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Multi-environment genomic selection in rice elite breeding lines.
Nguyen Van Hieu, Morantte Rose Imee Zhella, Lopena Vitaliano, Verdeprado Holden, Murori Rosemary, Ndayiragije Alexis, Kumar Katiyar Sanjay, Islam Md Rafiqul, Juma Roselyne Uside, Flandez-Galvez Hayde, Glaszmann Jean-Christophe, Cobb Joshua N., Bartholome Jérôme.
2023.
Rice, 16 (1)
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Traces of introgression from cAus into Tropical Japonica observed in African upland rice varieties.
Beye Abdoulaye, Billot Claire, Ronfort Joëlle, McNally Kenneth L., Diouf Diaga, Glaszmann Jean-Christophe.
2023.
Rice, 16 (1), 20 p.
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Exemples d'études de CropOmics : sur la diversité génomique (cours), sur des introgressions parmi "les 3000 riz" (miniprojets).
Bocs Stéphanie, Gantet Pascal, Glaszmann Jean-Christophe.
2022.
In : CropOmics: exemples de diversité génomique & miniprojets sur introgressions parmi « les 3000 riz ». Université de Montpellier. Montpellier : Université de Montpellier , 1 diaporama (21 vues)
Montpellier OMICS Days 2022 Conférence annuelle de bioinformatique et statistiques. 10, Montpellier, France, 26 Janvier 2022/26 Janvier 2022.
Édition du génome et amélioration des plantes : l'émergence d'une technologie.
Glaszmann Jean-Christophe, Ahmadi Nourollah, Billot Claire, Temple Ludovic.
2022.
In : Sciences, techniques et agricultures : gouverner pour transformer. Goulet Frédéric (ed.), Caron Patrick (ed.), Hubert Bernard (ed.), Joly, Pierre-Benoît (ed.). Paris : Presses des Mines , 243-248.
(Sciences sociales)
ISBN 978-2-35671-845-7
On the inference of complex phylogenetic networks by Markov Chain Monte-Carlo.
Rabier Charles-Elie, Berry Vinvent, Stoltz Marnus, Santos João D., Wang Wensheng, Glaszmann Jean-Christophe, Pardi Fabio, Scornavacca Céline.
2021.
PLoS Computational Biology, 17 (9):e1008380, 39 p.
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Three founding ancestral genomes involved in the origin of sugarcane.
Pompidor Nicolas, Charron Carine, Hervouet Catherine, Bocs Stéphanie, Droc Gaëtan, Rivallan Ronan, Manez Aurore, Mitros Therese, Swaminathan Kankshita, Glaszmann Jean-Christophe, Garsmeur Olivier, D'Hont Angélique.
2021.
Annals of Botany, 127 (6) : 827-840.
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Genome ancestry mosaics reveal multiple and cryptic contributors to cultivated banana.
Martin Guillaume, Cardi Céline, Sarah Gautier, Ricci Sebastien, Jenny Christophe, Fondi Emmanuel, Perrier Xavier, Glaszmann Jean-Christophe, D'Hont Angélique, Yahiaoui Nabila.
2020.
Plant Journal, 102 (5) : 1008-1025.
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Simulation-based evaluation of three methods for local ancestry deconvolution of non-model crop species genomes.
Cottin Aurélien, Penaud Benjamin, Glaszmann Jean-Christophe, Yahiaoui Nabila, Gautier Mathieu.
2020.
G3 - Genes Genomes Genetics, 10 (2) : 569-579.
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Crop evolution over the distance: from Asian to African rice cultivars.
Beye Abdoulaye, Santos Joao, Billot Claire, Diouf Diaga, Glaszmann Jean-Christophe.
2019.
In : Dedicated to the origins of agriculture and the domestication, evolution and utilization of genetic resources. Abstracts book. IRD, Bioversity International, Agropolis International, CIRAD, Montpellier SupAgro, Université de Montpellier, INRA. Montpellier : IRD , Résumé, p. 32.
Jack R. Harlan International Symposium. 3, Montpellier, France, 3 Juin 2019/7 Juin 2019.
Fine scale genomic signals of admixture and alien introgression among Asian rice landraces.
Santos Joao, Chebotarov Dmytro, McNally Kenneth L., Bartholome Jérôme, Droc Gaëtan, Billot Claire, Glaszmann Jean-Christophe.
2019.
Genome Biology and Evolution, 11 (5) : 1358-1373.
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Genome ancestry mosaics reveal multiple and cryptic contributors to cultivated banana.
Martin Guillaume, Cardi Céline, Sarah Gautier, Ricci Sébastien, Jenny Christophe, Fondi Emmanuel, Perrier Xavier, Glaszmann Jean-Christophe, D'Hont Angélique, Yahiaoui Nabila.
2019.
. Bordeaux : INRA , Résumé, 1 p.
Colloque annuel DynaGeV : Dynamique des génomes végétaux. 5, Bordeaux, France, 14 Novembre 2019/15 Novembre 2019.
Exploring the mosaic structure of rice genomes.
Santos Joao, Billot Claire, Glaszmann Jean-Christophe.
2018.
. PAG. San Diego : PAG , 1 p.
Plant and Animal Genome Conference. 26, San Diego, États-Unis, 13 Janvier 2018/17 Janvier 2018.
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Genomic variation in 3,010 diverse accessions of Asian cultivated rice.
Wang Wensheng, Mauleon Ramil P., Hu Zhiqiang, Chebotarov Dmytro, Tai Shuaishuai, Wu Zhi-Chao, Li Min, Zheng Tianqing, Fuentes Roven Rommel, Zhang Fan, Mansueto Locedie, Copetti Dario, Sanciangco Millicent, Palis Kevin Christian, Xu Jianlong, Sun Chen, Fu Binying, Zhang Hongliang, Gao Yongming, Zhao Xiuqin, Shen Fei, Cui Xiao, Yu Hong, Li Zichao, Chen Miaolin, Detras Jeffrey, Zhou Yong-Li, Zhang Xinyuan, Zhao Yue, Kudrna Dave, Wang Chunchao, Li Rui, Jia Ben, Lu Jinyuan, He Xianchang, Dong Zhaotong, Xu Jiabao, Li Yanhong, Wang Miao, Shi Jianxin, Li Jing, Zhang Dabing, Lee Seunghee, Hu Wushu, Poliakov Alexander, Dubchak Inna, Ulat Victor Jun, Borja Borja Nikki Frances, Mendoza John Robert, Ali Jauhar, Li Jing, Gao Qiang, Niu Yongchao, Yue Zhen, Naredo Ma. Elizabeth B., Talag Jayson, Wang Xueqiang, Li Jinjie, Fang Xiaodong, Yin Ye, Glaszmann Jean-Christophe, et al..
2018.
Nature, 557:7703 : 43-49.
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Local Ancestry lnference approaches to unravel plant genome mosaic: a simulation-based evaluation.
Cottin Aurélien, Penaud Benjamin, Martin Guillaume, Dos Santos J., Curk Franck, D'Hont Angélique, Glaszmann Jean-Christophe, Yahiaoui Nabila, Gautier Mathieu.
2018.
. Montpellier : ESEB , Résumé, 1 p.
Joint Congress on Evolutionary Biology, Montpellier, France, 19 Août 2018/22 Août 2018.
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A mosaic monoploid reference sequence for the highly complex genome of sugarcane.
Garsmeur Olivier, Droc Gaëtan, Antonise Rudie, Grimwood Jane, Potier Bernard, Aitken Karen S., Jenkins Jerry, Martin Guillaume, Charron Carine, Hervouet Catherine, Costet Laurent, Yahiaoui Nabila, Healey Adam, Sims David, Cherukuri Yesesri, Sreedasyam Avinash, Kilian Andrzej, Chan Agnes P., Van Sluys Marie-Anne, Swaminathan Kankshita, Town Christopher, Berges Hélène, Simmons Blake, Glaszmann Jean-Christophe, Van der Vossen Edwin, Henry Robert, Schmutz Jeremy, D'Hont Angélique.
2018.
Nature Communications, 9:2638, 10 p.
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Evaluation of methodologies for the characterization of plant mosaic genomes.
Cottin Aurélien, Penaud Benjamin, Martin Guillaume, Santos Joao, Curk Franck, D'Hont Angélique, Ruiz Manuel, Glaszmann Jean-Christophe, Yahiaoui Nabila, Gautier Mathieu.
2017.
In : Abstract Book Dynagev 2017. Réseau scientifique DYNAGEV. Montpellier : INRA , Résumé, 17.
Colloque annuel DynaGeV : Dynamique des génomes végétaux. 3, Montpellier, France, 8 Juin 2017/9 Juin 2017.
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Insight into the hybrid mosaic structure of cultivated banana genomes.
