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Addressing climate change in coffee farming: development of a methodology to select for drought tolerance in coffee varieties. Darracq Olivier, Leran Sophie, Aberkane Hafid, Palacios Algenis, Castillo Jonny, Bordeaux Mélanie, Marie Lison, Arigoni Fabrizio, Etienne Hervé, Bertrand Benoît, Marraccini Pierre. 2023. In : Book of abstracts of the 29th conference ASIC 2023. ASIC, VAAS. Hanoï : ASIC, p. 130. ASIC Conference on Coffee Science. 29, Hanoï, Viet Nam, 11 Septembre 2023/14 Septembre 2023.

'Bola de Oro' a promising grafting method that creates a new Arabica tree architecture. Courtel Philippe, Breitler Jean-Christophe, Alpizar Edgardo, Hidalgo Jose Martin, Bertrand Benoît. 2023. In : Book of abstracts of the 29th conference ASIC 2023. ASIC, VAAS. Hanoï : ASIC, p. 124. ASIC Conference on Coffee Science. 29, Hanoï, Viet Nam, 11 Septembre 2023/14 Septembre 2023.

" Coffee agroforestry business-driven clusters ": an innovative social and environmental organisational model for coffee farm renovation [version 2; peer review: 2 approved]. Meter Andrew, Penot Eric, Vaast Philippe, Etienne Hervé, Ponçon Eric, Bertrand Benoît. 2023. Open Research Europe, 2:61, 38 p.

Genetic-environment interactions and climatic variable effects on bean physical characteristics and chemical composition of Coffea arabica F1- hybrids in Vietnam. Sarzynski Thuan, Bertrand Benoît, Rigal Clément, Marraccini Pierre, Vaast Philippe, Nguyen Chang, Nguyen Hung, Nguyen Hai, Ngoc Quyen Luu, Navarini Luciano, Etienne Hervé. 2023. In : Book of abstracts of the 29th conference ASIC 2023. ASIC, VAAS. Hanoï : ASIC, p. 154. ASIC Conference on Coffee Science. 29, Hanoï, Viet Nam, 11 Septembre 2023/14 Septembre 2023.

Genetic-environment interactions and climatic variables effect on bean physical characteristics and chemical composition of Coffea arabica. Sarzynski Thuan, Bertrand Benoît, Rigal Clément, Marraccini Pierre, Vaast Philippe, Georget Frederic, Campa Claudine, Abdallah Cécile, Nguyen Thi Quynh Chang, Nguyen Hung Phi, Nguyen Hai Thy Thanh, Ngoc Quyen Luu, Ngan Giang Khong, Viet Thang Vu, Navarini Luciano, Lonzarich Valentina, Bossolasco Laurent, Etienne Hervé. 2023. Journal of the Science of Food and Agriculture, 103 : 4692-4703.

Global transcriptome profiling reveals differential regulatory, metabolic and hormonal networks during somatic embryogenesis in Coffea arabica. Awada Rayan, Lepelley Maud, Breton David, Charpagne Aline, Campa Claudine, Berry Victoria, Georget Frederic, Breitler Jean-Christophe, Leran Sophie, Djerrab Doaa, Martinez-Seidel Federico, Descombes Patrick, Crouzillat Dominique, Bertrand Benoît, Etienne Hervé. 2023. BMC Genomics, 24:41, 19 p.

Heterosis in F1 Arabica hybrids and its use under different agronomic conditions. Bertrand Benoît. 2023. In : Book of abstracts of the 29th conference ASIC 2023. ASIC, VAAS. Hanoï : ASIC, p. 92. ASIC Conference on Coffee Science. 29, Hanoï, Viet Nam, 11 Septembre 2023/14 Septembre 2023.

Potential beverage quality of three wild coffee species (Coffea brevipes, C. congensis and C. stenophylla) and consideration of their agronomic use. Bertrand Benoît, Davis Aaron P., Maraval Isabelle, Forestier Nelly, Mieulet Delphine. 2023. Journal of the Science of Food and Agriculture, 103 (7) : 3602-3612.

Conception de systèmes agroforestiers innovants à base de caféier. Bertrand Benoît, Rapidel Bruno. 2022. In : Transformations agroécologiques pour des systèmes alimentaires durables. Panorama de la recherche France-CGIAR = Agroecological transformation for sustainable food systems. Insight on France-CGIAR research. Atta-Krah Kwesi (ed.), Chotte Jean-Luc (ed.), Gascuel Chantal (ed.), Gitz Vincent (ed.), Hainzelin Etienne (ed.), Quintero Marcela (ed.), Sinclair Fergus L. (ed.). Agropolis. Montpellier : Agropolis International, 89-90. (Les dossiers d'Agropolis International, 26)

Description of an Arabica coffee ideotype for agroforestry cropping systems: A guideline for breeding more resilient new varieties. Breitler Jean-Christophe, Etienne Hervé, Leran Sophie, Marie Lison, Bertrand Benoît. 2022. Plants, 11 (16):2133, 24 p.

Feuille de route des recherches du Cirad à 10 ans sur la filière Café. Bertrand Benoît, Allinne Clémentine, Avelino Jacques, Biénabe Estelle, David Guillaume, Durand Noel, Leroy Thierry, Mieulet Delphine, Rigal Clément, Vaast Philippe. 2022. Montpellier : CIRAD, 84 p.

Genetic structuring of parental populations of coffee (Coffea canephora Pierre ex A. Froehner) breeding in Côte d'Ivoire using SNP markers. Gnapi Diane Estelle, N'Da Pokou Désiré, Legnaté Hyacinthe, Dapeng Zhang, Akaffou Doffou Sélastique, Koffi Kouamé Cyrille, Bertrand Benoît, Montagnon Christophe, N'Guetta Assanvo Simon-Pierre. 2022. Biotechnologie, Agronomie, Société et Environnement, 26 (3)

Is the genetic integrity of wild Coffea canephora from Ivory Coast threatened by hybridization with introduced coffee trees from Central Africa? Gnapi Diane Estelle, N'Da Pokou Désiré, Legnaté Hyacinthe, Dapeng Zhang, Montagnon Christophe, Bertrand Benoît, N'Guetta Assanvo Simon-Pierre. 2022. Euphytica, 218:62, 13 p.

Shade effects on yield across different Coffea arabica cultivars — how much is too much? A meta-analysis. Koutouleas Athina, Sarzynski Thuan, Bertrand Benoît, Bordeaux Mélanie, Skovmand Bosselmann Aske, Campa Claudine, Etienne Hervé, Turreira-Garcia Nerea, Leran Sophie, Markussen Bo, Marraccini Pierre, Cochicho Ramalho José, Vaast Philippe, Raebild Anders. 2022. Agronomy for Sustainable Development, 42:55, 13 p.

A comparative analysis of genomic and phenomic predictions of growth-related traits in three-way coffee hybrids. Mbebi Alain J., Breitler Jean-Christophe, Bordeaux Mélanie, Sulpice Ronan, McHale Marcus, Hao Tong, Toniutti Lucile, Alonso Castillo Jonny, Bertrand Benoît, Nikoloski Zoran. 2022. G3 - Genes Genomes Genetics, 12 (9):jkac170, 14 p.

Arabusta seed morphology: Arabica-like or Robusta-like? A preliminary comparison with parental species. Crisafulli Paola, Del Terra Lorenzo, Lonzarich Valentina, Bertrand Benoît, Campa Claudine, Charmetant Pierre, Leroy Thierry, Perthuis Bernard, Navarini Luciano. 2021. In : 28th Conference of Association for the Science and Information on Coffee - Books of abstracts. ASIC. Montpellier : ASIC, Résumé, p. 193. Conference of Association for the Science and Information on Coffee (ASIC 2021). 28, Montpellier, France, 28 Juin 2021/1 Juillet 2021.

Breeding for the main agricultural farming of Arabica coffee. Bertrand Benoît, Villegas Hincapie Andres Mauricio, Marie Lison, Breitler Jean-Christophe. 2021. Frontiers in Sustainable Food Systems, 5:709901, 15 p.

Coffee (Coffea arabica L.) bean transcriptome and volatiles under stress. Echeverria-Beirute Fabian, Murray Seth C., Klein Patricia E., Bertrand Benoît. 2021. In : 28th Conference of Association for the Science and Information on Coffee - Books of abstracts. ASIC. Montpellier : ASIC, Résumé, p. 122. Conference of Association for the Science and Information on Coffee (ASIC 2021). 28, Montpellier, France, 28 Juin 2021/1 Juillet 2021.

