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A high-density genetic map from a cacao F2 progeny and QTL detection for resistance to witches' broom disease. Chia Wong Julio Alfonso, Clément Didier, Mournet Pierre, dos Santos Nascimento Anadine, Solís Bonilla José Luis, Vanderlei Lopes Uilson, Pires José Luis, Peres Gramacho Karina. 2022. Tree Genetics and Genomes, 18:31, 14 p.

Feuille de route des recherches Cirad à 10 ans sur la filière Cacao. Ten Hoopen Gerben Martijn, Cilas Christian, Saj Stéphane, Argout Xavier, Boulanger Renaud, Carimentrand Aurélie, Cerdan Claire, Clément Didier, Dromard Marine, Harmand Jean-Michel, Jagoret Patrick, Muller Emmanuelle, Rapidel Bruno, De Romemont Aurelle, Rhone Bénédicte, Ribeyre Fabienne, Ruf François, Wibaux Thomas, Côte François-Xavier. 2021. Montpellier : CIRAD, 156 p.

A reference high-density genetic map of Theobroma grandiflorum (Willd. ex Spreng) and QTL detection for resistance to witches' broom disease (Moniliophthora perniciosa). Mournet Pierre, Beviláqua de Albuquerque Paulo Sérgio, Moysés Alves Rafael, Silva-Werneck Joseilde Oliveira, Rivallan Ronan, Marcellino Lucilia Helena, Clément Didier. 2020. Tree Genetics and Genomes, 16:89, 13 p.

Transferibilidade e mapeamento de microssatélites entre Theobroma cacao L. E Theobroma grandiflorum (WILLD. EX. SPRENG.) Schum. dos Santos Nascimento Anadine, Alves Rafael Moyses, de Sousa Silva Carlos Rogério, Beviláqua de Albuquerque Paulo Sérgio, Santos Lima Lemos Lívia, Peres Gramacho Karina, Clément Didier. 2019. AgroTropica, 31 (2) : 85-102.

The Guiana cacao genetic group (Theobroma cacao L.): A new core collection in French Guiana. Lachenaud Philippe, Clément Didier, Argout Xavier, Scalabrin Simone, Doare Fabien. 2018. Botany Letters, 165 (2) : 248-254.

Liste des clones de cacaoyers spontanés de Guyane (Theobroma cacao L.) pré-sélectionnés " candidats-élites ". Clément Didier, Lachenaud Philippe. 2018. Montpellier : CIRAD, 4 p.

Liste des clones de cacaoyers spontanés de Guyane (Theobroma cacao L.) pré-sélectionnés " candidats-élites ". Annexe au dossier Cacao. Clément Didier, Lachenaud Philippe. 2018. La Lettre du Conseil Scientifique du Parc Naturel Régional de Guyane (2), 4 p.

Deciphering the Theobroma cacao self-incompatibility system: from genomics to diagnostic markers for self-compatibility. Lanaud Claire, Fouet Olivier, Legavre Thierry, Lopes Uilson Vanderlei, Sounigo Olivier, Eyango Marie Claire, Mermaz Benoit, da Silva Marcos Ramos, Loor Solorzano Rey Gaston, Argout Xavier, Gyapay Gabor, Ebaiarrey Herman Ebai, Colonges Kelly, Sanier Christine, Rivallan Ronan, Mastin Géraldine, Cryer Nicholas, Boccara Michel, Verdeil Jean-Luc, Efombagn Mousseni Ives Bruno, Peres Gramacho Karina, Clément Didier. 2017. Journal of Experimental Botany, 68 (17) : 4775-4790.

Exploration of the T. cacao genome sequence to decipher the incompatibility system of Theobroma cacao and to identify diagnostic markers. Lanaud Claire, Fouet Olivier, Legavre Thierry, Lopes Uilson Vanderlei, Sounigo Olivier, Eyango Marie Claire, Mermaz Benoit, da Silva Marcos Ramos, Loor Solorzano Rey Gaston, Argout Xavier, Gyapay Gabor, Ebaiarrey Herman Ebai, Colonges Kelly, Sanier Christine, Rivallan Ronan, Mastin Géraldine, Cryer Nicholas, Boccara Michel, Efombagn Mousseni Ives Bruno, Gramacho Karina Peres, Clément Didier. 2017. In : Proceedings of the first International Symposium on Cocoa Research ISCR 2017. ICCO. Lima : ICCO, 11 p. International Symposium on Cocoa Research – ISCR 2017 : Promoting Advances in Research to Enhance the Profitability of Cocoa Farming. 1, Lima, Pérou, 13 Novembre 2017/17 Novembre 2017.

Genome size, cytogenetic data and transferability of EST-SSRs markers in wild and cultivated species of the genus Theobroma L. (Byttnerioideae, Malvaceae). da Silva Rangeline Azevedo, Souza Gustavo, Lemos Lívia Santos Lima, Lopes Uilson Vanderlei, Patrocinio Nara Geórgia Ribeiro Braz, Alves Rafael Moyses, Marcellino Lucilia Helena, Clément Didier, Micheli Fabienne, Gramacho Karina Peres. 2017. PloS One, 12 (2):e0170799, 15 p.

Genome-wide association mapping of sexual incompatibility genes in cacao (Theobroma cacao L.). da Silva Marcos Ramos, Clément Didier, Gramacho Karina Peres, Monteiro Wilson Reis, Argout Xavier, Lanaud Claire, Lopes Uilson Vanderlei. 2016. Tree Genetics and Genomes, 12 (3):62, 13 p.

Classical and "omics" approaches to control witches' broom (Moniliopthora perniciosa) disease of cacao [P0997]. Gramacho Karina Peres, Clément Didier, Pires José Luis, Vanderlei Lopes Uilson, Micheli Fabienne. 2015. In : Plant and Animal Genomes Conference XXIII Conference, San diego, United States, San Diego, United States, January 10-14, 2015. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genome Conference. 23, San Diego, États-Unis, 10 Janvier 2015/14 Janvier 2015.

