de plans de gestion des ressources forestières. Aubert Sigrid, Müller Jean Pierre, Rakotobe Holy. 2013. In : HAFATRA Haitao momba ny Ala sy Fanarenana ny Ala ary Trai-kefa. Technique et savoir pour la restauration forestière. La restauration forestière à Vohimana. Bouvet J.M , Rakouth B., Randrianjafy H., Roger E. (Eds.). Antananarivo : FOREAIM, 93-100.
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La boîte à outils Mexico, un environnement générique pour piloter l'exploration numérique de modèles. Richard Hervé, Monod Hervé, Wang Juhui, Couteau Jean, Dumoulin Nicolas, Poussin Benjamin, Soulie Jean-Christophe, Ramat Eric. 2013. In : Analyse de sensibilité et exploration de modèles : application aux sciences de la nature et de l'environnement. Faivre Robert (ed.), Iooss Bertrand (ed.), Mahévas Stéphanie (ed.), Makowski David (ed.), Monod Hervé (ed.). Versailles : Ed. Quae, 233-253. (Savoir-faire) ISBN 978-2-7592-1906-3
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2012

Building crop models within different crop modelling frameworks. Adam Myriam, Corbeels Marc, Leffelaar Peter A., Van Keulen Herman, Wery Jacques, Ewert Franck. 2012. Agricultural Systems, 113 : 57-63.
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Chado Controller : Advanced annotation management with a community annotation system. Guignon Valentin, Droc Gaëtan, Alaux Michael, Baurens Franc-Christophe, Garsmeur Olivier, Poiron Claire, Carver Timothy L.W., Rouard Mathieu, Bocs Stéphanie. 2012. Bioinformatics, 28 (7) : 1054-1056.
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L-Py: an L-system simulation framework for modeling plant architecture development based on a dynamic language. Boudon Frédéric, Pradal Christophe, Cokelaer Thomas, Prusinkiewicz Przemyslaw, Godin Christophe. 2012. Frontiers in Plant Science, 3 (76), 20 p.
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Markets as communication systems: Simulating and assessing the performance of market networks. Galtier Franck, Bousquet François, Antona Martine, Bommel Pierre. 2012. Journal of Evolutionary Economics, 22 (1) : 161-201.
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Participatory agent-based simulation for renewable resource management: the role of the Cormas simulation platform to nurture a community of practice. Le Page Christophe, Becu Nicolas, Bommel Pierre, Bousquet François. 2012. Journal of Artificial Societies and Social Simulation, 15 (1), 16 p.
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Une approche générique de la modélisation spatiale et temporelle : application à la modélisation des paysages. Degenne Pascal. 2012. Marne-la-Vallée : Université de Marne-la-Vallée, 195 p. Thèse de doctorat : Informatique : Université de Marne-la-Vallée
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Virtual Laboratory Environment : un environnement de multimodélisation et de simulation de systèmes complexes. Quesnel Gauthier, Ramat Eric, Soulie Jean-Christophe, Duvivier David, Duboz Raphaël. 2012. Studia Informatica Universalis, 10 (1) : 205-234.
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2011

GNPAnnot community annotation system applied to sugarcane bac clone sequences (W572). Guignon Valentin, Droc Gaëtan, Garsmeur Olivier, Charron Carine, D'Hont Angélique, Bocs Stéphanie. 2011. In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XIXth Conference, San Diego, CA (USA), January 15-19, 2011. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genomes Conference. 19, San Diego, États-Unis, 15 Janvier 2011/19 Janvier 2011.
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The Pl@ntnet project: plant computational identification and collaborative information system. Barthélémy Daniel, Boujemaa Nozha, Mathieu Daniel, Jean-François M., Joly Alexis, Mouysset Elise. 2011. In : IBC2011. XVIII International Botanical Congress, 23-30 July 2011, Melbourne, Australia. s.l. : s.n., Résumé, 577. International Botanical Congress. 18, Melbourne, Australie, 23 Juillet 2011/30 Juillet 2011.
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2010

Chado Controller a database monitor for confidentiality, quality and tracking of genomic annotations. Guignon Valentin, Droc Gaëtan, Poiron Claire, Lengellé Juliette, Garsmeur Olivier, Baurens Franc-Christophe, Bocs Stéphanie. 2010. In : Journées ouvertes biologie informatique mathématique (JOBIM), Montpellier, France, 07-09 septembre 2010. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. Journées ouvertes biologie informatique mathématique, Montpellier, France, 7 Septembre 2010/9 Septembre 2010.
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Ontology, a mediator for agent-based modeling in social science. Livet Pierre, Müller Jean Pierre, Phan Denis, Sanders Lena, Auatabu Titeem. 2010. Journal of Artificial Societies and Social Simulation, 13 (1), 14 p.
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2009

