Résultats pour : "évolution"

Divergence in evolutionary potential of life history traits among wild populations is predicted by differences in climatic conditions. Chantepie Stéphane, Charmantier Anne, Delahaie Boris, Adriaensen Frank, Matthysen Erik, Visser Marcel E., Alvarez Elena, Barba Emilio, Orell Markku, Sheldon Ben, Ivankina Elena, Kerimov Anvar, Lavergne Sébastien, Teplitsky Céline. 2024. Evolution Letters, 8 (1) : 29-42.

New insights in the evolutionary history of cacao-infecting badnaviruses. Gonzalez Grande Patricia Lorena, Micheli Fabienne. 2024. Physiological and Molecular Plant Pathology, 130:102242, 20 p.

Understanding the joint evolution of dispersal and host specialisation using phytophagous arthropods as a model group. Ravigné Virginie, Rodrigues Leonor R., Charlery De La Masseliere Maud, Facon Benoît, Kuczyński Lechosław, Radwan Jacek, Skoracka Anna, Magalhães Sara. 2024. Biological Reviews - Cambridge Philosophical Society, 99 : 219-237.

AraDiv: A dataset of functional traits and leaf hyperspectral reflectance of Arabidopsis thaliana. Przybylska Stefania, Violle Cyrille, Vile Denis, Scheepens J.F., Lacombe Benoit, Le Roux Xavier, Perrier Lisa, Sales-Mabily Lou, Laumond Mariette, Vinyeta Mariona, Moulin Pierre, Beurier Grégory, Rouan Lauriane, Cornet Denis, Vasseur François. 2023. Scientific Data, 10:314, 8 p.

Draft genome sequences of Neurospora crassa clade B, isolated from burned Cytisus sp. plants in France. Bonometti Lucas, De Bellis Fabien, Cros-Arteil Sandrine, Gladieux Pierre, Stajich Jason E., Gueret Elise. 2023. Microbiology Resource Announcements, 12 (12), 3 p.

Evolution of the cotton genus, Gossypium, and its domestication in the Americas. Viot Christopher, Wendel Jonathan F.. 2023. Critical Reviews in Plant Sciences, 42 (1) : 1-33.

Genetic diversity, evolution, and diagnosis of sugarcane yellow leaf virus from 19 sugarcane-producing locations worldwide. Rott Philippe, Grinstead Samuel, Dallot Sylvie, Foster Zachary S. L., Daugrois Jean-Heinrich, Fernandez Emmanuel, Kaye Claudia, Hendrickson Leticia, Hu Xiaojun, Adhikari Bishwo, Malapi Martha, Grunwald Niklaus J., Roumagnac Philippe, Mollov Dimitre S.. 2023. Plant Disease, 10711 : 3437-3447.

Genome assembly of Musa beccarii shows extensive chromosomal rearrangements and genome expansion during evolution of Musaceae genomes. Wang Zheng-Feng, Rouard Mathieu, Droc Gaëtan, Heslop Harrison Pat, Ge Xue-Jun. 2023. GigaScience, 12, 20 p.

Inter-comparison and validation against in-situ measurements of satellite estimates of incoming solar radiation for Central Africa: From the annual means to the diurnal cycles. Ouhechou Amine, Philippon Nathalie, Morel Béatrice, Trentmann Jörg, Graillet Alexandre, Mariscal Armand, Nouvellon Yann. 2023. Atmospheric Research, 287:106711, 20 p.

Multiple gene co-options underlie the rapid evolution of sexually deceptive flowers in Gorteria diffusa. Kellenberger Roman T., Ponraj Udhaya, Delahaie Boris, Fattorini Róisín, Balk Janneke, Lopez-Gomollon Sara, Müller Karin H., Ellis Allan G., Glover Beverley J.. 2023. Current Biology, 33 (8) : 1502-1512.

Origins and evolution of oasis agriculture in the Sahara: Evidence from morphometric analyses of archaeological date palm seeds. Kaczmarek Thomas, Van der Veen Marijke, Ivorra Sarah, Mattingly David, Terral Jean-Frédéric, Gros-Balthazard Muriel. 2023. Holocene, 34 (3), 13 p.

Phylostems: A new graphical tool to investigate temporal signal of heterochronous sequences datasets. Doizy Anna, Prin Amaury, Cornu Guillaume, Chiroleu Frédéric, Rieux Adrien. 2023. Bioinformatics Advances, 3 (1):vbad026, 5 p.

Sensitivity analysis of a crop metapopulation model. Rouger Baptiste, Goldringer Isabelle, Barbillon Pierre, Miramon Anne, Naino Jika Abdel Kader, Thomas Mathieu. 2023. Ecological Modelling, 475:110174, 14 p.

Whole-genome sequences of Bipolaris bicolor, Curvularia hawaiiensis, Curvularia spicifera, and Exserohilum rostratum isolated from rice in Burkina Faso, France, Mali, and Pakistan. Kaboré Kouka Hilaire, Kassankogno Abalo Itolou, Adreit Henri, Ravel Sébastien, Charriat Florian, Diagne Diariatou, Lebrun Marc-Henri, Tharreau Didier. 2023. Mycology, 12 (11), 4 p.

Ant phylogenomics reveals a natural selection hotspot preceding the origin of complex eusociality. Romiguier Jonathan, Borowiec Marek L., Weyna Arthur, Helleu Quentin, Loire Etienne, La Mendola Christine, Rabeling Christian, Fisher Brian L., Ward Philip S., Keller Laurent. 2022. Current Biology, 32 (13) : 2942-2947.

Association mapping of colour variation in a butterfly provides evidence that a supergene locks together a cluster of adaptive loci. Jay Paul, Leroy Manon, Le Poul Yann, Whibley Annabel, Arias Monica, Chouteau Mathieu, Joron Mathieu. 2022. Philosophical Transactions - Royal Society. Biological Sciences, 377 (1856), dossier Genomic architecture of supergenes: causes and evolutionary consequences, 14 p.

Childhood encephalitis in the Greater Mekong region (the SouthEast Asia Encephalitis Project): A multicentre prospective study. Pommier Jean-David, Gorman Christopher, Crabol Yoann, Bleakley Kevin, Sothy Heng, Santy Ky, Tran Huong Thi Thu, Nguyen Lam Van, Bunnakea Em, Hlaing Chaw Su, Aye Mya Min Aye, Cappelle Julien, Herrant Magali, Piola Patrice, Rosset Bruno, Chevalier Véronique, Tarantola Arnaud, Channa Mey, SEAe Consortium, et al.. 2022. Lancet. Global Health, 10 (7) : e989-e1002.

Coagulation methods and drying step are the key drivers of the dynamics of structuration of natural rubber during the maturation of coagula. Noinart Jidapa, Vaysse Laurent, Musigamart Natedao, Sainte-Beuve Jérôme, Flori Albert, Liengprayoon Siriluck, Rattanawong Ratchanee, Granet Françoise, Bonfils Frédéric. 2022. Express Polymer Letters, 16 (11) : 1161-1171.

Distribution of invasive versus native whitefly species and their pyrethroid knock‑down resistance allele in a context of interspecific hybridization. Taquet Alizée, Jourdan-Pineau Hélène, Simiand Christophe, Grondin Martial, Barrès Benoit, Delatte Hélène. 2022. Scientific Reports, 12:8448, 14 p.

Exploring the emergence and evolution of plant pathogenic microbes using historical and paleontological sources. Malmstrom Carolyn M., Martin Michael, Gagnevin Lionel. 2022. Annual Review of Phytopathology, 60 (1) : 187-209.

Incipient speciation between host-plant strains in the fall armyworm. Durand Karine, Yainna Kumarihami Sudeeptha, Nam Kiwoong. 2022. BMC Ecology and Evolution, 22 (1), 8 p.

PanExplorer: A web-based tool for exploratory analysis and visualization of bacterial pan-genomes. Dereeper Alexis, Summo Marilyne, Meyer Damien. 2022. Bioinformatics, 38 (18) : 4412-4414.

Role of spike compensatory mutations in the interspecies transmission of SARS-CoV-2. Frutos Roger, Yahi Nouara, Gavotte Laurent, Fantini Jacques, Devaux Christian. 2022. One Health, 15:100429, 9 p.

