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Distinct communities and differing dispersal routes in bacteria and fungi of honey bees, honey, and flowers. Tiusanen Mikko, Becker-Scarpitta Antoine, Wirta Helena. 2024. Microbial Ecology, 87:100, 10 p.

Potential of silicon-rich biochar (Sichar) amendment to control crop pests and pathogens in agroecosystems: A review. Ratnadass Alain, Lopez Llandres Ana, Goebel François-Régis, Husson Olivier, Jean Janine, Napoli Alfredo, Sester Mathilde, Joseph Stephen. 2024. Science of the Total Environment, 910:168545, 19 p.

The influence of long-term storage on the epiphytic microbiome of postharvest apples and on Penicillium expansum occurrence and patulin accumulation. Al Riachy Reem, Strub Caroline, Durand Noel, Chochois Vincent, Lopez-Lauri Félicie, Fontana Angélique, Schorr-Galindo Sabine. 2024. Toxins, 16 (2), n.spéc. Toxins: 15th Anniversary:102, 28 p.

The main features and microbiota diversity of fermented camel milk. Bilal Zauresh, Akhmetsadykova Shynar, Baubekova Almagul, Tormo Helene, Faye Bernard, Konuspayeva Gaukhar. 2024. Foods, 13 (13):1985, 16 p.

Does host plant drive variation in microbial gut communities in a recently shifted pest? Javal Marion, Terblanche John S., Benoit Laure, Conlong Desmond, Lloyd James R., Smit Chantelle, Chapuis Marie-Pierre. 2023. Microbial Ecology, 86 : 636-646.

Influence of endosymbionts on the reproductive fitness of the tick Ornithodoros moubata. Taraveau Florian, Pollet Thomas, Duhayon Maxime, Gardes Laëtitia, Jourdan-Pineau Hélène. 2023. Peer Community Journal, 3:e102, 18 p.

Occurrence of biogenic amines and their correlation with bacterial communities in the Ivorian traditional fermented fish adjuevan during the storage. Abre Marina, Kouakou-Kouamé Clémentine Amenan, N'Guessan Florent Kouadio, Teyssier Corinne, Montet Didier. 2023. Folia Microbiologica, 68 (2) : 257-275.

Bidirectional interactions between arboviruses and the bacterial and viral microbiota in Aedes aegypti and Culex quinquefasciatus. Shi Chenyan, Beller Leen, Wang Lanjiao, Rosales Rosas Ana, De Coninck Lander, Héry Lyza, Mousson Laurence, Pagès Nonito, Raes Jeroen, Delang Leen, Vega-Rúa Anubis, Failloux Anna-Bella, Matthijnssens Jelle. 2022. Mbio, 13 (5), 18 p.

Consumption of golden berries (Physalis peruviana L.) might reduce biomarkers of oxidative stress and alter gut permeability in men without changing inflammation status or the gut microbiota. Sierra Jelver A., Escobar Juan S., Corrales-Agudelo Vanesa, Lara-Guzmán Oscar J., Velásquez-Mejía Eliana P., Henao-Rojas Juan Camilo, Caro-Quintero Alejandro, Vaillant Fabrice, Muñoz-Durango Katalina. 2022. Food Research International, 162:111949, 11 p.

Dynamics of bacterial and fungal communities of mango: From the tree to ready-to-Eat products. Taibi Ahmed, Diop Alioune, Leneveu-Jenvrin Charlène, Broussolle Véronique, Lortal Sylvie, Méot Jean-Michel, Soria Christian, Chillet Marc, Lechaudel Mathieu, Minier Jérôme, Constancias Florentin, Remize Fabienne, Meile Jean-Christophe. 2022. Food Microbiology, 108:104095, 14 p.

Eating eggplants as a cucurbit feeder: Dietary shifts affect the gut microbiome of the melon fly Zeugodacus cucurbitae (Diptera, Tephritidae). Hendrycks Wouter, Delatte Hélène, Moquet Laura, Bourtzis Kostas, Mullens Nele, De Meyer Marc, Backeljau Thierry, Virgilio Massimiliano. 2022. MicrobiologyOpen, 11 (4):e1307, 16 p.

Fruit fly phylogeny imprints bacterial gut microbiota. Ravigné Virginie, Becker Nathalie, Massol François, Guichoux Erwan, Boury Christophe, Mahe Frédéric, Facon Benoît. 2022. Evolutionary Applications, 15 (10), n.spéc. Evolution in Agricultural Systems : 1621-1638.

Host specificity shapes the soil rhizospheric bacteriobiome of cereals and legumes. Ben Zineb Ameni, Barkaoui Karim, Karray Fatma, Mhiri Najla, Sayadi Sami, Mliki Ahmed, Gargouri Mahmoud. 2022. Annales de l'Institut National de la Recherche Agronomique de Tunisie, 95 : 31-42.

Olive agroforestry shapes rhizosphere microbiome networks associated with annual crops and impacts the biomass production under low-rainfed conditions. Ben Zineb Ameni, Barkaoui Karim, Karray Fatma, Mhiri Najla, Sayadi Sami, Mliki Ahmed, Gargouri Mahmoud. 2022. Frontiers in Microbiology, 13:977797, 18 p.

Towards a microbiota-based understanding of sugarcane health. Sanguin Hervé, Sood Sushma, Tournier Estelle, Julian Charlotte, Fernandez Emmanuel, Mahe Frédéric, Filloux Denis, Daugrois Jean-Heinrich, Roumagnac Philippe, Rott Philippe. 2022. Sugar Journal (June), Résumé : 28-29. ASSCT 2022 Annual Meeting, Bonita Springs, États-Unis, 21 Juin 2022/23 Juin 2022.

The impact of the rice production system (irrigated vs lowland) on root-associated microbiome from farmer's fields in western Burkina Faso. Barro Mariam, Wonni Issa, Simonin Marie, Kassankogno Abalo Itolou, Klonowska Agnieszka, Moulin Lionel, Béna Gilles, Somda Irénée, Brunel Caroline, Tollenaere Charlotte. 2022. FEMS Microbiology, Ecology, 98 (9):fiac085, 17 p.