Enhancing the adoption worldwide of Arabica hybrids through implementation of on-farm trials, transfer of propagation techniques and stakeholder dialog platforms. Etienne Hervé, Georget Frederic, Ruiz Teresa, Bordeaux Mélanie, Leroy Thierry, Penot Eric, Marraccini Pierre, Vaast Philippe, Courtel Philippe, Turreira-Garcia Nerea, Ehabe Ejolle Eugène, Nyambi Gwendoline, Njiayouom Ibrahim, Billa Samuel, Bertrand Benoît, Do Vinh Nang, Nguyen Chang, Nguyen Van, Luu Quyen, Nguyen Hung Phi, Bueso Valera Carlos, Skovmand Bosselmann Aske. 2021. In : 28th Conference of Association for the Science and Information on Coffee - Books of abstracts. ASIC. Montpellier : ASIC, Résumé, p. 127. Conference of Association for the Science and Information on Coffee (ASIC 2021). 28, Montpellier, France, 28 Juin 2021/1 Juillet 2021.

Modélisation, analyse prospective et simulation de l'utilisation d'une nouvelle variété hybride Arabica en système agroforestier dans un concept de coffee cluster (CaFc) dans la région du Nord-Ouest du Vietnam (Dien Bien Phu/Son La). Penot Eric, Fanguède Auberi, Rigal Clément, Skovmand Bosselmann Aske, Vaast Philippe, Bertrand Benoît. 2021. . INRAE, SFER, CIRAD. Toulouse : SFER Journées de recherche en sciences sociales (JRSS). 15, Toulouse, France, 9 Décembre 2021/10 Décembre 2021.

On-farm performance of Arabica F1 Hybrids in the western highlands of Cameroon. Billa Samuel, Nyambi Gwendoline, Mourn Piau, Kuate Marcel, Camus Baptiste, Fuhrman Thessa, Bertrand Benoît, Bosselmann Aske, Regal Clement, Nchounji Ibrahim, Etienne Hervé, Penot Eric, Leroy Thierry, Ehabe Ejolle Eugène. 2021. In : 28th Conference of Association for the Science and Information on Coffee - Books of abstracts. ASIC. Montpellier : ASIC, Résumé, p. 240. Conference of Association for the Science and Information on Coffee (ASIC 2021). 28, Montpellier, France, 28 Juin 2021/1 Juillet 2021.

Photoperiod-dependent transcriptional modifications in key metabolic pathways in Coffea arabica. Djerrab Doaa, Bertrand Benoît, Breitler Jean-Christophe, Leran Sophie, Dechamp Eveline, Campa Claudine, Barrachina Célia, Conejero Geneviève, Etienne Hervé, Sulpice Ronan. 2021. Tree Physiology, 41 (2) : 302-316.

Quality comparison of Arabusta and Robusta grown in French Guiana. Abdallah Cécile, Portaluri Vincent, Navarini Luciano, Crisafulli Paola, Lonzarich Valentina, Charmetant Pierre, Thomas Freddy, Perthuis Bernard, Etienne Hervé, Bertrand Benoît, Leroy Thierry, Campa Claudine. 2021. In : 28th Conference of Association for the Science and Information on Coffee - Books of abstracts. ASIC. Montpellier : ASIC, Résumé, p. 146. Conference of Association for the Science and Information on Coffee (ASIC 2021). 28, Montpellier, France, 28 Juin 2021/1 Juillet 2021.

Study of circadian regulation of primary metabolism in coffee plant is key to develop coffee varieties adapted to climate change. Breitler Jean-Christophe, Toniutti Lucile, Djerrab Doaa, Leran Sophie, Campa Claudine, Etienne Hervé, Bertrand Benoît. 2021. In : 28th Conference of Association for the Science and Information on Coffee - Books of abstracts. ASIC. Montpellier : ASIC, Résumé, p. 39. Conference of Association for the Science and Information on Coffee (ASIC 2021). 28, Montpellier, France, 28 Juin 2021/1 Juillet 2021.

Synthèse des GT filières 2020. Côte François-Xavier (ed.), Bachelier Bruno, Bessou Cécile, Macombe Catherine, Dabat Marie-Hélène, Clavel Danièle, Perret Sylvain, Bourgoin Jeremy, Valette Elodie, Corniaux Christian, Marzin Jacques, Lançon Frédéric, Gautier Denis, Kahane Rémi, Tharreau Didier, Zakhia Nadine, De Lattre-Gasquet Marie, Dumas Patrice, Prades Alexia, Sainte Beuve Jérôme, Baufume Servane, Bertrand Benoît, Loeillet Denis, Blangy Lisa, Saletes Sloan, Rafflegeau Sylvain, Cipra Christine. 2021. Montpellier : CIRAD, 54 p.

Unravelling the metabolic and hormonal machinery during key steps of somatic embryogenesis: A case study in coffee. Awada Rayan, Campa Claudine, Gibault Estelle, Dechamp Eveline, Georget Frederic, Lepelley Maud, Abdallah Cécile, Erban Alexander, Martinez-Seidel Federico, Kopka Joachim, Legendre Laurent, Leran Sophie, Conejero Geneviève, Verdeil Jean-Luc, Crouzillat Dominique, Breton David, Bertrand Benoît, Etienne Hervé. 2021. In : 28th Conference of Association for the Science and Information on Coffee - Books of abstracts. ASIC. Montpellier : ASIC, Résumé, p. 68. Conference of Association for the Science and Information on Coffee (ASIC 2021). 28, Montpellier, France, 28 Juin 2021/1 Juillet 2021.

A single polyploidization event at the origin of the tetraploid genome of Coffea arabica is responsible for extremely low genetic variation in wild and cultivated germplasm. Scalabrin Simone, Toniutti Lucile, Di Gaspero Gabriele, Scaglione Davide, Magris Gabriele, Vidotto Michele, Pinosio Sara, Cattonaro Frederica, Magni Federica, Jurman Irena, Cerutti Mario, Suggi Liverani Furio, Navarini Luciano, Del Terra Lorenzo, Pellegrino Gloria, Ruosi Manuela Rosanna, Vitulo Nicola, Valle Giorgio, Pallavicini Alberto, Graziosi Giorgio, Klein Patricia E., Bentley Nolan, Murray Seth C., Solano William, Al Hakimi Amin, Schilling Timothy, Montagnon Christophe, Kotch George, Bertrand Benoît, Morgante Michele. 2021. In : 28th Conference of Association for the Science and Information on Coffee - Books of abstracts. ASIC. Montpellier : ASIC, Résumé, p. 102. Conference of Association for the Science and Information on Coffee (ASIC 2021). 28, Montpellier, France, 28 Juin 2021/1 Juillet 2021.

5-CQA and mangiferin, two leaf biomarkers of adaptation to full sun or shade conditions in Coffea arabica L. Duangsodsri Teerarat, Villain Luc, Vestalys Ialy Rojo, Michalet Serge, Abdallah Cécile, Breitler Jean-Christophe, Bordeaux Mélanie, Villegas Andres Mauricio, Raherimandimby Marson, Legendre Laurent, Etienne Hervé, Bertrand Benoît, Campa Claudine. 2020. Metabolites, 10 (10):383, 22 p.

Authentication of Coffea arabica varieties through DNA fingerprinting and its significance for the coffee sector. Pruvot-Woehl Solène, Krishnan Sarada, Solano William, Schilling Timothy, Toniutti Lucile, Bertrand Benoît, Montagnon Christophe. 2020. Journal of AOAC International, 103 (2) : 325-334.

Data Management Plan update for the BREEDCAFS Project [Rethinking the breeding of tropical perennial crops in agroforestry systems:the Arabica coffee case]. Bertrand Benoît, Dedieu Laurence. 2020. Montpellier : CIRAD, 18 p.

Full moonlight-induced circadian clock entrainment in Coffea arabica. Breitler Jean-Christophe, Djerrab Doaa, Leran Sophie, Toniutti Lucile, Guittin Charlie, Severac Dany, Pratlong Marine, Dereeper Alexis, Etienne Hervé, Bertrand Benoît. 2020. BMC Plant Biology, 20:24, 11 p.

G x E interactions on yield and quality in Coffea arabica: New F1 hybrids outperform American cultivars. Marie Lison, Abdallah Cécile, Campa Claudine, Courtel Philippe, Bordeaux Mélanie, Navarini Luciano, Lonzarich Valentina, Skovmand Bosselmann Aske, Turreira-Garcia Nerea, Alpizar Edgardo, Georget Frederic, Breitler Jean-Christophe, Etienne Hervé, Bertrand Benoît. 2020. Euphytica, 216:78, 17 p.