Martin Guillaume, Cardi Céline, Sarah Gautier, Jourda Cyril, Ricci Sebastien, Jenny Christophe, Perrier Xavier, D'Hont Angélique, Glaszmann Jean-Christophe, Yahiaoui Nabila.
2017.
In : Plant Genome Evolution 2017. Sitges : s.n. , 1 p.
Plant Genome Evolution 2017, Sitges, Espagne, 1 Octobre 2017/3 Octobre 2017.
Using the 3k genomes to decipher the mosaic structure of genome diversity in rice.
Santos Joao, Billot Claire, Glaszmann Jean-Christophe.
2017.
In : Abstract Book Dynagev 2017. Réseau scientifique DYNAGEV. Montpellier : INRA , Résumé, 16.
Colloque annuel DynaGeV : Dynamique des génomes végétaux. 3, Montpellier, France, 8 Juin 2017/9 Juin 2017.
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Insight into the mosaic structure of cultivated banana genomes.
Martin Guillaume, Cardi Céline, Sarah Gautier, Jourda Cyril, Ricci Sebastien, Jenny Christophe, Perrier Xavier, D'Hont Angélique, Glaszmann Jean-Christophe, Yahiaoui Nabila.
2016.
. Paris : INRA , Résumé, 1 p.
Workshop DynaGeV : Dynamique des Génomes Végétaux, Paris, France, 7 Juillet 2016/8 Juillet 2016.
Comparative analysis of genetic variation in kava (Piper methysticum) assessed by SSR and DArT reveals zygotic foundation and clonal diversification.
Vandenbroucke Henri, Mournet Pierre, Malapa Roger, Glaszmann Jean-Christophe, Chaïr Hâna, Lebot Vincent.
2015.
Genome (Ottawa), 58 (1) : 1-11.
Experimental assessment of the accuracy of genomic selection in sugarcane.
Gouy Matthieu, Rousselle Yves, Bastianelli Denis, Lecomte Philippe, Bonnal Laurent, Roques Danièle, Efile Jean-Claude, Rocher Solen, Daugrois Jean-Heinrich, Toubi Lyonel, Nabeneza Serge, Hervouet Catherine, Telismart Hugues, Denis Marie, Thong-Chane Audrey, Glaszmann Jean-Christophe, Hoarau Jean-Yves, Nibouche Samuel, Costet Laurent.
2015.
In : Pushing the frontiers of sugarcane improvement, ISSCT Workshop abstracts. ERCANE, ARTAS, Tereos Océan Indien. Saint-Gilles : ISSCT , 56.
Germplasm and Breeding ISSCT Workshop. 11, Saint-Gilles, Réunion, 1 Juin 2015/5 Juin 2015.
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Genome-wide association studies (GWAS) in sugarcane context: Experience from a case study and questions about ways of optimization of GWAS. MO11.
Hoarau Jean-Yves, Débibakas Sarah, Garsmeur Olivier, Roques Danièle, Rocher Solen, Glaszmann Jean-Christophe, Daugrois Jean-Heinrich, D'Hont Angélique.
2015.
In : Pushing the frontiers of sugarcane improvement. ISSCT. Saint-Gilles : ISSCT , Résumé, 49.
Germplasm and Breeding ISSCT Workshop. 11, Saint-Gilles, Réunion, 1 Juin 2015/5 Juin 2015.
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Plant breeding for climate-smart agriculture.
Glaszmann Jean-Christophe.
2015.
In : Building tomorrow’s research agenda and bridging the science-policy gap. CIRAD, INRA, IRD, Agropolis International, Wageningen UR, CGIAR, UCDAVIS, FAO, Agreenium, GFAR. Montpellier : CIRAD , 77-80.
Climate-Smart Agriculture 2015 : Global Science Conference. 3, Montpellier, France, 16 Mars 2015/18 Mars 2015.
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Influence of ethnolinguistic diversity on the sorghum genetic patterns in subsistence farming systems in Eastern Kenya.
Labeyrie Vanesse, Deu Monique, Barnaud Adeline, Calatayud Caroline, Buiron Marylène, Wambugu Peterson Weru, Manel Stéphanie, Glaszmann Jean-Christophe, Leclerc Christian.
2014.
PloS One, 9 (2):e92178, 14 p.
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ARCAD, a structuring node in the French plant genetic resource conservation system.
Glaszmann Jean-Christophe, Pham Jean Louis, Labouisse Jean-Pierre.
2013.
In : A gateway to the new era of global food security : 3rd International Symposium on Genomics of Plant Genetic Resources (GPGR3), Jeju, Korea, April 16-19, 2013. s.l. : s.n. , Résumé, 1 p.
International Symposium on Genomics of Plant Genetic Resources. 3, Jeju, Corée du Sud, 16 Avril 2013/19 Avril 2013.
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Amélioration des plantes : quelle évolution face aux enjeux planétaires.
Glaszmann Jean-Christophe.
2013.
In : 50 ème Salon international de l'agriculture (SIA 2013). Paris, France, 23 février au 3 mars 2013. s.l. : s.n. , Résumé, 1 p.
Salon international de l'agriculture. 50, Paris, France, 23 Février 2013/3 Mars 2013.
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Experimental assessment of the accuracy of genomic selection in sugarcane.
Gouy Matthieu, Rousselle Yves, Bastianelli Denis, Lecomte Philippe, Bonnal Laurent, Roques Danièle, Efile Jean-Claude, Rocher Solen, Daugrois Jean-Heinrich, Toubi Lyonel, Nabeneza Serge, Hervouet Catherine, Telismart Hugues, Denis Marie, Thong-Chane Audrey, Glaszmann Jean-Christophe, Hoarau Jean-Yves, Nibouche Samuel, Costet Laurent.
2013.
Theoretical and Applied Genetics, 126 (10) : 2575-2586.
Genome configuration and breeding strategies in three tropical polyploid crops.
Glaszmann Jean-Christophe.
2013.
In : A gateway to the new era of global food security : 3rd International Symposium on Genomics of Plant Genetic Resources (GPGR3), Jeju, Korea, April 16-19, 2013. s.l. : s.n. , Résumé, 1 p.
International Symposium on Genomics of Plant Genetic Resources. 3, Jeju, Corée du Sud, 16 Avril 2013/19 Avril 2013.
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Histoire, génétique et économie. Aux racines de l'amélioration des plantes.
Chauvet Michel, Glaszmann Jean-Christophe, Tordjman Hélène.
2013.
In : Tables rondes de l'INP-ENSAT sur le développement durable, Toulouse, France, 14 novembre 2012. Mission d'animation des arobiosciences. s.l. : s.n. , 1-32.
Tables rondes de l'INP-ENSAT sur le développement durable, Toulouse, France, 14 Novembre 2012.
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Interspecific introgression and trait dissection in peanut (Arachis hypogaea) : W336.
Foncéka Daniel, Tossim Hodo-Abalo, Rivallan Ronan, Faye Issa, Leal-Bertioli Soraya C.M., Valls José F.M., Glaszmann Jean-Christophe, Courtois Brigitte, Rami Jean-François.
2013.
In : Plant and Animal Genome XXI conference, San Diego, USA, January 12-16 2013,. s.l. : s.n. , Résumé, 1 p.
Plant and Animal Genome conference. 21, San Diego, États-Unis, 12 Janvier 2013/16 Janvier 2013.
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Massive sorghum collection genotyped with SSR markers to enhance use of global genetic resources.
Billot Claire, Ramu Punna, Bouchet Sophie, Chantereau Jacques, Deu Monique, Gardes Laëtitia, Noyer Jean-Louis, Rami Jean-François, Rivallan Ronan, Li Yu, Lu Ping, Wang Tianyu, Folkertsma Rolf T., Arnaud Elizabeth, Upadhyaya Hari D., Glaszmann Jean-Christophe, Hash Charles Tom.
2013.
PloS One, 8 (4):e59714, 16 p.
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Patterns of rice diversity from SNP delineated the origin of the atypical O. sativa group in Madagascar from intermediary forms of the Indian sub-continent.
Ahmadi Nourollah, Billot Claire, Droc Gaëtan, Brunel Dominique, Frouin Julien, Ramanantsoanirina Alain, McNally Kenneth L., Courtois Brigitte, Glaszmann Jean-Christophe.
2013.
In : 7th International Rice Genetics Symposium (RG7), Manila, Philippines, 5-8 November 2013. International Rice Research Institute. s.l. : s.n. , Résumé, 1 p.
International Rice Genetics Symposium. 7, Manille, Philippines, 5 Novembre 2013/8 Novembre 2013.
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Population development to help resolve and move traits in genomics-assisted breeding : OP03.
Glaszmann Jean-Christophe.
2013.