Design of a domain specific language for modelling processes in landscapes. Degenne Pascal, Lo Seen Danny, Parigot Didier, Forax Rémi, Tran Annelise, Ait Lahcen Ayoub, Curé Olivier, Jeansoulin Robert. 2009. Ecological Modelling, 220 (24) : 3527-3535.
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Epidémiologie spatiale : les maladies vues du ciel. Tran Annelise, Guis Hélène, Guernier Vanina, Gerbier Guillaume. 2009. In : Introduction à l'épidémiologie intégrative des maladies infectieuses et parasitaires. Guégan Jean-François, Choisy Marc. Paris : De Boeck Université, 41-80. (LMD) ISBN 978-2-8041-5948-1

La notion de cadre conceptuel de modélisation : penser la place des ontologies dans le processus de modélisation. Müller Jean Pierre. 2009. In : 16èmes Journées de Rochebrune. Rencontres Interdisciplinaires sur les Systèmes Complexes Naturels et Artificiels "Ontologie et dynamique des systèmes complexes, perspectives interdisciplinaires", 19-23 janvier 2009, Rochebrune, France. s.l. : s.n., 11 p. Journées de Rochebrune : Rencontres Interdisciplinaires sur les Systèmes Complexes Naturels et Artificiels. 16, Rochebrune, France, 19 Janvier 2009/23 Janvier 2009.
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2008

Des roselières et des hommes : ButorStar un jeu de rôles pour l'aide à la gestion collective. Mathevet Raphaël, Le Page Christophe, Etienne Michel, Poulin Brigitte, Lefebvre Gaëtan, Cazin Franck, Ruffray Xavier. 2008. Revue Internationale de Géomatique, 18 (3) : 375-395.
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The Generation Challenge Programme platform : Semantic standards and workbench for crop science. Bruskiewich Richard, Senger Martin, Davenport Guy, Ruiz Manuel, Rouard Mathieu, Hazekamp Tom, Takeya Masaru, Doi Koji, Satoh Kouji, Costa Marcos, Simon Reinhard, Balaji Jayashree, Akintunde Akinnola, Mauleon Ramil P., Wanchana Samart, Shah Trushar, Anacleto Mylah, Portugal Arllet, Jun Ulat Victor, Thongjuea Supat, Braak Kyle, Ritter Sebastian, Dereeper Alexis. 2008. International Journal of Plant Genomics, 2008, 6 p.
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Geomatics and territorial governance: tools, knowledge and expertise. Viau Alain A., Boutinot Laurence. 2008. International Journal of Sustainable Development, 11 (2-3-4) : 226-246.

L'intelligence économique : co-construction et émergence d'une discipline via un réseau humain. Bernat Jean-Pierre (ed.). 2008. Paris : Hermès-Lavoisier, 284 p. (Management et gestion des STICS. IC2) ISBN 978-2-7462-2046-1

Méthodes ABC : Approximate Bayesian Computation. Ravigné Virginie, Barrès Benoit, Tharreau Didier. 2008. . s.l. : Réunion ANR Emerfundis, Diaporama, (10 vues) Réunion ANR Emerfundis, Paris, France, 13 Mars 2008/14 Mars 2008.
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OpenAlea: a visual programming and component-based software platform for plant modelling. Pradal Christophe, Dufour-Kowalski Samuel, Boudon Frédéric, Fournier Christian, Godin Christophe. 2008. Functional Plant Biology, 35 (9-10) : 751-760. International Workshop on Functional-Structural Plant Models. 5, Napier, Nouvelle-Zélande, 4 Novembre 2007/9 Novembre 2007.
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2007

De l'équation mathématique au programme informatique, dialogue entre mathématiciens et informaticiens. Treuil Jean-Pierre, Lobry Claude, Millier Claude, Müller Jean Pierre, Hervé Dominique. 2007. Natures Sciences Sociétés, 15 (1) : 33-43.
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Déclics, le portail d'information scientifique du Cirad. Fily Marie-Françoise, Boyer Annie. 2007. In : Rencontres des professionnels de l'IST 2007, Nancy, 18-20 juin 2007. INIST-CNRS. Montpellier : Cirad, 1 p. Rencontres des Professionnels de l'IST. 5, Nancy, France, 18 Juin 2007/20 Juin 2007.

Emergence in multi-agent systems: conceptual and methodological issues. Dessalles Jean-Louis, Müller Jean Pierre, Phan Denis. 2007. In : Agent-based modelling and simulation in the social and human sciences. Phan Denis (ed.), Amblard Frédéric (ed.). Oxford : The Bardwell Press, 327-355. (GEMAS Studies in social analysis) ISBN 978-1-905622-01-6
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SAT, a flexible and optimized Web application for SSR marker development. Dereeper Alexis, Argout Xavier, Billot Claire, Rami Jean-François, Ruiz Manuel. 2007. BMC Bioinformatics, 8 (465), 10 p.
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Sist. Système d'information scientifique et technique. Pour la science en Afrique. Deboin Marie-Claude, Rescanière Olivier. 2007. Montpellier : CIRAD, 8 p. ISBN 978-87614-641-9
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Software standardization managing a pineaple's culture : End of study. Thesis. Boisvilliers Gaël. 2007. Paris : École Supérieure d'Informatique, 65 p. Mémoire de fin d'études : École Supérieure d'Informatique
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2005