Limited genotypic and geographic variability of 16-O-methylated diterpene content in Coffea arabica green beans. Portaluri Vincent, Thomas Freddy, Guyader Sophie, Jamin Eric, Bertrand Benoît, Remaud Gérald S., Schievano Elisabetta, Mammi Stefano, Guercia Elena, Navarini Luciano. 2020. Food Chemistry, 329:127129, 7 p.

A single polyploidization event at the origin of the tetraploid genome of Coffea arabica is responsible for the extremely low genetic variation in wild and cultivated germplasm. Scalabrin Simone, Toniutti Lucile, Di Gaspero Gabriele, Scaglione Davide, Magris Gabriele, Vidotto Michele, Pinosio Sara, Cattonaro Frederica, Magni Federica, Jurman Irena, Cerutti Mario, Suggi Liverani Furio, Navarini Luciano, Del Terra Lorenzo, Pellegrino Gloria, Ruosi Manuela Rosanna, Vitulo Nicola, Valle Giorgio, Pallavicini Alberto, Graziosi Giorgio, Klein Patricia E., Bentley Nolan, Murray Seth C., Solano William, Al Hakimi Amin, Schilling Timothy, Montagnon Christophe, Morgante Michele, Bertrand Benoît. 2020. Scientific Reports, 10:4642, 13 p.

Association study of tree size and male sterility in a F2 Coffea Arabica population. Toniutti Lucile, Bordeaux Mélanie, Klein Patricia E., Bertrand Benoît, Montagnon Christophe. 2019. In : 27th Biennial ASIC Conference, Portland, 16-20 September 2018. Book of abstracts 2019. ASIC, SCA. Portland : ASIC, Résumé, 1 p. Biennial ASIC Conference. 27, Portland, États-Unis, 16 Septembre 2018/20 Septembre 2018.

Beyond economic advantages of agroforestry systems: what role and place of externalities in farmers' strategies? Penot Eric, Danthu Pascal, Chambon Bénédicte, Bertrand Benoît. 2019. In : 4th World Congress on Agroforestry. Book of abstracts. Dupraz Christian (ed.), Gosme Marie (ed.), Lawson Gerry (ed.). CIRAD, INRA, World Agroforestry, Agropolis International, MUSE. Montpellier : CIRAD-INRA, Résumé, p. 428. World Congress on Agroforestry. 4, Montpellier, France, 20 Mai 2019/22 Mai 2019.

Coffee somatic embryogenesis, a model to decipher fundamental mechanisms associated to totipotency, somaclonal variation and photo-autotrophy acquisition. Etienne Hervé, Breitler Jean-Christophe, Bertrand Benoît, Dechamp Eveline, Marraccini Pierre, Leran Sophie, Campa Claudine, Duangsodsri Teerarat, Georget Frederic, Awada Rayan. 2019. In : 27th Biennial ASIC Conference, Portland, 16-20 September 2018. Book of abstracts 2019. ASIC, SCA. Portland : ASIC, Résumé, 1 p. Biennial ASIC Conference. 27, Portland, États-Unis, 16 Septembre 2018/20 Septembre 2018.

Local value-chain with Coffee/Cocoa agroforestry business driven Clusters to foster social and environmental innovations. Penot Eric, Baufume Servane, Etienne Hervé, Mouafi S., Blangy Lisa, Saletes Sloan, Bertrand Benoît. 2019. In : 4th World Congress on Agroforestry. Book of abstracts. Dupraz Christian (ed.), Gosme Marie (ed.), Lawson Gerry (ed.). CIRAD, INRA, World Agroforestry, Agropolis International, MUSE. Montpellier : CIRAD-INRA, Résumé, p. 288. World Congress on Agroforestry. 4, Montpellier, France, 20 Mai 2019/22 Mai 2019.

New varieties for innovative agroforestry coffee systems. Bertrand Benoît, Breitler Jean-Christophe, Georget Frederic, Penot Eric, Bordeaux Mélanie, Marraccini Pierre, Leran Sophie, Campa Claudine, Bonato Olivier, Villain Luc, Etienne Hervé. 2019. In : The agroecological transition of agricultural systems in the Global South. Côte François-Xavier (ed.), Poirier-Magona Emmanuelle (ed.), Perret Sylvain (ed.), Roudier Philippe (ed.), Bruno Rapidel (ed.), Thirion Marie-Cécile (ed.). Versailles : Ed. Quae, 161-176. (Agricultures et défis du monde) ISBN 978-2-7592-3056-3

Physiological plasticity: a key element of coffe hybrjds to face leaf rust disease attack. Toniutti Lucile, Breitler Jean-Christophe, Campa Claudine, Bertrand Benoît, Etienne Hervé, Lambot Charles, Herrera Juan Carlos. 2019. In : 27th Biennial ASIC Conference, Portland, 16-20 September 2018. Book of abstracts 2019. ASIC, SCA. Portland : ASIC, Résumé, 1 p. Biennial ASIC Conference. 27, Portland, États-Unis, 16 Septembre 2018/20 Septembre 2018.

Starmaya: The first arabica F1 coffee hybrid produced using genetic male sterility. Georget Frederic, Marie Lison, Alpizar Edgardo, Courtel Philippe, Bordeaux Mélanie, Hidalgo Martin, Marraccini Pierre, Breitler Jean-Christophe, Dechamp Eveline, Poncon Clément, Etienne Hervé, Bertrand Benoît. 2019. Frontiers in Plant Science, 10:1344, 13 p.

Unravelling the metabolic and hormonal machinery during key steps of somatic embryogenesis: A case study in coffee. Awada Rayan, Campa Claudine, Gibault Estelle, Dechamp Eveline, Georget Frederic, Lepelley Maud, Abdallah Cécile, Erban Alexander, Martinez-Seidel Federico, Kopka Joachim, Legendre Laurent, Leran Sophie, Conejero Geneviève, Verdeil Jean-Luc, Crouzillat Dominique, Breton David, Bertrand Benoît, Etienne Hervé. 2019. International Journal of Molecular Sciences, 20 (19):4665, 29 p.

Wide C. arabica genetic study brings new insights on movements and breeding history of the species. Pruvot-Woehl Solène, Toniutti Lucile, Al Hakimi Amin, Krishnan Sarada, Klein Patricia E., Murray Seth C., Solano William, Schilling Timothy, Adugna Girma, Bertrand Benoît, Montagnon Christophe. 2019. In : 27th Biennial ASIC Conference, Portland, 16-20 September 2018. Book of abstracts 2019. ASIC, SCA. Portland : ASIC, Résumé, 1 p. Biennial ASIC Conference. 27, Portland, États-Unis, 16 Septembre 2018/20 Septembre 2018.

An altered circadian clock coupled with a higher photosynthesis efficiency could explain the better agronomic performance of a new coffee clone when compared with a standard variety. Toniutti Lucile, Breitler Jean-Christophe, Guittin Charlie, Doulbeau Sylvie, Etienne Hervé, Campa Claudine, Lambot Charles, Herrera Pinilla Juan-Carlos, Bertrand Benoît. 2019. International Journal of Molecular Sciences, 20 (3):736, 19 p.

A global approach to decipher molecular basis of coffee tree adaptation to shade. Duangsodsri Teerarat, Leran Sophie, Villegas A.M., Vestalys I., Artins A., Etienne Hervé, Breitler Jean-Christophe, Villain Luc, Bertrand Benoît, Campa Claudine. 2019. In : 4th World Congress on Agroforestry. Book of abstracts. Dupraz Christian (ed.), Gosme Marie (ed.), Lawson Gerry (ed.). CIRAD, INRA, World Agroforestry, Agropolis International, MUSE. Montpellier : CIRAD-INRA, Résumé, p. 749. World Congress on Agroforestry. 4, Montpellier, France, 20 Mai 2019/22 Mai 2019.

The greater phenotypic homeostasis of the allopolyploid Coffea arabica improved the transcriptional homeostasis over that of both diploid parents. Bertrand Benoît, Bardil Amélie, Etienne Hervé. 2019. In : 27th Biennial ASIC Conference, Portland, 16-20 September 2018. Book of abstracts 2019. ASIC, SCA. Portland : ASIC, Résumé, 1 p. Biennial ASIC Conference. 27, Portland, États-Unis, 16 Septembre 2018/20 Septembre 2018.