In : Biotic and Abiotic Stress Tolerance in Plants: the Challenge for the 21st Century : Book of abstracts of the CIBA 2013. Brasileiro Ana Christina Miranda (ed.), Fortes Ferreira Claudia (ed.), Fernandez Diana (ed.), Micheli Fabienne (ed.), Coelho Filho M.A. (ed.), Marraccini Pierre (ed.). EMBRAPA, UESC, CIRAD, IRD. Brasilia : EMBRAPA , Résumé, 10-11.
Workshop on Biotic and Abiotic Stress Tolerance in Plants: the Challenge for the 21st Century, Ilhéus-Bahia, Brésil, 6 Novembre 2013/8 Novembre 2013.
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Repenser l'amélioration des plantes.
Ahmadi Nourollah, Bertrand Benoît, Glaszmann Jean-Christophe.
2013.
In : Cultiver la biodiversité pour transformer l'agriculture. Hainzelin Etienne (ed.). Versailles : Ed. Quae , 99-146.
(Synthèses)
ISBN 978-2-7592-1900-1
Rethinking plant breeding.
Ahmadi Nourollah, Bertrand Benoît, Glaszmann Jean-Christophe.
2013.
In : Cultivating biodiversity to transform agriculture. Hainzelin Etienne (ed.). Heidelberg : Springer [Allemagne] , 91-140.
ISBN 978-94-007-7983-9
Construction of chromosome segment substitution lines in peanut (Arachis hypogaea L.) using a wild synthetic and QTL mapping for plant morphology.
Foncéka Daniel, Tossim Hodo-Abalo, Rivallan Ronan, Vignes Hélène, Lacut Elodie, De Bellis Fabien, Faye Issa, Ndoye Ousmane, Leal-Bertioli Soraya C.M., Valls José F.M., Bertioli David J., Glaszmann Jean-Christophe, Courtois Brigitte, Rami Jean-François.
2012.
PloS One, 7 (11):e48642, 11 p.
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Discovery of a major allele of Os2AP in Myanmar aromatic rice.
Khin Myo Myint, Arikit Siwaret, Plabpla Anucha, Wanchana Samart, Courtois Brigitte, Glaszmann Jean-Christophe, Vanavichit Apichart.
2012.
In : Royal Golden Jubilee Ph.D Congress, April 6-8, 2012, Pattaya, Thailand. s.l. : s.n. , 1 p.
Royal Golden Jubilee Ph.D Congress, Pattaya, Thaïlande, 6 Avril 2012/8 Avril 2012.
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Ensemble dans le Challenge Programme Generation.
Glaszmann Jean-Christophe.
2012.
In : Du Brésil en Europe : 10 ans du Programme Labex, modèle de laboratoire sans murs de l'Embrapa. Pedro Arcuri (ed.), Paula Dias (ed.). Agropolis. Montpellier : Agropolis International , 37.
(Les dossiers d'Agropolis International, 15)
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Fostered and left behind alleles in peanut : Interspecific QTL mapping reveals footprints of domestication and useful natural variation for breeding.
Foncéka Daniel, Tossim Hodo-Abalo, Rivallan Ronan, Vignes Hélène, Faye Issa, Ndoye Ousmane, Moretzsohn Márcio C., Bertioli David J., Glaszmann Jean-Christophe, Courtois Brigitte, Rami Jean-François.
2012.
BMC Plant Biology, 12 (26), 16 p.
Genetic structure, linkage disequilibrium and signature of selection in sorghum: lessons from physically anchored DArT markers.
Bouchet Sophie, Pot David, Deu Monique, Rami Jean-François, Billot Claire, Perrier Xavier, Rivallan Ronan, Gardes Laëtitia, Xia Ling, Wenzl Peter, Kilian Andrzej, Glaszmann Jean-Christophe.
2012.
PloS One, 7 (3):e33470, 14 p.
Genomic resources, interspecific introgression and trait dissection in Groundnut.
Foncéka Daniel, Glaszmann Jean-Christophe, Rami Jean-François.
2012.
In : Colloque France-Brésil : Des Recherches pour l'Agronomie, la Biodiversité et la Santé, 16-17 octobre 2012, Montpellier, France. s.l. : s.n. , Résumé, 7.
Colloque France-Brésil : Des Recherches pour l'Agronomie, la Biodiversité et la Santé, Montpellier, France, 16 Octobre 2012/17 Octobre 2012.
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Haplotype structure around Bru 1 reveals a narrow genetic basis for brown rust resistance in modern sugarcane cultivars.
Costet Laurent, Le Cunff Loïc, Royaert Stefan, Raboin Louis-Marie, Hervouet Catherine, Toubi Lyonel, Telismart Hugues, Garsmeur Olivier, Rousselle Yves, Pauquet Jérôme, Nibouche Samuel, Glaszmann Jean-Christophe, Hoarau Jean-Yves, D'Hont Angélique.
2012.
Theoretical and Applied Genetics, 125 (5) : 825-836.
Marqueurs moléculaires utilisables en sélection chez la canne à sucre : cas de la résistance à la rouille brune.
Costet Laurent, Le Cunff Loïc, Royaert Stefan, Raboin Louis-Marie, Hervouet Catherine, Toubi Lyonel, Telismart Hugues, Garsmeur Olivier, Rousselle Yves, Pauquet Jérôme, Nibouche Samuel, Glaszmann Jean-Christophe, Hoarau Jean-Yves, D'Hont Angélique.
2012.
In : La canne à sucre source de développement et d'innovation : Congrès sucrier ARTAS-AFCAS, 10-14 septembre 2012, Saint Denis, La Rénion et du 15 au 19 septembre 2012 à Maurice. ARTAS ; AFCAS. s.l. : s.n. , 10 p.
Congrès sucrier ARTAS-AFCAS, Saint Gilles, Réunion, 10 Septembre 2012/14 Septembre 2012.
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Patterns and dynamics of genetic diversity in Sorghum.
Glaszmann Jean-Christophe.
2012.
In : International VIPCA conference on 'Molecular Ecology', February 4th-7th, Vienna, Austria. s.l. : s.n. , Résumé, 1 p.
International VIPCA conference on 'Molecular Ecology', Vienne, Autriche, 4 Février 2012/7 Février 2012.
Ressources génétiques, analyse du génome et amélioration variétale de l'arachide.
Rami Jean-François, Foncéka Daniel, Bertioli Soraya, Bertioli David J., Ndoye Ousmane, Glaszmann Jean-Christophe.
2012.
In : Du Brésil en Europe : 10 ans du Programme Labex, modèle de laboratoire sans murs de l'Embrapa. Pedro Arcuri (ed.), Paula Dias (ed.). Agropolis. Montpellier : Agropolis International , 37.
(Les dossiers d'Agropolis International, 15)
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Specific patterns of genetic diversity among aromatic rice varieties in Myanmar.
Myint Khin M., Courtois Brigitte, Risterucci Ange-Marie, Frouin Julien, Soe Khin, Thet Khin M., Vanavichit Apichart, Glaszmann Jean-Christophe.
2012.
Rice, 5 (20), 13 p.
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The banana (Musa acuminata) genome and the evolution of monocotyledonous plants.
D'Hont Angélique, Denoeud France, Aury Jean-Marc, Baurens Franc-Christophe, Carreel Françoise, Garsmeur Olivier, Noël Benjamin, Bocs Stéphanie, Droc Gaëtan, Rouard Mathieu, Da Silva Corinne, Jabbari Kamel, Cardi Céline, Poulain Julie, Souquet Marlène, Labadie Karine, Jourda Cyril, Lengellé Juliette, Rodier-Goud Marguerite, Alberti Adriana, Bernard Maria, Correa Margot, Ayyampalayam Saravanaraj, Mckain Michael R, Leebens-Mack Jim, Burgess Diane, Freeling Mike, Mbéguié-A-Mbéguié Didier, Chabannes Matthieu, Wicker Thomas, Panaud Olivier, Barbosa Jose, Hribova Eva, Heslop Harrison Pat, Habas Rémy, Rivallan Ronan, François Philippe, Poiron Claire, Kilian Andrzej, Burthia Dheema, Jenny Christophe, Bakry Frédéric, Brown Spencer, Guignon Valentin, Kema Gert H.J., Dita Miguel A., Waalwijk Cees, Joseph Steeve, Diévart Anne, Jaillon Olivier, Leclercq Julie, Argout Xavier, Lyons Eric, Almeida Ana, Jeridi Mouna, Dolezel Jaroslav, Roux Nicolas, Risterucci Ange-Marie, Weissenbach Jean, Ruiz Manuel, Glaszmann Jean-Christophe, Quetier Francis, Yahiaoui Nabila, Wincker Patrick.
2012.
Nature, 488 (7410) : 213-217.