Analysis of the plant architecture via tree-structured statistical models : The hidden markov tree models. Durand Jean-Baptiste, Guédon Yann, Caraglio Yves, Costes Evelyne. 2005. New Phytologist, 166 (3) : 813-825.
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Couplage de modèles de flux de gènes et de modèles de dynamique forestière. Dreyfus Philippe, Pichot Christian, De Coligny François, Gourlet-Fleury Sylvie, Cornu Guillaume, Jésel Sébastien, Dessard Hélène, Oddou-Muratorio Sylvie, Gerber Sophie, Caron Patrick, Latouche-Hallé Céline, Lefèvre François, Courbet François, Seynave Ingrid. 2005. In : Un dialogue pour la diversité génétique : 5e Colloque National BRG - ISARA, Lyon, 3-4-5 novembre 2004 = A dialog for the genetic diversity. BRG. Paris : BRG, 231-250. (Les Actes du BRG, 5) ISBN 2-908447-33-9 Colloque national BRG Dialogue pour la diversité génétique. 5, Lyon, France, 3 Novembre 2004/5 Novembre 2004.
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From GCM grid cell to agricultural plot : Scale issues affecting modelling of climate impact. Baron Christian, Sultan Benjamin, Balme Maud, Sarr Benoit, Traoré Seydou B., Lebel Thierry, Janicot Serge, Dingkuhn Michaël. 2005. Philosophical Transactions - Royal Society. Biological Sciences, 360 (1463) : 2095-2108.
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Functional-structural plant modelling. Godin Christophe, Sinoquet Hervé. 2005. New Phytologist, 166 (3) : 705-708.
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Modélisation des plantes : vers la compréhension de l'interaction gène-forme. Godin Christophe. 2005. In : Thématiques INRIA : Modéliser le vivant, Le Chesnay, 10 mai 2005. INRIA. Le Chesnay : INRIA, Diaporama, (59 vues) Thématiques INRIA, Cycle "Modéliser le vivant", Rocquencourt, France, 5 Avril 2005/24 Mai 2005.
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Optimisation pour la modélisation agronomique : développement et évaluation d'algorithmes d'optimisation ; définition et mise en oeuvre d'une méthodologie d'optimisation. Martinez Vincent. 2005. Toulouse : INSA de Toulouse, 54 p. Mémoire : Institut national des sciences appliquées de Toulouse

Plant systems biology: linking theory and experiment. Talks. ST5. Toward a model for organ initiation patterns at the shoot apical meristem. Traas Jan, Barbier de Reuille Pierre, Courseau I., Morin Halima, Carraro Nicola, Godin Christophe. 2005. Journal of Experimental Botany, 56, suppl. 1 : Society for Experimental Biology Plant Frontier Meeting Abstracts : i24-i24.
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Simulation of light transmission under Acacia mangium Willd. and Tecton grandis L. canopies and comparison with in situ measurements. Leroy Céline, Laurans Marilyne, Dauzat Jean, Sabatier Sylvie-Annabel, Auclair Daniel. 2005. In : International Worhshop on Smallholder Agroforestry Option for Degraded Soils, Malany, Indonesia, August 18-21,2005. s.l. : s.n., 61-65. International Workshop on Samllhoder Agroforestry Options for Degraded Soils, Malang, Indonésie, 18 Août 2005/21 Août 2005.

Toward a quantification of self-similarity in plants. Ferraro Pascal, Godin Christophe, Prusinkiewicz Przemyslaw. 2005. Fractals, 13 (2) : 91-109.
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Vers un modèle dynamique du méristème apical caulinaire d'Arabidopsis thaliana. Barbier de Reuille Pierre. 2005. Montpellier : UM2, 197 p. Thèse de doctorat : Informatique : Université Montpellier 2
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2004

Adaptation en français d'un module de formation électronique sur la gestion des documents électroniques. Serari Mokhtaria. 2004. Villeurbanne : ENSSIB, 44 p. Mémoire DESS : Réseaux d'information et document électronique : Ecole nationale supérieure des sciences de l'information et des bibliothèques
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Analysis of the plant architecture via tree-structured statistical models : The hidden Markov trees. Durand Jean-Baptiste, Guédon Yann, Caraglio Yves, Costes Evelyne. 2004. In : Proceedings of the 4th International workshop on functional-structural plant models (FSPM), abstracts of papers and posters, 7-11 June 2004, Montpellier, France. Godin Christophe (ed.), Hanan Jim (ed.), Kurth Winfried (ed.), Lacointe André (ed.), Takenaka Akio (ed.), Prusinkiewicz Przemyslaw (ed.), Dejong Thedore M. (ed.), Beveridge Christine (ed.). CIRAD-AMIS-UMR AMAP. Montpellier : CIRAD-AMAP, 61-64. International Workshop on Functional-Structural Plant Models (FSPM). 4, Montpellier, France, 7 Juin 2004/11 Juin 2004.