The mosquito microbiome includes habitat-specific but rare symbionts. Schrieke Hans, Maignien Loïs, Constancias Florentin, Trigodet Florian, Chakloute Sarah, Rakotoarivony Ignace, Marie Albane, L'Ambert Grégory, Makoundou Patrick, Pagès Nonito, Eren A. Murat, Weill Mylène, Sicard Mathieu, Reveillaud Julie. 2022. Computational and Structural Biotechnology Journal, 20 : 410-420.

Coévolution plantes-parasites en populations naturelles. Ravigné Virginie, Halkett Fabien, Tollenaere Charlotte. 2021. In : L'immunité des plantes : pour des cultures résistantes aux maladies. Lannou Christian (ed.), Roby Dominique (ed.), Ravigné Virginie (ed.), Hannachi Mourad (ed.), Moury Benoit (ed.). Versailles : Ed. Quae, 115-123. (Savoir faire) ISBN 978-2-7592-3233-08

Microbiome status of cider-apples, from orchard to processing, with a special focus on Penicillium expansum occurrence and patulin contamination. Al Riachy Reem, Strub Caroline, Durand Noël, Guibert Benjamin, Guichard Hugues, Constancias Florentin, Chochois Vincent, Lopez-Lauri Félicie, Fontana Angélique, Schorr-Galindo Sabine. 2021. Journal of Fungi, 7 (4), n.spéc. Fungal Biodiversity and Ecology:244, 21 p.

Periodontitis associates with species-specific gene expression of the oral microbiota. Belstrom Daniel, Constancias Florentin, Drautz-Moses Daniela I., Schuster Stephan C., Veleba Mark, Mahé Frédéric, Givskov Michael. 2021. npj Biofilms and Microbiomes, 7:76, 10 p.

Terroir is the main driver of the epiphytic bacterial and fungal communities of mango carposphere in Reunion Island. Taibi Ahmed, Rivallan Ronan, Broussolle Véronique, Pallet Dominique, Lortal Sylvie, Meile Jean-Christophe, Constancias Florentin. 2021. Frontiers in Microbiology, 11:619226, 19 p.

Coffee microbiota and its potential use in sustainable crop management. A review. Duong Benoit, Marraccini Pierre, Maeght Jean-Luc, Vaast Philippe, Lebrun Michel, Duponnois Robin. 2020. Frontiers in Sustainable Food Systems, 4:607935, 31 p.

Differences in microbiota between two multilocus lineages of the sugarcane Aphid (Melanaphis sacchari) in the continental United States. Holt Jocelyn R., Styer Alex, White Jennifer A., Armstrong John Scott, Nibouche Samuel, Costet Laurent, Malacrinò Antonino, Antwi Josephine B., Wulff Jason, Peterson Garry, McLaren Neal, Medina Raul F.. 2020. Annals of the Entomological Society of America, 113 (4), n.spéc. Advanced Genetic Analysis of Invasive Arthropods:saaa003 : 257-265.

Heterogeneity of the rice microbial community of the Chinese centuries-old Honghe Hani rice terraces system. Alonso Pascal, Blondin Laurence, Gladieux Pierre, Mahé Frédéric, Sanguin Hervé, Ferdinand Romain, Filloux Denis, Desmarais Eric, Cerqueira Frédérique, Jin Baihui, Huang Huichuan, He Xiahong, Morel Jean-Benoit, Martin Darren Patrick, Roumagnac Philippe, Vernière Christian. 2020. Environmental Microbiology, 22 (8) : 3429-3445.

Influence de l'hôte et de phytovirus sur l'assemblage du microbiote du riz à l'échelle de deux agrosystèmes. Alonso Pascal. 2020. Montpellier : Montpellier SupAgro, 218 p. Thèse de doctorat : Microbiologie. Bio-informatique : Montpellier SupAgro

Soil-microorganism-mediated invasional meltdown in plants. Zhang Zhijie, Liu Yanjie, Brunel Caroline, van Kleunen Mark. 2020. Nature Ecology and Evolution, 4 : 1612-1621.

Community richness of amphibian skin bacteria correlates with bioclimate at the global scale. Kueneman Jordan G., Bletz Molly C., McKenzie Valerie J., Becker C. Guilherme, Joseph Maxwell B., Abarca Juan G., Archer Holly, Arellano Ana Lisette, Bataille Arnaud, Becker Matthew, Belden Lisa K., Crottini Angelica, Geffers Robert, Haddad Célio. F. B., Harris Reid N., Holden Whitney M., Hughey Myra, Jarek Michael, Kearns Patrick J., Kerby Jacob L., Kielgast Jos, Kurabayashi Atsushi, Longo Ana V., et al.. 2019. Nature Ecology and Evolution, 3 : 381-389.

Optimize the plant microbiota to increase plant growth and health. Barret M., Dufour Philippe, Durand-Tardif Mylène, Mariadassou M., Mougel Christophe, Perez P., Roumagnac Philippe, Sanguin Hervé, Steinberg Christian, Szambien M.. 2019. Paris : GIS Biotechnologies Vertes, 12 p.

Responses of rhizospheric microbial communities of native and alien plant species to Cuscuta parasitism. Brunel Caroline, Beifen Yang, Pouteau Robin, Li Jummin, van Kleunen Mark. 2019. Microbial Ecology, 79 : 617-630.

Bacterial symbionts in lepidoptera: Their diversity, transmission, and impact on the host. Paniagua Voirol Luis R., Frago Enric, Kaltenpoth Martin, Hilker Monika, Fatouros Nina E.. 2018. Frontiers in Microbiology, 9:556, 14 p.