Coffee somatic embryogenesis: How did research, experience gained and innovations promote the commercial propagation of elite clones from the two cultivated species. Etienne Hervé, Breton David, Breitler Jean-Christophe, Bertrand Benoît, Dechamp Eveline, Awada Rayan, Marraccini Pierre, Leran Sophie, Alpizar Edgardo, Campa Claudine, Courtel Philippe, Georget Frederic, Ducos Jean-Paul. 2018. Frontiers in Plant Science, 9:1630, 21p.

Creating new coffee varieties to cope with climate changes: current knowledge and future challenges. Marraccini Pierre, De Aquino Oliveira Sinara, Torres Luana F., Alves G.C.S., Breitler Jean-Christophe, Campa Claudine, Leran Sophie, Villain Luc, Georget Frederic, De Kochko Alexandre, Poncet Valérie, Andrade Alan Carvalho, Etienne Hervé, Bertrand Benoît. 2018. In : Abstracts of 12th IPMB2018. Agropolis Fondation, MUSE, l'INRA, le CNRS, Montpellier SupAgro, l'Université de Montpellier, l'IRD, CIRAD, la SFBV, le Labex Tulip, la SPS, Molecular Plant, The Plant Cell, Communications Biology, la Région Occitanie - Pyrénées/Méditerranée. Montpellier : IPMB, 2 p. Congress of the International Plant Molecular Biology ( IPMB2018). 12, Montpellier, France, 5 Août 2018/10 Août 2018.

De nouvelles variétés pour des systèmes caféiers agroforestiers innovants. Bertrand Benoît, Breitler Jean-Christophe, Georget Frederic, Penot Eric, Bordeaux Mélanie, Marraccini Pierre, Leran Sophie, Campa Claudine, Bonato Olivier, Villain Luc, Etienne Hervé. 2018. In : La transition agro-écologique des agricultures du Sud. Côte François-Xavier (ed.), Poirier-Magona Emmanuelle (ed.), Perret Sylvain (ed.), Roudier Philippe (ed.), Bruno Rapidel (ed.), Thirion Marie-Cécile (ed.). Versailles : Ed. Quae, 231-256. (Agricultures et défis du monde) ISBN 978-2-7592-2824-9

Rust and thinning management effect on cup quality and plant performance for two cultivars of Coffea arabica L. Echeverria-Beirute Fabian, Murray Seth C., Klein Patricia E., Kerth Chris, Miller Rhonda, Bertrand Benoît. 2018. Journal of Agricultural and Food Chemistry, 66 (21) : 5281-5292.

Semejanza entre el crecimiento en vivero de cafetos (Coffea arabica L.) obtenidos por embriogénesis somática y por semillas. Hermoso Gallardo Luis, Suárez-Villasmil Lourdes, Etienne Hervé, Bertrand Benoît, Barry-Etienne Dominique, Menendez-Yuffa Andrea. 2018. Revista Biodiversidad Neotropical, 8 (3):156, 11 p.

Cultivating coffee quality - Terroir and agro-ecosystem. Lambot Charles, Herrera Juan Carlos, Bertrand Benoît, Sadeghian Siavosh, Benavides Pablo, Gaitan Alvaro. 2017. In : The craft and science of coffee. Folmer, Britta (ed.). Londres : Academic Press, 17-49. ISBN 978-0-12-803520-7

Differential fine-tuning of gene expression regulation in coffee leaves by CcDREB1D promoter haplotypes under water deficit. Costa Alves Gabriel Sergio, Ferreira Torres Luana, Dechamp Eveline, Breitler Jean-Christophe, Joët Thierry, Gatineau Frédéric, Carvalho Andrade Alan, Bertrand Benoît, Marraccini Pierre, Etienne Hervé. 2017. Journal of Experimental Botany, 68 (11) : 3017-3031.

Identification by the DArTseq method of the genetic origin of the Coffea canephora cultivated in Vietnam and Mexico [P0105]. Garavito Andrea, Montagnon Christophe, Guyot Romain, Bertrand Benoît. 2017. In : Proceedings Plant and Animal Genome XXV Conference. San Diego : PAG, 1 p. Plant and Animal Genome Conference. 25, San Diego, États-Unis, 14 Janvier 2017/18 Janvier 2017.

Influence of environmental conditions and genetic background of Arabica coffee (C. arabica L) on leaf rust (Hemileia vastatrix)pathogenesis. Toniutti Lucile, Breitler Jean-Christophe, Etienne Hervé, Campa Claudine, Doulbeau Sylvie, Urban Laurent, Lambot Charles, Pinilla Juan-Carlos H., Bertrand Benoît. 2017. Frontiers in Plant Science, 8:2025, 12 p.

Inoculation with selected Saccharomyces cerevisiae yeast in coffee fermentation : Pilot- and industrial-scale evaluations of the impact on the process and coffee quality. Berthiot Laurent, Lahon Marie-Christine, Alter Pascaline, Bertrand Benoît, Durand Noel, Boulanger Renaud, Maraval Isabelle, Ortiz-Julien A., Sieczkowski Nathallie. 2017. . Universita Del Piemonte Orientale, Universita Degli Studi Di Torino. Turin : Universita Del Piemonte Orientale, Résumé, 1 p. International Conference on Cocoa Coffee and Tea 2017. 4, Turin, Italie, 25 Juin 2017/28 Juin 2017.

Juvenile coffee leaves acclimated to low light are unable to cope with a moderate light increase. Campa Claudine, Urban Laurent, Mondolot Laurence, Fabre Denis, Roques Sandrine, Lizzi Yves, Aarrouf Jawad, Doulbeau Sylvie, Breitler Jean-Christophe, Letrez Céline, Toniutti Lucile, Bertrand Benoît, La Fisca Philippe, Bidel Luc P.R., Etienne Hervé. 2017. Frontiers in Plant Science, 8:1126, 16 p.

Selección de variedades híbridas F1 de café arabica para los sistemas agroforestales mexicanos. Breitler Jean-Christophe, Bertrand Benoît, Etienne Hervé, Georget Frederic, Campa Claudine, Bordeaux Mélanie, Villain Luc. 2017. In : Libro de resumenes: Red tematica de sistemas agroforestales de Mexico Reunion Nacional. CONACYT, CONAFOR, JALISCO. La Paz : Red SAM, Résumé, 50. Primera Reunión Nacional de la Red SAM. 1, La Paz, Mexique, 30 Octobre 2017/1 Novembre 2017.

Somatic embryogenesis-derived coffee plantlets can be efficiently propagated by horticultural rooted mini-cuttings: A boost for somatic embryogenesis. Georget Frederic, Courtel Philippe, Garcia Eduardo Malo, Hidalgo Martin, Alpizar Edgardo, Breitler Jean-Christophe, Bertrand Benoît, Etienne Hervé. 2017. Scientia Horticulturae, 216 : 177-185.

Are genetics and epigenetic instabilities of plant embryogenic cells a fatality? The experience of coffee somatic embryogenesis. Etienne Hervé, Bertrand Benoît, Dechamp Eveline, Maurel Patrick, Georget Frederic, Guyot Romain, Breitler Jean-Christophe. 2016. Human Genetics and Embryology, 6 (136), 5 p.

Biodiversidad agrícola y sistemas campesinos de producción de semillas. Clavel Danièle, Bazile Didier, Bertrand Benoît, Sounigo Olivier, Vom Brocke Kirsten, Trouche Gilles. 2016. In : Las agriculturas familiares y los mundos del futuro. Sourisseau Jean-Michel (ed.). San José : IICA-AFD, 331-350. (AgriculturaS y retoS mundiales) ISBN 978-92-9248-648-8

Healthy tropical plants to mitigate the impact of climate change - as exemplified in coffee. Bertrand Benoît, Marraccini Pierre, Villain Luc, Breitler Jean-Christophe, Etienne Hervé. 2016. In : Climate change and agriculture worldwide. Torquebiau Emmanuel (ed.), Manley David (trad.), Cowan Paul (trad.). Heidelberg : Springer, 83-95. ISBN 978-94-017-7460-4

Identification by the DArTseq method of the genetic origin of the Coffea canephora cultivated in Vietnam and Mexico. Garavito Andrea, Montagnon Christophe, Guyot Romain, Bertrand Benoît. 2016. BMC Plant Biology, 16 (242), 12 p.

A single-step method for RNA isolation from tropical crops in the field. Breitler Jean-Christophe, Campa Claudine, Georget Frederic, Bertrand Benoît, Etienne Hervé. 2016. Scientific Reports, 6 (38368), 6 p.