Methods for analyzing plant structure at different scales. Guédon Yann. 2004. In : Proceedings of the 4th International workshop on functional-structural plant models (FSPM), abstracts of papers and posters, 7-11 June 2004, Montpellier, France. Godin Christophe (ed.), Hanan Jim (ed.), Kurth Winfried (ed.), Lacointe André (ed.), Takenaka Akio (ed.), Prusinkiewicz Przemyslaw (ed.), Dejong Thedore M. (ed.), Beveridge Christine (ed.). CIRAD-AMIS-UMR AMAP. Montpellier : CIRAD-AMAP, 51-55. International Workshop on Functional-Structural Plant Models (FSPM). 4, Montpellier, France, 7 Juin 2004/11 Juin 2004.

Using real-time model-checking tools in agricultural planning : application to livestock waste management. Helias Arnaud, Guerrin François, Steyer Jean-Philippe. 2004. In : MCPL 2004, 3rd Conference on Management and Control of Production and Logistics, 3-5 November 2004, Santiago de Chile. IFAC. s.l. : s.n., 8 p. Conference on Management and Control of Production and Logistics. 3, Santiago de Chile, Chili, 3 Novembre 2004/4 Novembre 2004.

A dynamic, architectural plant model simulating resource-dependent growth. Yan Hong-Ping, Kang Meng Zhen, De Reffye Philippe, Dingkuhn Michaël. 2004. Annals of Botany, 93 : 591-602.
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2003

AMAPmod : visao geral. Godin Christophe, Guédon Yann, Bellouti Samir (collab.), Ferraro Pascal (collab.), Nouguier Christophe (collab.), Dones Nicolas (collab.), Adam Boris (collab.), Caraglio Yves (collab.), Costes Evelyne (collab.), Sinoquet Hervé (collab.). 2003. In : Memorias do workshop internacional sobre digitalizaçao para arquitetura tridimensional - 3D em sistemas agroflorestais. Rakocevic Miroslava, Medrado Moacir José Sales, Ribaski Jorge. EMBRAPA-Florestas. Brasilia : EMBRAPA, 25-65. (Documentos) Workshop International sobre Digitalizaçao para Arquitetura Tridimensional - 3D em Sistemas Agroflorestais, Curitiba, Brésil, 4 Novembre 2002/8 Novembre 2002.

Agricultural trade liberalization in a world of uncertainty : discussion of the results of a world CGE model. Boussard Jean-Marc, Gérard Françoise, Piketty Marie-Gabrielle, Christensen Ane-Kathrine, Voituriez Tancrède. 2003. In : International Conference on Policy Modeling, July 3-5, 2003, Istanbul, Turkey. s.l. : s.n. ECOMOD 2003 : International Conference On Policy Modeling, Istanbul, Turquie, 3 Juillet 2003/5 Juillet 2003.
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GreenLab : a new methodology towards plant functional-structural model - Structural aspect. Hu Bao-Gang, De Reffye Philippe, Zhao X., Yan Hong-Ping, Kang Meng Zhen. 2003. In : Plant growth modeling and applications. Proceedings PMA03 : The First International symposium on plant growth modeling, simulation, visualization and their applications, Beijing, China, October 13-16, 2003. Hu Bao-Gang (ed.), Jaeger Marc (ed.). Institut d'automatique-LIAMA, Chinese Agriculture University. Pékin : Tsinghua University Press, 21-35. ISBN 7-302-07140-3 International Symposium on Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and their Applications (PMA03). 1, Pékin, Chine, 13 Octobre 2003/16 Octobre 2003.
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High performance computing and visualization for forestry applications - Project SILVES. Blaise Frédéric, Cavin X., Paul J.C.. 2003. In : Plant growth modeling and applications. Proceedings PMA03 : The First International symposium on plant growth modeling, simulation, visualization and their applications, Beijing, China, October 13-16, 2003. Hu Bao-Gang (ed.), Jaeger Marc (ed.). Institut d'automatique-LIAMA, Chinese Agriculture University. Pékin : Tsinghua University Press, 194-202. ISBN 7-302-07140-3 International Symposium on Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and their Applications (PMA03). 1, Pékin, Chine, 13 Octobre 2003/16 Octobre 2003.
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Interactive simulation of plant architecture based on a dual-scale automaton model. Zhao X., De Reffye Philippe, Barthélémy Daniel, Hu Bao-Gang. 2003. In : Plant growth modeling and applications. Proceedings PMA03 : The First International symposium on plant growth modeling, simulation, visualization and their applications, Beijing, China, October 13-16, 2003. Hu Bao-Gang (ed.), Jaeger Marc (ed.). Institut d'automatique-LIAMA, Chinese Agriculture University. Pékin : Tsinghua University Press, 144-153. ISBN 7-302-07140-3 International Symposium on Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and their Applications (PMA03). 1, Pékin, Chine, 13 Octobre 2003/16 Octobre 2003.
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Interdisciplinary training on multi-agent systems (MAS), social sciences and integrated natural resource management (INRM) in Thailand. Bousquet François, Trébuil Guy, Gajaseni Nantana, Ekasingh Benchaphum, Wongsamun Chaicharn. 2003. In : International Conference Grad Blueprint 2003 : Multidisciplinary programs, management for future graduate studies, 7-9 May 2003, Bangkok, Thailand. s.l. : s.n., 1 p. International Conference Grad Blueprint 2003, Bangkok, Thaïlande, 7 Mai 2003/9 Mai 2003.
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MAGI 2 : modèle d'approvisionnement global informatique. Evolution de l'application vers la prise en charge de différentes typologies de bassin. Gontier Grégory. 2003. Montpellier : UM2, 72 p. Mémoire DESS : Techniques nouvelles en informatique. Option BMW : Université Montpellier 2