Chemical and biological 'Barcodes' or markers in food traceability: A case study on Wines. Dey Gargi, Montet Didier. 2018. In : Food traceability and authenticity: analytical techniques. Montet Didier (ed.), Ray Ramesh C. (ed.). Boca Raton : CRC Press, 90-115. (Food Biology Series) ISBN 978-1-4987-8842-7

Food traceability and authenticity: analytical techniques. Montet Didier (ed.), Ray Ramesh C. (ed.). 2018. Boca Raton : CRC Press, 354 p. (Food Biology Series) ISBN 978-1-4987-8842-7

Geographical origin traceability of foodstuffs using a molecular technique PCR-DGGE. Montet Didier, Kouakou Amenan Clémentine, Hamdouche Yasmine, Teyssier Corinne, Rychlik Tomasz, Tatsadjieu Ngoune Léopold, Froeder Arcuri Edna. 2018. In : Food traceability and authenticity: analytical techniques. Didier Montet (ed.), Ramesh C Ray (ed.). Boca Raton : CRC Press, 137-154. (Food Biology Series) ISBN 978-1-4987-8842-7

Influence des conditions de la traite sur les qualités physico-chimiques et microbiologiques du lait cru collecté à Maroua, Cameroun. Maïworé Justine, Baane Marie-Paul, Toudjani Amadou Alhadji, Daibe Ouassing Alain, Tatsadjieu Ngoune Léopold, Montet Didier. 2018. Afrique Science, 14 (4) : 235-248.

Microbial communities in natural rubber coagula during maturation: Impacts on technological properties of dry natural rubber. Salomez M., Subileau Maeva, Vallaeys T., Santoni Sylvain, Bonfils Frédéric, Sainte-Beuve Jérôme, Intapun Jutharat, Granet Françoise, Vaysse Laurent, Dubreucq Eric. 2018. Journal of Applied Microbiology, 124 (2) : 444-456.

Application of the PCR-DGGE technique to the fungal community of traditional Wielkopolska fried ripened curd cheese to determine its PGI authenticity. Rychlik Tomasz, Szwengiel Artur, Bednarek Marta, Arcuri Edna F., Montet Didier, Mayo Baltasar, Nowak Jacek, Czarnecki Zbigniew. 2017. Food Control, 73 (Part B) : 1074-1081.

Functional genes of microorganisms, comprehending the dynamics of agricultural ecosystems. Reali Catiusca, Pilz Júnior Harry Luiz, Meile Jean-Christophe, Shorr Galindo Sabine, Fiuza Lidia Mariana. 2017. Brazilian Archives of Biology and Technology, 60:e17160370, 18 p.

Le microbiote des plantes : un ménage à trois milliards ? Roumagnac Philippe. 2017. Montpellier : Université de Montpellier, 49 p. Habilitation à diriger des recherches : Université de Montpellier

Application of PCR-DGGE to the study of dynamics and biodiversity of microbial contaminants during the processing of Hibiscus sabdariffa drinks and concentrates. Ndiaye Ndeye Adiara, Hamdouche Yasmine, Kane Ale, Cisse Mady, Berthiot Laurent, Touré-Kané N. Coumba, Montet Didier. 2016. Fruits, 71 (3) : 141-149.

Applications of metagenomics to fermented foods. Bigot Céline, Meile Jean-Christophe, Remize Fabienne, Strub Caroline. 2016. In : Fermented foods. Part I: biochemistry and biotechnology. Montet Didier (ed.), Ray Ramesh C. (ed.). Boca Raton : CRC Press, 333-346. (Food Biology Series) ISBN 978-1-4987-4079-1

Biological control of cacao diseases. Ten Hoopen Gerben Martijn, Krauss Ulrike. 2016. In : Cacao diseases: a history of old enemies and new encounters. Bailey Bryan A. (ed.), Meinhardt Lyndel W. (ed.). Cham : Springer International Publishing, 511-566. ISBN 978-3-319-24787-8

How to determine the geographical origin of seafood? El Sheikha Aly, Montet Didier. 2016. Critical Reviews in Food Science and Nutrition, 56 (2) : 306-317.

Microbiome diversity differs between amphibian skin regions: Implications for chytridiomycosis mitigation efforts. Bataille Arnaud, Lee-Cruz Larisa, Tripathi Binu, Kim Hyoki, Waldman Bruce. 2016. Microbial Ecology, 71 (1) : 221-232.

Phosphorus availability and microbial community in the rhizosphere of intercropped cereal and legume along a P-fertilizer gradient. Tang Xiaoyan, Placella Sarah A., Daydé Florent, Bernard Laetitia, Robin Agnès, Journet Etienne-Pascal, Justes Eric, Hinsinger Philippe. 2016. Plant and Soil, 407 (1) : 119-134.

Assessment of prebiotic potential of Akpan-yoghurt-like product and effects on the human intestinal microbiota. Gullón Beatriz, Pereira Miguel, Mestres Christian, Hounhouigan Joseph Djidjoho, Pallet Dominique, Alonso José Luis, Pintado Manuela. 2015. Journal of Functional Foods, 19 (Part A) : 545-553.

Below ground microbial diversity as influenced by coffee agroforestry systems in the Western Ghats, India. Bagyaraj D.J., Thilagar G., Ravisha C., Kushalappa Cheppudira G., Krishnamurthy K.N., Vaast Philippe. 2015. Agriculture, Ecosystems and Environment, 202 : 198-202.

Discriminating organic and conventional foods by analysis of their microbial ecology: An application on fruits. Bigot Céline, Meile Jean-Christophe, Kapitan Gnimdu André, Montet Didier. 2015. Food Control, 48 : 123-129.

Discrimination des fruits issus de l'agriculture biologique par analyse comparative de leurs communautés microbiennes. Bigot Céline. 2015. Montpellier : Montpellier SupAgro, 204 p. Thèse de doctorat : Biotechnologie, microbiologie : Montpellier SupAgro Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques

Discrimination des procédés de transformation post-récolte du cacao et du café par analyse globale de l'écologie microbienne. Hamdouche Yasmine. 2015. Montpellier : Montpellier SupAgro, 292 p. Thèse de doctorat : Biotechnologie, Microbiologie : Montpellier SupAgro Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques

Dynamics of microbial ecology during cocoa fermentation and drying: Towards the identification of molecular markers. Hamdouche Yasmine, Guehi Tagro Simplice, Durand Noël, Kedjebo Kra Brou Didier, Montet Didier, Meile Jean-Christophe. 2015. Food Control, 48 : 117-122.