Advanced variety development and multiplication of Arabica Coffee: Challenges and opportunities. Bertrand Benoît, Charrier André, van der Vossen Herbert. 2015. In : Proceedings of the 25th International Conference on Coffee Science. ASIC. Paris : ASIC, 42-59. ISBN 978-2-900212-24-0 International Conference on Coffee Science. 25, Armenia, Colombie, 8 Septembre 2014/13 Septembre 2014.

Agricultural biodiversity and rural systems of seed production. Clavel Danièle, Bazile Didier, Bertrand Benoît, Sounigo Olivier, Vom Brocke Kirsten, Trouche Gilles. 2015. In : Family farming and the Worlds to come. Sourisseau Jean-Michel (ed.). Dordrecht : Springer [Pays-Bas], 285-300.

Assessment of genetic and epigenetic changes during cell culture ageing and relations with somaclonal variation in Coffea arabica. Bobadilla Landey Roberto, Cenci Alberto, Guyot Romain, Bertrand Benoît, Georget Frederic, Dechamp Eveline, Herrera Juan Carlos, Aribi Jamel, Lashermes Philippe, Etienne Hervé. 2015. Plant Cell, Tissue and Organ Culture, 122 (3) : 517-531.

Development of a male sterility based reproductive system to ensure a cost effective and massive propagation of new outstanding F1 Arabica hybrids by seed. Georget Frederic, Alpizar Edgardo, Courtel Philippe, Hidalgo Martin, Dechamp Eveline, Poncon C., Etienne Hervé, Bertrand Benoît. 2015. In : Proceedings of the 25th International Conference on Coffee Science. ASIC. Paris : ASIC, 42-45. ISBN 978-2-900212-24-0 International Conference on Coffee Science. 25, Armenia, Colombie, 8 Septembre 2014/13 Septembre 2014.

Diseases caused by nematodes. Rivillas C.A., Villain Luc, Bertrand Benoît. 2015. In : Compendium of Coffee Diseases and Pests. Alvaro L. Gaitán (ed.), Marco A. Cristancho (ed.), Bertha L. Castro Caicedo (ed.), Carlos A. Rivillas (ed.), Gabriel Cadena Gómez (ed.). Saint-Paul : The American Phytopathological Society, 37-42. ISBN 978-0-89054-470-9

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Embryogenic potential of hybrids originated from Coffea arabica (Caturra X Timor Hybrid) X wild Ethiopian accessions crosses (Pb212). Villegas A.M., Gongora C., Posada S.H., Bertrand Benoît, Gast F.. 2015. In : Proceedings of the 25th International Conference on Coffee Science. ASIC. Paris : ASIC, 42-47. ISBN 978-2-900212-24-0 International Conference on Coffee Science. 25, Armenia, Colombie, 8 Septembre 2014/13 Septembre 2014.

Environmental effects on coffee seed biochemical composition and quality attributes: a genomic perspective. Joët Thierry, Bertrand Benoît, Dussert Stéphane. 2015. In : Proceedings of the 25th International Conference on Coffee Science. ASIC. Paris : ASIC, 42-49. ISBN 978-2-900212-24-0 International Conference on Coffee Science. 25, Armenia, Colombie, 8 Septembre 2014/13 Septembre 2014.

La bonne santé des plantes tropicales pour atténuer les effets du changement climatique: l'exemple du caféier. Bertrand Benoît, Marraccini Pierre, Villain Luc, Breitler Jean-Christophe, Etienne Hervé. 2015. In : Changement climatique et agricultures du monde. Torquebiau Emmanuel (ed.). Versailles : Ed. Quae, 84-95. (Agricultures et défis du monde)

Next generation variety development for sustainable production of arabica coffee (Coffea arabica L.): A review. van der Vossen Herbert, Bertrand Benoît, Charrier André. 2015. Euphytica, 204 (2) : 243-256.

A booster for commercial propagation of Coffea arabica F1 hybrids: somatic embryo-derived plantlets can Be efficiently propagated in nursery via rooted cuttings. Georget Frederic, Courtel Philippe, Malo Eduardo, Hidalgo Martin, Alpizar Edgardo, Poncon C., Bertrand Benoît, Etienne Hervé. 2015. In : Proceedings of the 25th International Conference on Coffee Science. ASIC. Paris : ASIC, 42-45. ISBN 978-2-900212-24-0 International Conference on Coffee Science. 25, Armenia, Colombie, 8 Septembre 2014/13 Septembre 2014.

The greater phenotypic homeostasis of the allopolyploid Coffea arabica improved the transcriptional homeostasis over that of both diploid parents. Bertrand Benoît, Bardil Amélie, Baraille Hélène, Dussert Stéphane, Doulbeau Sylvie, Dubois Emeric, Severac Dany, Dereeper Alexis, Etienne Hervé. 2015. Plant and Cell Physiology, 56 (10) : 2035-2051.

Biodiversité agricole et systèmes paysans de production de semences. Clavel Danièle, Bazile Didier, Bertrand Benoît, Sounigo Olivier, Vom Brocke Kirsten, Trouche Gilles. 2014. In : Agricultures familiales et mondes à venir. Sourisseau Jean-Michel (ed.). Versailles : Ed. Quae, 287-302. (Agricultures et défis du monde) ISBN 978-2-7592-2141-7

Regulation of galactomannan biosynthesis in coffee seeds. Joët Thierry, Laffargue Andréina, Salmona Jordi, Doulbeau Sylvie, Descroix Frédéric, Bertrand Benoît, Lashermes Philippe, Dussert Stéphane. 2014. Journal of Experimental Botany, 65 (1) : 323-337.

Récipient pour la culture in vitro de matériel végétal en conditions stériles, par immersion temporaire. Etienne Hervé, Georget Frederic, Bertrand Benoît. 2014. Paris : INPI, 29 p. N° de dépôt : 1153642, N° de brevet : FR2974580 B1, N° de dépôt international : PCT/FR2012/050919, N° de brevet international : WO2012/146872 A1, N° de brevet : BR112013027846 A2, N° de brevet : MX2013012473 A

The coffee genome provides insight into the convergent evolution of caffeine biosynthesis. Denoeud France, Carretero-Paulet Lorenzo, Dereeper Alexis, Droc Gaëtan, Guyot Romain, Pietrella Marco, Chunfang Zheng, Alberti Adriana, Anthony François, Aprea Giuseppe, Aury Jean-Marc, Bento Pascal, Bernard Maria, Bocs Stéphanie, Campa Claudine, Cenci Alberto, Combes Marie-Christine, Crouzillat Dominique, Da Silva Corinne, Daddiego Loretta, De Bellis Fabien, Dussert Stéphane, Garsmeur Olivier, Gayraud Thomas, Guignon Valentin, Jahn Katharina, Jamilloux Véronique, Joët Thierry, Labadie Karine, Tianying Lan, Leclercq Julie, Lepelley Maud, Leroy Thierry, Lei-Ting Li, Librado Pablo, Lopez Loredana, Muñoz Adriana, Noël Benjamin, Pallavicini Alberto, Perrotta Gaetano, Poncet Valérie, Pot David, Priyono, Rigoreau Michel, Rouard Mathieu, Rozas Julio, Tranchant-Dubreuil Christine, VanBuren Robert, Qiong Zhang, Andrade Alan A., Argout Xavier, Bertrand Benoît, De Kochko Alexandre, Graziosi Giorgio, Henry Robert, Jayarama, Ming Ray, Nagai Chifumi, Rounsley Steve, Sankoff David, Giuliano Giovanni, Albert Victor A., Wincker Patrick, Lashermes Philippe. 2014. Science, 345 (6201) : 1181-1184.

Climatic factors directly impact the biochemical composition and the volatile organic compounds fingerprint in green Arabica coffee bean as well coffee beverage quality. Bertrand Benoît, Boulanger Renaud, Dussert Stéphane, Laffargue Andréina, Ribeyre Fabienne, Berthiot Laurent, Descroix Frédéric, Joët Thierry. 2013. In : Proceedings of the 24th International Conference on Coffee Science, San José, Costa Rica, 12th-16th November 2012 = Actes du 24ème Colloque scientifique international sur le café, San José, Costa Rica, 12-16 novembre 2012. ASIC. Paris : ASIC, 628-635. ISBN 978-2-900212-23-3 International Conference on Coffee Science. 24, San José, Costa Rica, 12 Novembre 2012/16 Novembre 2012.