A chromosome-level reference genome of Ensete glaucum gives insight into diversity and chromosomal and repetitive sequence evolution in the Musaceae. Wang Ziwei, Rouard Mathieu, Biswas Manosh Kumar, Droc Gaëtan, Cui Dongli, Roux Nicolas, Baurens Franc-Christophe, Ge Xue-Jun, Schwarzacher Trude, Heslop-Harrison Pat, Liu Qing. 2022. GigaScience, 11:giac027, 21 p.

Adaptation and correlated fitness responses over two time scales in Drosophila suzukii populations evolving in different environments. Olazcuaga Laure, Foucaud Julien, Gautier Mathieu, Deschamps Candice, Loiseau Anne, Leménager Nicolas, Facon Benoît, Ravigné Virginie, Hufbauer Ruth A., Estoup Arnaud, Rode Nicolas-Olivier. 2021. Journal of Evolutionary Biology, 34 (8) : 1225-1240.

Coconut genome assembly enables evolutionary analysis of palms and highlights signaling pathways involved in salt tolerance. Yang Yaodong, Bocs Stéphanie, Fan Haikuo, Armero Alix, Baudouin Luc, Xu Pengwei, Xu Junyang, This Dominique, Hamelin Chantal, Iqbal Amjad, Qadri Rashad, Zhou Lixia, Li Jing, Wu Yi, Ma Zilong, Issali Auguste Emmanuel, Rivallan Ronan, Liu Na, Xia Wei, Peng Ming, Xiao Yong. 2021. Communications Biology, 4:105, 14 p.

Contribution of historical herbarium small RNAs to the reconstruction of a cassava mosaic geminivirus evolutionary history. Rieux Adrien, Campos Paola, Duvermy Arnaud, Scussel Sarah, Martin Darren Patrick, Gaudeul Myriam, Lefeuvre Pierre, Becker Nathalie, Lett Jean-Michel. 2021. Scientific Reports, 11 (1):21280, 12 p.

Contribution à l'étude génomique des histoires démographique et adaptative des bovins et ovins de l'Océan Indien. Magnier Jessica. 2021. Montpellier : Montpellier SupAgro, 314 p. Thèse de doctorat : Génétique et génomique : Montpellier SupAgro

Coévolution plantes-parasites en populations naturelles. Ravigné Virginie, Halkett Fabien, Tollenaere Charlotte. 2021. In : L'immunité des plantes : pour des cultures résistantes aux maladies. Lannou Christian (ed.), Roby Dominique (ed.), Ravigné Virginie (ed.), Hannachi Mourad (ed.), Moury Benoit (ed.). Versailles : Ed. Quae, 115-123. (Savoir faire) ISBN 978-2-7592-3233-08

Derivation of the kinetics of devolatilisation and oxidation of pulverized biomass in a drop tube furnace: Sensitivity to volume evolution and drag-coefficient model. Mohanna Hassan, Commandre Jean-Michel, Piriou Bruno, Taupin Benoit, Vaitilingom Gilles, Honore David. 2021. Fuel, 293:120434, 12 p.

Evolutionary processes involved in the emergence and expansion of an atypical O. sativa group in Madagascar. Ahmadi Nourollah, Ramanantsoanirina Alain, Santos João D., Frouin Julien, Radanielina Tendro. 2021. Rice, 14 (1), 18 p.

Hornets and honey bees: A coevolutionary arms race between ancient adaptations and new invasive threats. Cappa Federico, Cini Alessandro, Bortolotti Laura, Poidatz Juliette, Cervo Rita. 2021. Insects, 12 (11), n.spéc. Arthropod Natural Enemies of Bees:1037, 17 p.

Producción y comercialización mundial del arroz. Mendez Del Villar Patricio. 2021. In : 100 años del cultivo de arroz en Chile en un contexto internacional 1920 - 2020. Tomo 1. Paredes Mario (ed.), Becerra Viviana (ed.), Donoso Gabriel (ed.). Chillán : INIA, 302-313. (Libros INIA, 40) ISBN 978-956-7016-51-8

Revisiting the Pneumocystis host specificity paradigm and transmission ecology in wild Southeast Asian rodents. Latinne Alice, Chen Hsuan-Wien, Kuo Chi-Chien, Lorica Renee, Singleton Grant, Stuart Alex, Malbas Fedelino F., Demanche Christine, Chabé Magali, Michaux Johan, Morand Serge. 2021. Infection, Genetics and Evolution, 93:104978, 13 p.

Time-calibrated genomic evolution of a monomorphic bacterium during its establishment as an endemic crop pathogen. Richard Damien, Pruvost Olivier, Balloux François, Boyer Claudine, Rieux Adrien, Lefeuvre Pierre. 2021. Molecular Ecology, 30 (8) : 1823-1835.

Chromosome reciprocal translocations have accompanied subspecies evolution in bananas. Martin Guillaume, Baurens Franc-Christophe, Hervouet Catherine, Salmon Frédéric, Delos Jean-Marie Eric, Labadie Karine, Perdereau Aude, Mournet Pierre, Blois Louis, Dupouy Marion, Carreel Françoise, Ricci Sebastien, Lemainque Arnaud, Yahiaoui Nabila, D'Hont Angélique. 2020. Plant Journal, 104 : 1698-1711.

Coffee rust epidemics in Central America: Chronicle of a resistance breakdown following the great epidemics of 2012 and 2013. Avelino Jacques, Anzueto Francisco. 2020. In : Emerging plant diseases and global food security. Ristaino Jean Beagle (ed.), Records Angela (ed.). Saint Paul : APS Press, 185-198. ISBN 978-0-89054-638-3

Convergent evolution leading to the appearance of furanocoumarins in citrus plants. Limones-Mendez Mariana, Dugrand-Judek Audray, Villard Cloé, Coqueret Victoire, Froelicher Yann, Bourgaud Frédéric, Olry Alexandre, Hehn Alain. 2020. Plant Science, 292:110392, 9 p.

Evolutionary trajectories in plant-associated Pseudomonas and Xanthomonas strains. Scortichini Marco (ed.), Arnold Dawn (ed.), Pruvost Olivier (ed.), Jacques Marie Agnès (ed.), Bernal Adriana Jimena (ed.). 2020. Lausanne : Frontiers Media, 172 p. (Frontiers Research Topics) ISBN 978-2-88963-700-3

Fitness advantage of inter-species TYLCV recombinants induced by beneficial intra-genomic interactions rather than by specific mutations. Urbino Cica, Regragui Zohra Fatima, Granier Martine, Peterschmitt Michel. 2020. Virology, 542 : 20-27.

Origin and diversity of plant receptor-like kinases. Diévart Anne, Gottin Celine, Périn Christophe, Ranwez Vincent, Chantret Nathalie. 2020. Annual Review of Plant Biology, 71 : 131-156.

Repeated gain and loss of a single gene modulates the evolution of vascular plant pathogen lifestyles. Gluck-Thaler E., Cerutti Aude, Pérez-Quintero Alvaro L., Butchacas Jules, Roman-Reyna Verónica, Madhavan Vishnu Narayanan, Shantharaj Deepak, Merfa Marcus V., Pesce Céline, Jauneau Alain, Vancheva T., Lang Jillian M., Allen Caitilyn, Verdier Valérie, Gagnevin Lionel, Szurek Boris, Beckham Gregg T., De La Fuente Leonardo, Patel Hitendra Kumar, Sonti Ramesh V., Bragard Claude, Leach Jan E., Noel Laurent D., Slot J., Koebnik Ralf, Jacobs Jonathan M.. 2020. Science Advances, 6 (46), 10 p.

When European meets African honeybees (Apis mellifera L.) in the tropics: Morphological changes related to genetics in Mauritius Island. Galataud Julien, Delatte Hélène, Techer Maéva Angélique, Simiand Christophe, Sookar Preeaduth, Reynaud Bernard, Clémencet Johanna. 2020. PloS One, 15 (11):e0242053, 22 p.

Bayesian evolution analyses suggests the global spread of Xanthomonas cynarae pv. gardneri occurred during the global adoption of hybrid tomato seed. Jibrin Mustafa O., Potnis Neha, Timilsina Sujan, Minsavage Gerald V., Shutt V.M., Coutinho Teresa A., Pruvost Olivier, Siri M.I., Pianzzola M.J., Quezado Duval Art M., Nikolaeva Ekaterina V., Egel Daniel S., Creswell Tom, Ruhl Gail E., Maynard Lystranne, Gulig P., Vallad Gary E., Roberts Pamela D., Goss Erica, Jones Jeffrey B.. 2019. Phytopathology, 109 (10S), suppl. Plant Health 2019, Résumé : 141-142. American Phytopathological Society 2019 Annual Meeting, Cleveland, États-Unis, 3 Août 2019/7 Août 2019.