A reference microsatellite kit to assess for genetic diversity of Sorghum bicolor (Poaceae).
Billot Claire, Rivallan Ronan, Ndoye Sall Mbaye, Foncéka Daniel, Deu Monique, Glaszmann Jean-Christophe, Noyer Jean-Louis, Rami Jean-François, Risterucci Ange-Marie, Wincker Patrick, Ramu Punna, Hash Charles Tom.
2012.
American Journal of Botany, 99 (6), e245-e250
Core reference sets of sorghum and musa : from a whole collection to a mini core collection and back (W291).
Glaszmann Jean-Christophe, Billot Claire, Arnaud Elizabeth, Mc Grath Sarah K., Seetharam K., Sharma Shivali, Perrier Xavier, Upadhyaya Hari D..
2011.
In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XIXth Conference, San Diego, CA (USA), January 15-19, 2011. s.l. : s.n. , Résumé
Plant and Animal Genomes Conference. 19, San Diego, États-Unis, 15 Janvier 2011/19 Janvier 2011.
Diversity Arrays Technology effectively reveals DNA polymorphism in a large and complex genome of sugarcane.
Heller-Uszynska Katarzyna, Uszynski Grzegorz, Huttner Eric, Evers Margaret, Carlig Jason, Caig Vanessa, Aitken Karen S., Jackson Phil A., Piperidis George, Cox Mike, Gilmour Ross, D'Hont Angélique, Butterfield Mike, Glaszmann Jean-Christophe, Kilian Andrzej.
2011.
Molecular Breeding, 8 (1) : 37-55.
High homologous gene conservation despite extreme autopolyploid redundancy in sugarcane.
Garsmeur Olivier, Charron Carine, Bocs Stéphanie, Jouffe Vincent, Samain Sylvie, Couloux Arnaud, Droc Gaëtan, Zini Cyrille, Glaszmann Jean-Christophe, Van Sluys Marie-Anne, D'Hont Angélique.
2011.
New Phytologist, 189 (2) : 629-642.
The relationship between population structure and aluminum tolerance in cultivated sorghum.
Caniato Fernanda F., Guimaraes Claudia T., Hamblin Martha, Billot Claire, Rami Jean-François, Hufnagel Barbara, Kochian Leon V., Liu Jiping, Garcia Antonio Augusto Franco, Hash Charles Tom, Ramu Punna, Mitchell Sharon, Kresovich Stephen, Oliveira Antonio Carlos, De Avellar Gisela, Borém Aluizio, Glaszmann Jean-Christophe, Schaffert Robert E., Magalhaes Jurandir V..
2011.
PloS One, 6 (6):e20830, 14 p.
Accessing genetic diversity for crop improvement.
Glaszmann Jean-Christophe, Kilian B., Upadhyaya Hari D., Varshney Rajeev K..
2010.
Current Opinion in Plant Biology, 13 (2) : 167-173.
Association mapping for aluminum tolerance in candidate regions of the AltSB locus in sorghum.
Caniato Fernanda F., Guimaraes Claudia T., Kresovich Stephen, Mitchell Sharon, Hamblin Martha, Zhiwu Zhang, Glaszmann Jean-Christophe, Schaffert Robert E., Kochian Leon V., Magalhaes Jurandir V..
2010.
In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XVIIIth Conference, San Diego, CA (USA), January 09-13, 2010. s.l. : s.n. , Résumé
Plant and Animal Genomes Conference. 18, San Diego, États-Unis, 9 Janvier 2010/13 Janvier 2010.
Comparison of seven homoeologous haplotypes (BAC) within the high polyploid sugarcane genome : [Abstract W604].
Charron Carine, Garsmeur Olivier, Jouffe Vincent, Bocs Stéphanie, Samain Sylvie, Couloux Arnaud, Droc Gaëtan, Glaszmann Jean-Christophe, Van Sluys Marie-Anne, D'Hont Angélique.
2010.
In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XVIIIth Conference, San Diego, CA (USA), January 09-13, 2010. s.l. : s.n. , Résumé
Plant and Animal Genomes Conference. 18, San Diego, États-Unis, 9 Janvier 2010/13 Janvier 2010.
Crop genomics for food improvement.
Glaszmann Jean-Christophe, This Patrice, Guiderdoni Emmanuel.
2010.
In : 14th Human Genome Meeting (HGM2010)"next generation genomics and medicine", 18-21 may 2010, Montpellier, France. Human Genome Organisation (HUGO). s.l. : s.n. , Résumé, 1 p.
Human Genome Meeting "next generation genomics and medicine". 14, Montpellier, France, 18 Mai 2010/21 Mai 2010.
Diversity arrays technology (DArT) and statistical tools for genome profile-based molecular breeding of sugarcane : [Abstract W305].
Heller-Uszynska Katarzyna, Uszynski Grzegorz, Evers Margaret, Huttner Eric, Carlig Jason, Caig Vanessa, Detering Frank, Aitken Karen S., Jackson Phil A., Hermann Scott, Cox Mike, D'Hont Angélique, Butterfield Mike, Glaszmann Jean-Christophe, Kilian Andrzej.
2010.
In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XVIIIth Conference, San Diego, CA (USA), January 09-13, 2010. s.l. : s.n. , Résumé
Plant and Animal Genomes Conference. 18, San Diego, États-Unis, 9 Janvier 2010/13 Janvier 2010.
Ensemble dans le Challenge Programme Generation.
Glaszmann Jean-Christophe.
2010.
In : Modèle de laboratoire sans murs : le labex Brésilien = A model laboratory without walls : the Brazilian Labex. Savidan Yves (ed.), Arcuri Pedro (ed.). Agropolis. Montpellier : Agropolis International , 14.
(Les dossiers d'Agropolis International, 10)
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A GCP challenge initiative: Drought tolerance improvement for sorghum in Africa : [Abstract W144].
Rami Jean-François, Témé Niaba, Vaksmann Michel, Lespinasse Denis, Billot Claire, Bouchet Sophie, Hash Charles Tom, Deshpande Santosh, Ramu Punna, Senthilvel S., Upadhyaya Hari D., Weltzien Eva, Rattunde H. Frederick W., Jordan David R., Borrell Andrew, Paterson Andrew H., Kresovich Stephen, Glaszmann Jean-Christophe, Niangado Oumar.
2010.
In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XVIIIth Conference, San Diego, CA (USA), January 09-13, 2010. s.l. : s.n. , Résumé
Plant and Animal Genomes Conference. 18, San Diego, États-Unis, 9 Janvier 2010/13 Janvier 2010.
Genomics-based exploitation of germplasm diversity in major tropical crops.
Glaszmann Jean-Christophe, Ahmadi Nourollah, Courtois Brigitte, Bouchet Sophie, Deu Monique, Hippolyte Isabelle, Perrier Xavier, Lanaud Claire, Seguin Marc, Le Guen Vincent, Foncéka Daniel, Rami Jean-François, Billot Claire, Mc Grath Sarah, Noyer Jean-Louis.
2010.
In : 5th European Plant Science Organisation (EPSO) Conference "Plants for life", 29 August - 02 September 2010, Olos, Finland. s.l. : s.n. , Résumé, 1 p.
European Plant Science Organisation (EPSO) Conference. 5, Olos, Finlande, 28 Août 2010/2 Septembre 2010.
More genomic resources for less-studied crops.
Varshney Rajeev K., Glaszmann Jean-Christophe, Leung Hei, Ribaut Jean-Marcel.
2010.
Trends in Biotechnology, 28 (9) : 452-460.
Multiple scale analysis of genetic diversity in sorghum.
Deu Monique, Barnaud Adeline, Barro-Kondombo Clarisse Pulchérie, Bouchet Sophie, De Alencar Figueiredo Lucio Flavio, Sagnard Fabrice, Glaszmann Jean-Christophe.
2010.
In : Final program and abstracts of the 2nd International Symposium on Genomics of Plant Genetic Resources, Bologna, Italy, 24-27 April 2010. Rome : Bioversity International , Résumé, 39.
International Symposium on Genomics of Plant Genetic Resources. 2, Bologne, Italie, 24 Avril 2010/27 Avril 2010.
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Ressources génétiques, analyse du génome et amélioration variétale de l'arachide.
Rami Jean-François, Foncéka Daniel, Bertioli Soraya, Bertioli David J., Ndoye Ousmane, Glaszmann Jean-Christophe.
2010.
In : Modèle de laboratoire sans murs : le labex Brésilien = A model laboratory without walls : the Brazilian Labex. Savidan Yves (ed.), Arcuri Pedro (ed.). Agropolis. Montpellier : Agropolis International , 15.
(Les dossiers d'Agropolis International, 10)
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Some data on allele diversity at orthologous candidate genes in GCP crops : [P234].