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Tree and plant volume imaging - An introductive study towards voxelized functional landscapes. Jaeger Marc, Teng Jun. 2003. In : Plant growth modeling and applications. Proceedings PMA03 : The First International symposium on plant growth modeling, simulation, visualization and their applications, Beijing, China, October 13-16, 2003. Hu Bao-Gang (ed.), Jaeger Marc (ed.). Institut d'automatique-LIAMA, Chinese Agriculture University. Pékin : Tsinghua University Press, 169-181. ISBN 7-302-07140-3 International Symposium on Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and their Applications (PMA03). 1, Pékin, Chine, 13 Octobre 2003/16 Octobre 2003.
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CAPSIS: Computer-aided projection for strategies in silviculture. De Coligny François, Ancelin Philippe, Cornu Guillaume, Courbaud Benoît, Dreyfus Philippe, Goreaud François, Gourlet-Fleury Sylvie, Meredieu Céline, Saint André Laurent. 2002. In : Reality, models and parameter estimation, the forestry scenario, Sesimbra, 2nd - 5th June 2002. Amaro Ana (ed.), Reed David (ed.), Soares Paula (ed.). ISG, ISA. Lisbonne : Instituto Superior de Agronomia, 10 p. Workshop on Reality, Models and Parameter Estimation, the Forestry Scenario, Sesimbra, Portugal, 2 Juin 2002/5 Juin 2002.
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Modèle macro-économique à dominante agricole pour l'analyse de l'impact du changement climatique et des effets des politiques en terme d'efficacité et d'équité : rapport de fin d'étude au GICC, 28 février 2002. Gérard Françoise, Piketty Marie-Gabrielle, Boussard Jean-Marc, Christensen Ane-Kathrine (collab.), Fallot Abigaïl (collab.), Voituriez Tancrède (collab.), Desalos Caroline (collab.), Maunier Nicolas (collab.), Provo Véronique (collab.). 2002. Nogent-sur-Marne : CIRAD-AMIS, 121 p. N° de rapport : CIRAD-AMIS N° 10/2002
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Transferts d'eau et de solutés dans les sols : formation organisée du 9 au 13 septembre 2002. Marlet Serge, Findeling Antoine. 2002. Montpellier : CIRAD-AMIS, 1 Cd-Rom

2001

Amélioration du programme WIN-DL50 avec le langage Borland C++ Builder v.5.0. Dumas Vanessa. 2001. Montpellier : UM2, 69 p. Mémoire IUP : Génie mathématique et informatique : Université Montpellier 2

Intelligence artificielle et aide à la décision en agriculture. Jallas Eric, Martin-Clouaire Roger, Sequeira R.A., Martin Pierre, Nowak Richard, Crétenet Michel. 2001. In : Modélisation des agroécosystèmes et aide à la décision. Malézieux Eric (ed.), Trébuil Guy (ed.), Jaeger Marc (ed.). Montpellier : CIRAD, 217-240. (Repères) ISBN 2-87614-474-3
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La culture de l'ananas en Guadeloupe : version 1.0. Magnier Hélène. 2001. Montpellier : CIRAD, 1 Cd-Rom

Les mauvaises herbes de la Réunion et leur identification. Le Bourgeois Thomas, Grard Pierre, Jeuffrault Eric. 2001. In : Dix-huitième conférence du COLUMA. Journées internationales sur la lutte contre les mauvaises herbes, 5-6-7- décembre 2001, Toulouse, France = Eighteenth COLUMA Conference International meeting on weed control, 5-6-7 December 2001, Toulouse, France. COLUMA. Paris : ANPP, 1207-1213. (AFPP Annales) ISBN 2-905550-92-9 Conférence du COLUMA : journées internationales sur la lutte contre les mauvaises herbes. 18, Toulouse, France, 5 Décembre 2001/7 Décembre 2001.
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L'informatique scientifique : rôle, enjeux et perspectives. Jaeger Marc. 2000. Montpellier : CIRAD, 56 p. (Documents de la direction scientifique, 3)
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Constructing parametric models of trees from digitised datasets. Henton Stefan, Godin Christophe. 1999. Montpellier : CIRAD, 24 p.