Classical and "omics" approaches to control witches' broom disease of cacao [W120]. Peres Gramacho Karina, Pires José Luis, Clément Didier, Vanderlei Lopes Uilson, Micheli Fabienne. 2015. In : Plant and Animal Genomes Conference XXIII Conference, San diego, United States, San Diego, United States, January 10-14, 2015. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genome Conference. 23, San Diego, États-Unis, 10 Janvier 2015/14 Janvier 2015.

DICACAO. Diversité des cacaoyers spontanés de Guyane et des endophytes associés. Intérêt et utilisation dans la lutte contre les maladies : Programme Convergence 2007-2013, Région Guyane. Rapport final Mars 2014. Lachenaud Philippe, Clément Didier (collab.). 2014. Montpellier : CIRAD-BIOS, 15 p.

QTLs Detection under natural infection of Moniliophtora perniciosa in a cacao F2 progeny with Scavina-6 descendants. Feitosa Jucá Santos Francisca, Vanderlei Lopes Uilson, Pires José Luis, Melo G.R.P., Peres Gramacho Karina, Clément Didier. 2014. AgroTropica, 26 (1) : 65-72.

A protocol for large scale genomic DNA isolation for cacao genetics analysis. Ferreira Santos Rogério Mercês, Vanderlei Lopes Uilson, Clément Didier, Pires José Luis, Matos Lima Eline, Batista Messia Tamiles, Peres Gramacho Karina. 2014. African Journal of Biotechnology, 13 (7) : 814-820.

Application of genomics tools for cacao disease resistance : S04T07. Gramacho Karina Peres, Pires José Luis, Clément Didier, Lemos L.S.L., Lopes Uilson Vanderlei, Santos Rogério M.F., Gomes L.I.S., Ganem Rodrigo Sousa. 2013. In : Biotic and Abiotic Stress Tolerance in Plants: the Challenge for the 21st Century : Book of abstracts of the CIBA 2013. Brasileiro Ana Christina Miranda (ed.), Fortes Ferreira Claudia (ed.), Fernandez Diana (ed.), Micheli Fabienne (ed.), Coelho Filho M.A. (ed.), Marraccini Pierre (ed.). EMBRAPA, UESC, CIRAD, IRD. Brasilia : EMBRAPA, Résumé, 30. Workshop on Biotic and Abiotic Stress Tolerance in Plants: the Challenge for the 21st Century, Ilhéus-Bahia, Brésil, 6 Novembre 2013/8 Novembre 2013.

Genetic mapping and QTLs detection in a Theobroma grandiflora progeny : S04P01. Nascimento A.S., Alves Rafael Moyses, De Albuquerque P.S.B., Silva R.S., De Oliveira H.O., Dos Santos C.R., Kempner T., Dos Santos L.F., Marcellino L., Micheli Fabienne, Gramacho Karina Peres, Clément Didier. 2013. In : Biotic and Abiotic Stress Tolerance in Plants: the Challenge for the 21st Century : Book of abstracts of the CIBA 2013. Brasileiro Ana Christina Miranda (ed.), Fortes Ferreira Claudia (ed.), Fernandez Diana (ed.), Micheli Fabienne (ed.), Coelho Filho M.A. (ed.), Marraccini Pierre (ed.). EMBRAPA, UESC, CIRAD, IRD. Brasilia : EMBRAPA, Résumé, 54-55. Workshop on Biotic and Abiotic Stress Tolerance in Plants: the Challenge for the 21st Century, Ilhéus-Bahia, Brésil, 6 Novembre 2013/8 Novembre 2013.

Genomic selection on cacao for disease resistance : S04T08. Lopes Uilson Vanderlei, Monteiro Wilson Reis, Clément Didier, Gramacho Karina Peres, Pires José Luis, Phillips-Mora Wilbert, Lanaud Claire. 2013. In : Biotic and Abiotic Stress Tolerance in Plants: the Challenge for the 21st Century : Book of abstracts of the CIBA 2013. Brasileiro Ana Christina Miranda (ed.), Fortes Ferreira Claudia (ed.), Fernandez Diana (ed.), Micheli Fabienne (ed.), Coelho Filho M.A. (ed.), Marraccini Pierre (ed.). EMBRAPA, UESC, CIRAD, IRD. Brasilia : EMBRAPA, Résumé, 30. Workshop on Biotic and Abiotic Stress Tolerance in Plants: the Challenge for the 21st Century, Ilhéus-Bahia, Brésil, 6 Novembre 2013/8 Novembre 2013.

Identification, characterization and mapping of EST-derived SSRs from the cacao-Ceratocystis cacaofunesta interaction. Ferreira Santos Rogério Mercês, Clément Didier, Santos Lima Livia, Legravre Thierry, Lanaud Claire, Schnell Raymond J., Pires José Luis, Lopes Uilson Vanderlei, Micheli Fabienne, Gramacho Karina Peres. 2013. Tree Genetics and Genomes, 9 (1) : 117-127.

Selection for resistance to cacao Moniliasis assisted by molecular markers : S04P06. Reis M.R.A., Gramacho Karina Peres, Clément Didier, Lopes Uilson Vanderlei. 2013. In : Biotic and Abiotic Stress Tolerance in Plants: the Challenge for the 21st Century : Book of abstracts of the CIBA 2013. Brasileiro Ana Christina Miranda (ed.), Fortes Ferreira Claudia (ed.), Fernandez Diana (ed.), Micheli Fabienne (ed.), Coelho Filho M.A. (ed.), Marraccini Pierre (ed.). EMBRAPA, UESC, CIRAD, IRD. Brasilia : EMBRAPA, Résumé, 57. Workshop on Biotic and Abiotic Stress Tolerance in Plants: the Challenge for the 21st Century, Ilhéus-Bahia, Brésil, 6 Novembre 2013/8 Novembre 2013.