This Dominique, Courtois Brigitte, Philippe Romain, Mournet Pierre, Billot Claire, Glaszmann Jean-Christophe, Schaftleiner Roland, Simon Reinhard, Rojas Percy, Bonierbale Merideth, Varshney Rajeev K., Hash Charles Tom, Upadhyaya Hari D., Nayak Spurthi, Brunel Dominique, El-Malki Redouane, Le Paslier Marie Christine, McNally Kenneth L., Baum Michaël, Choumane Wafaa, Von Korff Maria, Blair Matthew, Fregene Martin.
2010.
In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XVIIIth Conference, San Diego, CA (USA), January 09-13, 2010. s.l. : s.n. , Résumé
Plant and Animal Genomes Conference. 18, San Diego, États-Unis, 9 Janvier 2010/13 Janvier 2010.
Structure, allelic diversity and selection of Asr genes, candidate for drought tolerance, in Oryza sativa L. and wild relatives.
Philippe Romain, Courtois Brigitte, McNally Kenneth L., Mournet Pierre, El-Malki Redouane, Le Paslier Marie Christine, Fabre Denis, Billot Claire, Brunel Dominique, Glaszmann Jean-Christophe, This Dominique.
2010.
Theoretical and Applied Genetics, 121 (4) : 769-787.
Using crop genetic diversity to address stress tolerance in agriculture.
Glaszmann Jean-Christophe, Ribaut Jean-Marcel, Leung Hei.
2010.
In : HUGO-OECD Symposium on Genomics and Bioeconomy, 17 may 2010, Montpellier, France. Human Genome Organisation (HUGO) ; Organisation for Economic Co-operation and Development (OECD). s.l. : s.n. , Résumé, 1 p.
HUGO-OECD Symposium on Genomics and Bioeconomy, Montpellier, France, 17 Mai 2010.
Variability of grain quality in sorghum: association with polymorphism in Sh2, Bt2, SssI, Ae1, Wx and O2.
De Alencar Figueiredo Lucio Flavio, Sine Bassirou, Chantereau Jacques, Mestres Christian, Fliedel Geneviève, Rami Jean-François, Glaszmann Jean-Christophe, Deu Monique, Courtois Brigitte.
2010.
Theoretical and Applied Genetics, 121 (6) : 1171-1185.
A large est resource for Theobroma cacao including cDNAS isolated from various organs and under various biotic and abiotic stresses.
Lanaud Claire, Fouet Olivier, Gramacho Karina Peres, Argout Xavier, Legavre Thierry, Sabau Xavier, Risterucci Ange-Marie, Wincker Patrick, Da Silva Corinne, Loor Rey Gaston, Lopes Uilson Vanderlei, Cascardo Julio Cezar M., Courtois Brigitte, Kuhn David N., Schnell Raymond J., Bailey Bryan, Babin Régis, Sounigo Olivier, Ducamp Michel, Paulin Didier, Deberdt Peninna, Verica Joseph, Guiltinan Mark J., Alemanno Laurence, Machado Regina, Phillips Wilbert, Micheli Fabienne, Da Silva Gesteira Abelmon, Clément Didier, Maximova Siela N., Boccara Michel, Butler David R., Rosenquist Eric, Gilmour Martin, Glaszmann Jean-Christophe.
2010.
In : 15th International Cocoa Research Conference : cocoa productivity, quality, profitability, human health and the environment = 15e Conférence internationale sur la recherche cacaoyère : Productivité, qualité, rentabilité du cacao, santé humaine et environnement ; 15 Conferencia Internacional de Pesquisas em Cacau. Cacau : produtividade, qualidade, rentabilidade, saude humanna e amb. Lagos : Cocoa Producers' Alliance , 185-191.
Conférence internationale sur la recherche cacaoyère. 15, San José, Costa Rica, 9 Octobre 2006/14 Octobre 2006.
A saturated SSR/DArT linkage map of Musa acuminata addressing genome rearrangements among bananas.
Hippolyte Isabelle, Bakry Frédéric, Seguin Marc, Gardes Laëtitia, Rivallan Ronan, Risterucci Ange-Marie, Jenny Christophe, Perrier Xavier, Carreel Françoise, Argout Xavier, Piffanelli Pietro, Khan Imtiaz A., Miller Roberto Neil Gerard, Pappas Junior Georgios, Mbéguié-A-Mbéguié Didier, Matsumoto Takashi, De Bernardinis Véronique, Huttner Eric, Kilian Andrzej, Baurens Franc-Christophe, D'Hont Angélique, Côte François-Xavier, Courtois Brigitte, Glaszmann Jean-Christophe.
2010.
BMC Plant Biology, 10 (65), 18 p.
Development and assessment of Diversity Arrays Technology for high-throughput DNA analyses in Musa.
Risterucci Ange-Marie, Hippolyte Isabelle, Perrier Xavier, Xia Ling, Caig Vanessa, Evers Margaret, Huttner Eric, Kilian Andrzej, Glaszmann Jean-Christophe.
2009.
Theoretical and Applied Genetics, 119 (6) : 1093-1103.
Genetic mapping of wild introgressions into cultivated peanut: a way toward enlarging the genetic basis of a recent allotetraploid.
Foncéka Daniel, Hodo-Abalo Tossim, Rivallan Ronan, Faye Issa, Ndoye Sall Mbaye, Ndoye Ousmane, Favero Alessandra P., Bertioli David J., Glaszmann Jean-Christophe, Courtois Brigitte, Rami Jean-François.
2009.
BMC Plant Biology, 9 (103), 13 p.
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Geographic and genetic structure of African oil palm diversity suggests new approaches to breeding.
Cochard Benoît, Adon Benjamin, Rekima Samah, Billotte Norbert, Desmier De Chenon Roch, Koutou Anatole, Nouy Bruno, Omoré Alphonse, Razak Purba, Glaszmann Jean-Christophe, Noyer Jean-Louis.
2009.
Tree Genetics and Genomes, 5 (3) : 493-504.
Insights into the genome of Musa (banana), a giant herb bearing fleshy fruits.
D'Hont Angélique, Piffanelli Pietro, Lescot Magali, Town Christopher, Leebens-Mack Jim, Blanc Guillaume, Souza Manoel, Pappas Junior Georgios, Roux Nicolas, Glaszmann Jean-Christophe, Sasaki Takuji.
2009.
In : Proceedings of the 9th International Plant Molecular Biology Congress, October 25-30, 2009, St Louis, USA. by Pierre Gustafon (ed.). Lancaster : DEStech Publications , Résumé, 219.
ISBN 978-1-60595-018-1 IPMB Congress. 9, St Louis, États-Unis, 25 Octobre 2009/30 Octobre 2009.
L'intégration, art ou science ?
Chevassus-au-Louis Bernard, Génard Michel, Glaszmann Jean-Christophe, Habib Robert, Houllier François, Lancelot Renaud, Malézieux Eric, Muchnik José.
2009.
In : Colloque international Inra-Cirad : partenariat, innovation, agriculture = INRA-CIRAD Open Science Network Meeting : partnerships, innovation, agriculture. Kammili Trish (ed.), Brossier Jacques (ed.), Hubert Bernard (ed.), Tourrand Jean-François (ed.). INRA, CIRAD. Paris : IFRAI , 132-157.
Colloque international INRA-CIRAD partenariat, innovation, agriculture, Paris, France, 3 Juin 2008.
Linkage disequilibrium mapping and tagging in sugarcane : [Abstract W233].
Glaszmann Jean-Christophe, Raboin Louis-Marie, Costet Laurent, Hoarau Jean-Yves, Butterfield Mike, D'Hont Angélique.
2009.
In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XVII Conference, San Diego, CA (USA), January 10-14, 2009. s.l. : s.n. , Résumé
Plant and Animal Genomes Conference. 17, San Diego, États-Unis, 10 Janvier 2009/14 Janvier 2009.
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Phylogeographic evidence of crop neo-diversity in Sorghum : [Abstract W101].
De Alencar Figueiredo Lucio Flavio, Calatayud Caroline, Dupuits Céline, Billot Claire, Rami Jean-François, Brunel Dominique, Perrier Xavier, Courtois Brigitte, Deu Monique, Glaszmann Jean-Christophe.
2009.
In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XVII Conference, San Diego, CA (USA), January 10-14, 2009. s.l. : s.n. , Résumé
Plant and Animal Genomes Conference. 17, San Diego, États-Unis, 10 Janvier 2009/14 Janvier 2009.
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Analysis of genome-wide linkage disequilibrium in the highly polyploid sugarcane.
Raboin Louis-Marie, Pauquet Jérôme, Butterfield Mike, D'Hont Angélique, Glaszmann Jean-Christophe.
2008.
Theoretical and Applied Genetics, 116 (5) : 701-714.