Symbiosis in an overlooked microcosm: a systematic review of the bacterial flora of mites. Chaisiri Kittipong, McGarry John W., Morand Serge, Makepeace Benjamin L.. 2015. Parasitology, 142 (09) : 1152-1162.

Étude et modélisation d'un traitement thermique suivi d'un conditionnement (température, aw et CO2) pour la maîtrise de la flore fongique d'altération des dattes à humidité intermédiaire. Belbahi Amine. 2015. Montpellier : Montpellier SupAgro, 132 p. Thèse de doctorat : Génie des Procédés : Montpellier SupAgro

Composition of Anopheles coluzzii and Anopheles gambiae microbiota from larval to adult stages. Gimonneau Geoffrey, Tchioffo Majoline T., Abate Luc, Boissiere Anne, Awono-Ambéné Parfait, Nsango Sandrine E., Christen Richard, Morlais Isabelle. 2014. Infection, Genetics and Evolution, 28 : 715-724.

Diversity of urinary excretion patterns of main ellagitannins' colonic metabolites after ingestion of tropical highland blackberry (Rubus adenotrichus) juice. García-Muñoz Cristina, Hernandez Lorena, Pérez Ana Mercedes, Vaillant Fabrice. 2014. Food Research International, 55 : 161-169.

Does the addition of labile substrate destabilise old soil organic matter? Derrien Delphine, Plain Caroline, Courty Pierre-Emmanuel, Gelhaye Louisette, Moerdijk-Poortvliet Tanja C.W., Thomas Fabien, Versini Antoine, Zeller Bernd, Koutika Lydie-Stella, Boschker Henricus T.S., Epron Daniel. 2014. Soil Biology and Biochemistry, 76 : 149-160.

Metabolic fate of ellagitannins: Implications for health, and research perspectives for innovative functional foods. García-Muñoz Cristina, Vaillant Fabrice. 2014. Critical Reviews in Food Science and Nutrition, 54 (12) : 1584-1598.

Qualité microbiologique des tranches de mangues (Mangifera indica L.) vendues à Dakar (Sénégal). Kasse Moussa, Cisse Mady, Toure Aminata, Ducamp-Collin Marie-Noelle, Guisse Aliou. 2014. International Journal of Biological and Chemical Sciences, 8 (4) : 1611-1619.

Application of PCR-DGGE to the study of dynamics and biodiversity of yeasts and potentially OTA producing fungi during coffee processing. Durand Noël, El Sheikh M.A., Suarez Quiroz Mirna Leonor, Gonzales-Rios Oscar, Nganou Donkeng Nadège, Fontana-Tachon Angélique, Montet Didier. 2013. Food Control, 34 (2) : 466-471.

Determination of speciality food salt origin by using 16S rDNA fingerprinting of bacterial communities by PCReDGGE: An application on marine salts produced in solar salterns from the French Atlantic Ocean. Dufossé Laurent, Donadio Clara, Valla Alain, Meile Jean-Christophe, Montet Didier. 2013. Food Control, 32 (2) : 644-649.

Modulation of malaria infection in Anopheles gambiae mosquitoes exposed to natural midgut bacteria. Tchioffo Majoline T., Boissiere Anne, Churcher Thomas S., Abate Luc, Gimonneau Geoffrey, Nsango Sandrine E., Awono-Ambéné Parfait, Christen Richard, Berry Antoine, Morlais Isabelle. 2013. PloS One, 8 (12):e816663, 9 p.

Research of some physicochemical and biological pollution indicators in four fisheries of the northern part of Cameroon. Maïworé Justine, Tatsadjieu Ngoune Léopold, Montet Didier, Mbofung Carl Moses. 2013. Intrenational Research Journal of Microbiology, 4 (6) : 147-155.

Soil nutrient availability and CO2 production in agroforestry systems after the addition of Erythrina poeppigiana pruning residues and native microbial inocula. Payan-Zelaya Fidel, Harmand Jean-Michel, Flores-Macías Antonio, Beer John, Ramos-Espinoza Guadalupe, De Léon González Fernando. 2013. Agroforestry Systems, 87 (2) : 439-450.

Unexpected similar stability of soil microbial CO2 respiration in 20-year manured and in unmanured tropical soils. Chotte Jean-Luc, Diouf Mayécor, Assigbetse Komi, Lesueur Didier, Rabary Bodovololona, Sall Saidou. 2013. Environmental Chemistry Letters, 11 (2) : 135-142.

Changes in land use system and environmental factors affect arbuscular mycorrhizal fungal density and diversity, and enzyme activities in rhizospheric soils of Acacia senegal (L.) willd. Ndoye Fatou, Kane Aboubacry, Ngonkeu Eddy Léonard Mangaptché, Bakhoum Niokhor, Sanon Arsene, Diouf Diégane, Sy Mame Ourèye, Baudoin Ezékiel, Noba Kandioura, Prin Yves. 2012. ISRN Ecology, 2012 (ID 563191), 13 p.