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Simulations on virtual world : understanding the interactions between ecological and social dynamics. Le Page Christophe, Bousquet François, Takforyan Ani, Bakam Innocent. 1999. In : Jardin planétaire'99 : actes = Planetary garden'99 : proceedings. INRA, CIRAD, Savoie-Conseil général. Chambery : Prospective 2100, 286-290. International symposium on sustainable ecosystem management. 1, Chambery, France, 14 Mars 1999/18 Mars 1999.
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Sésame doc 6 : référentiel bibliographique en agronomie tropicale francophone. CIRAD-DG-DIST - FRA. 1999. Montpellier : CIRAD, 1 Cd-Rom

1998

AMAPsim : un outil de construction et simulation de plantes numériques tridimensionnelles - principes et applications. Rey Hervé, Barczi Jean-François, Caraglio Yves, De Reffye Philippe. 1998. In : Architecture et modélisation en arboriculture fruitière. INRA, CTIFL, CIRAD, ENSAM. Montpellier : INRA, 296-306. Colloque sur les recherches fruitières. 11, Montpellier, France, 5 Mars 1998/6 Mars 1998.
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ASPIC : un outil d'aide à la gestion de l'information sur les périmètres irrigués collectifs. Le Gal Pierre-Yves, Passouant Michel, Bruel Olivier. 1998. In : L'irrigation et la gestion collective de la ressource en eau en France et dans le monde, Montpellier, 19 et 20 novembre 1998. SFER, CEMAGREF, ORSTOM, Agropolis. Antony : CEMAGREF, 10 p. Colloque sur l'Irrigation et la gestion collective de la ressource en eau en France et dans le monde, Montpellier, France, 19 Novembre 1998/20 Novembre 1998.
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Analyse de la diversité génétique : mesures de dissimilarité et représentations arborées. Perrier Xavier. 1998. Montpellier : Université de Montpellier 2, 192 p. Thèse d'université : Université des sciences et techniques du Languedoc

Cormas : common-pool resources and multi-agent systems. Bousquet François, Bakam Innocent, Proton Hubert, Le Page Christophe. 1998. Lecture Notes in Computer Science. LNAI. Lecture Notes in Artificial Intelligence, 1416 : 826-837. International Conference on Industrial and Engineering Applications of Artificial Intelligence and Expert Systems (IEA-98-AIE). 11, Castellon, Espagne, 1 Juin 1998/4 Juin 1998.

Déformation d'objets 3D sous contraintes à volume constant. Manesco P.. 1998. Montpellier : Université de Montpellier 2, 28 p. Mémoire DEA : Fin d'Etudes en Informatique : Université des sciences et techniques du Languedoc

EU agricultural policy : a public finance approach illustrated by CGE-models. Christensen Ane-Kathrine. 1998. Paris : Université Panthéon-Sorbonne, 140 p. Thèse de doctorat : Sciences économiques : Université Panthéon-Sorbonne

Evaluation of the simplex method for training simple multilayer neural networks. Dornier Manuel, Heyd B., Danzart Marc. 1998. Neural Computing and Applications, 7 : 107-114.
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Exploration et analyse de l'architecture des arbres fruitiers. Godin Christophe, Guédon Yann, Costes Evelyne. 1998. In : Architecture et modélisation en arboriculture fruitière. INRA, CTIFL, CIRAD, ENSAM. Montpellier : INRA, 33-45. Colloque sur les recherches fruitières. 11, Montpellier, France, 5 Mars 1998/6 Mars 1998.
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Integrating topological and geometric information for digitizing plant architecture. Godin Christophe, Costes Evelyne, Sinoquet Hervé. 1998. Montpellier : CIRAD-AMIS, 27 p. (Documents de travail du programme modélisation des plantes, 4)

L'architecture des plantes et son utilisation en agronomie : bilan et perspective. De Reffye Philippe, Houllier François. 1998. In : Architecture et modélisation en arboriculture fruitière. INRA, CTIFL, CIRAD, ENSAM. Montpellier : INRA, 9-21. Colloque sur les recherches fruitières. 11, Montpellier, France, 5 Mars 1998/6 Mars 1998.
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Le codage des plantes utilisé dans AMAPmod. Version 1. Godin Christophe. 1998. Montpellier : CIRAD-AMIS, 21 p. (Documents de travail du programme modélisation des plantes, 3)

Mesures de l'architecture des plantes par digitalisation 3D. Sinoquet Hervé, Godin Christophe, Costes Evelyne. 1998. In : Numérisation 3D-Human modeling : actes des conférences. Anon. s.l. : s.n., 1-9. Congrès sur la numérisation 3D, design et digitilisation, création industrielle et artistique, Paris, France, 27 Mai 1998/28 Mai 1998.

Modelling plant growth and architecture : some recent advances and applications to agronomy and forestry. De Reffye Philippe, Blaise Frédéric, Houllier François. 1998. In : II Modelling Plant Growth, Environmental Control and Farm Management in Protected Cultivation, Wageningen, Netherlands. ISHS ; ed. by L.F.M. Marcelis. Wageningen : ISHS, 105-116. (Acta Horticulturae, 0567-7572, 456) ISBN 978-90-66057-50-0 International Symposium on Models for Plant Growth, Environmental Control and Farm Management in Protected Cultivation. 2, Wageningen, Pays-Bas, 25 Août 1997/28 Août 1997.