Diploid/polyploid syntenic shuttle mapping and haplotype-specific chromosome walking toward a rust resistance gene (Bru1) in highly polyploid sugarcane (2n ~ 12x ~ 115).
Le Cunff Loïc, Garsmeur Olivier, Raboin Louis-Marie, Pauquet Jérôme, Telismart Hugues, Selvi Athiappan, Grivet Laurent, Philippe Romain, Begum Dilara, Deu Monique, Costet Laurent, Wing Rod A., Glaszmann Jean-Christophe, D'Hont Angélique.
2008.
Genetics, 180 (1) : 649-660.
Insights into the Musa genome : Syntenic relationships to rice and between Musa species.
Lescot Magali, Piffanelli Pietro, Ciampi Ana, Ruiz Manuel, Blanc Guillaume, Leebens-Mack Jim, Da Silva Felipe, Santos Candice M.R., D'Hont Angélique, Garsmeur Olivier, Vilarinhos Alberto Duarte, Kanamori Hiroyuki, Matsumoto Takashi, Ronning Catherine, Cheung Foo, Haas Brian, Althoff Ryan, Arbogast Tammy, Hine Erin, Pappas Junior Georgios, Sasaki Takuji, Souza Manoel, Miller Roberto Neil Gerard, Glaszmann Jean-Christophe, Town Christopher.
2008.
BMC Genomics, 9 (58), 20 p.
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International programs and the use of modern biotechnologies for crop improvement.
Ribaut Jean-Marcel, Monneveux Philippe, Glaszmann Jean-Christophe, Leung Hei, Van Hintum Theo, De Vicente M. Carmen.
2008.
In : Genomics of tropical crop plants. Moore Paul H. (ed.), Ming Ray (ed.). New York : Springer [Etats-Unis] , 21-61.
(Plant Genetics and Genomics: Crops and Models, 1)
ISBN 978-0-387-71218-5
Musa genetic mapping.
Hippolyte Isabelle, Seguin Marc, Bakry Frédéric, Gardes Laëtitia, Baurens Franc-Christophe, Miller Roberto Neil Gerard, Khan Imtiaz A., Jenny Christophe, Carreel Françoise, Huttner Eric, Perrier Xavier, Kilian Andrzej, Risterucci Ange-Marie, Glaszmann Jean-Christophe.
2008.
In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XVIth Conference, San Diego, CA (USA), January 12-16, 2008. s.l. : s.n. , Résumé
Plant and Animal Genomes Conference. 16, San Diego, États-Unis, 12 Janvier 2008/16 Janvier 2008.
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Phylogeographic evidence of crop neodiversity in sorghum.
De Alencar Figueiredo Lucio Flavio, Calatayud Caroline, Dupuits Céline, Billot Claire, Rami Jean-François, Brunel Denys, Perrier Xavier, Courtois Brigitte, Deu Monique, Glaszmann Jean-Christophe.
2008.
Genetics, 179 (2) : 997-1008.
Rapport de mission à La Réunion des 3 DS du Cirad, 10-18 juin 2008.
Caron Patrick, Habib Robert, Glaszmann Jean-Christophe.
2008.
Montpellier : CIRAD, 16 p.
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Sugarcane: A major source of sweetness, alcohol, and bio-energy.
D'Hont Angélique, Mendes Souza Glaucia, Menossi Marcelo, Vincentz Michel, Van Sluys Marie-Anne, Glaszmann Jean-Christophe, Ulian Eugenio C..
2008.
In : Genomics of tropical crop plants. Moore Paul H. (ed.), Ming Ray (ed.). New York : Springer [Etats-Unis] , 483-513.
(Plant Genetics and Genomics: Crops and Models, 1)
ISBN 978-0-387-71218-5
Adding value to cocoa (Theobroma cacao L.) germplasm information with domestication history and admixture mapping.
Marcano Maria, Pugh Tatiana, Cros Emile, Morales Sonia, Portillo Elvis, Courtois Brigitte, Glaszmann Jean-Christophe, Engels Johannes M.M., Phillips Wilbert, Astorga Carlos, Risterucci Ange-Marie, Fouet Olivier, Gonzalez Ventura, Rosenberg Kai, Vallat Isabelle, Dagert Manuel, Lanaud Claire.
2007.
Theoretical and Applied Genetics, 114 (5) : 877-884.
Amélioration des plantes et intensification écologique.
Glaszmann Jean-Christophe.
2007.
In : L'intensification écologique : du concept au terrain, quelles démarches de recherche mettre en oeuvre ?. CIRAD. Montpellier : CIRAD , Résumé, 1 p.
Rencontres du Cirad 2007 journée agronomie, Montpellier, France, 30 Août 2007.
Establishment of diversity arrays technology for whole-genome profiling of banana.
Huttner Eric, Risterucci Ange-Marie, Hippolyte Isabelle, Caig Vanessa, Carlig Jason, Evers Margaret, Uszynski Grzegorz, Wenzl Peter, Glaszmann Jean-Christophe, Kilian Andrzej.
2007.
In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XVth Conference, San Diego, CA (USA), January 13-17, 2007. s.l. : s.n. , Résumé
Plant and Animal Genomes Conference. 15, San Diego, États-Unis, 13 Janvier 2007/17 Janvier 2007.
Exploring genetic diversity in sorghum.
Rami Jean-François, Alencar Lucio, Bouchet Sophie, Billot Claire, Deu Monique, Hash Charles Tom, Li Yu, Kilian Andrzej, Courtois Brigitte, Glaszmann Jean-Christophe.
2007.
In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XVth Conference, San Diego, CA (USA), January 13-17, 2007. s.l. : s.n. , Résumé
Plant and Animal Genomes Conference. 15, San Diego, États-Unis, 13 Janvier 2007/17 Janvier 2007.
Genome-wide linkage disequilibrium analysis and association study for smut resistance in the highly polyploid genome of sugarcane.
Pauquet Jérôme, Raboin Louis-Marie, Costet Bernard, Butterfield Mike, Glaszmann Jean-Christophe, D'Hont Angélique.
2007.
In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XVth Conference, San Diego, CA (USA), January 13-17, 2007. s.l. : s.n. , Résumé
Plant and Animal Genomes Conference. 15, San Diego, États-Unis, 13 Janvier 2007/17 Janvier 2007.
Gérer durablement la biodiversité tropicale et subtropicale : îles.
Glaszmann Jean-Christophe.
2007.
In : Ecosystèmes et sociétés : concevoir une recherche pour un développement durable. Loyat Jacques (ed.). CEMAGREF, CIRAD, IFREMER, INRA, IRD, MNHN. Montpellier : IRD , 163-167.
ISBN 978-2-7099-1627-1
Orthologous comparison in a gene-rich region among grasses reveals stability in the sugarcane polyploid genome.
Jannoo Nazeema, Grivet Laurent, Chantret Nathalie, Garsmeur Olivier, Glaszmann Jean-Christophe, Arruda Paulo, D'Hont Angélique.
2007.
Plant Journal, 50 (4) : 574-585.
Progress of musa (banana and plantain) genetic diversity and genome analysis at Agropolis-CIRAD.
Hippolyte Isabelle, Bakry Frédéric, Carreel Françoise, Jenny Christophe, Arnaud Elizabeth, Roux Nicolas, Glaszmann Jean-Christophe, Risterucci Ange-Marie, Garsmeur Olivier, D'Hont Angélique, Baurens Franc-Christophe.
2007.
In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XVth Conference, San Diego, CA (USA), January 13-17, 2007. s.l. : s.n. , Résumé
Plant and Animal Genomes Conference. 15, San Diego, États-Unis, 13 Janvier 2007/17 Janvier 2007.
Whole genome scan and linkage disequilibrium evaluation on a sorghum core collection.
Bouchet Sophie, Billot Claire, Deu Monique, Rami Jean-François, Xia Ling, Kilian Andrzej, Glaszmann Jean-Christophe.
2007.
In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XVth Conference, San Diego, CA (USA), January 13-17, 2007. s.l. : s.n. , Résumé
Plant and Animal Genomes Conference. 15, San Diego, États-Unis, 13 Janvier 2007/17 Janvier 2007.
A large EST resource for theobroma cacao L.
Lanaud Claire, Fouet Olivier, Gramacho Karina Peres, Argout Xavier, Legavre Thierry, Sabau Xavier, Risterucci Ange-Marie, Wincker Patrick, Da Silva Corinne, Loor Solorzano Rey Gaston, Cascardo Julio Cezar M., Courtois Brigitte, Kuhn David N., Schnell Rey J., Babin Régis, Sounigo Olivier, Ducamp Michel, Deberdt Peninna, Verica Joseph, Guiltinan Mark J., Alemanno Laurence, Machado Regina, Philips Wilbert, Maximova Siela N., Rosenquist Eric, Gilmour Martin, Glaszmann Jean-Christophe.