Determination of fish origin by using 16S rDNA fingerprinting of microbial communities by PCR-DGGE : an application on fish from different tropical origins. Montet Didier, Le N'Guyen Doan Duy, Kouakou Amenan Clémentine. 2012. In : Aquaculture. Muchlisin Zainal Abidin (ed.). Rijeka : InTech, 93-108. ISBN 978-953-307-974-5

Effects of organic and inorganic applications on soil bacterial and fungal microbial communities diversity and impacts of earthworms on microbial diversity in the Kabete long-term trial, Kenya. Kamaa Mary M., Mburu Harrison N., Blanchart Eric, Chibole Livingstone, Chotte Jean-Luc, Kibunja Catherine N., Lesueur Didier. 2012. In : Lessons learned from long-term soil fertility management experiments in Africa. Bationo André (ed.), Waswa Boaz (ed.), Kihara Job (ed.), Adolwa Ivan Solomon (ed.), Vanlauwe Bernard (ed.), Saidou Koala (ed.). Heidelberg : Springer [Allemagne], 121-136. ISBN 978-94-007-2937-7

Identification of yeasts associated with the fermented fish, adjuevan, of Ivory Coast by using the molecular technique of PCR-denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE). Kouakou Amenan Clémentine, Cissé Mohamed, Kossonou Epiphane, Brou Kouakou David, Koffi Djè Marcellin, Montet Didier. 2012. African Journal of Microbiology Research, 6 (19) : 4138-4145.

Influence of technological treatments on bacterial communities in tilapia (Oreochromis niloticus) as determined by 16S rDNA fingerprinting using polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis (PCR-DGGE). Maïworé Justine, Tatsadjieu Ngoune Léopold, Goli Thierry, Montet Didier, Mbofung C.M.F.. 2012. African Journal of Biotechnology, 11 (34) : 8586-8593.

Mise au point d'outils moléculaires pour l'identification des flores fongiques ochratoxinogènes : application à la traçabilité du café Camerounais. Nganou Donkeng Nadège. 2012. Ngaoundéré : Ecole nationale supérieure des sciences agro indutrielles, 175 p. Thèse de doctorat : Sciences alimentaires et nutrition. Microbiologie et sécurité alimentaire : Université de Ngaoundéré

Molecular bacterial characterization and free amino acids composition in Ivorian traditional fermented fish produced by two methods. Kouakou Amenan Clémentine, N'Guessan Kouadio Florent, Durand Noël, Thomas Dadier A., Montet Didier, Koffi Djè Marcellin. 2012. Fisheries Science, 78 (5) : 1125-1136.

Antimicrobial effects of essential oils of Cinnamosma fragrans on the bacterial communities in the rearing water of Penaeus monodon larvae. Sarter Samira, Randrianarivelo Roger, Ruez Philippe, Raherimandimby Marson, Danthu Pascal. 2011. Vector Borne and Zoonotic Diseases, 11 (4) : 433-437.

Aquaculture microbiology and biotechnology. Volume 2. Montet Didier (ed.), Ray Ramesh C. (ed.). 2011. Enfield : Science Publishers, 306 p. ISBN 978-1-57808-711-2

Biodégradation de bois pollués par les communautés fongiques endogènes de sols tropicaux (Guyane). Chaffanel Fanny. 2011. Brest : UBO, 33 p. Mémoire de master : Sciences technologies santé. Spécialité Microbiologie fondamentale et appliquée : Université de bretagne occidentale

Biological bar code for determining the geographical origin of fruits using 28S rDNA fingerprinting of fungal communities by PCR-DGGE an application to shea tree fruits. El Sheikha Aly, Bouvet Jean-Marc, Montet Didier. 2011. Quality Assurance and Safety of Crops and Foods, 3 (1) : 40-47.

Determination of fruit origin by using 28S rDNA fingerprinting of fungi communities by PCR-DGGE: an application to Physalis fruits from Egypt, Uganda and Colombia. El Sheikha Aly, Montet Didier. 2011. Fruits, 66 (2) : 79-89.

Effects of organic and inorganic fertilization on soil bacterial and fungal microbial diversity in the Kabete long-term trial, Kenya. Kamaa Mary M., Mburu Harrison N., Blanchart Eric, Chibole Livingstone, Chotte Jean-Luc, Kibunja Catherine N., Lesueur Didier. 2011. Biology and Fertility of Soils, 47 (3) : 315-321.

Occurrence of pathogenic bacteria in traditional millet-based fermented gruels for young children in West Africa: Ben-Saalga and Ben-Kida in Ouagadougou (Burkina-Faso). Akaki Koffi David, Loiseau Gérard, Vernière-Icar Christèle, Guyot Jean-Pierre. 2011. Advance Journal of Food Science and Technology, 3 (6) : 446-454.

Parasite community ecology and epidemiological interactions at the wildlife/domestic/human interface : can we anticipate emerging infectious diseases in their hotspots? Caron Alexandre, De Garine-Wichatitsky Michel, Morand Serge. 2011. Ecohealth, 7, suppl., Résumé, S24 International One Health Congress. 1, Victoria, Australie, 14 Février 2011/16 Février 2011.

A biological bar code for determining the geographical origin of fruit by using 28S rDNA fingerprinting of fungal communities by PCR-DGGE: An application to physalis fruits from Egypt. El Sheikha Aly, Metayer Isabelle, Montet Didier. 2011. Food Biotechnology, 25 (2) : 115-129.

Combined effects of postharvest heat treatment and chitosan coating on quality of fresh-cut mangoes (Mangifera indica L.). Djioua Tassadit, Charles Florence, Freire Murillo, Filgueiras Heloisa, Ducamp-Collin Marie-Noelle, Salomon Huguette. 2010. International Journal of Food Science and Technology, 45 (4) : 849-855.

Study of the microbial diversity of Oreochromis niloticus of three lakes of Cameroon by PCR-DGGE: Application to the determination of the geographical origin. Tatsadjieu Ngoune Léopold, Maïworé Justine, Hadjia M.B., Loiseau Gérard, Montet Didier, Mbofung C.M.F.. 2010. Food Control, 21 (5) : 673-678.

Comparison of bacterial communities of tilapia fish from Cameroon and Vietnam using PCR-DGGE (polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis). Maïworé Justine, Tatsadjieu Ngoune Léopold, Montet Didier, Loiseau Gérard, Mbofung C.M.F.. 2009. African Journal of Biotechnology, 8 (24) : 7156-7163.