Effector profiles of Xanthomonas perforans and X. euvesicatoria provide insights into the evolution of host range and virulence in BLS pathogens. Iruegas-Bocardo Fernanda, Timilsina Sujan, Jibrin Mustafa O., Minsavage Gerald V., Abrahamian Peter, Egel Daniel S., Creswell Tom, Miller Sydney, Rotondo Francesca, Louws Frank John, Adhikari Tushar, Trueman Cheryl L., Roach Rebecca, Coutinho Teresa A., Pruvost Olivier, Nga Nguyen Thi Thu, Luo Laixin, Kebede Misrak, Potnis Neha, Vallad Gary E., Jones Jeffrey B., Goss Erica. 2019. Phytopathology, 109 (10S), suppl. Plant Health 2019, Résumé : 21-22. American Phytopathological Society 2019 Annual Meeting, Cleveland, États-Unis, 3 Août 2019/7 Août 2019.

Genotyping by sequencing can reveal the complex mosaic genomes in gene pools resulting from reticulate evolution: a case study in diploid and polyploid citrus. Ahmed Dalel, Comte Aurore, Curk Franck, Costantino Gilles, Luro François, Dereeper Alexis, Mournet Pierre, Froelicher Yann, Ollitrault Patrick. 2019. Annals of Botany, 123 (7) : 1231-1251.

Green desert or all you can eat? How diverse and edible was the flora of Vanuatu before human introductions? Lebot Vincent, Sam Chanel. 2019. In : Debating Lapita: Distribution, chronology, society and subsistence. Bedford Stuart (ed.), Spriggs Matthew (ed.). Canberra : ANU Press, 403-415. (Terra Australis, 52) ISBN 978-1-76046-330-4

Old World camels in a modern world – a balancing act between conservation and genetic improvement. Burger Pamela A., Ciani Elena, Faye Bernard. 2019. Animal Genetics, 50 (6) : 598-612.

Autosomal and mitochondrial adaptation following admixture: a case study on the honeybees of Reunion Island. Wragg David, Techer Maéva Angélique, Canale-Tabet Kamila, Basso Benjamin, Bidanel Jean-Pierre, Labarthe Emmanuelle, Bouchez Olivier, Le Conte Yves, Clémencet Johanna, Delatte Hélène, Vignal Alain. 2018. Genome Biology and Evolution, 10 (1) : 220-238.

Cropping systems. Réchauchère Olivier, Makowski David, Malézieux Eric, Maraux Florent. 2018. In : Land use and food security in 2050: a narrow road. Le Mouël Chantal (ed.), De Lattre-Gasquet Marie (ed.), Mora Olivier (ed.). Versailles : Ed. Quae, 179-193. (Matière à débattre et décider) ISBN 978-2-7592-2880-5

Diversité, écologie et évolution des plantes monocaules de Nouvelle-Calédonie. Bruy David. 2018. Montpellier : Université de Montpellier, 329 p. Thèse de doctorat : Ecologie fonctionnelle et sciences agronomiques : Université de Montpellier

Experimental demonstration of the impact of hard and soft selection regimes on polymorphism maintenance in spatially heterogeneous environments. Gallet Romain, Froissart Rémi, Ravigné Virginie. 2018. Evolution, 72 (8) : 1677-1688.

Farm structures: Current shaping forces and future farms. Donnars Catherine, De Lattre-Gasquet Marie, Marzin Jacques, Piet Laurent. 2018. In : Land use and food security in 2050: a narrow road. Le Mouël Chantal (ed.), De Lattre-Gasquet Marie (ed.), Mora Olivier (ed.). Versailles : Ed. Quae, 155-178. (Matière à débattre et décider) ISBN 978-2-7592-2880-5

Genomics of the origin and evolution of Citrus. Wu Guohong Albert, Terol Javier F., Ibáñez Victoria, López-García Antonio, Pérez-Román Estela, Borredá Carles, Domingo Concha, Tadeo Francisco, Carbonell-Caballero Jose, Alonso Roberto, Curk Franck, Du Dongliang, Ollitrault Patrick, Roose Mikeal L., Dopazo Joaquin, Gmitter Frederick G., Rokhsar Daniel S., Talon Manuel. 2018. Nature, 554 (7692) : 311-136.

Late Holocene forest contraction and fragmentation in central Africa. Maley Jean, Doumenge Charles, Giresse Pierre, Mahé Gil, Philippon Nathalie, Hubau Wannes, Lokonda Michel O., Tshibamba Johm M., Chepstow-Lusty Alex. 2018. Quaternary Research, 89 (1), n.spéc. Tribute to Daniel Livingstone and Paul Colinvaux : 43-59.

Origin and evolution. Coppens D'Eeckenbrugge Geo, Duval Marie-France, Leal Freddy. 2018. In : The pineapple: Botany, production and uses. Sanewski Garth M. (ed.), Bartholomew Duane P. (ed.), Paull Robert E. (ed.). Wallingford : CABI, 32-41. ISBN 978-1-78639-330-2

Torymidae (Hymenoptera, Chalcidoidea) revised: Molecular phylogeny, circumscription and reclassification of the family with discussion of its biogeography and evolution of life-history traits. Jansta Peter, Cruaud Astrid, Delvare Gérard, Genson Gwenaëlle, Heraty John M., Krizkova Barbora, Rasplus Jean-Yves. 2018. Cladistics, 34 (6) : 627-651.

The typical RB76 recombination breakpoint of the invasive recombinant tomato yellow leaf curl virus of Morocco can be generated experimentally but is not positively selected in tomato. Belabess Zineb, Urbino Cica, Granier Martine, Tahiri Abdessalem, Blenzar Abdelali, Peterschmitt Michel. 2018. Virus Research, 243 : 44-51.

Are French geographical indications losing their soul? Anglicizing recent developments in the governance of the link to the origin in France. Marie-Vivien Delphine, Bérard Laurence, Boutonnet Jean-Pierre, Casabianca François. 2017. World Development, 98 : 25-34.

Biological traits, rather than environment, shape detection curves of large vertebrates in neotropical rainforests. Denis Thomas, Richard-Hansen Cécile, Brunaux Olivier, Etienne Marie-Pierre, Guitet Stéphane, Hérault Bruno. 2017. Ecological Applications, 27 (5) : 1564-1577.

Diversité et origine génétique des espèces de la sous famille des Aurantioideae et décryptage des structures interspécifiques des génomes des agrumes modernes. Oueslati Bahri Amel. 2017. Tunis : Université de Tunis El Manar, 200 p. Thèse de doctorat : Biologie. Génétique et biologie moléculaire : Université de Tunis El Manar

Domestication rewired gene expression and nucleotide diversity patterns in tomato. Sauvage Christopher, Rau Andrea, Aichholz Charlotte, Chadoeuf Joël, Sarah Gautier, Ruiz Manuel, Santoni Sylvain, Causse Mathilde, David Jacques, Glemin Sylvain. 2017. Plant Journal, 91 (4) : 631-645.

Evolutionary forces affecting synonymous variations in plant genomes. Clément Yves, Sarah Gautier, Holtz Yan, Homa Félix, Pointet Stéphanie, Contreras Sandy, Nabholz Benoit, Sabot François, Sauné Laure, Ardisson Morgane, Bacilieri Roberto, Besnard Guillaume, Berger Angélique, Cardi Céline, De Bellis Fabien, Fouet Olivier, Jourda Cyril, Khadari Bouchaib, Lanaud Claire, Leroy Thierry, Pot David, Sauvage Christopher, Scarcelli Nora, Tregear James, Vigouroux Yves, Yahiaoui Nabila, Ruiz Manuel, Santoni Sylvain, Labouisse Jean-Pierre, Pham Jean Louis, David Jacques, Glemin Sylvain. 2017. PLoS Genetics, 13 (5):e1006799, 28 p.

Exploring the relationship between tychoparthenogenesis and inbreeding depression in the Desert Locust, Schistocerca gregaria. Little Chelsea, Chapuis Marie-Pierre, Blondin Laurence, Chapuis Elodie, Jourdan Hélène. 2017. Ecology and Evolution, 7 (15) : 6003-6011.

Genome-wide association analysis identifies resistance loci for bacterial blight in a diverse collection of indica rice germplasm. Zhang Fan, Wu Zhi-Chao, Wang Ming-Ming, Dingkuhn Michael, Xu Jian-Long, Zhou Yong-Li, Li Zhikang. 2017. PloS One, 12 (3):e0174598, 17 p.