Breakdown of scavina resistance in Bahia caused by the evolution of Moniliophthora perniciosa. Gramacho Karina Peres, Pires José Luis, Clément Didier, Juca F.F., Melo G.R.P., Patrocinio Nara Geórgia Ribeiro Braz, Moreira R.F., Sousa L.A., Lopes Uilson Vanderlei. 2012. In : 17th Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère, Yaounde, Cameroun, 15 - 20 Octobre 2012. COPAL. s.l. : s.n., 6 p. Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 17, Yaoundé, Cameroun, 15 Octobre 2012/20 Octobre 2012.

Contournement de la résistance de Scavina dans la région de Bahia causé par l'évolution de Moniliophthora Perniciosa. Gramacho Karina Peres, Pires José Luis, Clément Didier, Juca F.F., Melo G.R.P., Patrocinio Nara Geórgia Ribeiro Braz, Sousa L.A., Lopes Uilson Vanderlei. 2012. In : 17th Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère : Résumés = 17th International Cocoa Research Conference ; 17th Conferencia Internacional De Investigaçao Sobre 0 Cacau ; 17th Conferencia International de Investigacion en Cacao. Lagos : Alliance des Pays Producteurs de Cacao, Résumé, 74. Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 17, Yaoundé, Cameroun, 15 Octobre 2012/20 Octobre 2012.

Dernières avancées dans le séquençage du génome de Theobroma Cacao Criollo : nouvel assemblage, annotations et outils. Argout Xavier, Aury Jean-Marc, Guiltinan Marc, Droc Gaëtan, Gouzy Jérôme, Maximova Siela N., Fouet Olivier, Schuster Stephan C., Boccara Michel, Clément Didier, Tahi G.Mathias, Gramacho Karina Peres, Lanaud Claire. 2012. In : 17th Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère : Résumés = 17th International Cocoa Research Conference ; 17th Conferencia Internacional De Investigaçao Sobre 0 Cacau ; 17th Conferencia International de Investigacion en Cacao. Lagos : Alliance des Pays Producteurs de Cacao, Résumé, 25. Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 17, Yaoundé, Cameroun, 15 Octobre 2012/20 Octobre 2012.

Discovery and mapping of a new expressed sequence tag-single nucleotide polymorphism and simple sequence repeat panel for large-scale genetic studies and breeding of Theobroma cacao L. Allègre Mathilde, Argout Xavier, Boccara Michel, Fouet Olivier, Roguet Yolande, Bérard Aurélie, Thévenin Jean-Marc, Chauveau Aurélie, Rivallan Ronan, Clément Didier, Courtois Brigitte, Gramacho Karina Peres, Boland-Auge Anne, Tahi Mathias Gnion, Umaharan Pathmanathan, Brunel Dominique, Lanaud Claire. 2012. DNA Research, 19 (1) : 23-35.

Etude sur l'hérédité et l'indentification de QTL associés à la résistance au flétrissement dû à Ceratocystis chez le cacaoyer. Ferreira Santos Rogério Mercês, Lopes Uilson Vanderlei, Vieira Midlej Silva Stela Dalva, Micheli Fabienne, Clément Didier, Gramacho Karina Peres. 2012. In : 17th Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère : Résumés = 17th International Cocoa Research Conference ; 17th Conferencia Internacional De Investigaçao Sobre 0 Cacau ; 17th Conferencia International de Investigacion en Cacao. Lagos : Alliance des Pays Producteurs de Cacao, Résumé, 31. Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 17, Yaoundé, Cameroun, 15 Octobre 2012/20 Octobre 2012.

Identification of quantitative trait loci linked to Ceratocystis wilt resistance in cacao. Santos Rogério M.F., Lopes Uilson Vanderlei, Silva Setal D.V.M., Micheli Fabienne, Clément Didier, Gramacho Karina Peres. 2012. Molecular Breeding, 30 (4) : 1563-1571.

QTL evolution under natural infection using a F2 Scavina-6 x ICS1 population for witches'broom resistance in Bahia, Brazil. Clément Didier, Pires José Luis, Gramacho Karina Peres, Juca F.F., Melo G.R.P., Lopes Uilson Vanderlei. 2012. In : 17th Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère, Yaounde, Cameroun, 15 - 20 Octobre 2012. COPAL. s.l. : s.n., 8 p. Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 17, Yaoundé, Cameroun, 15 Octobre 2012/20 Octobre 2012.

Study of inheritance and identification of QTLs linked to Ceratocystis wilt resistance in cacao. Ferreira Santos Rogério Mercês, Lopes Uilson Vanderlei, Vieira Midlej Silva Stela Dalva, Micheli Fabienne, Clément Didier, Peres Gramacho Karina. 2012. In : 17th Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère, Yaounde, Cameroun, 15 - 20 Octobre 2012. COPAL. s.l. : s.n., 4 p. Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 17, Yaoundé, Cameroun, 15 Octobre 2012/20 Octobre 2012.

Une méthode simplifiée de traitement "en vrac" pour détecter les mauvais étiquetage dans les collections de matériel génétique du cacaoyer. Reis de Andrade Silva Adriana, Gramacho Karina Peres, Clément Didier, Lopes Uilson Vanderlei. 2012. In : 17th Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère : Résumés = 17th International Cocoa Research Conference ; 17th Conferencia Internacional De Investigaçao Sobre 0 Cacau ; 17th Conferencia International de Investigacion en Cacao. Lagos : Alliance des Pays Producteurs de Cacao, Résumé, 154. Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 17, Yaoundé, Cameroun, 15 Octobre 2012/20 Octobre 2012.

Cacao breeding in Bahia, Brazil - strategies and results. Vanderlei Lopes Uilson, Monteiro Wilson Reis, Pires José Luis, Clément Didier, Yamada Milton Macoto, Peres Gramacho Karina. 2011. Crop Breeding and Applied Biotechnology, S1 : 73-81.