Contribution of subgenomes to the transcriptome and their intertwined regulation in the allopolyploid Coffea arabica L. grown in contrasted temperatures : W190. Combes Marie-Christine, Dereeper Alexis, Bertrand Benoît, Lashermes Philippe. 2013. In : Plant and Animal Genome XXI conference, San Diego, USA, January 12-16 2013,. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. Plant and Animal Genome conference. 21, San Diego, États-Unis, 12 Janvier 2013/16 Janvier 2013.

Contribution of subgenomes to the transcriptome and their intertwined regulation in the allopolyploid Coffea arabica grown at contrasted temperatures. Combes Marie-Christine, Dereeper Alexis, Severac Dany, Bertrand Benoît, Lashermes Philippe. 2013. New Phytologist, 200 (1) : 251-260.

De l'invention technique à l'innovation sociale : quels rôle et responsabilité de la recherche dans l'accompagnement du changement ? Alami Sophia, Clavel Danièle, Maffezzoli Camille, Bertrand Benoît. 2013. In : L'innovation : analyser, anticiper, agir. Réseau de recherche sur l'innovation. Bruxelles : PIE-Peter Lang, 251-270. (Business & Innovation, 5) ISBN 978-2-87574-051-9

Development of coffee somatic and zygotic embryos to plants differs in the morphological, histochemical and hydration aspects. Etienne Hervé, Bertrand Benoît, Georget Frederic, Lartaud Marc, Montes Fabienne, Dechamp Eveline, Verdeil Jean-Luc, Barry-Etienne Dominique. 2013. Tree Physiology, 33 (6) : 640-653.

Diversity of root-knot nematodes parasitizing coffee in Central America. Villain Luc, Sarah Jean-Louis, Hernandez Adan, Bertrand Benoît, Anthony François, Lashermes Philippe, Charmetant Pierre, Anzueto Francisco, Carneiro Regina Maria Dechechi Gomes. 2013. Nematropica, 43 (2) : 194-206.

High genetic and epigenetic stability in coffea arabica plants derived from embryogenic suspensions and secondary embryogenesis as revealed by AFLP, MSAP and the phenotypic variation rate. Bodadilla Landey Roberto, Cenci Alberto, Georget Frederic, Bertrand Benoît, Camayo Gloria, Dechamp Eveline, Herrera Juan Carlos, Santoni Sylvain, Lashermes Philippe, Simpson June, Etienne Hervé. 2013. PloS One, 8 (2):e56372, 15 p.

Repenser l'amélioration des plantes. Ahmadi Nourollah, Bertrand Benoît, Glaszmann Jean-Christophe. 2013. In : Cultiver la biodiversité pour transformer l'agriculture. Hainzelin Etienne (ed.). Versailles : Ed. Quae, 99-146. (Synthèses) ISBN 978-2-7592-1900-1

Rethinking plant breeding. Ahmadi Nourollah, Bertrand Benoît, Glaszmann Jean-Christophe. 2013. In : Cultivating biodiversity to transform agriculture. Hainzelin Etienne (ed.). Heidelberg : Springer [Allemagne], 91-140. ISBN 978-94-007-7983-9

Synthèse d'études de cas sur l'évaluation d'impact de la recherche agronomique dans les pays du sud : Rapport final. Barret Danielle, Alami Sophia, Biénabe Estelle, Temple Ludovic, Bertrand Benoît (collab.), Bonnet Pascal (collab.), Faure Guy (collab.), Gadet Orlane (collab.), Lancelot Renaud (collab.), Libeau Geneviève (collab.), Maffezzoli Camille (collab.), Medah Benjamin (collab.), Parrot Laurent (collab.), Rey Jean-Yves (collab.), Saiah Camille (collab.), Toillier Aurélie (collab.), Vannière Henri (collab.), Vayssières Jean-François (collab.), Zarrouk Rachid (collab.). 2013. Montpellier : CIRAD, 79 p.

Breeding for coffee quality. Montagnon Christophe, Marraccini Pierre, Bertrand Benoît. 2012. In : Specialty coffee : managing quality. Oberthür Thomas (ed.), Läderach Peter (ed.), Cock James H. (ed.). Penang : IPNI [Southeast Asia], 89-117. ISBN 978-983-44503-1-1

Climatic factors directly impact the volatile organic compound fingerprint in green Arabica coffee bean as well as coffee beverage quality. Bertrand Benoît, Boulanger Renaud, Dussert Stéphane, Ribeyre Fabienne, Berthiot Laurent, Descroix Frédéric, Joët Thierry. 2012. Food Chemistry, 135 (4) : 2575-2583.

Coffee resistance to Colletotrichum kahawae is associated with lignification, accumulation of phenols and cell death at infection sites. Loureiro Andreia A., Nicole Michel, Varzea Victor, Moncada P., Bertrand Benoît, Silva M.C.. 2012. Physiological and Molecular Plant Pathology, 77 (1) : 23-32.

Création et diffusion de variétés de caféiers Arabica : quelles innovations variétales ? Bertrand Benoît, Montagnon Christophe, Georget Frederic, Charmetant Pierre, Etienne Hervé. 2012. Cahiers Agricultures, 21 (2-3) : 77-88.

Des évolutions marquantes pour le café en ce début de XXI e siècle. Charrier André, Bertrand Benoît, Lashermes Philippe. 2012. Cahiers Agricultures, 21 (2-3) : 73-76.

Effets de l'environnement sur l'accumulation des composés de réserve de la graine de caféier. Joët Thierry, Laffargue Andréina, Salmona Jordi, Boulanger Renaud, Bertrand Benoît, Dussert Stéphane. 2012. In : Métabolisme, environnement et développement. 2èmes Journées thématiques transversales de l'UMR DIADE, 25-26 octobre 2012, Montpellier, France. s.l. : s.n., 7. Journées thématiques transversales de l'UMR DIADE. 2, Montpellier, France, 25 Octobre 2012/26 Octobre 2012.

Homeologous gene expression in response to growing temperature in a recent allopolyploid (Coffea arabica L.). Combes Marie-Christine, Cenci Alberto, Baraille Hélène, Bertrand Benoît, Lashermes Philippe. 2012. Journal of Heredity, 103 (1) : 36-46.

Un exemple de transfert de technologie réussi dans le domaine de la micropropagation : la multiplication de Coffea arabica par embryogenèse somatique. Etienne Hervé, Bertrand Benoît, Montagnon Christophe, Bodadilla Landey Roberto, Dechamp Eveline, Jourdan Isabelle, Alpizar Edgardo, Malo Eduardo, Georget Frederic. 2012. Cahiers Agricultures, 21 (2-3) : 115-124.

Agrobacterium-mediated genetic transformation of Coffea arabica (L.) is greatly enhanced by using established embryogenic callus cultures. Ribas Alessandra, Dechamp Eveline, Champion Anthony, Bertrand Benoît, Combes Marie-Christine, Verdeil Jean-Luc, Lapeyre Fabienne, Lashermes Philippe, Etienne Hervé. 2011. BMC Plant Biology, 11 (92), 15 p.

Coffea canephora genome sequencing, a tool for comparative genomics and efficient crop improvement (W511). De Kochko Alexandre, Albert Victor A., Andrade Alan Carvalho, Argout Xavier, Bertrand Benoît, Giuliano Giovanni, Graziosi Giorgio, Henry Robert, Jayarama Jayarama, Lashermes Philippe, Ming Ray, Nagai Chifumi, Rounsley Steve, Sankoff David, Wincker Patrick. 2011. In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XIXth Conference, San Diego, CA (USA), January 15-19, 2011. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genomes Conference. 19, San Diego, États-Unis, 15 Janvier 2011/19 Janvier 2011.

Coffea and Psilanthus. Anthony François, Bertrand Benoît, Etienne Hervé, Lashermes Philippe. 2011. In : Wild crop relatives : genomic and breeding resources. Plantation and ornamental crops. Kole Chittaranjan (ed.). Heidelberg : Springer [Allemagne], 41-61. ISBN 978-3-642-21200-0

Evaluation de l'impact de la recherche au Cirad : Rapport du groupe de travail. Saint-Martin Gilles, Alami Sophia, Arvanitis Rigas, Barret Danielle, Bertrand Benoît, Colinet Laurence, Delarue Jocelyne, Faure Guy, Letourmy Philippe, Mourzelas Mireille, Pallet Dominique, Temple Ludovic, Vagneron Isabelle. 2011. s.l. : s.n., 44 p.