Genotyping by sequencing reveals the interspecific C. maxima / C. reticulata admixture along the genomes of modern citrus varieties of mandarins, tangors, tangelos, orangelos and grapefruits. Oueslati Amel, Salhi-Hannachi Amel, Luro François, Vignes Hélène, Mournet Pierre, Ollitrault Patrick. 2017. PloS One, 12 (10):e0185618, 22 p.

Giant tortoises spread to western Indian Ocean islands by sea drift in pre-Holocene times, not by later human agency - response to Wilmé et al. (2016a). Cheke Anthony S., Pedrono Miguel, Bour Roger, Anderson Atholl, Griffiths Christine, Iverson John B., Hume Julian P., Walsh Martin. 2017. Journal of Biogeography, 44 (6) : 1426-1429.

Linking 2D observations to 3D modeling of enamel microstructure – a new integrative framework applied to hippopotamoidea evolutionary history. Alloing-Séguier Léanie, Martinand-Mari Camille, Barczi Jean-François, Lihoreau Mathieu. 2017. Journal of Mammalian Evolution, 24 (2) : 221-231.

Natural variation in life history strategy of Arabidopsis thaliana determines stress responses to drought and insects of different feeding guilds. Davila Olivas Nelson H., Frago Enric, Thoen Manus P. M., Kloth Karen J., Becker Frank F. M., Van Loon Joop J.A., Gort Gerrit, Keurentjes Joost J. B., van Heerwaarden Joost, Dicke Marcel. 2017. Molecular Ecology, 26 (11) : 2959-2977.

Phytophthora megakarya and Phytophthora palmivora, closely related causal agents of cacao black pod rot, underwent increases in genome sizes and gene numbers by different mechanisms. Ali Shahin, Shao Jonathan, Lary David J., Kronmiller Brent A., Shen Danyu, Strem Mary, Amoako-Attah Ishmael, Yaw Akrofi Andrew, Begoude Dider, Ten Hoopen Gerben Martijn, Coulibaly Klotioloma, Kébé Boubacar Ismaël, Melnick Rachel L., Guiltinan Mark J., Tyler Brett, Meinhardt Lyndel W., Bailey Bryan. 2017. Genome Biology and Evolution, 9 (3) : 536-557.

Tipdatingbeast: An r package to assist the implementation of phylogenetic tip-dating tests using beast. Rieux Adrien, Khatchikian Camilo E.. 2017. Molecular Ecology Resources, 17 (4) : 608-613.

The evolutionary fate of the chloroplast and nuclear rps16 genes as revealed through the sequencing and comparative analyses of four novel legume chloroplast genomes from Lupinus. Keller J., Rousseau-Gueutin Mathieu, Martin Guillaume, Morice Jérôme, Boutte Julien, Coissac E., Ourari M., Ainouche Malika Lily, Salmon Armel, Cabello-Hurtado F., Ainouche Abdelkader. 2017. DNA Research, 24 (4) : 343-358.

A first higher-level time-calibrated phylogeny of antlions (Neuroptera: Myrmeleontidae). Michel Bruno, Clamens Anne-Laure, Béthoux Olivier, Kergoat Gael J., Condamine Fabien L.. 2017. Molecular Phylogenetics and Evolution, 107 : 103-116.

A large set of 26 new reference transcriptomes dedicated to comparative population genomics in crops and wild relatives. Sarah Gautier, Homa Félix, Pointet Stéphanie, Contreras Sandy, Sabot François, Nabholz Benoit, Santoni Sylvain, Sauné Laure, Ardisson Morgane, Chantret Nathalie, Sauvage Christopher, Tregear James, Jourda Cyril, Pot David, Vigouroux Yves, Chaïr Hâna, Scarcelli Nora, Billot Claire, Yahiaoui Nabila, Bacilieri Roberto, Khadari Bouchaib, Boccara Michel, Barnaud Adeline, Péros Jean-Pierre, Labouisse Jean-Pierre, Pham Jean Louis, David Jacques, Glemin Sylvain, Ruiz Manuel. 2017. Molecular Ecology Resources, 17 (3) : 565-580.

Ancient and modern DNA reveal dynamics of domestication and cross-continental dispersal of the dromedary. Almathen Faisal, Charruau Pauline, Mohandesan Elmira, Mwacharo Joram M., Orozco-terWengel Pablo, Pitt Daniel, Abdussamad Abdussamad M., Uerpmann Margarethe, Uerpmann Hans-Peter, De Cupere Bea, Magee Peter, Alnaqeeb Majed A., Salim Bashir, Raziq Abdul, Dessie Tadelle, Abdelhadi Omer M.A., Banabazi Mohammad H., Al-Eknah Marzouk, Walzer Chris, Faye Bernard, Hofreiter Michael, Peters Joris, Hanotte Olivier, Burger Pamela A.. 2016. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 113 (24) : 6707-6712.

Biodiversity and health: Lessons and recommendations from an interdisciplinary conference to advise Southeast Asian research, society and policy. Walther Bruno Andreas, Boëte Christophe, Binot Aurélie, By Youlet, Cappelle Julien, Carrique-Mas Juan, Chou Monidarin, Furey Neil M., Kim Sothea, Lajaunie Claire, Lek Sovan, Méral Philippe, Neang Malyne, Tan Boon-Huan, Walton Catherine, Morand Serge. 2016. Infection, Genetics and Evolution, 40 : 29-46.

Combining conservative and variable markers to infer the evolutionary history of Prunus subgen. Amygdalus s.l. under domestication. Delplancke Malou, Yazbek Mariana, Arrigo Nils, Espindola Anahi, Joly Hélène, Alvarez Nadir. 2016. Genetic Resources and Crop Evolution, 63 (2) : 221-234.

Divergent evolutionary and epidemiological dynamics of cassava mosaic geminiviruses in Madagascar. De Bruyn Alexandre, Harimalala Mireille Aurélie, Zinga Innocent, Mabvakure Batsirai, Hoareau Murielle, Ravigné Virginie, Walters Matthew, Reynaud Bernard, Varsani Arvind, Harkins Gordon William, Martin Darren Patrick, Lett Jean-Michel, Lefeuvre Pierre. 2016. BMC Evolutionary Biology, 16 (182), 21 p.

Ecosystem Services and Climate Change. Locatelli Bruno. 2016. In : Routledge handbook of ecosystem services. Potschin Marion (ed.), Haines-Young Roy (ed.), Fish Robert (ed.), Turner R. Kerry (ed.). New York : Routledge, 481-490. ISBN 978-1-138-02508-0

Evolution of compatibility range in the rice-Magnaporthe oryzae system: An uneven distribution of R genes between rice subspecies. Gallet Romain, Fontaine Colin, Bonnot François, Milazzo Joëlle, Tertois Christophe, Adreit Henri, Ravigné Virginie, Fournier Elisabeth, Tharreau Didier. 2016. Phytopathology, 106 (4) : 348-354.

Evolutionary dynamics of the Leucine-Rich Repeats Receptor-Like Kinase (LRR-RLK) subfamily in angiosperms. Fischer Iris, Diévart Anne, Droc Gaëtan, Dufayard Jean François, Chantret Nathalie. 2016. Plant Physiology, 170 (3) : 1595-1610.

Evolutionary heritage influences Amazon tree ecology. Coelho de Souza Fernanda, Dexter Kyle G., Phillips Oliver L., Brienen Roel, Chave Jérôme, Galbraith David, Lopez Gonzalez Gabriela, Monteagudo Mendoza Abel, Pennington R.T., Poorter Lourens, Alexiades Miguel N., Álvarez-Dávila Esteban, Andrade Ana, Aragao Luiz E.O.C., Araujo-Murakami Alejandro, Arets Eric J. M. M., Aymard Corredor Gerardo A., Baraloto Christopher, Barroso Jorcely, Bonal Damien, Boot Rene G.A., Camargo Jose Luis C., Comiskey James, Cornejo Valverde Fernando, de Camargo Plínio B., Di Fiore Anthony, Elias Fernando, Erwin Terry, Feldpausch Ted R., Ferreira Leandro V., Fyllas Nikolaos M., Gloor Emanuel, Hérault Bruno, et al.. 2016. Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, 283 (1844):20161587, 10 p.