Impacts de la gestion du sol sur la biomasse microbienne et le statut organique deu sol de la zone ouest du Cameroun. Fotio Daniel, Simon Serge, Njomgang Roseline, Nguefack Julienne, Ngueguim Martin, Maniepi J.S.N., Teguefouet Pierre, Mfopou Mewouo Yvette Clarice. 2009. In : Atelier PCP-REPARAC "Innover pour améliorer les revenus des exploitations familiales et la production agricoles du Grand Sud Cameroun, 24-26 juin 2009, Mbalmayo, Cameroun. s.l. : s.n., 13 p. Atelier PCP-REPARAC "Innover pour améliorer les revenus des exploitations familiales et la production agricoles du Grand Sud Cameroun", Mbalmayo, Cameroun, 24 Juin 2009/26 Juin 2009.

Utilisation de la PCR-DGGE dans la détermination d'origine : exemples d'applications sur les fruits et les poissons. Montet Didier, Le Nguyen Doan Duy, El Sheikha Aly, Condur Ana, Metayer Isabelle, Loiseau Gérard. 2009. In : La lutte contre la fraude : les nouveaux défis biotechnologiques : Biotrace 2009, Montpellier 2-3 février 2009. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. Biotrace 2009, Montpellier, France, 2 Février 2009/3 Février 2009.

Analyse de la diversité des populations microbiennes des aliments. El Sheikha Aly, Condur Ana, Le Nguyen Doan Duy, Loiseau Gérard, Montet Didier. 2008. In : Journées de l'UMR Qualisud, 19-20 juin 2008, Montpellier, France. s.l. : s.n., 1 p. Journées de l'UMR Qualisud, Montpellier, France, 19 Juin 2008/20 Juin 2008.

Application of PCR-DGGE in determining food origin : cases studies of fish and fruits. Montet Didier, Le Nguyen Doan Duy, El Sheikha Aly, Condur Ana, Metayer Isabelle, Loiseau Gérard. 2008. In : Greening the food chain, 3 and 4. Includes papers from the workshops : 3. Traceability: Tracking and tracing in the food chain 4. Supplying sustainable and innovative food and drink solutions. Eds by Richard Glass, Wayne Martindale. Wellesbourne : AAB, 11-22. (Aspects of applied biology, 87) Workshop on Traceability : Tacking and Tracing in the Food Chain. 3, York, Royaume-Uni, 15 Novembre 2008.

Determination of citrus fruit origin by using 16S rDNA fingerprinting of bacterial communities by PCR- DGGE : application à la clémentine du Maroc et de l'Espagne. Le N'Guyen Doan Duy, Gemrot Elodie, Loiseau Gérard, Montet Didier. 2008. Fruits, 63 (2) : 75-84.

Determination of fish origin by using 16S rDNA fingerprinting of bacterial communities by PCR-DGGE : An application on Pangasius fish from Viet Nam. Le N'Guyen Doan Duy, Hanh Ha Ngoc, Dijoux Daniel, Loiseau Gérard, Montet Didier. 2008. Food Control, 19 (5) : 454-460.

Détermination de l'origine géographique des aliments par une technique de biologie moléculaire, la PCR-DGGE (La Réaction de Polymérisation en Chaîne-Dénaturation Gradient Gel Electrophoresis). Le Nguyen Doan Duy, El Sheikha Aly, Loiseau Gérard, Montet Didier. 2008. In : Journées de l'UMR Qualisud, 19-20 juin 2008, Montpellier, France. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. Journées de l'UMR Qualisud, Montpellier, France, 19 Juin 2008/20 Juin 2008.

Détermination de l'origine géographique des poissons par l'obtention de l'empreinte génétique de leur communauté bactérienne par PCR-DGGE (Polymerase Chain Reaction - Denaturing Gradient Gel Electrophoresis). Le Nguyen Doan Duy. 2008. Montpellier : UM2, 460 p. Thèse de doctorat : Biotechnologie, Microbiologie : Université Montpellier 2

Impact of cocoa processing technologies in free fatty acids formation in stored raw cocoa beans. Guehi Tagro Simplice, Dingkuhn Michaël, Cros Emile, Fourny Gérard, Ratomahenina Robert, Moulin Guy, Clément Anne. 2008. African Journal of Agricultural Research, 3 (3) : 174-179.

Improving microbial safety of poultry products by combined steam and lactic acid decontamination treatments. Lecompte Jean-Yves, Collignan Antoine, Sarter Samira, Portaguen Stéphane, Kondjoyan Alain. 2008. In : ICEF 10 : Tenth International Congress on Engineering and Food, Viña del Mar, Chile, April 20 - 24, 2008. s.l. : s.n., 1 p. International Congress on Engineering and Food. 10, Viña del Mar, Chili, 20 Avril 2008/24 Avril 2008.

The impact of soil organic matter applications combined with mineral fertilization on both microbial and fungal soil communities in Kenya. Muema Esther, Musyoki Mary, Mugadi Doreen, Chotte Jean-Luc, Mburu Harrison N., Vanlauwe Bernard, Kibunja Catherine N., Lesueur Didier. 2008. In : The 13th Congress of the African Association for Biological Nitrogen Fixation, satellite workshop on Mycorrhiza, December 15th - 18th 2008, Hammamet, Tunisia : book of abstracts. CBBC, AABNF, Tunisian Association for Biotechnology. Hammam Lif : CBBC, Résumé, 58. AABNF Congress. 13, Hammamet, Tunisie, 15 Décembre 2008/18 Décembre 2008.

Etude de la biodiversité de la microflore des eaux de lavage des bananes en station de conditionnement et relation avec la manifestation de la pourriture de couronne au Cameroun. Ewané Cécile Annie. 2007. Gembloux : FUSAGx, 140 p. Mémoire DEA : Sciences agronomique et ingénierie biologique : Faculté universitaire des sciences agronomiques de Gembloux

Study on the microflora and biochemistry of cocoa fermentation in the Dominican Republic. Lagunes Galvez Sandra Guadalupe, Loiseau Gérard, Paredes Jose Luis, Barel Michel, Guiraud Joseph-Pierre. 2007. International Journal of Food Microbiology, 114 : 124-130.