2007.
In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XVth Conference, San Diego, CA (USA), January 13-17, 2007. s.l. : s.n. , Résumé
Plant and Animal Genomes Conference. 15, San Diego, États-Unis, 13 Janvier 2007/17 Janvier 2007.
Analyse et prédiction des patrons de déséquilibre de liaison dans les collections de ressources génétiques de plantes pérennes ou annuelles, autogames ou allogames.
Seguin Marc, Attard Agnès, Bataillon Thomas, Billot Claire, Cenci Alberto, Chantret Nathalie, Courtois Brigitte, David Jacques, Deu Monique, El Azhari Najoi, Glaszmann Jean-Christophe, Glemin Sylvain, Haudry Annabelle, Le Guen Vincent, Maynadier Marie, Pomies Virginie, Ronfort Joëlle, Tsitronne Anne, Weber Christelle.
2006.
In : Les ressources génétiques : des ressources partagées : 6ème Colloque national BRG, La Rochelle, 2-4 octobre 2006. BRG. Paris : BRG , 57-74.
(Les Actes du BRG, 1768-2215, 6)
Colloque national BRG Ressources génétiques. 6, La Rochelle, France, 2 Octobre 2006/4 Octobre 2006.
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DArT, a whole genome profiling method for high-troughput genotyping of Musa.
Risterucci Ange-Marie, Hippolyte Isabelle, Caig Vanessa, Carling J., Evers Margaret, Uszynski Grzegorz, Wenzl Peter, Xia L., Huttner Eric, Glaszmann Jean-Christophe, Kilian Andrzej.
2006.
In : Plant Genomics European Meetings, Venice, 2006. Bologne : Ed. Avenue media , Résumé, 154.
Plant Genomics European Meetings. 5, Venise, Italie, 11 Octobre 2006/14 Octobre 2006.
Diversity arrays technology (DArT) : An efficient plateform for whole-genome profiling of crops.
Wongtiem Prapit, Perera Chandrika, Risterucci Ange-Marie, Xia Ling, Patarapuwadol Sujin, Carlig Jason, Caig Vanessa, Evers Margaret, Uszynski Grzegorz, Wenzl Peter, Huttner Eric, Fregene Martin, De Vicente M. Carmen, Glaszmann Jean-Christophe, Kilian Andrzej.
2006.
In : XIV Conference Plant and Animal Genome Conference, San Diego, Etats-Unis, 14-18 january 2006. s.l. : s.n. , Diaporama, (21 vues)
Plant and Animal Genomes Conference. 14, San Diego, États-Unis, 14 Janvier 2006/18 Janvier 2006.
Le challenge Programme Génération (CPG).
Glaszmann Jean-Christophe.
2006.
In : La France et le CGIAR : delivering scientific results for agricultural development = France and the CGIAR : delivering scientific results for agricultural development. Rocchi Daniel (ed.), Despréaux Denis (ed.), Frison Emile A. (ed.), Hubert Bernard (ed.), Lantin Manuel M. (ed.). Washington : CGIAR , 102-105.
Le décryptage des origines et de la diversité génétique du riz cultivé.
Second Gérard, Glaszmann Jean-Christophe, Panaud Olivier.
2006.
In : La France et le CGIAR : delivering scientific results for agricultural development = France and the CGIAR : delivering scientific results for agricultural development. Rocchi Daniel (ed.), Despréaux Denis (ed.), Frison Emile A. (ed.), Hubert Bernard (ed.), Lantin Manuel M. (ed.). Washington : CGIAR , 11-14.
Le regard de la génomique sur la diversité naturelle des plantes cultivées.
David Jacques, Loudet Olivier, Glaszmann Jean-Christophe.
2006.
Biofutur (266) : 22-27.
Molecular evidence of sugarcane evolution and domestication.
Grivet Laurent, Glaszmann Jean-Christophe, D'Hont Angélique.
2006.
In : Darwin's harvest : New approaches to the origins, evolution, and conservation of crops. Motley Timothy J. (ed.), Zerega Nyree (ed.), Cross Hugh (ed.). New York : Columbia University Press , 49-66.
ISBN 0-231-13316-2
Sugarcane improvement through breeding and biotechnology.
Ming Ray, Moore Paul H., Wu Kuo-Kao, D'Hont Angélique, Glaszmann Jean-Christophe, Tew Thomas L..
2006.
In : Plant breeding reviews, volume 27. Janick Jules (ed.). New York : John Wiley , 15-118.
(Plant Breeding Reviews, 27)
ISBN 978-0-471-73213-6
Validation of diversity arrays technology (DArT) as a plateform for whole-genome profiling in orphan crops.
Wongtiem Prapit, Perera Chandrika, Risterucci Ange-Marie, Xia Ling, Patarapuwadol Sujin, Carlig Jason, Caig Vanessa, Evers Margaret, Uszynski Grzegorz, Huttner Eric, Wenzl Peter, Fregene Martin, De Vicente M. Carmen, Glaszmann Jean-Christophe, Kilian Andrzej.
2006.
In : XIV Conference Plant and Animal Genome Conference, 2006-01. 14-18, San Diego, Etats-Unis. s.l. : s.n. , 1 p.
Plant and Animal Genomes Conference. 14, San Diego, États-Unis, 14 Janvier 2006/18 Janvier 2006.
Analysis of the Musa genome from BAC sequencing and its comparison with rice.
Piffanelli Pietro, Ciampi Ana, Ruiz Manuel, Rodrigues da Silva Felipe, Lescot Magali, Papas Georgios J., Ronning Catherine, Haas Brian, Wortman Jennifer, Frison Emile A., Roux Nicolas, Miller Roberto Neil Gerard, Côte François-Xavier, D'Hont Angélique, Souza Manoel, Glaszmann Jean-Christophe, Town Christopher.
2005.
In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XIIIth Conference, San Diego, CA (USA), January 15-19, 2005. s.l. : s.n. , Résumé
Plant and Animal Genomes Conference. 13, San Diego, États-Unis, 15 Janvier 2005/19 Janvier 2005.
Construction and characterization of a Coffea canephora BAC library to study the organization of sucrose biosynthesis genes.
Leroy Thierry, Marraccini Pierre, Dufour Magali, Montagnon Christophe, Lashermes Philippe, Sabau Xavier, Ferreira Lucia Pires, Jourdan Isabelle, Pot David, Andrade Alan Carvalho, Glaszmann Jean-Christophe, Vieira Luiz Gonzaga Esteves, Piffanelli Pietro.
2005.
Theoretical and Applied Genetics, 111 (6) : 1032-1041.
Gene allelic diversity in the genomic region of the Stay-Green QTL-2 in sorghum.
Foncéka Daniel, Billot Claire, Rivallan Ronan, Courtois Brigitte, Deu Monique, Glaszmann Jean-Christophe, Rami Jean-François.
2005.
In : Annual Research Meeting Generation Challenge Programme, Rome, Italy, September 29 to October 1, 2005. s.l. : s.n. , 1 p.
Annual Research Meeting Generation Challenge Programme, Rome, Italie, 29 Septembre 2005/1 Octobre 2005.
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New resources and integrated maps for IR64 x Azucena, a reference population in rice : [P361].
Ahmadi Nourollah, Dubreuil-Tranchant Christine, Courtois Brigitte, Foncéka Daniel, This Dominique, Mc Couch Susan R., Lorieux Mathias, Glaszmann Jean-Christophe, Ghesquière Alain.
2005.
In : 5th International Rice Genetics Symposium (A platform for exploring developments in rice genetics and their applications) and 3rd International Symposium of Rice Functional Genomics. Abstract. IRRI. Manila : IRRI , Résumé, 237.
International Rice Genetics Symposium. 5, Manille, Philippines, 19 Novembre 2005/23 Novembre 2005.
A framework for genetic diversity analysis in the generation Cp.
Glaszmann Jean-Christophe.
2005.
In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XIIIth Conference, San Diego, CA (USA), January 15-19, 2005. s.l. : s.n. , Résumé
Plant and Animal Genomes Conference. 13, San Diego, États-Unis, 15 Janvier 2005/19 Janvier 2005.
A step towards association studies for amylose and protein contents in sorghum.
De Alencar Figueiredo Lucio Flavio, Courtois Brigitte, Deu Monique, Rami Jean-François, Fliedel Geneviève, Mestres Christian, Davrieux Fabrice, Chantereau Jacques, Garsmeur Olivier, Grabulos Joël, Fallet Véronique, Glaszmann Jean-Christophe.
2005.