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Multilocus phylogeny and ecological differentiation of the "Eupelmus urozonus species group" (Hymenoptera, Eupelmidae) in the West-Palaearctic. Al Khatib Fadel, Cruaud Astrid, Fusu Lucian, Genson Gwenaëlle, Rasplus Jean-Yves, Ris Nicolas, Delvare Gérard. 2016. BMC Evolutionary Biology, 16 (13), 20 p.

Preliminary study on prevalence, risk factor and genetic homogeneity of porcine reproductive and respiratory syndrome virus in registered pig farms in Heilongjiang, China. Wang Jingfei, Wen H., Wang Shaoli, Sun W., Shen N., Liu Z., Liu Yating, Jiang C., Sun G., Goutard Flavie, Cai X.. 2016. Transboundary and Emerging Diseases, 63 (5) : e369-e380.

TALE-Like Effectors are an ancestral feature of the #Ralstonia solanacearum" species complex and converge in DNA targeting specificity. Schandry Niklas, de Lange Orlando, Prior Philippe, Lahaye Thomas. 2016. Frontiers in Plant Science, 7 (1225), 16 p.

Towards a molecular taxonomic key of the Aurantioideae subfamily using chloroplastic SNP diagnostic markers of the main clades genotyped by competitive allele-specific PCR. Oueslati Amel, Ollitrault Frédérique, Baraket Ghada, Salhi-Hannachi Amel, Navarro Luis, Ollitrault Patrick. 2016. BMC Genetics, 17 (118), 14 p.

Transcriptome analysis in Coffea eugenioides, an Arabica coffee ancestor, reveals differentially expressed genes in leaves and fruits. Yuyama Priscilla Mary, Reis Júnior Osvaldo, Ivamoto Suzana Tiemi, Domingues Douglas S., Carazzolle Marcelo Falsarella, Pereira Gonçalo Amarante Guimarães, Charmetant Pierre, Leroy Thierry, Pereira Luiz Filipe P.. 2016. Molecular Genetics and Genomics, 291 (1) : 323-336.

A gene-based map of the Nod factor-independent Aeschynomene evenia sheds new light on the evolution of nodulation and legume genomes. Chaintreuil Clémence, Rivallan Ronan, Bertioli David J., Klopp Christophe, Gouzy Jérôme, Courtois Brigitte, Leleux Philippe, Martin Guillaume, Rami Jean-François, Gully Djamel, Parrinello Hugues, Severac Dany, Patrel Delphine, Fardoux Joël, Ribière William, Boursot Marc, Cartieaux Fabienne, Czernic Pierre, Ratet Pascal, Mournet Pierre, Giraud Eric, Arrighi Jean-François. 2016. DNA Research, 23 (4) : 365-376.

Biological invasion and biological control select for different life histories. Tayeh Ashraf, Hufbauer Ruth A., Estoup Arnaud, Ravigné Virginie, Frachon Léa, Facon Benoît. 2015. Nature Communications, 6 (7268), 5 p.

Clade- and species-specific features of genome evolution in the Saccharomycetaceae. Wolfe Kenneth H., Armisén David, Proux-Wera Estelle, ÓhÉigeartaigh Seán S., Azam Haleema, Gordon Jonathan, Byrne Kevin P.. 2015. FEMS Yeast Research, 15 (5), 12 p.

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Comparative genomics of 43 strains of Xanthomonas citri pv. citri reveals the evolutionary events giving rise to pathotypes with different host ranges. Gordon Jonathan, Lefeuvre Pierre, Escalon Aline, Barbe Valérie, Cruveiller Stéphane, Gagnevin Lionel, Pruvost Olivier. 2015. BMC Genomics, 16 (1098), 20 p.

Comparative genomics of a cannabis pathogen reveals insight into the evolution of pathogenicity in Xanthomonas. Jacobs Jonathan M., Pesce Céline, Lefeuvre Pierre, Koebnik Ralf. 2015. Frontiers in Plant Science, 6 (431), 13 p.

Deciphering genome content and evolutionary relationships of isolates from the fungus Magnaporthe oryzae attacking different host plants. Chiapello Hélène, Mallet Ludovic, Guerin Cyprien, Aguileta Gabriela, Amselem Joelle, Kroj Thomas, Ortega-Abboud Enrique, Lebrun Marc-Henri, Henrissat Bernard, Gendrault Annie, Rodolphe François, Tharreau Didier, Fournier Elisabeth. 2015. Genome Biology and Evolution, 7 (10) : 2896-2912.

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Diversité, évolution et contrôle des virus des plantes tropicales : l'ennemi peut aussi venir de l'intérieur. Caruana Marie-Line. 2015. Montpellier : Université de Montpellier 2, 73 p. Habilitation à diriger des recherches : Université Montpellier 2

Draft genome sequence of Xanthomonas sacchari strain LMG 476. Pieretti Isabelle, Bolot Stéphanie, Carrère Sébastien, Barbe Valérie, Cociancich Stéphane, Rott Philippe, Royer Monique. 2015. Genome Announcements, 3 (2):e00146, 2 p.

Dynamique évolutive de Ralstonia solanacearum en réponse aux pressions de sélection de l'aubergine résistante : approche populationnelle, de génétique évolutive et fonctionnelle de la durabilité de la résistance. Guinard Jérémy. 2015. Saint-Denis : Université de la Réunion, 415 p. Thèse de doctorat : Sciences. Génétique des populations, phytopathologie, bactériologie, épidémiologie moléculaire : Université de la Réunion

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Evidence of intense chromosomal shuffling during conifer evolution. de Miguel Marina, Bartholomé Jérôme, Ehrenmann François, Murat Florent, Moriguchi Yoshinari, Uchiyama Kentaro, Ueno Saneyoshi, Tsumura Yoshihiko, Lagraulet Hélène, de Maria Nuria, Cabezas José-Antonio, Cervera María-Teresa, Gion Jean-Marc, Salse Jérôme, Plomion Christophe. 2015. Genome Biology and Evolution, 7 (1) : 2799-2809.

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Diversité, évolution et émergence des phytovirus à transmission vectorielle : la chronique des géminivirus. Lett Jean-Michel. 2014. Saint-Denis : Université de la Réunion, 85 p. Habilitation à diriger des recherches : Université de la Réunion

Ecologie, diversité, et découverte de phytovirus à l'échelle de deux agro-écosystèmes dans un cadre spatio-temporel à l'aide de la géo-métagénomique. Bernardo Pauline. 2014. Montpellier : UM2, 278 p. Thèse de doctorat : Microbiologie parasitologie : Université Montpellier 2

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Sélection et évolution de la résistance aux fongicides systémiques chez Mycosphaerella fijiensis agent causal de la maladie des raies noires des bananiers. Ngando Essoh Otto Josué. 2014. Montpellier : Montpellier SupAgro, 143 p. Thèse de doctorat : Systèmes intégrés en biologie, agronomie, géosciences, hydrosciences et environnement (SIBAGHE) : Montpellier SupAgro Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques

The coffee genome provides insight into the convergent evolution of caffeine biosynthesis. Denoeud France, Carretero-Paulet Lorenzo, Dereeper Alexis, Droc Gaëtan, Guyot Romain, Pietrella Marco, Chunfang Zheng, Alberti Adriana, Anthony François, Aprea Giuseppe, Aury Jean-Marc, Bento Pascal, Bernard Maria, Bocs Stéphanie, Campa Claudine, Cenci Alberto, Combes Marie-Christine, Crouzillat Dominique, Da Silva Corinne, Daddiego Loretta, De Bellis Fabien, Dussert Stéphane, Garsmeur Olivier, Gayraud Thomas, Guignon Valentin, Jahn Katharina, Jamilloux Véronique, Joët Thierry, Labadie Karine, Tianying Lan, Leclercq Julie, Lepelley Maud, Leroy Thierry, Lei-Ting Li, Librado Pablo, Lopez Loredana, Muñoz Adriana, Noël Benjamin, Pallavicini Alberto, Perrotta Gaetano, Poncet Valérie, Pot David, Priyono, Rigoreau Michel, Rouard Mathieu, Rozas Julio, Tranchant-Dubreuil Christine, VanBuren Robert, Qiong Zhang, Andrade Alan A., Argout Xavier, Bertrand Benoît, De Kochko Alexandre, Graziosi Giorgio, Henry Robert, Jayarama, Ming Ray, Nagai Chifumi, Rounsley Steve, Sankoff David, Giuliano Giovanni, Albert Victor A., Wincker Patrick, Lashermes Philippe. 2014. Science, 345 (6201) : 1181-1184.