Deciphering the genome structure of Theobroma cacao (W107). Argout Xavier, Salse Jérôme, Aury Jean-Marc, Guiltinan Mark J., Droc Gaëtan, Gouzy Jérôme, Allègre Mathilde, Chaparro Christian, Legavre Thierry, Maximova Siela N., Abrouk Michael, Murat Florent, Fouet Olivier, Poulain Julie, Ruiz Manuel, Roguet Yolande, Rodier-Goud Marguerite, Barbosa-Neto Jose Fernandes, Sabot François, Kudrna Dave, Ammiraju Jetty Siva S., Schuster Stephan C., Carlson John E., Sallet Erika, Schiex Thomas, Dievart Anne, Kramer Melissa, Gelley Laura, Shi Zi, Bérard Aurélie, Viot Christopher, Boccara Michel, Risterucci Ange-Marie, Guignon Valentin, Sabau Xavier, Axtell Michael J., Ma Zhaorong, Zhang Yufan, Brown Spencer, Bourge Mickael, Golser Wolfgang, Song Xiang, Clément Didier, Rivallan Ronan, Tahi G.Mathias, Akaza Joseph Moroh, Pittolat Bertrand, Gramacho Karina Peres, D'Hont Angélique, Brunel Dominique, Infante Diogenes, Kébé Ismael S., Costet Pierre, Wing Rod A., Mc Combie William Richard, Guiderdoni Emmanuel, Quetier Francis, Panaud Olivier, Wincker Patrick, Bocs Stéphanie, Lanaud Claire. 2011. In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XIXth Conference, San Diego, CA (USA), January 15-19, 2011. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genomes Conference. 19, San Diego, États-Unis, 15 Janvier 2011/19 Janvier 2011.

Identification of QTLs linked to resistance for ceratocystis wilt in cacao. [Abstract 1424]. Santos Rogério M.F., Clément Didier, Silva Setal D.V.M., Lopes Uilson Vanderlei, Mello J.M.R., Damaceno V.O., Pires Jose Luis, Micheli Fabienne, Gramacho Karina Peres. 2011. Tropical Plant Pathology, 36, suppl., Résumé : 997. Congresso Brasileiro de Fitopatologia. 44, Bento Gonçalves, Brésil, 14 Août 2011/19 Août 2011.

Identification, characterization and mapping of EST-derived SSRs from cacao-Ceratocystis cacaofunesta interaction. Santos Rogério M.F., Gramacho Karina Peres, Clément Didier, Lemos L.S.L., Melo B.L.B., Juca F.F., Pires José Luis, Lopes Uilson Vanderlei, Micheli Fabienne. 2011. In : III Symposio Brasileiro de Genética Molecular de Plantas, 10 a 15 de abril de 2011, Ilhéus, BA. SBG. Ribeirão Preto : SBG, Résumé, 16. Simposio Brasileiro de Genética Molecular de Plantas. 3, Ilheus, Brésil, 10 Avril 2011/15 Avril 2011.

New witches broom QTL in the Sca 6 x ICS 1 F2 population. Juca F.F., Nascimento A.P.S., Mello J.M.R., Aguiar R.S., Pires Jose Luis, Lopes Uilson Vanderlei, Santos Rogério M.F., Clément Didier, Gramacho Karina Peres. 2011. In : III Symposio Brasileiro de Genética Molecular de Plantas, 10 a 15 de abril de 2011, Ilhéus, BA. SBG. Ribeirão Preto : SBG, Résumé, 55. Simposio Brasileiro de Genética Molecular de Plantas. 3, Ilheus, Brésil, 10 Avril 2011/15 Avril 2011.

QTL detection and marker assisted selection for the resistance to Phytophthora palmivora using a F2 Theobroma cacao L. progeny. Ferreira Santos Rogério Mercês, Lisboa dos Santos Elisa Susilene, Martins Newman Luz Edna Dora, Allègre Mathilde, Argout Xavier, Fouet Olivier, Gramacho Karina Peres, Santana Dayse, Mello Ribeiro João Marcos, Primo Da Costa Edaci, Lanaud Claire, Clément Didier. 2011. In : 15th Quantitative Trait Locus and Marker Assisted Selection Workshop : Book of abstracts, May 19-20, 2011, Rennes, France. INRA , AgroCampus Ouest. s.l. : s.n., Résumé, 42. Quantitative Trait Locus and Marker Assited Selection Workshop. 15, Rennes, France, 19 Mai 2011/20 Mai 2011.

Resistance gradient of black pod disease in cocoa and selection by leaf disk assay. Lisboa dos Santos Elisa Susilene, Cerqueira-Silva Carlos Bernard Moreno, Clément Didier, Martins Newman Luz Edna Dora. 2011. Crop Breeding and Applied Biotechnology, 11 (4) : 297-303.

Selection for cacao resistance to Moniliasis assisted by molecular markers. Reis M.R.A., Gramacho Karina Peres, Santos Rogério M.F., Clément Didier, Lopes Uilson Vanderlei. 2011. In : III Symposio Brasileiro de Genética Molecular de Plantas, 10 a 15 de abril de 2011, Ilhéus, BA. SBG. Ribeirão Preto : SBG, Résumé, 57. Simposio Brasileiro de Genética Molecular de Plantas. 3, Ilheus, Brésil, 10 Avril 2011/15 Avril 2011.

Sequencing the Cocoa criollo genome : An international initiative of the ICGS (International Cocoa Genome Sequencing) consortium (P050). Argout Xavier, Salse Jérôme, Aury Jean-Marc, Guiltinan Mark J., Droc Gaëtan, Gouzy Jérôme, Allègre Mathilde, Chaparro Christian, Legavre Thierry, Maximova Siela N., Abrouk Michael, Murat Florent, Fouet Olivier, Poulain Julie, Ruiz Manuel, Roguet Yolande, Rodier-Goud Marguerite, Barbosa-Neto Jose Fernandes, Sabot François, Kudrna Dave, Ammiraju Jetty Siva S., Schuster Stephan C., Carlson John E., Sallet Erika, Schiex Thomas, Dievart Anne, Kramer Melissa, Gelley Laura, Shi Zi, Bérard Aurélie, Viot Christopher, Boccara Michel, Mournet Pierre, Risterucci Ange-Marie, Guignon Valentin, Sabau Xavier, Axtell Michael J., Ma Zhaorong, Zhang Yufan, Brown Spencer, Bourge Mickael, Golser Wolfgang, Song Xiang, Clément Didier, Rivallan Ronan, Tahi G.Mathias, Akaza Joseph Moroh, Pittolat Bertrand, Gramacho Karina Peres, D'Hont Angélique, Brunel Dominique, Infante Diogenes, Kébé Ismael S., Costet Pierre, Wing Rod A., Mc Combie William Richard, Guiderdoni Emmanuel, Quetier Francis, Panaud Olivier, Wincker Patrick, Bocs Stéphanie, Lanaud Claire. 2011. In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XIXth Conference, San Diego, CA (USA), January 15-19, 2011. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genomes Conference. 19, San Diego, États-Unis, 15 Janvier 2011/19 Janvier 2011.