In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XIIIth Conference, San Diego, CA (USA), January 15-19, 2005. s.l. : s.n. , Résumé
Plant and Animal Genomes Conference. 13, San Diego, États-Unis, 15 Janvier 2005/19 Janvier 2005.
Comparative analysis of Musa and rice genome structure and organization.
Piffanelli Pietro, Ciampi Ana, Ruiz Manuel, Rodrigues da Silva Felipe, Papas Georgios J., Ronning Catherine, Haas Brian, Wortman Jennifer, Frison Emile A., Roux Nicolas, Miller Roberto Neil Gerard, Côte François-Xavier, D'Hont Angélique, Souza Manoel, Glaszmann Jean-Christophe, Town Christopher.
2004.
In : First International congress on Musa: harnessing research for improved livelihoods, 6-9 July 2004, Penang, Malaysia. Abstract guide. Picq Claudine (ed.), Vézina Anne (ed.). INIBAP, MARDI, BAPNET, University of Malaya, University of Putra, IPGRI. Montpellier : INIBAP , Résumé, 21.
International Congress on Musa: Harnessing Research for Improved Livelihoods. 1, Penang, Malaisie, 6 Juillet 2004/9 Juillet 2004.
Construction of a sugarcane BAC contig the target resistance gene Bru1 through exploitation of synteny with sorghum and rice [Workshop : ICSB. W120].
Le Cunff Loïc, Garsmeur Olivier, Raboin Louis-Marie, Grivet Laurent, Glaszmann Jean-Christophe, D'Hont Angélique.
2004.
. s.l. : s.n.
Plant and Animal Genomes Conference. 12, San Diego, États-Unis, 10 Janvier 2004/14 Janvier 2004.
Construction of an Oryza glaberrima TAC library [larges insert librarie. P 143].
Amoussou Pierre-Louis, Guiderdoni Emmanuel, Snape John W.S., Glaszmann Jean-Christophe, Bancroft Ian, Piffanelli Pietro.
2004.
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Plant and Animal Genomes Conference. 12, San Diego, États-Unis, 10 Janvier 2004/14 Janvier 2004.
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Genetic and physical mapping of resistance and defence gene analogs colocalised with QTL of resistance for Phytophthora in cocoa [ fruit trees. P 600].
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High throughput T-DNA insertion mutagenesis in rice : A first step towards in silico reverse genetics.
Sallaud Christophe, Gay Céline, Larmande Pierre, Bes Martine, Piffanelli Pietro, Piegu Benoît, Droc Gaëtan, Regad Farid, Bourgeois Emmanuelle, Meynard Donaldo, Perin Christophe, Sabau Xavier, Ghesquière Alain, Glaszmann Jean-Christophe, Delseny Michel, Guiderdoni Emmanuel.
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Construction of large insert BAC library from the B genome of banana (Musa balbisiana).
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ESTs as a source for sequence polymorphism discovery in sugarcarne : example of the Adh genes.
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Musagenomics: Creation of a BAC-based platform for banana genomics [S04-16].
Piffanelli Pietro, Dolezel Jaroslav, Sabau Xavier, Vilarinhos Alberto Duarte, Souza Manoel, Ciampi Ana, Noa-Carrazana Juan Carlos, Safar Jan, Town Christopher, Mbéguié-A-Mbéguié Didier, D'Hont Angélique, Chalhoub Boulos, Careel Françoise, Lagoda Pierre, Côte François-Xavier, Glaszmann Jean-Christophe, Frison Emile A..
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Progress in genetic mapping of sugarcane smut resistance.
Raboin Louis-Marie, Hoarau Jean-Yves, Costet Laurent, Telismart Hugues, Glaszmann Jean-Christophe, D'Hont Angélique.
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Bactrop: A BAC-based platform for physical mapping of tropical species.
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Detection of SNP from EST data in sugarcane.
Grivet Laurent, Glaszmann Jean-Christophe, Arruda Paulo.
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Plant, Animal and Microbe Genomes Conference. 10, San Diego, États-Unis, 12 Janvier 2002/16 Janvier 2002.
Exploitation of sorghum molecular for map-based cloning of a major rust resistance gene in sugarcane.
D'Hont Angélique, Le Cunff Loïc, Garsmeur Olivier, Paulet Florence, Begum Dilara, Wing Rod A., Glaszmann Jean-Christophe.
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Final report on the ICSB project " Map-based cloning of a rust resistance gene in sugarcane. I ".
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Genetic dissection of a modern sugarcane cultivar (Saccharum spp.). I. Genome mapping with AFLP markers.
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QTL tagging in sorghum with the view to cloning genes of generic interest : development of an SSR and BAC molecular back-up.
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(Les dossiers d'Agropolis International, 1)
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Undertaking genetic mapping of sugarcane smut resistance.
Raboin Louis-Marie, Offmann Bernard Gilles, Hoarau Jean-Yves, Notaise Julien, Costet Laurent, Telismart Hugues, Roques Danièle, Rott Philippe, Glaszmann Jean-Christophe, D'Hont Angélique.
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Walk towards a major rust resistance gene in sugarcane cultivar R570 (2n=ca115).
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A direct comparison between the genetic maps of sorghum and rice.
Ventelon M., Deu Monique, Garsmeur Olivier, Doligez Agnès, Ghesquière Alain, Lorieux Mathias, Rami Jean-François, Glaszmann Jean-Christophe, Grivet Laurent.
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Theoretical and Applied Genetics, 102 : 379-386.
Application of synteny across Poaceae to determine the map location of a sugarcane rust resistance gene.
Asnaghi Carole, Paulet Florence, Kaye Claudia, Grivet Laurent, Deu Monique, Glaszmann Jean-Christophe, D'Hont Angélique.
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Co-operation with developing countries in the field of biotechnologies : the Agropolis plant genome technolocal platform.
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Co-opération with developing countries in the field of biotechnologies : the Agropolis plant genome technological platform.
Delseny Michel, Glaszmann Jean-Christophe, Hainnaux Guy.
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Entretiens d'Agropolis : Apport des outils biotechnologiques à l'amélioration variétale des plantes méditerranéennes et tropicales. 9, Montpellier, France, 22 Mai 2000.
Comparison of three strategies for sampling a core collection of the Icrisat sorghum landrace collection.
Grenier Cécile, Deu Monique, Bramel Cox Paula Jane, Glaszmann Jean-Christophe, Kresovich Stephen, Hamon Perla.
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Plant and Animal Genomes Conference. 8, San Diego, États-Unis, 9 Janvier 2000/12 Janvier 2000.
Progress in genetic analysis of resistance to rust and leaf scald in sugarcane.
Offmann Bernard Gilles, Raboin Louis-Marie, Asnaghi Carole, Kaye Claudia, Ruffel Sandrine, Roques Danièle, Girard Jean-Claude, Notaise Julien, Saumtally A. Salem, Dookun A., Grivet Laurent, Rott Philippe, Glaszmann Jean-Christophe, D'Hont Angélique.
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Use of molecular markers in the sorghum breeding program at CIRAD.
Deu Monique, Grivet Laurent, Trouche Gilles, Barro Clarisse, Ratnadass Alain, Diabaté M., Hamada Mohamed Ag, Fliedel Geneviève, Rami Jean-François, Grenier Cécile, Hamon Perla, Glaszmann Jean-Christophe, Chantereau Jacques.
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Development of microsatellite enriched libraries in several tropical species.
Gay Céline, Rodier-Goud Marguerite, Kaye Claudia, Pieretti Isabelle, Billotte Norbert, Baurens Franc-Christophe, Lebrun Patricia, Seguin Marc, D'Hont Angélique, Glaszmann Jean-Christophe, Risterucci Ange-Marie.
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Development of microsatellites markers in sugarcane: constraints related to polyploidy.
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Linkage disequilibrium among modern sugarcane cultivars.
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Microsatellites in rice : characterization of the genetic resources for varieties adapted to European conditions.
Luce Claude, Risterucci Ange-Marie, Noyer Jean-Louis, Feyt Henri, Tharreau Didier, Glaszmann Jean-Christophe.
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Montpellier : CIRAD, 1 affiche
Molecular investigation of the genetic base of sugarcane cultivars.
Jannoo Nazeema, Grivet Laurent, Seguin Marc, Paulet Florence, Domaingue Robert, Rao P.S., Dookun A., D'Hont Angélique, Glaszmann Jean-Christophe.
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Utilization of the syntenic relationship between sugarcane, sorghum, maize and rice to saturate a targeted area in sugarcane.
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Plant and Animal Genomes Conference. 7, San Diego, États-Unis, 17 Janvier 1999/21 Janvier 1999.
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The interspecific genome structure of cultivated banana, Musa spp. revealed by flow cytometry and genomic DNA in situ hybridisation.
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The isolation and characterization of microsatellites in surgarcane.
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