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The genomic substrate for adaptive radiation in African cichlid fish. Brawand David, Wagner Catherine E., Li Yang I., Malinsky Milan, Keller Irène, Fan Shaohua, Simakov Oleg, Ng Alvin Y., Lim Zhi Wei, Bezault Etienne, Turner-Maier Jason, Johnson Jeremy, Alcazar Rosa, Noh Hyun Ji, Russell Pamela, Aken Bronwen, Alföldi Jessica, Amemiya Chris, Azzouzi Naoual, Baroiller Jean-François, Barloy-Hubler Frédérique, Berlin Aaron, Bloomquist Ryan, Carleton Karen L., Conte Matthew A., D'Cotta Helena, Eshel Orly, Gaffney Leslie, Galibert Francis, Gante Hugo F., Gnerre Sante, Greuter Lucie, Guyon Richard, Haddad Nathalie S., Haerty Wilfried, Harris Rayna M., Hofmann Hans A., Hourlier Thibaut, Hulata Gideon, Jaffe David B., Lara Marcia, Lee Alison P., MacCallum Iain, Mwaiko Salome, Nikaido Masato, Nishihara Hidenori, Ozouf-Costaz Catherine, Penman David J., Przybylski Darius, Rakotomanga Michelle, Renn Suzy C. P., Ribeiro Filipe J., Ron Micha, Salzburger Walter, Sanchez-Pulido Luis, Santos Emilia, Searle Steve, Sharpe Ted, Swofford Ross, Tan Frederick J., Williams Louise, Young Sarah, Yin Shuangye, Okada Norihiro, Kocher Thomas D., Miska Eric A., Lander Eric S., Venkatesh Byrappa, Fernald Russell D., Meyer Axel, Ponting Chris P., Streelman J. Todd, Lindblad-Toh Kerstin, Seehausen Ole, Di Palma Frederica. 2014. Nature, 513 (7518) : 375-381.

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Cytological and molecular characterization of three gametoclones of Citrus clementina. Germanà Maria Antonietta, Aleza Pablo, Carrera Esther, Chen Chunxian, Chiancone Benedetta, Costantino Gilles, Dambier Dominique, Deng Xiuxin, Federici Claire T., Froelicher Yann, Guo Wenwu, Ibáñez Victoria, Juarez José, Kwok Kevin, Luro François, Machado Marcos Antonio, Naranjo Miguel Angel, Navarro Luis, Ollitrault Patrick, Rios Gabino, Roose Mikeal L., Talon Manuel, Xu Qiang, Gmitter Frederick G. Jr.. 2013. BMC Plant Biology, 13 (1), 8 p.

Endogenous pararetroviruses - a reservoir of virus infection in plants. Chabannes Matthieu, Iskra Caruana Marie-Line. 2013. Current Opinion in Virology, 3 (6) : 615-620.

Global analysis of Coffea canephora Pierre ex Froehner (Rubiaceae) from the Guineo-Congolese region reveals impacts from climatic refuges and migration effects. Cubry Philippe, De Bellis Fabien, Pot David, Musoli Pascal, Leroy Thierry. 2013. Genetic Resources and Crop Evolution, 60 (2) : 483-501.

Historical collections reveal patterns of diffusion of sweet potato in Oceania obscured by modern plant movements and recombination. Roullier Caroline, Benoit Laure, McKey Doyle B., Lebot Vincent. 2013. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 110 (6) : 2205-2210.

Host associations, biogeography, and phylogenetics of avian malaria in southern African waterfowl. Cumming Graeme S., Shepard Eric, Okanga Sharon, Caron Alexandre, Ndlovu Mduduzi, Peters Jeffrey L.. 2013. Parasitology, 140 : 193-201.

Identification and characterisation of a highly divergent geminivirus: Evolutionary and taxonomic implications. Bernardo Pauline, Golden Michael, Akram Mohammad, Naimuddin, Nadarajan Nagaswamy, Fernandez Emmanuel, Granier Martine, Rebelo Anthony, Peterschmitt Michel, Martin Darren Patrick, Roumagnac Philippe. 2013. Virus Research, 177 (1) : 35-45.

Insight into the biology, genetics and evolution of the Centella asiatica polyploid complex in Madagascar. Rakotondralambo Raoseta Soaharin'my Ony, Rodier-Goud Marguerite, Rivallan Ronan, Lussert Alexandra, Danthu Pascal, De Lamotte Frédéric, Ralambofetra Eliane, Ramavovololona Perle, Noyer Jean-Louis, Baurens Franc-Christophe. 2013. Industrial Crops and Products, 47 : 118-125.

Isolation and characterization of microsatellite loci from Iguana delicatissima (Reptilia: Iguanidae), new perspectives for investigation of hybridization events with Iguana iguana. Valette V., Filipová L., Vuillaume B., Cherbonnel C., Risterucci Ange-Marie, Delaunay C., Breuil M., Grandjean F.. 2013. Conservation Genetics Resources, 5 (1) : 173-175.

L'Egypte des produits laitiers. Projet JEAI DAIRY. Galal Salah, Alary Véronique. 2013. Sciences au Sud (70) : 6.

Microsatellite and flow cytometry analysis to help understand the origin of Dioscorea alata polyploids. Némorin Alice, David Jacques, Maledon Erick, Nudol Elie, Dalon J., Arnau Gemma. 2013. Annals of Botany, 112 (5) : 811-819.

New avian paramyxoviruses type I strains identified in Africa provide new outcomes for phylogeny reconstruction and genotype classification. Servan de Almeida Renata, Hammoumi Saliha, Gil Patricia, Briand François-Xavier, Molia Sophie, Gaidet Nicolas, Cappelle Julien, Chevalier Véronique, Balança Gilles, Traoré Abdallah, Grillet Colette, Fridolin Maminiaina Olivier, Guendouz Samia, Dakouo Martin, Samake Kassim, Bezeid Ould El Mamy, Diarra Abbas, Chaka Hassen, Goutard Flavie, Thompson Peter, Martinez Dominique, Jestin Véronique, Albina Emmanuel. 2013. PloS One, 8 (10):e76413, 16 p.

Organisation et évolution de familles de gènes impliqués dans la maturation du fruit chez le bananier. Jourda Cyril. 2013. Montpellier : UM2, 353 p. Thèse de doctorat : Systèmes intégrés en biologie, agronomie, géosciences, hydrosciences et environnement (SIBAGHE). Biologie intégrative des plantes : Université Montpellier 2

Organización de la diversidad genética de los cítricos. Garcia Lor Andrés. 2013. Valence : Universidad Politecnica de Valencia, 259 p. Tesis doctoral : Universidad Politecnica de Valencia

Pan-African genetic structure in the African Buffalo (Syncerus caffer): Investigating intraspecific divergence. Smitz Nathalie, Berthouly Cécile, Cornélis Daniel, Heller Rasmus, Van Hooft Pim, Chardonnet Philippe, Caron Alexandre, Prins Herbert, Van Vuuren Bettine Jansen, De Longh Hans, Michaux Johan. 2013. PloS One, 8 (2):e56325, 17 p.

Population genomics of the endangered giant Galápagos tortoise. Loire Etienne, Chiari Ylenia, Bernard Aurélien, Cahais Vincent, Romiguier Jonathan, Nabholz Benoit, Lourenco Joao M., Galtier Nicolas. 2013. Genome Biology, 14 (12) : R136.

Systématique et évolution du genre Psychotria (Rubiaceae) en Nouvelle-Calédonie. Barrabé Laure. 2013. Nouméa : UNC, 367 p. Thèse de doctorat : ès Physiologie et biologie des organismes - Populations - Interactions : Université de la Nouvelle-Calédonie

Thermotolerance adaptation to human-modified habitats occurs in the native range of the invasive ant Wasmannia auropunctata before long-distance dispersal. Foucaud Julien, Rey Olivier, Robert Stéphanie, Crespin Laurent, Orivel Jérôme, Facon Benoît, Loiseau Anne, Jourdan Hervé, Kenne Martin, Mbenoun Masse Paul Serge, Tindo Maurice, Vonshak Merav, Estoup Arnaud. 2013. Evolutionary Applications, 6 (4) : 721-734.