Optimisation de la gestion forestière des massifs forestiers artificiels du Burundi : intérêt d'un transfert de savoir-faire de l'Aquitaine vers le Burundi en matière de cartographie et gestion informatisée des massifs forestiers. Ndabirorere Salvador. 1998. Créteil : Université de Paris-Val-de-Marne, 67 p. Mémoire DESS : Gestion des systèmes agro-sylvo-pastoraux en zones tropicales : Université de Paris-Val-de-Marne

Rapport de mission au Mali : appui au service cartographie-informatique. Pain-Orcet Michelle, Narboni Philippe, Trébuchon Jean-François. 1998. Montpellier : CIRAD-Forêt, 101 p.
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Simulation of the growth of plants. Modeling of metamorphosis and spatial interactions in the architecture and development of plants. Blaise Frédéric, Barczi Jean-François, Jaeger Marc, Dinouard Pierre, De Reffye Philippe. 1998. In : Cyberworlds. Kunii T.L. (ed.), Luciani A. (ed.). Tokyo : Springer, 81-109.

Spécifications fonctionnelles du logiciel AMAPCOD. Version 1.2. Godin Christophe, Martin Pierre. 1998. Montpellier : CIRAD-AMIS, 65 p. (Documents de travail du programme modélisation des plantes, 2)

Statistiques et système d'information. Passouant Michel. 1998. In : XXIXe journées de statistique = [XXIXth statistics conference]. ASU. Carcassonne : IUT-STID, 1-3. Journées de statistiques. 29, Carcassonne, France, 26 Mai 1997/30 Mai 1997.

Transformation d'un modèle de simulation du plant moyen en un modèle peuplement. Martin Pierre. 1998. Montpellier : USTL, 28 p. Mémoire DEA : Informatique : Université des sciences et techniques du Languedoc

Une approche fonctionnelle pour la simulation de la croissance d'arbres fruitiers : le logiciel AMAPpara. Fourcaud Thierry, Blaise Frédéric, De Reffye Philippe, Lac Patrick. 1998. In : Architecture et modélisation en arboriculture fruitière. INRA, CTIFL, CIRAD, ENSAM. Montpellier : INRA, 307-316. Colloque sur les recherches fruitières. 11, Montpellier, France, 5 Mars 1998/6 Mars 1998.
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Une méthode de comparaison structurelle d'arborescences non ordonnées. Ferraro Pascal, Godin Christophe. 1998. Montpellier : CIRAD-AMIS, 44 p. (Documents de travail du programme modélisation des plantes, 1)

A multiscale model of plant topological structures. Godin Christophe, Caraglio Yves. 1998. Journal of Theoretical Biology (191) : 1-46.
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1997

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EGID a computerized data-base system for citrus. Cottin Roland. 1997. In : 5ème Congrès international des pépinièristes des agrumes (Montpellier, 5-7 mars 1997), résumés = 5th International congress of citrus nurserymen (montpellier, 5-7 March 1997), abstracts ; 5. Congreso mundial de viveritas de citricos. ISCN. Montpellier : CIRAD, 1 p. World Congress of the International Society of Citrus Nurserymen. 5, Montpellier, France, 5 Mars 1997/8 Mars 1997.

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Manuel de perfectionnement Wordperfect 6.1. Sada-Tailly Paulette. 1996. Montpellier : CIRAD-SAR, 71 p.

Outils informatiques de gestion des plantations industrielles d'Eucalyptus au Congo. Laclau Jean-Paul, Tambaud M.M., Mankedi D.R.. 1996. Pointe-Noire : CIRAD-Forêt, 82 p.
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Projet de biomodélisation du criquet pélerin. Présentation résumée du biomodèle SGR. Version opérationnelle 1996. Launois Michel, Duranton Jean-François, Launois-Luong My-Hanh, Lecoq Michel, Popov M., Gay Pierre-Emmanuel, Gigault Jérôme, Balança Gilles, Coste Caroline, Foucart Antoine, Monard Annie. 1996. Montpellier : CIRAD-GERDAT, 23 p.

Rapport technique de l'algorithme utilisé dans Trashcam V3. Suite au stage effectué du 01/10/95 au 31/10/96. Hugon M.. 1996. s.l. : s.n., 25 p. Mémoire IUP : Génie Mathématique et Informatique : Université des sciences et techniques du Languedoc

Rapport technique. Base de données contrats. Cauneille Sandrine. 1996. Montpellier : CIRAD-CA, 13 p.

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Architecture and development sequence of Araucaria araucana in natural forests of Argentina. Grosfeld Javier, Barthélémy Daniel. 1995. In : Actas de las IV jornadas forestales Patagonias. Tome 1 = [Actes des IVe journées forestières de Patagonie. Tome 1 ]. Anon. s.l. : s.n., 12-31. Jornadas Forestales Patagonias. 4, San Martin de los Andes, Argentine, Octobre 1995.

COTON Doc: an encyclopaedic software tool for cotton pest control. Girardot Benoit. 1995. Agriculture et Développement, numéro spécial 1995 Highlights : 43-46.
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Cartographie et changement d'échelle. Le point de vue du naturaliste. Propositions d'applications en cartographie informatique. Guillobez Serge, Bertrand Roger. 1995. Bulletin - Société Française de Photogrammétrie et de Télédétection (140) : 8-9.