Genetic study on several mechanical properties of the wood of Coffea arabica and Coffea canephora coffee trees. Cilas Christian, Godin Christophe, Bertrand Benoît, Montagnon Christophe, Baillères Henri. 2011. In : Proceedings of the 23rd International Conference on Coffee Science; Bali, Indonesia, October 3-8, 2010 = Actes du 23ème Colloque scientifique international sur le café, Bali, Indonésie, 3-8 octobre 2010. ASIC. Paris : ASIC, 638-642. ISBN 978-2-900212-22-6 International Conference on Coffee Science. 23, Bali, Indonésie, 3 Octobre 2010/8 Octobre 2010.

Genomic expression dominance in the natural allopolyploid Coffea arabica is massively affected by growth temperature. Bardil Amélie, Dantas de Almeida Juliana, Combes Marie-Christine, Lashermes Philippe, Bertrand Benoît. 2011. New Phytologist, 192 (3) : 760-774.

Hétérois et variétés hybrides chez un Allotetraploïde pérenne (Coffea arabica). Bertrand Benoît. 2011. Montpellier : UM2, 73 p. Habilitation à diriger des recherches : Université Montpellier 2

Isoenzymatic characterization of Colletotrichum kahawae isolates with different levels of aggressiveness. Loureiro Andreia A., Guerra-Guimarães Leonor, Lidon Fernando C., Bertrand Benoît, Silva Maria C., Varzea Victor. 2011. Tropical Plant Pathology, 36 (5) : 287-293.

The 'PUCE CAFE' project: The first 15K coffee microarray, a new tool for discovering candidate genes correlated to agronomic and quality traits. Privat Isabelle, Bardil Amélie, Bombarely Gomez Aureliano, Severac Dany, Dantec Christelle, Fuentes Ivanna, Mueller Lukas, Joët Thierry, Pot David, Foucrier Séverine, Dussert Stéphane, Leroy Thierry, Journot Laurent, De Kochko Alexandre, Campa Claudine, Combes Marie-Christine, Lashermes Philippe, Bertrand Benoît. 2011. BMC Genomics, 12 (5), 14 p.

Performance of Coffea arabica F1 hybrids in agroforestry and full-sun cropping systems in comparison with American pure line cultivars. Bertrand Benoît, Alpizar Edgardo, Lara Luis, Santacreo Rodney, Hidalgo M., Quijano J.M., Montagnon Christophe, Georget Frederic, Etienne Hervé. 2011. Euphytica, 181 (2) : 147-158.

Performance of Coffea arabica F1 hybrids in comparison with Americain pure line varieties. Bertrand Benoît, Alpizar Edgardo, Llara L., Santacreo Rodney, Hidalgo M., Quijano J.M., Charmetant Pierre, Montagnon Christophe, Georget Frederic, Etienne Hervé. 2011. In : Proceedings of the 23rd International Conference on Coffee Science; Bali, Indonesia, October 3-8, 2010 = Actes du 23ème Colloque scientifique international sur le café, Bali, Indonésie, 3-8 octobre 2010. ASIC. Paris : ASIC, 484-496. ISBN 978-2-900212-22-6 International Conference on Coffee Science. 23, Bali, Indonésie, 3 Octobre 2010/8 Octobre 2010.

Sequencing the coffee genome (W152). Wincker Patrick, Albert Victor A., Andrade Alan A., Argout Xavier, Bertrand Benoît, De Kochko Alexandre, Giuliano Giovanni, Graziosi Giorgio, Henry Robert, Jayarama Jayarama, Lashermes Philippe, Ming Ray, Nagai Chifumi, Rounsley Steve, Sankoff David. 2011. In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XIXth Conference, San Diego, CA (USA), January 15-19, 2011. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genomes Conference. 19, San Diego, États-Unis, 15 Janvier 2011/19 Janvier 2011.

An example of successful technology transfer: Coffea arabica propagation by somatic embryogenesis. Georget Frederic, Bertrand Benoît, Malo Eduardo, Montagnon Christophe, Alpizar Edgardo, Dechamp Eveline, Jourdan Isabelle, Etienne Hervé. 2011. In : Proceedings of the 23rd International Conference on Coffee Science; Bali, Indonesia, October 3-8, 2010 = Actes du 23ème Colloque scientifique international sur le café, Bali, Indonésie, 3-8 octobre 2010. ASIC. Paris : ASIC, 496-506. ISBN 978-2-900212-22-6 International Conference on Coffee Science. 23, Bali, Indonésie, 3 Octobre 2010/8 Octobre 2010.

Current applications of coffee (Coffea arabica) somatic embryogenesis for industrial propagation of elite heterozygous materials in Central America and Mexico. Etienne Hervé, Bertrand Benoît, Ribas Alessandra, Lashermes Philippe, Malo Eduardo, Montagnon Christophe, Alpizar Edgardo, Bobadilla R., Simpson J., Dechamp Eveline, Jourdan Isabelle, Georget Frederic. 2010. In : Proceedings of the IUFRO Working Party 2.09.02: "Somatic Embryogenesis of Trees" conference on "Advances in Somatic Embryogenesis of Trees and Its Application for the Future Forests and Plantations", August 19-21, 2010, Suwon, Republic of Korea. Park Y.S. (ed.), Bonga J.M. (ed.), Park S.Y. (ed.), Moon H.K. (ed.). Vienne : IUFRO, 59-67. IUFRO Working Party 2.09.02 Somatic Embyogenesis of Forest Tree Conference, Suwon, Corée du Sud, 19 Août 2010/21 Août 2010.

Current applications of coffee (Coffea arabica) somatic embryogenesis for industrial propagation of elite heterozygous materials in Central America and Mexico and for routine functional genomics. Etienne Hervé, Bertrand Benoît, Ribas Alessandra, Lashermes Philippe, Malo Eduardo, Montagnon Christophe, Alpizar Edgardo, Bobadilla R., Simpson J., Dechamp Eveline, Jourdan Isabelle, Georget Frederic. 2010. In : Advances in somatic embryogenesis of trees and its application for the future forests and plantations : IUFRO Working Party 2.09.02 : Somatic Embbryogenesis of Forest Trees Conferences, Suwon, Korea, August 19-21, 2010. IUFRO. s.l. : s.n., Résumé, 54-55. IUFRO Working Party 2.09.02 Somatic Embyogenesis of Forest Tree Conference, Suwon, Corée du Sud, 19 Août 2010/21 Août 2010.

Gene expression divergences between the allopolyploid Coffea arabica and its diploids relatives appear environment-dependant. Bardil Amélie, Combes Marie-Christine, Lashermes Philippe, Bertrand Benoît. 2010. In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XVIIIth Conference, San Diego, CA (USA), January 09-13, 2010. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genomes Conference. 18, San Diego, États-Unis, 9 Janvier 2010/13 Janvier 2010.

Influence of environmental factors, wet processing and their interactions on the biochemical composition of green Arabica coffee beans. Joët Thierry, Laffargue Andréina, Descroix Frédéric, Doulbeau Sylvie, Bertrand Benoît, De Kochko Alexandre, Dussert Stéphane. 2010. Food Chemistry, 118 (3) : 693-701.

Microsatellite polymorphism in hybrids of Coffea arabia (L.) produced industrially by somatic embryogenesis. Menendez-Yuffa Andrea, Bertrand Benoît, Georget Frederic, Jourdan Isabelle, Lashermes Philippe, Malo Eduardo, Montagnon Christophe, Santoni Sylvain, Tollon Christine, Etienne Hervé. 2010. In : 12th IAPB Congress. Sustainability through agricultural biotechnology : food, biomatrerials, energy and environment, June 6-11, 2010, Saint Louis, Missouri, USA. IAPB. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. IAPB Congress 2010. 12, Saint-Louis, États-Unis, 6 Juin 2010/11 Juin 2010.

A comparative analysis of the development and quality of nursery plants derived from somatic embryogenesis and from seedlings for large-scale propagation of coffee (Coffea arabica L.). Menendez-Yuffa Andrea, Barry-Etienne Dominique, Bertrand Benoît, Georget Frederic, Etienne Hervé. 2010. Plant Cell, Tissue and Organ Culture, 102 (3) : 297-307.

Breeding coffee (Coffea arabica) for sustainable production. Lashermes Philippe, Bertrand Benoît, Etienne Hervé. 2009. In : Breeding plantation tree crops : tropical species. Jain Shri Mohan (ed.), Priyadarshan P.M. (ed.). New York : Springer [Etats-Unis], 525-543. ISBN 978-0-387-71199-7

Genotypic and environmental effects on coffee (Coffea arabica L.) bean fatty acid profile: Impact on variety and origin chemometric determination. Villarreal Diana, Laffargue Andréina, Posada Huver, Bertrand Benoît, Lashermes Philippe, Dussert Stéphane. 2009. Journal of Agricultural and Food Chemistry, 57 (23) : 11321-11327.