The genome of Theobroma cacao. Argout Xavier, Salse Jérôme, Aury Jean-Marc, Guiltinan Mark J., Droc Gaëtan, Gouzy Jérôme, Allègre Mathilde, Chaparro Christian, Legavre Thierry, Maximova Siela N., Abrouk Michael, Murat Florent, Fouet Olivier, Poulain Julie, Ruiz Manuel, Roguet Yolande, Rodier-Goud Marguerite, Barbosa-Neto Jose Fernandes, Sabot François, Kudrna Dave, Ammiraju Jetty Siva S., Schuster Stephan C., Carlson John E., Sallet Erika, Schiex Thomas, Dievart Anne, Kramer Melissa, Gelley Laura, Shi Zi, Bérard Aurélie, Viot Christopher, Boccara Michel, Risterucci Ange-Marie, Guignon Valentin, Sabau Xavier, Axtell Michael J., Ma Zhaorong, Zhang Yufan, Brown Spencer, Bourge Mickael, Golser Wolfgang, Song Xiang, Clément Didier, Rivallan Ronan, Tahi G.Mathias, Akaza Joseph Moroh, Pitollat Bertrand, Gramacho Karina Peres, D'Hont Angélique, Brunel Dominique, Infante Diogenes, Kébé Ismael S., Costet Pierre, Wing Rod A., Mc Combie William Richard, Guiderdoni Emmanuel, Quetier Francis, Panaud Olivier, Wincker Patrick, Bocs Stéphanie, Lanaud Claire. 2011. Nature Genetics, 43 (2) : 101-108.

Caracterização fenotípica de uma população segregante de cacaueiro quanto à resistência à podridão-parda. De Cassia Bahia Rita, Lopes Uilson Vanderlei, Luz Edna Dora Martin Newman, Carvalho Santos Ronaldo, Reboucas Machado Regina Cele, Clément Didier, Ferreira Santos Rogério Mercês, Ahnert Dario, Corrêa Ronan Xavier. 2010. In : 15th International Cocoa Research Conference : cocoa productivity, quality, profitability, human health and the environment = 15e Conférence internationale sur la recherche cacaoyère : Productivité, qualité, rentabilité du cacao, santé humaine et environnement ; 15 Conferencia Internacional de Pesquisas em Cacau. Cacau : produtividade, qualidade, rentabilidade, saude humanna e amb. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, 445-451. Conférence internationale sur la recherche cacaoyère. 15, San José, Costa Rica, 9 Octobre 2006/14 Octobre 2006.

Development, characterization, validation, and mapping of SSRs derived from Theobroma cacao L.-Moniliophthora perniciosa interaction ESTs. Santos Lima Livia, Peres Gramacho Karina, Pires José Luis, Clément Didier, Lopes Uilson Vanderlei, Carels Nicolas, Da Silva Gesteira Abelmon, Gaiotto Fernanda Amato, De Mattos Cascardo Julio Cézar, Micheli Fabienne. 2010. Tree Genetics and Genomes, 6 (5) : 663-676.

Identificação de SNPs na população F2 SCA6 x ICS1para obtençao de marcas associadas à resistência do cacaueiro a vassoura-de-bruxa : [Resumo]. Lemos L.S.L., Gramacho Karina Peres, Santos Rogério M.F., Clément Didier, Santos S.F., Ganem Rodrigo Sousa, Lima L., Sousa L.A., Braz Nara G.R., Gesteira Abelmon S., Pires José Luis, Micheli Fabienne. 2010. In : Resumos do 56° Congresso Brasileiro de Genética, 14 a 17 de setembro de 2010, Guaruja, Brasil. Sociedade Brasileira de Genética. s.l. : s.n., 171. Congresso Brasileiro de Genética. 56, Guaruja, Brésil, 14 Septembre 2010/17 Septembre 2010.

Obtenção de produtos de PCR dos principais fungos causadores de doenças no cacaueiro visando estudos filogeneticos e taxonômicos : [Resumo]. Santos Rogério M.F., Lemos L.S.L., Juca F.F., Dos Santos M.V.O., Kruschewsky M.C., Ganem Rodrigo Sousa, Clément Didier, Micheli Fabienne, Gramacho Karina Peres. 2010. In : Resumos do 56° Congresso Brasileiro de Genética, 14 a 17 de setembro de 2010, Guaruja, Brasil. Sociedade Brasileira de Genética. s.l. : s.n., 127. Congresso Brasileiro de Genética. 56, Guaruja, Brésil, 14 Septembre 2010/17 Septembre 2010.

Preventive breeding for disease resistance : a strategy aimed at a sustainable global production of cocoa. Lopes Uilson Vanderlei, Monteiro Wilson Reis, Pereira João Louis, Gramacho Karina Peres, Clément Didier, Pires José Luis, Yamada Milton Macoto. 2010. In : 15th International Cocoa Research Conference : cocoa productivity, quality, profitability, human health and the environment = 15e Conférence internationale sur la recherche cacaoyère : Productivité, qualité, rentabilité du cacao, santé humaine et environnement ; 15 Conferencia Internacional de Pesquisas em Cacau. Cacau : produtividade, qualidade, rentabilidade, saude humanna e amb. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, 3-9. Conférence internationale sur la recherche cacaoyère. 15, San José, Costa Rica, 9 Octobre 2006/14 Octobre 2006.