Coton Doc : un nouvel outil pour gérer la lutte contre les ennemis du cotonnier. Girardot Benoit. 1995. Agriculture et Développement (5) : 47-50.
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Document préparatoire à la revue externe de l'unité de modélisation des plantes. CIRAD-GERDAT-UNITE DE MODELISATION DES PLANTES - FRA. 1995. Montpellier : CIRAD, 197 p.

Développement de la base de données de résultats d'analyses technologiques du laboratoire de technologie cotonnière. Mahistre D.. 1995. Montpellier : EPSI, 90 p. Mémoire de fin d'études : Ecole privée des sciences informatiques

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Compte-rendu de mission. Traitement informatique des données d'inventaire de la forêt de Ngotto. Narboni Philippe. 1994. Nogent-sur-Marne : CIRAD-Forêt, 100 p.

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Etude de cas sur un village du Burkina Faso. Analyse faite sous LISA. Sada-Tailly Paulette. 1991. Montpellier : CIRAD-SAR, 34 p.

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Mode de calcul pour l'étude de la fertilisation minérale des caféiers basée sur l'analyse du sol. Snoeck Jacques, Jadin Pierre. 1990. Café, Cacao, Thé, 34 (1) : 3-21.
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Rapport de mission au Mali du 22 octobre au 1er novembre 1989. Joly Alain. 1990. Montpellier : CIRAD-IRCT, 19 p.

Wordperfect 5.0. Support de cours. Tailly Paulette. 1990. Montpellier : CIRAD-SAR, 15 p.

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Logento : logiciel de gestion des résultats des essais entomologiques en culture cotonnière. Girardot Benoit. 1989. In : Actes de la 1ère Conférence de la recherche cotonnière africaine, Lomé, Togo, 31 janvier - 2 février 1989 : Tome II = Proceedings of the 1st African cotton research conference, Lome, Togo, January 31 - February 2, 1989. Vol. 2. Berger Michel (ed.), Frydrych Danielle (ed.). Togo-Ministère du développement rural, CIRAD-IRCT. Wageningen : CTA, 317-324. ISBN 2-902197-04-7 Conférence de la recherche cotonnière africaine. 1, Lomé, Togo, 31 Janvier 1989/2 Février 1989.

PANTROP, un système expert d'aide à la détermination des principales familles botaniques tropicales. Grard Pierre. 1989. Montpellier : CIRAD-IRCT, 56 p. Mémoire DEA : Fin d'Etudes en Botanique Tropicale Appliquée : Université des sciences et techniques du Languedoc

Rapport de mission "Iphytrop". Deuse Jacques, Sabadie Serge, Sor Joël. 1989. Montpellier : CIRAD-IRAT, 72 p.

Rapport de synthèse (activités) 1988. Programme cotonnier. CIRAD-IRCT - CMR. 1989. Montpellier : CIRAD-IRCT, 32 p.

1988

BASEFLO : la gestion de données dans les relevés d'enherbement. Grard Pierre, Le Bourgeois Thomas. 1988. Coton et Fibres Tropicales, 43 (1) : 29-36.
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Gestion de la distribution du logiciel LISA. Sada-Tailly Paulette, Boule M.C.. 1988. Montpellier : CIRAD-DSA, 48 p.

Manuel d'utilisation de LISA : Logiciel Intégré des Systèmes Agraires. Francillon G., Sicard Jean-Charles, Sada-Tailly Paulette. 1988. Montpellier : CIRAD-DSA, 432 p.

Modélisation et stimulation de l'architecture de l'hévéa. Dinouard Pierre, De Reffye Philippe, Jaeger Marc. 1988. In : Compte-rendu du colloque exploitation-physiologie et amélioration de l'hévéa : colloque international IRRDB Hevea 88 , 2 au 7 novembre 1988, Paris (France). Jacob Jean-Louis (ed.), Prévôt Jean-Claude (ed.). IRRDB, CIRAD-IRCA-Laboratoire de physiologie et biochimie. Montpellier : CIRAD-IRCA, 513-517. ISBN 2-901317-09-10 Colloque International IRRDB Hevea 88, Paris, France, 2 Novembre 1988/7 Novembre 1988.
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Rapport de mission au Togo du 14 au 28 novembre 1987. Joly Alain. 1988. Montpellier : CIRAD-IRCT, 57 p.

Rapport de stage concernant l'agroclimatologie et l'évapotranspiration au Niger. Tchougourou A.. 1988. Montpellier : CIRAD-IRAT, 70 p.

1987

Représentation et simulation de croissance des végétaux. Jaeger Marc. 1987. Strasbourg : Université Pasteur, 166 p. Thèse d'université : Informatique : Université Louis Pasteur
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1985

Représentation de végétaux. Jaeger Marc. 1985. Strasbourg : Université louis pasteur, 62 p. Mémoire DEA : Fin d'Etudes en Traitement Graphique, Traitement d'Images : Université Louis Pasteur

1983

Rapport 1982-1983, informatisation du projet NEB. Meurillon G.. 1983. Paris : GERDAT-IRCT, 30 p.

1975

1973

Projet d'exploitation informatique des méthodes multivariables par le service méthodologie. N Guyen Ngoc Quoi, Weil J.. 1973. Nogent-sur-Marne : GERDAT-IRAT, 9 p.

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