Une relation trophique originale : la vection entomophile d'agents pathogènes. Herrbach Etienne, Sauvion Nicolas, Boudon-Padieu Elisabeth, Lett Jean-Michel, Reynaud Bernard, Sforza René. 2013. In : Interactions insectes-plantes. Sauvion Nicolas (ed.), Calatayud Paul-André (ed.), Thiéry Denis (ed.), Marion-Poll Frédéric (ed.). Marseille : IRD [Marseille], 511-548. ISBN 978-2-7099-1746-9|978-2-7592-2018-2

Using a surviving lineage of Madagascar's vanished megafauna for ecological restoration. Pedrono Miguel, Griffiths Owen L., Clausen Alison, Smith Lora L., Griffiths Christine J., Wilmé Lucienne, Burney David A.. 2013. Biological Conservation, 159 : 501-506.

The complete chloroplast genome of banana (Musa acuminata, Zingiberales): Insight into plastid monocotyledon evolution. Martin Guillaume, Baurens Franc-Christophe, Cardi Céline, Aury Jean-Marc, D'Hont Angélique. 2013. PloS One, 8 (6):e67350, 10 p.

Adaptive evolution by recombination is not associated with increased mutation rates in Maize streak virus. Monjane Adérito Luis, Pande Daniel, Lakay Francisco, Shepherd Dionne Natalie, Van der Walt Eric, Lefeuvre Pierre, Lett Jean-Michel, Varsani Arvind, Rybicki Edward P., Martin Darren Patrick. 2012. BMC Evolutionary Biology, 12 (252), 13 p.

Analysis of the Meiotic Segregation in Intergeneric Hybrids of Tilapias. Bezault Etienne, Rognon François, Clota Frédéric, Gharbi Karim, Baroiller Jean-François, Chevassus Bernard. 2012. International Journal of Evolutionary Biology, 2012 (ID 817562), 10 p.

Ancestral synteny shared between distantly-related plant species from the asterid (Coffea canephora and Solanum Sp.) and rosid (Vitis vinifera) clades. Guyot Romain, Lefebvre-Pautigny Florent, Tranchant-Dubreuil Christine, Rigoreau Michel, Hamon Perla, Leroy Thierry, Hamon Serge, Poncet Julie, Crouzillat Dominique, De Kochko Alexandre. 2012. BMC Genomics, 13 (103), 14 p.

Anthropogenically induced adaptation to invade (AIAI) : Contemporary adaptation to human-altered habitats within the native range can promote invasions. Hufbauer Ruth A., Facon Benoît, Ravigné Virginie, Turgeon Julie, Foucaud Julien, Lee Carol E., Rey Olivier, Estoup Arnaud. 2012. Evolutionary Applications, 5 (1) : 89-101.

Arms race co-evolution of Magnaporthe oryzae AVR-Pik and rice Pik genes driven by their physical interactions. Kanzaki Hiroyuki, Yoshida Kentaro, Saitoh Hiromasa, Fujisaki Koki, Hirabuchi Akiko, Alaux Ludovic, Fournier Elisabeth, Tharreau Didier, Terauchi Ryohei, Sundaresan Venkatesan. 2012. Plant Journal, 72 (6) : 894-907.

Circulating virus load determines the size of bottlenecks in viral populations progressing within a host. Gutiérrez Serafin, Yvon Michel, Pirolles Elodie, Garzo Elisa, Fereres Alberto, Michalakis Yannis, Blanc Stéphane. 2012. PLoS Pathogens, 8 (11):e1003009, 10 p.

Contrasting recombination patterns and demographic histories of the plant pathogen Ralstonia solanacearum inferred from MLSA. Wicker Emmanuel, Lefeuvre Pierre, De Cambiaire Jean-Charles, Lemaire Christophe, Poussier Stéphane, Prior Philippe. 2012. ISME Journal, 6 : 961-974.

Deciphering arboviral emergence within insular ecosystems. Tortosa Pablo, Pascalis Hervé, Guernier Vanina, Cardinale Eric, Le Corre Matthieu, Goodman Steven M., Dellagi Koussay. 2012. Infection, Genetics and Evolution, 12 (6) : 1333-1339.

Development of indel markers from Citrus clementina (Rutaceae) BAC-end sequences and interspecific transferability in Citrus. Ollitrault Frédérique, Terol Javier F., Martin Alena Alonso, Pina José Antonio, Navarro Luis, Talon Manuel, Ollitrault Patrick. 2012. American Journal of Botany, 99 (7), e268-e273

Détection et caractérisation moléculaires rapides du virus de la peste porcine africaine et utilisation des reconstructions phylogénétiques pour reconstituer son histoire évolutive. Michaud Vincent. 2012. Montpellier : UM2, 252 p. Thèse de doctorat : Science chimique et biologique de la santé. Virologie : Université Montpellier 2

Evolution of African cassava mosaic virus by recombination between bipartite and monopartite begomoviruses. Tiendrebeogo Fidèle, Lefeuvre Pierre, Hoareau Murielle, Harimalala Mireille Aurélie, De Bruyn Alexandre, Villemot Julie, Traore Valentin S.E., Konaté Gnissa, Traoré Alfred S., Barro Nicolas, Reynaud Bernard, Traoré Oumar, Lett Jean-Michel. 2012. Virology Journal, 9 (67), 7 p.

Growth form evolution in piperales and its relevance for understanding angiosperm diversification: An integrative approach combining plant architecture, anatomy, and biomechanics. Isnard Sandrine, Prospéri Maria-Juliana, Wanke Stefan, Wagner Sarah T., Samain Marie-Christine, Trueba Santiago, Frenzke Lena, Neinhuis Christoph, Rowe Nick P.. 2012. International Journal of Plant Sciences, 173 (6) : 610-639.

Matita, a new retroelement from peanut : Characterization and evolutionary context in the light of the Arachis A-B genome divergence. Nielen Stephan, Vidigal Bruna S., Leal-Bertioli Soraya C.M., Ratnaparkhe Milind B., Paterson Andrew H., Garsmeur Olivier, D'Hont Angélique, Guimarães Patricia M., Bertioli David J.. 2012. Molecular Genetics and Genomics, 287 (1) : 21-38.

Mitochondrial genomes reveal the global phylogeography and dispersal routes of the migratory locust. Ma Chuan, Yang Pengcheng, Jiang Feng, Chapuis Marie-Pierre, Shali Yasen, Sword Gregory A., Kang Le. 2012. Molecular Ecology, 21 (17) : 4344-4358.

Pollen-based climate reconstruction: Calibration of the vegetation-pollen processes. Garreta V., Guiot J., Mortier Frédéric, Chadoeuf Joël, Hély Christelle. 2012. Ecological Modelling, 235-236 : 81-94.

Quels sont les enjeux au cours de l'évolution du bananier qui ont conduit au maintien de séquences virales de Banana streak virus dans son génome ? Duroy Pierre-Olivier. 2012. Montpellier : UM2, 213 p. Thèse de doctorat : Systèmes intégrés en biologie, agronomie, géosciences, hydrosciences et environnement (SIBAGHE). Biologie intégrative des plantes : Université Montpellier 2

The banana (Musa acuminata) genome and the evolution of monocotyledonous plants. D'Hont Angélique, Denoeud France, Aury Jean-Marc, Baurens Franc-Christophe, Carreel Françoise, Garsmeur Olivier, Noël Benjamin, Bocs Stéphanie, Droc Gaëtan, Rouard Mathieu, Da Silva Corinne, Jabbari Kamel, Cardi Céline, Poulain Julie, Souquet Marlène, Labadie Karine, Jourda Cyril, Lengellé Juliette, Rodier-Goud Marguerite, Alberti Adriana, Bernard Maria, Correa Margot, Ayyampalayam Saravanaraj, Mckain Michael R, Leebens-Mack Jim, Burgess Diane, Freeling Mike, Mbéguié-A-Mbéguié Didier, Chabannes Matthieu, Wicker Thomas, Panaud Olivier, Barbosa Jose, Hribova Eva, Heslop Harrison Pat, Habas Rémy, Rivallan Ronan, François Philippe, Poiron Claire, Kilian Andrzej, Burthia Dheema, Jenny Christophe, Bakry Frédéric, Brown Spencer, Guignon Valentin, Kema Gert H.J., Dita Miguel A., Waalwijk Cees, Joseph Steeve, Diévart Anne, Jaillon Olivier, Leclercq Julie, Argout Xavier, Lyons Eric, Almeida Ana, Jeridi Mouna, Dolezel Jaroslav, Roux Nicolas, Risterucci Ange-Marie, Weissenbach Jean, Ruiz Manuel, Glaszmann Jean-Christophe, Quetier Francis, Yahiaoui Nabila, Wincker Patrick. 2012. Nature, 488 (7410) : 213-217.