Relationship between molecular markers and incompatibility in Theobroma cacao. Macoto Yamada Milton, Faleiro Fabio G., Clément Didier, Vanderlei Lopes Uilson, Pires José Luis, Pires Melo Gilson Roberto. 2010. AgroTropica, 22 (2) : 71-74.

Vers la cartographie fine et physique de la région du principal QTL de résistance au balai de sorcière (Crinipellis perniciosa) apporté par Scavina-6. Clément Didier, Lopes Uilson Vanderlei, Yamada Milton Macoto, Pires José Luis, Monteiro Wilson Reis, Santos Ronaldo, Neto Alfredo Dantas, Gramacho Karina Peres, Dos Santos Reinaldo, Lanaud Claire. 2010. In : 15th International Cocoa Research Conference : cocoa productivity, quality, profitability, human health and the environment = 15e Conférence internationale sur la recherche cacaoyère : Productivité, qualité, rentabilité du cacao, santé humaine et environnement ; 15 Conferencia Internacional de Pesquisas em Cacau. Cacau : produtividade, qualidade, rentabilidade, saude humanna e amb. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, 209-214. Conférence internationale sur la recherche cacaoyère. 15, San José, Costa Rica, 9 Octobre 2006/14 Octobre 2006.

A large est resource for Theobroma cacao including cDNAS isolated from various organs and under various biotic and abiotic stresses. Lanaud Claire, Fouet Olivier, Gramacho Karina Peres, Argout Xavier, Legavre Thierry, Sabau Xavier, Risterucci Ange-Marie, Wincker Patrick, Da Silva Corinne, Loor Rey Gaston, Lopes Uilson Vanderlei, Cascardo Julio Cezar M., Courtois Brigitte, Kuhn David N., Schnell Raymond J., Bailey Bryan, Babin Régis, Sounigo Olivier, Ducamp Michel, Paulin Didier, Deberdt Peninna, Verica Joseph, Guiltinan Mark J., Alemanno Laurence, Machado Regina, Phillips Wilbert, Micheli Fabienne, Da Silva Gesteira Abelmon, Clément Didier, Maximova Siela N., Boccara Michel, Butler David R., Rosenquist Eric, Gilmour Martin, Glaszmann Jean-Christophe. 2010. In : 15th International Cocoa Research Conference : cocoa productivity, quality, profitability, human health and the environment = 15e Conférence internationale sur la recherche cacaoyère : Productivité, qualité, rentabilité du cacao, santé humaine et environnement ; 15 Conferencia Internacional de Pesquisas em Cacau. Cacau : produtividade, qualidade, rentabilidade, saude humanna e amb. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, 185-191. Conférence internationale sur la recherche cacaoyère. 15, San José, Costa Rica, 9 Octobre 2006/14 Octobre 2006.

The use of wild relatives as a potential method for improving cocoa traits. Carvalho Santos Ronaldo, Lopes Uilson Vanderlei, Clément Didier, Monteiro Wilson Reis, Pires José Luis, Ahnert Dario. 2010. In : 15th International Cocoa Research Conference : cocoa productivity, quality, profitability, human health and the environment = 15e Conférence internationale sur la recherche cacaoyère : Productivité, qualité, rentabilité du cacao, santé humaine et environnement ; 15 Conferencia Internacional de Pesquisas em Cacau. Cacau : produtividade, qualidade, rentabilidade, saude humanna e amb. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, 1789-1794. Conférence internationale sur la recherche cacaoyère. 15, San José, Costa Rica, 9 Octobre 2006/14 Octobre 2006.

Genetic improvement in cocoa. Monteiro Wilson Reis, Lopes Uilson Vanderlei, Clément Didier. 2009. In : Breeding plantation tree crops : tropical species. Jain Shri Mohan (ed.), Priyadarshan P.M. (ed.). New York : Springer [Etats-Unis], 589-626. ISBN 978-0-387-71199-7

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A new codominant marker-based cocoa linkage map : development and intergration of new microsatellite markers into cocoa linkage map. A new cocoa reference map. Pugh Tatiana, Fouet Olivier, Risterucci Ange-Marie, Brottier Philippe, Abouladze M., Delettrez Claire, Courtois Brigitte, Clément Didier, Larmande Pierre, N'Goran Jeanne A.K., Lanaud Claire. 2005. In : 14th International Cocoa Research Conference. Proceedings : rumo a uma economia sustentavel do cacau - quais as estrategias para este fim ? = 14th International Cocoa Research Conference. Proccedings ; 14e Conférence internationale sur la recherche cacaoyère. Actes ; 14 Conferencia Internacional de Pesquisas em Cacau. Atas ; 14 Conferencia Internacional de Investigacion en Cacao. Actas : towards a sustainable cocoa economy - what strategies to this end ? ; vers une économie cacaoyère durable : quelles stratégies d'approche ? ; rumo a uma economia sustentavel do cacau - quais as estrategias para este fim ? ; hacia una economia sustentable del ca. CEPLAC, CRIG, MCB. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, 153-160. ISBN 978-065-959-5 Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 14, Accra, Ghana, 13 Octobre 2003/18 Octobre 2003.

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Bulk segregant analyses of (17-3/1 X 36-3/1) progeny for resistance to Phytophthora : preliminary results. Lanaud Claire, Paulin Didier, Clément Didier, Ducamp Michel, Fouet Olivier, Vezian-Bonnemayre Katia, Efron Yoel, Risterucci Ange-Marie. 2004. In : Cocoa germplasm improvement: global and participatory approaches. CFC, ICCO, IPGRI. Rome : IPGRI, Diaporama, (9 vues) CFC/ICCO/IPGRI Projects Workshop, Reading, Royaume-Uni, 28 Mars 2004/3 Avril 2004.

Creation of BAC genomic for cocoa (Theobroma cacao L.) for physical mapping of RGA containing BAC clones. Clément Didier, Lanaud Claire, Sabau Xavier, Fouet Olivier, Le Cunff Loïc, Ruiz E., Risterucci Ange-Marie, Glaszmann Jean-Christophe, Piffanelli Pietro. 2004. Theoretical and Applied Genetics, 108 (8) : 1627-1634.