An evaluation of milk quality in Uganda : Value chain assessment and recommendations. Grimaud Patrice, Sserunjogi Mohamed L., Grillet Nelly. 2007. African Journal of Food, Agriculture, Nutrition and Development, 7 (5), 16 p.

Impact d'un apport de compost sur la taille et l'activité de la communauté microbienne du sol. Saison Carine, Degrange Valérie, Oliver Robert, Commeaux Claire, Montange Denis, Le Roux Xavier. 2006. In : Impacts du recyclage des déchets agro-industriels : Actes de l'atelier de clôture de l'ATP, 1-2 juillet 2004. Findeling Antoine (ed.), Marlet Serge (ed.), Montange Denis (ed.), Saint Macary Hervé (ed.). CIRAD. Montpellier : CIRAD, 8 p. Atelier de clôture de l'ATP : Impacts du recyclage des déchets agro-industriels, Montpellier, France, 1 Juillet 2004/2 Juillet 2004.

Identification et validation de marqueurs spécifiques pour la traçabilité de poissons d'aquaculture lors de leur import/export. Leesing Ratanaporn. 2005. Montpellier : UM2, 183 p. Thèse de doctorat : Sciences des aliments : Université Montpellier 2

Analyse de l'antibiorésistance de la flore commensale de poisson d'élevage asiatique. Sarter Samira, Nguyen Hoang Nam Kha, Lee Sing Ratanaporn, Loiseau Gérard, Legavre Thierry, Goli Thierry, Montet Didier. 2004. In : VIème Congrès de la Société française de microbiologie, Bordeaux, France, 10-12 mai 2004. s.l. : s.n., 1 p. Congrès de la Société Française de Microbiologie. 6, Bordeaux, France, 10 Mai 2004/12 Mai 2004.

Création d'un code barre biologique pour assurer la traçabilité des produits aquatiques applications à la traçabilité des poissons : mise au point d'une analyse des ADN de la flore commensale de tilapia par PCR-DGGE. Projet phylogène. Gemrot François. 2004. Montpellier : UM2, 39 p. Mémoire DEA : Sciences des aliments : Université Montpellier 2

Effect of freezing on fish microbial flora. Goli Thierry, Nguyen Thanh T.. 2004. In : Seminar on Food Safety and International Trade: The French-Thai Approach and the EU Regulation, September 9-10, 2004, Bangkok, Thailand. s.l. : s.n., Diaporama, (25 vues) Seminar on Food Safety and International Trade: The French-Thai Approach and the EU Regulation, Bangkok, Thaïlande, 9 Septembre 2004/10 Septembre 2004.

Identification de marqueurs discriminants pour assurer la traçabilité des produits aquatiques tropicaux : applications à la traçabilité des poissons en Asie du sud-est : rapport annuel ATP 02/50. Montet Didier. 2004. Montpellier : CIRAD-AMIS, 27 p. ["note_numeros_type_typename_" not defined] : CIRAD-AMIS N°06-2004

Contribution des glucides, protides et lipides à l'évolution géochimique du sol, suite à un apport de vinasse de rhumerie; Conséquences sur la mobilisation de métaux. Pautremat Nathalie, Renault Pierre, Cazevieille Patrick, Marlet Serge. 2003. In : Les Vèmes journées de l'Ecologie Fonctionnelle, Nancy, France, 12-14 March 2003. s.l. : s.n., 1 p. Journées de l'Ecologie Fonctionnelle. 5, Nancy, France, 12 Mars 2003/14 Mars 2003.

Rapport annuel d'activités du projet FIRC. Année 3 - 1/1/2002-31/12/2002 : recherche des facteurs responsables des teneurs élevées en acides gras libres (AGL) du cacao ivoirien. Cros Emile. 2003. Montpellier : CIRAD-CP, 36 p.

Statut organique et fertilité des sols dans les systèmes de culture bananiers en Guadeloupe. Lombard Karine. 2003. Rennes : ENSAR, 56 p. Mémoire DAA : Agro-environnement. Production végétale durable : Ecole nationale supérieure agronomique de Rennes

La conservation par le froid du poisson et des produits de la mer : réfrigération et la congélation. Goli Thierry. 2002. In : Mémento de l'agronome. CIRAD, GRET, France-MAE. Montpellier : CIRAD, 1 Cd-Rom ISBN 2-86844-130-0

Effet du séchage d'échantillons d'un sol ferrugineux tropical sur la détermination de la biomasse microbienne : comparaison de deux méthodes biocidales de référence. Fardoux Joël, Fernandes Paula, Niane-Badiane Aminata, Chotte Jean-Luc. 2000. Etude et Gestion des Sols, 7 (4) : 385-394.

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Influence du procédé de dépulpage de la drupe de Coffea arabica L. sur la fermentation. Avallone Sylvie, Guyot Bernard, Brillouet Jean-Marc, Guiraud Joseph-Pierre. 1999. Plantations, Recherche, Développement, 6 (5) : 338-343.

Biomasse microbienne dans les sols. Niane-Badiane Aminata, Ganry Francis, Jacquin F.. 1998. Afrique Agriculture (263) : 45.

Characterization of the Beninese traditional ogi, a fermented maize slurry : physicochemical and microbiological aspects. Coffi Nago Mathurin, Hounhouigan Joseph D., Akissoé Noël H., Zanou E., Mestres Christian. 1998. International Journal of Food Science and Technology, 33 : 307-315.

Congrès mondial des sciences du sol. AISS - USA, AFES - FRA. 1998. Montpellier : CIRAD, 1 Cd-Rom Congrès Mondial de Science du Sol. 16, Montpellier, France, 20 Août 1998/26 Août 1998.