Metabolic pathways in tropical dicotyledonous albuminous seeds : Coffea arabica as a case study. Joët Thierry, Laffargue Andréina, Salmona Jordi, Doulbeau Sylvie, Descroix Frédéric, Bertrand Benoît, De Kochko Alexandre, Dussert Stéphane. 2009. New Phytologist, 182 : 146-162.

Sources of resistance to root-knot nematodes in coffee : characterisation, genetic bases and perspectives. Villain Luc, Bertrand Benoît, Lashermes Philippe, Etienne Hervé, Anthony François. 2009. In : Second International Congress of Tropical Nematology, Maceio Alagos, Brazil, October 4-9, 2009. s.l. : s.n., Résumé, 258. International Congress of Tropical Nematology. 2, Maceio Alagoas, Brésil, 4 Octobre 2009/9 Octobre 2009.

Stability across environments of the coffee variety near infrared spectral signature. Posada Huver, Ferrand M., Davrieux Fabrice, Lashermes Philippe, Bertrand Benoît. 2009. Heredity, 102 (2) : 113-119.

Study on the Coffea arabica / Colletotrichum kahawae pathosystem: Impact of a biological plant protection product. Durand Noël, Bertrand Benoît, Guyot Bernard, Guiraud Joseph-Pierre, Fontana-Tachon Angélique. 2009. Journal of Plant Diseases and Protection, 116 (2) : 78-85.

Agrobacterium rhizogenes-transformed roots of Coffee (Coffea arabica): Conditions for long-term proliferation, and morphological and molecular characterization. Alpizar Edgardo, Dechamp Eveline, Lapeyre-Montes Fabienne, Guilhaumon Claire, Bertrand Benoît, Jourdan Christophe, Lashermes Philippe, Etienne Hervé. 2008. Annals of Botany, 101 (7) : 929-940.

Chemometric discrimination of coffee (Coffea arabica L.) genotypes and growig origins : [A124]. Villarreal Diana, Bertrand Benoît, Laffargue Andréina, Posada Huver, Lashermes Philippe, Dussert Stéphane. 2008. In : 22nd International Conference on Coffee Science. ASIC. Montpellier : ASIC, 1497-1506. ISBN 2-900212-21-9 International Conference on Coffee Science. 22, Campinas, Brésil, 14 Septembre 2008/19 Septembre 2008.

The Coffee Microarray Project: a new tool to discover candidate genes correlated to quality traits. Privat Isabelle, Bertrand Benoît, Lashermes Philippe. 2008. In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XVIth Conference, San Diego, CA (USA), January 12-16, 2008. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genomes Conference. 16, San Diego, États-Unis, 12 Janvier 2008/16 Janvier 2008.

Comparison of the effectiveness of fatty acids, chlorogenic acids, and elements for the chemometric discrimination of coffee (Coffea arabica L.) varieties and growing origins. Bertrand Benoît, Villarreal Diana, Laffargue Andréina, Posada Huver, Lashermes Philippe, Dussert Stéphane. 2008. Journal of Agricultural and Food Chemistry, 56 (6) : 2273-2280.

Current status of coffee (Coffea arabica L.) genetic resources in Ethiopia : Implications for conservation. Labouisse Jean-Pierre, Bellachew Bayetta, Kotecha Surendra, Bertrand Benoît. 2008. Genetic Resources and Crop Evolution, 55 (7) : 1079-1093.

Deciphering transcriptional networks that govern Coffea arabica seed development using combined cDNA array and real-time RT-PCR approaches. Salmona Jordi, Dussert Stéphane, Descroix Frédéric, De Kochko Alexandre, Bertrand Benoît, Joët Thierry. 2008. Plant Molecular Biology, 66 (1-2) : 105-124.

Genetics of resistance to root-knot nematodes (Meloidoygyne spp.) and breeding. Bertrand Benoît, Anthony François. 2008. In : Plant-parasitic nematodes of coffee. Souza Ricardo M. (ed.). Berlin : Springer [Allemagne], 165-190. ISBN 978-1-4020-8719-6

Histological and ultrastructural characterization of coffee resistance to Colletotrichum kahawae : [PB659]. Loureiro Andreia A., Silva M.D.C., Varzea Victor, Moncada P., Bertrand Benoît, Nicole Michel. 2008. In : 22nd International Conference on Coffee Science. ASIC. Montpellier : ASIC, 1040-1044. ISBN 2-900212-21-9 International Conference on Coffee Science. 22, Campinas, Brésil, 14 Septembre 2008/19 Septembre 2008.

Identification of molecular markers linked to a gene conferring resistance to coffee berry disease (Colletotrichum kahawae) in Coffea arabica. Gichuru E.K., Agwanda Charles O., Combes Marie-Christine, Mutitu E.W., Ngugi E.C.K., Bertrand Benoît, Lashermes Philippe. 2008. Plant Pathology, 57 (6) : 1117-1124.

Near infrared spectral signature and their stability across environments : [C312]. Posada Huver, Ferrand M., Davrieux Fabrice, Lashermes Philippe, Bertrand Benoît. 2008. In : 22nd International Conference on Coffee Science. ASIC. Montpellier : ASIC, 438-447. ISBN 2-900212-21-9 International Conference on Coffee Science. 22, Campinas, Brésil, 14 Septembre 2008/19 Septembre 2008.

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Study on the Coffea arabica/Colletotrichum kahawae pathosystem. Impact of a Natural Elicitor (FEN 560) on this pathosystem : [PA597]. Durand Noël, Bertrand Benoît, Guyot Bernard, Guiraud Joseph-Pierre, Fontana-Tachon Angélique. 2008. In : 22nd International Conference on Coffee Science. ASIC. Montpellier : ASIC, 1563-1567. ISBN 2-900212-21-9 International Conference on Coffee Science. 22, Campinas, Brésil, 14 Septembre 2008/19 Septembre 2008.

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Characterization of Colletotrichum kahawae diversity. Loureiro Andreia A., Varzea Victor, Guerra-Guimarães Leonor, Ribeiro Almeida F., Silva M.C., Bertrand Benoît. 2007. In : 21st International Conference on Coffee Science, Montpellier (France), 11th - 15th September 2006 = 21ème Colloque scientifique international sur le café ; 21. Internationales Wissenshaftliches Kolloquium über Kaffee ; 21e Coloquio Cientifico Internacional sobre el Café. ASIC. Montpellier : ASIC, 1277-1283. ISBN 2-900212-20-0 Colloque Scientifique International sur le Café. 21, Montpellier, France, 11 Septembre 2006/15 Septembre 2006.

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Collection and ex situ conservation of coffee landraces in Ethiopia. The example of Harerge. Labouisse Jean-Pierre, Bellachew Bayetta, Hamelin Chantal, Kotecha Surendra, Bertrand Benoît. 2007. In : 21st International Conference on Coffee Science, Montpellier (France), 11th - 15th September 2006 = 21ème Colloque scientifique international sur le café ; 21. Internationales Wissenshaftliches Kolloquium über Kaffee ; 21e Coloquio Cientifico Internacional sobre el Café. ASIC. Montpellier : ASIC, 926-930. ISBN 2-900212-20-0 Colloque Scientifique International sur le Café. 21, Montpellier, France, 11 Septembre 2006/15 Septembre 2006.

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Uso de la embriogénesis somatica en biorreactor para la propagacion masal de materiales elites de café en America Central y Caribe. Etienne Hervé, Vasquez Nelly, Solano William, Pereira A., Anthony François, Barry-Etienne Dominique, Salazar C., Bertrand Benoît. 2000. In : Congreso Perspectivas y Limitaciones de la Biotecnologia en Paises en Desarollo, 24-28 de enero, 2000, San José, Costa Rica. Libro de resumenes. by Romero, R.M., Hernandez, A. and Solano, G. (eds.). San José : Universidad de San José, Résumé, 100. ISBN 9977-12-428-0 Congreso "Perspectivas y Limitaciones de la Biotecnologia en Paises en Desarrollo", San José, Costa Rica, 24 Janvier 2000/28 Janvier 2000.

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Note de synthèse sur un essai de mode de plantation et sur un essai d'association du cacaoyer avec des cultures vivrières. Note technique n° 1. Bertrand Benoît. 1988. In : Agronomie du cacaoyer. CIRAD-IRCC. Paris : CIRAD-IRCC, 6 p. Journées agronomiques de l'IRCC, Montpellier, France, 6 Septembre 1988/9 Septembre 1988.

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