The chestnut blight fungus world tour: successive introduction events from diverse origins in an invasive plant fungal pathogen. Dutech Cyril, Barrès Benoit, Bridier Julie, Robin Cécile, Milgroom Michael, Ravigné Virginie. 2012. Molecular Ecology, 21 (16) : 3931-3946.

The chiropteran haemosporidian Polychromophilus melanipherus: A worldwide species complex restricted to the family Miniopteridae. Duval Linda, Mejean Cyndie, Maganga Gaël Darren, Makanga Boris, Mangama Koumba Lilian, Peirce Michael, Ariey Frédéric, Bourgarel Mathieu. 2012. Infection, Genetics and Evolution, 12 (7) : 1558-1566.

A high-resolution map of the Nile tilapia genome: A resource for studying cichlids and other percomorphs. Guyon Richard, Rakotomanga Michelle, Azzouzi Naoual, Coutanceau Jean-Pierre, Bonillo Céline, D'Cotta Helena, Pepey Elodie, Soler Lucile, Rodier-Goud Marguerite, D'Hont Angélique, Conte Matthieu, Van Bers Nikkie, Penman David J., Hitte Christophe, Crooijmans Richard, Kocher Thomas D., Ozouf-Costaz Catherine, Baroiller Jean-François, Galibert Francis. 2012. BMC Genomics, 13 (222), 17 p.

A reference genetic map of C. clementina hort. ex Tan.; citrus evolution inferences from comparative mapping. Ollitrault Patrick, Terol Javier F., Chen Chunxian, Federici Claire T., Lotfy Samia, Hippolyte Isabelle, Ollitrault Frédérique, Bérard Aurélie, Chauveau Aurélie, Cuenca José, Costantino Gilles, Kacar A.Yildiz, Mu Lisa, Garcia-Lor Andrés, Froelicher Yann, Aleza Pablo, Boland Anne, Billot Claire, Navarro Luis, Luro François, Roose Mikeal L., Gmitter Frederick G. Jr., Talon Manuel, Brunel Dominique. 2012. BMC Genomics, 13 (593), 20 p.

Ananas. Coppens D'Eeckenbrugge Géo, Sanewski Garth M., Smith Mike K., Duval Marie-France, Leal Freddy. 2011. In : Wild crop relatives : genomic and breeding resources. Tropical and subtropical fruits. Kole Chittaranjan (ed.). Heidelberg : Springer [Allemagne], 21-41. ISBN 978-3-642-20446-3

Biodiversity and evolution in the Vanilla genus. Gigant Rodolphe, Bory Séverine, Grisoni Michel, Besse Pascale. 2011. In : The dynamical processes of biodiversity : case studies of evolution and spatial distribution. Oscar Grillo and Gianfranco Venora (eds.). Rijeka : InTech, 1-26. ISBN 978-953-307-772-7

The Cascajal Block: another testimony of the antiquity of pineapple in Mexico? Coppens D'Eeckenbrugge Géo, Uriza Avila Daniel E., Rebolledo Martínez Andrés, Rebolledo Martínez Laureano. 2011. Pineapple News (18) : 47-48.

Characterization of a resistance locus to coffee leaf rust (Hemileia vastratrix) in coffee trees: genomic organization, diversity and development of tools for functional gene validation. Ribas Alessandra. 2011. Montpellier : UM2, 227 p. Thèse de doctorat : Biologie intégrative des plantes : Université Montpellier 2

Divergent expression patterns of miR164 and CUP-SHAPED COTYLEDON genes in palms and other monocots : Implication for the evolution of meristem function in angiosperms. Adam Hélène, Marguerettaz Mélanie, Qadri Rashad, Adroher Bernard, Richaud Frédérique, Collin Myriam, Thuillet Anne-Céline, Vigouroux Yves, Laufs Patrick, Tregear James, Jouannic Stefan. 2011. Molecular Biology and Evolution, 28 (4) : 1439-1454.

Evolutionary time-scale of the begomoviruses : evidence from integrated sequences in the Nicotiana genome. Lefeuvre Pierre, Harkins Gordon William, Lett Jean-Michel, Briddon Rob W., Chase Mark W., Moury Benoit, Martin Darren Patrick. 2011. PloS One, 6 (5):e19193, 10 p.

High homologous gene conservation despite extreme autopolyploid redundancy in sugarcane. Garsmeur Olivier, Charron Carine, Bocs Stéphanie, Jouffe Vincent, Samain Sylvie, Couloux Arnaud, Droc Gaëtan, Zini Cyrille, Glaszmann Jean-Christophe, Van Sluys Marie-Anne, D'Hont Angélique. 2011. New Phytologist, 189 (2) : 629-642.

Les espèces de Culicoides du sous-genre Avaritia (Diptera : Ceratopogonidae) dans le monde : révision systématique et taxonomique des espèces d'intérêt dans la transmission d'Orbivirus. Mathieu Bruno. 2011. Strasbourg : Université de Strasbourg, 253 p. Thèse de doctorat : Sciences du vivant : Université de Strasbourg

Two novel Ty1-copia retrotransposons isolated from coffee trees can effectively reveal evolutionary relationships in the Coffea genus (Rubiaceae). Hamon Perla, Duroy Pierre-Olivier, Dubreuil-Tranchant Christine, Mafra d'Almeida Costa Paulo, Duret Caroline, Razafinarivo Norosa J., Couturon Emmanuel, Hamon Serge, De Kochko Alexandre, Poncet Valérie, Guyot Romain. 2011. Molecular Genetics and Genomics, 287 (1) : 447-460.

Comparative physical maps derived from BAC end sequences of tilapia (Oreochromis niloticus). Soler Lucile, Conte Matthew A., Katagiri Takayuki, Howe Aimée E., Lee Bo-Young, Amemiya Chris, Stuart Andrew, Dossat Carole, Poulain Julie, Johnson Jeremy, Di Palma Frederica, Lindblad-Toh Kerstin, Baroiller Jean-François, D'Cotta Helena, Ozouf-Costaz Catherine, Kocher Thomas D.. 2010. BMC Genomics, 11 (636), 8 p.

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Contribution à la connaissance de la distribution des tiques (acariens, Ixodidae et Amblyomnisdae), en Afrique ethiopienne continentale. Morel Pierre-Claude. 1969. Orsay : Université de Paris-Sud, 388 p. Thèse de doctorat : Sciences Naturelles : Université de Paris-Sud

Les variétés de riz du cercle de Banfora. IRAT - FRA. 1969. L'Agronomie Tropicale. Série 1, Riz et Riziculture et Cultures Vivrières Tropicales, 24 (8) : 691-708.

Facteurs physiques de fertilité des sols dans le Sud-Ouest malagasy. De Casabianca F.. 1968. In : Le colloque sur la fertilité des sols tropicaux. Paris : IRAT, 1540-1546. Colloque sur la fertilité des sols tropicaux, Antananarivo, Madagascar, 19 Novembre 1967/25 Novembre 1967.

Les fentes des grumes d'Okoumé : le stockage des grumes en Europe. Lepître C., Mariaux Alain, Lanly Jean-Paul. 1966. Bois et Forêts des Tropiques (106) : 17-25.

Chronique phytogéographique : les savanes du Sud de la République du Congo (Brazzaville) (suite). Bégué L.. 1965. Bois et Forêts des Tropiques (100) : 58-63.

Le Marché des bois tropicaux en France : 1re partie. CTFT - FRA. 1964. Bois et Forêts des Tropiques (96) : 51-61.

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Le Marché des bois tropicaux en France : 3e partie. CTFT - FRA. 1964. Bois et Forêts des Tropiques (98) : 41-60.

Problèmes de pâturage dans l'Adamaoua : 1re partie. Monnier F., Piot Jacques. 1964. Bois et Forêts des Tropiques (97) : 3-16.

Etude sur les pâturages et les questions fourragères en République Centrafricaine. Koechlin Jean. 1962. Revue d'Elevage et de Médecine Vétérinaire des Pays Tropicaux, 15 (1) : 43-73.

Le coton en Iran. IRCT [Guadeloupe] - GLP. 1960. Paris : IRCT, 8 p.

Le Sipo, variété d'acajou d'Afrique. CTFT - FRA. 1952. Bois et Forêts des Tropiques (25) : 323-328.

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