Etude des bactéries libres fixatrices d'azote atmosphérique. Rapport technique et financier. Mercky S.. 1997. Montpellier : CIRAD-EMVT, 77 p. N° de rapport : n°97023

La fermentation du cacao. Barel Michel. 1996. In : Microbiologie alimentaire. Tome 2 : aliments fermentés et fermentations alimentaires. Bourgeois C.M. (ed.), Larpent J.P. (ed.). Université de bretagne occidentale-Quimper. Paris : Technique et documentation Lavoisier, 275-286. (Collection sciences et techniques agro-alimentaires, 2) ISBN 2-7430-0080-5

La fermentation du café. Jacquet Michel. 1996. In : Microbiologie alimentaire. Tome 2 : aliments fermentés et fermentations alimentaires. Bourgeois C.M. (ed.), Larpent J.P. (ed.). Université de bretagne occidentale-Quimper. Paris : Technique et documentation Lavoisier, 287-298. (Collection sciences et techniques agro-alimentaires, 2) ISBN 2-7430-0080-5

La fusariose du palmier à huile : influence des facteurs édaphiques et culturaux sur la gravité de la maladie. Abadie Catherine. 1995. Orsay : Université de Paris-Sud, 139 p. Thèse d'université : Phytopathologie : Université de Paris-Sud

Extraction de l'huile de coco assistée par les enzymes. Bertrand F.. 1994. Aix-en-Provence : Université d'Aix-Marseille 3, 85 p. Thèse de doctorat : Microbiologie : Université Paul Cézanne

Technologie post-récolte et préparation du cacao. Stessels Louis. 1994. Montpellier : CIRAD-CP, 231 p. N° de rapport : CP_SIC 185

Etude de la réceptivité des sols à la fusariose du palmier à huile : rôle des facteurs biotiques et abiotiques des sols dans l'expression de cette réceptivité. Rapport semestriel n.1. Décembre 1992 - mai 1993. Contrat de recherche TS3* - CT92 - 002. Renard Jean-Luc. 1993. Montpellier : CIRAD-CP, 23 p.

Amidon aigre de manioc : Etude préliminaire de la filière de transformation traditionnelle et particulièrement de la phase de fermentation. Jory Michel. 1989. Montpellier : CIRAD-CEEMAT, 54 p. Mémoire Mastère : Technologies Agro-Alimentaires pour les Régions Chaudes : Ecole nationale supérieure des industries agricoles et alimentaires

Contribution à l'étude de deux processus de transformation du manioc comportant une phase de fermentation : le gari au Togo. L'amidon aigre en Colombie. Jory Michel. 1989. Montpellier : CIRAD-CEEMAT, 98 p. Mémoire Mastère : Technologies Agro-Alimentaires pour les Régions Chaudes : Ecole nationale supérieure des industries agricoles et alimentaires

Microbiologie café-cacao. Konaté Z.. 1989. Montpellier : CIRAD-IRCC, 22 p.

Mission au Cameroun. Etude de la microflore des fèves de cacao lors de la fermentation : influence du délai d'écabossage. Gueule Dominique. 1989. Montpellier : CIRAD-IRCC, 16 p.

Fermentation des fèves de cacao en lit fluide à trois phases. Jacquet Michel, Vincent Jean-Claude, Rios G.M., Gibert Henri. 1981. Café, Cacao, Thé, 25 (1) : 45-54.

Apport de facteurs de croissance à la micropopulation du rumen : valeur d'une méthode bactériologique chez les bovins tropicaux. Blancou Jean, Calvet Henry. 1978. Revue d'Elevage et de Médecine Vétérinaire des Pays Tropicaux, 31 (2) : 205-211.

Comparaison de la population microbienne du rumen et de son métabolisme saisonnier chez les zébus et les ovins du Sénégal. Blancou Jean. 1978. Revue d'Elevage et de Médecine Vétérinaire des Pays Tropicaux, 31 (1) : 21-26.

Note sur la microflore bactérienne intestinale d'un Nématode : Thelazia rhodesi. Blancou Jean, Vassiliades Georges, Mattei X.. 1978. Revue d'Elevage et de Médecine Vétérinaire des Pays Tropicaux, 31 (1) : 27-31.

Evolution de la microflore et des acides gras des fèves de cacao au cours du stockage. Etude préliminaire. Guénot M.C., Perriot Jean-Jacques, Vincent Jean-Claude. 1976. Café, Cacao, Thé, 20 (1) : 53-58.

Méthodes de conservation de la population microbienne du rumen in vitro. Blancou Jean. 1976. Revue d'Elevage et de Médecine Vétérinaire des Pays Tropicaux, 29 (4) : 305-308.

Contribution à l'étude de la population microbienne du rumen des zébus malgaches. Blancou Jean, Razafindramanana J.. 1974. Revue d'Elevage et de Médecine Vétérinaire des Pays Tropicaux, 27 (3) : 265-269.

Evolution de plusieurs caractéristiques d'un café Arabica au cours d'un stockage expérimental effectué à cinq humidités relatives et quatre températures différentes. Multon J.L., Poisson J., Cahagnier B., Hahn D., Barel Michel, Dos Santos Anderson Carvalho. 1974. Café, Cacao, Thé, 18 (2) : 121-132.

Etude de l'évolution de plusieurs caractéristiques d'un café Arabica au cours d'un stockage expérimental effectué à cinq humidités relatives différentes. Dos Santos Anderson Carvalho, Hahn D., Cahagnier B., Drapron R., Guilbot A., Lefebvre J., Multon J.L., Poisson J., Trentesaux E.. 1971. Café, Cacao, Thé, 15 (4) : 329-340.

Etude sur la digestibilité chez le zébu. Granier Pierre. 1968. Terre Malgache, 3 : 139-159.

Le colloque sur la fertilité des sols tropicaux. Rapport de synthèse (Suite et fin). IRAT - FRA. 1968. In : Le Colloque sur la fertilité des sols tropicaux. Anon.. Paris : IRAT, 517-667. (Agronomie tropicale, suppl.) Colloque sur la fertilité des sols tropicaux, Tananarive, Madagascar, 19 Novembre 1967/25 Novembre 1967.