Genetic and physical mapping of resistance and defence gene analogs colocalised with QTL of resistance for Phytophthora in cocoa [ fruit trees. P 600]. Lanaud Claire, Clément Didier, Fouet Olivier, Ruiz Manuel, Le Cunff Loïc, Risterucci Ange-Marie, Sabau Xavier, Glaszmann Jean-Christophe, Piffanelli Pietro. 2004. . s.l. : s.n. Plant and Animal Genomes Conference. 12, San Diego, États-Unis, 10 Janvier 2004/14 Janvier 2004.

Genetic mapping of quantitative trait loci for black pod resistance in cocoa. Lanaud Claire, Clément Didier, Flament Marie-Henriette, Risterucci Ange-Marie, Kébé Ismael S., Nyassé Salomon, Sounigo Olivier, Motilal Lambert A., Thévenin Jean-Marc, Paulin Didier, Ducamp Michel, N'Goran Jeanne A.K., Fargeas Dominique, Cilas Christian. 2004. In : Improvement of cocoa tree resistance to Phytophthora diseases. Cilas Christian (ed.), Despréaux Denis (ed.). Montpellier : CIRAD, 147-164. (Repères) ISBN 2-87614-562-6

Identification of off-types using DNA studies. Sounigo Olivier, Risterucci Ange-Marie, Clément Didier, Fouë O., Lanaud Claire. 2004. In : Cocoa germplasm improvement: global and participatory approaches. CFC, ICCO, IPGRI. Rome : IPGRI, Diaporama, (15 vues) CFC/ICCO/IPGRI Projects Workshop, Reading, Royaume-Uni, 28 Mars 2004/3 Avril 2004.

Rapport de mission au Brésil du 07/05 au 12/06/2004. Clément Didier. 2004. Montpellier : CIRAD-CP, 23 p. N° de rapport : CP_SIC 1754

A new cacao linkage map based on codominant markers : development and integration of 201 new microsatellite markers. Pugh Tatiana, Fouet Olivier, Risterucci Ange-Marie, Brottier Philippe, Abouladze M., Delettrez Claire, Courtois Brigitte, Clément Didier, Larmande Pierre, N'Goran Jeanne A.K., Lanaud Claire. 2004. Theoretical and Applied Genetics, 108 (6) : 1151-1161.

Bactrop: A platform of genomic resources to study organization and evolution of tropical crop species [S04-3]. Piffanelli Pietro, Noa-Carrazana Juan Carlos, Clément Didier, Ciampi Ana, Vilarinhos Alberto Duarte, Thibivilliers Sandra, Lagoda Pierre, Sabau Xavier, Ruiz Manuel, Karkouri Khalid, Leroy Thierry, Billotte Norbert, Seguin Marc, Safar Jan, D'Hont Angélique, Glaszmann Jean-Christophe. 2003. In : 7th International Congress of Plant Molecular Biology, ISPMB 2003, Barcelona (Spain), June 23-28. Book of abstracts. ISPMB. Barcelone : ISPMB Office, Résumé, 58. International Congress of Plant Molecular Biology. 7, Barcelone, Espagne, 23 Juin 2003/28 Juin 2003.

Creation of bac genomic for cocoa (Theobroma cacao L.) [S04-15). Clément Didier, Lanaud Claire, Glaszmann Jean-Christophe, Piffanelli Pietro. 2003. In : 7th International Congress of Plant Molecular Biology, ISPMB 2003, Barcelona (Spain), June 23-28. Book of abstracts. ISPMB. Barcelone : ISPMB Office, Résumé, 61. International Congress of Plant Molecular Biology. 7, Barcelone, Espagne, 23 Juin 2003/28 Juin 2003.

Genetic and physical mapping of resistance and defence gene analogs colocalised with QTL of resistance for Phytophthora in cocoa. Lanaud Claire, Clément Didier, Fouet Olivier, Ruiz Manuel, Le Cunff Loïc, Risterucci Ange-Marie, Sabau Xavier, Glaszmann Jean-Christophe, Piffanelli Pietro. 2003. In : 14th International Cocoa Research Conference, 13-18 October 2003, Accra, Ghana. Montpellier : Cirad, 1 p. Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 14, Accra, Ghana, 13 Octobre 2003/18 Octobre 2003.

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Mapping quantitative trait loci for bean traits and ovule number in Theobroma cacao L. Clément Didier, Risterucci Ange-Marie, Motamayor Juan Carlos, N'Goran Jeanne A.K., Lanaud Claire. 2003. Genome (Ottawa), 46 (1) : 103-111.

Rapport de mission au Brésil du 14/11 au 7/12/2003. Clément Didier. 2003. Montpellier : CIRAD-CP, 24 p. N° de rapport : CP_SIC 1680

Bactrop: A BAC-based platform for physical mapping of tropical species. Piffanelli Pietro, Lagoda Pierre, Clément Didier, Thibivilliers Sandra, Vilarinhos Alberto Duarte, Sabau Xavier, Billotte Norbert, Seguin Marc, Chalhoub Boulos, Glaszmann Jean-Christophe. 2002. In : Plant, Animal and Microbe Genomes 10th Conference, January 12 - 16, 2002, San Diego, California. s.l. : s.n., 1 p. Plant, Animal and Microbe Genomes Conference. 10, San Diego, États-Unis, 12 Janvier 2002/16 Janvier 2002.

Improved genetic resources exploitation by combining genome mapping and domestication processes knowledge in cocoa. Lanaud Claire, Motamayor Juan Carlos, Pugh Tatiana, Clément Didier, Risterucci Ange-Marie. 2002. In : Plant, Animal and Microbe Genomes 10th Conference. Abstracts. New York : Scherago International Plant, Animal and Microbe Genomes Conference. 10, San Diego, États-Unis, 12 Janvier 2002/16 Janvier 2002.

Mitochondrial diversity and inheritance in Theobroma cacao L. populations. Motamayor Juan Carlos, Clément Didier, Caiveau Olivier, Risterucci Ange-Marie, Lanaud Claire. 2002. In : Plant, Animal and Microbe Genomes 10th Conference. Abstracts. New York : Scherago International Plant, Animal and Microbe Genomes Conference. 10, San Diego, États-Unis, 12 Janvier 2002/16 Janvier 2002.

QTL for agronomic traits in Theobroma cacao L. Clément Didier, Risterucci Ange-Marie, Glaszmann Jean-Christophe, Lanaud Claire. 2002. In : Plant, Animal and Microbe Genomes 10th Conference, January 12 - 16, 2002, San Diego, California. s.l. : s.n., 1 p. Plant, Animal and Microbe Genomes Conference. 10, San Diego, États-Unis, 12 Janvier 2002/16 Janvier 2002.

Quantitative trait loci for agronomic traits in several progenitors of Theobroma cacao L. Clément Didier, Risterucci Ange-Marie, Lanaud Claire. 2002. In : Plant, Animal and Microbe Genomes 10th Conference. Abstracts. New York : Scherago International Plant, Animal and Microbe Genomes Conference. 10, San Diego, États-Unis, 12 Janvier 2002/16 Janvier 2002.

Rapport de mission au Brésil du 15 au 31 octobre 2002. Alemanno Laurence, Clément Didier, Micheli Fabienne, Thévenin Jean-Marc. 2002. Montpellier : CIRAD-CP, 45 p. N° de rapport : CP_SIC 1557

Rapport de mission aux Etats-Unis : San Diego (Plant, Animal and Microbe Genomes Conference) et Miami (meeting USDA/ARS) du 11 au 26 janvier 2002. Clément Didier. 2002. Montpellier : CIRAD-CP, 23 p. N° de rapport : CP_SIC 1468

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Cartographie génétique de caractères liés au rendement, à la vigueur, à la résistance à P. Palmivora et aux fèves, chez Theobroma cacao L. Clément Didier, Risterucci Ange-Marie, Grivet Laurent, Motamayor Juan Carlos, N'Goran Jeanne A.K., Lanaud Claire. 2001. In : 13th International Cocoa Research Conference. Proceedings : Towards the effective and optimum promotion of cocoa through research and development = 13e Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. Actes ; 13 Conferencia Internacional de Pesquisas em Cacau. Atas ; 13 Conferencia Internacional de Investigacion en Cacao. Actas : Vers la promotion efficace et optimum du cacao par la recherche et le développement ; Para um melhor e efetivo desenvolvimento do cacau atraves da pesquisa e do aperfeicoamento ; En pos de una promocion optima y efectiva del cacao mediante la investigacion y. MCB. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, 91-100. ISBN 983-40740-0-X Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 13, Kota Kinabalu, Malaisie, 9 Octobre 2000/14 Octobre 2000.

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Premier cycle de sélection récurrente en Côte d'Ivoire et choix des géniteurs du second cycle. Lachenaud Philippe, Eskes Albertus, N'Goran Jeanne A.K., Clément Didier, Kébé Ismael S., Tahi G.Mathias, Cilas Christian. 2001. In : 13th International Cocoa Research Conference. Proceedings : Towards the effective and optimum promotion of cocoa through research and development = 13e Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. Actes ; 13 Conferencia Internacional de Pesquisas em Cacau. Atas ; 13 Conferencia Internacional de Investigacion en Cacao. Actas : Vers la promotion efficace et optimum du cacao par la recherche et le développement ; Para um melhor e efetivo desenvolvimento do cacau atraves da pesquisa e do aperfeicoamento ; En pos de una promocion optima y efectiva del cacao mediante la investigacion y. MCB. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, 11-22. ISBN 983-40740-0-X Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 13, Kota Kinabalu, Malaisie, 9 Octobre 2000/14 Octobre 2000.

Rapport de mission au Brésil du 18 au 30 août 2001. Clément Didier. 2001. Montpellier : CIRAD-CP, 36 p. N° de rapport : CP_SIC 1406

Synthesis of studies on genetic basis of cocoa resistance to Phytophthora using molecular markers. Lanaud Claire, Flament Marie-Henriette, Nyassé Salomon, Risterucci Ange-Marie, Fargeas Dominique, Kébé Ismael S., Sounigo Olivier, Motilal Lambert A., Thévenin Jean-Marc, Paulin Didier, Ducamp Michel, Clément Didier, N'Goran Jeanne A.K., Cilas Christian. 2001. In : 13th International Cocoa Research Conference. Proceedings : Towards the effective and optimum promotion of cocoa through research and development = 13e Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. Actes ; 13 Conferencia Internacional de Pesquisas em Cacau. Atas ; 13 Conferencia Internacional de Investigacion en Cacao. Actas : Vers la promotion efficace et optimum du cacao par la recherche et le développement ; Para um melhor e efetivo desenvolvimento do cacau atraves da pesquisa e do aperfeicoamento ; En pos de una promocion optima y efectiva del cacao mediante la investigacion y. MCB. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, 127-135. ISBN 983-40740-0-X Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 13, Kota Kinabalu, Malaisie, 9 Octobre 2000/14 Octobre 2000.

Cartographie des QTLs liés à la résistance à P. palmivora dans des descendances de Côte d'Ivoire. Lanaud Claire, Kébé Boubacar Ismaël, Clément Didier, N'Goran Jeanne A.K., Flament Marie-Henriette, Tahi G.Mathias, Fargeas Dominique, Risterucci Ange-Marie, Pieretti Isabelle, Grivet Laurent. 2000. In : Bases génétiques de la résistance des cacaoyers aux maladies à Phytophthora : Résumés des communications = Genetic basis of cocoa tree resistance to Phytophthora diseases. Abstracts. Cilas Christian (ed.). CIRAD, CAOBISCO, CNRA, UWI-CRU, IRAD. Montpellier : CIRAD, 25-26. Scientific Closing Seminar of CAOBISCO / CIRAD / CNRA / CRU / IRAD Project, Montpellier, France, 19 Septembre 2000/20 Septembre 2000.

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